इंग्लैंड के नॉटिंघमशायर में एक गाय के गोबर के तालाब से एक नए प्रकार के ग्राम-नेगेटिव, एरोबिक, नमक-सहिष्णु, सक्रिय, छड़ी के आकार का और शिकारी बैक्टीरिया ASxL5T को अलग किया गया और कैम्पिलोबैक्टर को अपने शिकार के रूप में इस्तेमाल किया गया। इसके बाद, अन्य कैम्पिलोबैक्टर प्रजातियाँ और एंटरोबैक्टीरियासी परिवार के सदस्यों को शिकार के रूप में खोजा गया। मेजबान कोशिकाओं के बिना उपसंस्कृति के बाद, ब्रेन हार्ट इन्फ्यूजन एगर पर कमजोर सड़न रोकनेवाला विकास हासिल किया गया था। इष्टतम विकास की स्थिति 37 डिग्री सेल्सियस और पीएच 7 है। ट्रांसमिशन इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी ने शिकार की उपलब्धता से संबंधित कुछ बहुत ही असामान्य रूपात्मक विशेषताओं का खुलासा किया। 16एस आरआरएनए जीन अनुक्रम का उपयोग करते हुए फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण से संकेत मिलता है कि आइसोलेट समुद्री स्पिरुलिना परिवार के एक सदस्य से संबंधित है, लेकिन इसे किसी भी ज्ञात जीनस के सदस्य के रूप में स्पष्ट रूप से वर्गीकृत नहीं किया जा सकता है। ASxL5T के संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण ने समुद्री स्पाइरोकेट्स के सदस्यों के साथ संबंध की पुष्टि की। एक डेटाबेस खोज से पता चला कि कई ASxL5T समुद्र, भूमि की सतह और भूजल के कई असंवर्धित जीवाणुओं के साथ 16S rRNA जीन अनुक्रम साझा करते हैं। हमारा सुझाव है कि ASxL5T स्ट्रेन एक नए जीनस में एक नई प्रजाति का प्रतिनिधित्व करता है। हम वेनेटोरबैक्टर कुकुलस जीन नाम की अनुशंसा करते हैं। नवंबर, एसपी. नवंबर में, ASxL5T का उपयोग टाइप स्ट्रेन के रूप में किया गया था।
शिकारी जीवाणु वे जीवाणु होते हैं जो जैवसंश्लेषक सामग्री और ऊर्जा प्राप्त करने के लिए अन्य जीवित जीवाणुओं का शिकार करने और उन्हें मारने की क्षमता प्रदर्शित करते हैं। यह मृत सूक्ष्मजीवों से पोषक तत्वों की सामान्य पुनर्प्राप्ति से अलग है, और यह परजीवी बातचीत से भी अलग है, जिसमें बैक्टीरिया अपने मेजबान को मारे बिना उनके साथ घनिष्ठ संबंध बनाते हैं। शिकारी जीवाणुओं ने अपने निवास स्थान (जैसे समुद्री आवास) में प्रचुर मात्रा में खाद्य स्रोतों का लाभ उठाने के लिए विभिन्न जीवन चक्र विकसित किए हैं। वे वर्गीकरण की दृष्टि से विविध समूह हैं, जो केवल अपने अद्वितीय नसबंदी जीवन चक्र1 से जुड़े हुए हैं। शिकारी बैक्टीरिया के उदाहरण कई अलग-अलग फ़ाइला में पाए गए हैं, जिनमें शामिल हैं: प्रोटीओबैक्टीरिया, बैक्टेरॉइड्स और क्लोरेला।3। हालाँकि, सबसे अच्छी तरह से अध्ययन किए गए शिकारी बैक्टीरिया बीडेलोविब्रियो और बीडेलोविब्रियो-और-जैसे जीव (BALOs4) हैं। शिकारी बैक्टीरिया नए जैविक रूप से सक्रिय यौगिकों और जीवाणुरोधी एजेंटों5 का एक आशाजनक स्रोत हैं।
माना जाता है कि शिकारी बैक्टीरिया माइक्रोबियल विविधता को बढ़ाते हैं और पारिस्थितिकी तंत्र के स्वास्थ्य, उत्पादकता और स्थिरता पर सकारात्मक प्रभाव डालते हैं। इन सकारात्मक विशेषताओं के बावजूद, बैक्टीरिया के संवर्धन की कठिनाई और उनके जटिल जीवन चक्रों को समझने के लिए सेल इंटरैक्शन का सावधानीपूर्वक निरीक्षण करने की आवश्यकता के कारण नए शिकारी बैक्टीरिया पर बहुत कम अध्ययन हुए हैं। कंप्यूटर विश्लेषण से यह जानकारी प्राप्त करना आसान नहीं है।
बढ़ते रोगाणुरोधी प्रतिरोध के युग में, जीवाणु रोगज़नक़ों को लक्षित करने के लिए नई रणनीतियों का अध्ययन किया जा रहा है, जैसे कि बैक्टीरियोफेज और शिकारी बैक्टीरिया7,8 का उपयोग। ASxL5T बैक्टीरिया को 2019 में नॉटिंघमशायर विश्वविद्यालय, नॉटिंघमशायर के डेयरी सेंटर से एकत्र किए गए गाय के गोबर से फेज आइसोलेशन तकनीक का उपयोग करके अलग किया गया था। जांच का उद्देश्य जैविक नियंत्रण एजेंटों के रूप में क्षमता वाले जीवों को अलग करना है। कैम्पिलोबैक्टर हयोइंटेस्टाइनलिस एक जूनोटिक रोगज़नक़ है, जो तेजी से मानव आंतों के रोगों से जुड़ा हुआ है10। यह सीरम में सर्वव्यापी है और लक्ष्य होस्ट के रूप में उपयोग किया जाता है।
ASxL5T जीवाणु को बीफ़ जेली से अलग किया गया था क्योंकि यह देखा गया था कि सी. ह्योइंटेस्टाइनलिस के लॉन पर इसके द्वारा बनाई गई सजीले टुकड़े बैक्टीरियोफेज द्वारा उत्पादित सजीले टुकड़े के समान थे। यह एक अप्रत्याशित खोज है, क्योंकि फ़ेज़ अलगाव प्रक्रिया के भाग में 0.2 µm फ़िल्टर के माध्यम से फ़िल्टर करना शामिल है, जिसे बैक्टीरिया कोशिकाओं को हटाने के लिए डिज़ाइन किया गया है। पट्टिका से निकाली गई सामग्री की सूक्ष्म जांच से पता चला कि छोटे ग्राम-नकारात्मक घुमावदार रॉड के आकार के बैक्टीरिया ने पॉलीहाइड्रॉक्सीब्यूटाइरेट (पीएचबी) जमा नहीं किया। शिकार कोशिकाओं से स्वतंत्र सड़न रोकनेवाला संस्कृति समृद्ध ठोस माध्यम (जैसे मस्तिष्क हृदय जलसेक अगर (बीएचआई) और रक्त अगर (बीए)) पर महसूस की जाती है, और इसकी वृद्धि कमजोर होती है। यह भारी इनोकुलम सुधार के साथ उपसंस्कृति के बाद प्राप्त किया जाता है। यह माइक्रोएरोबिक (7% v/v ऑक्सीजन) और वायुमंडलीय ऑक्सीजन स्थितियों में समान रूप से अच्छी तरह से बढ़ता है, लेकिन अवायवीय वातावरण में नहीं। 72 घंटों के बाद, कॉलोनी का व्यास बहुत छोटा था, 2 मिमी तक पहुंच गया, और यह बेज, पारभासी, गोल, उत्तल और चमकदार था। मानक जैव रासायनिक परीक्षण में बाधा आती है क्योंकि ASxL5T को तरल मीडिया में विश्वसनीय रूप से सुसंस्कृत नहीं किया जा सकता है, जो बताता है कि यह बायोफिल्म निर्माण के जटिल जीवन चक्र पर निर्भर हो सकता है। हालाँकि, प्लेट सस्पेंशन से पता चला कि ASxL5T एरोबिक है, ऑक्सीडेज और कैटालेज़ के लिए सकारात्मक है, और 5% NaCl को सहन कर सकता है। ASxL5T 10 माइक्रोग्राम स्ट्रेप्टोमाइसिन के प्रति प्रतिरोधी है, लेकिन परीक्षण किए गए अन्य सभी एंटीबायोटिक दवाओं के प्रति संवेदनशील है। ASxL5T जीवाणु कोशिकाओं की जांच TEM द्वारा की गई (चित्र 1)। जब BA पर शिकार कोशिकाओं के बिना उगाया जाता है, तो ASxL5T कोशिकाएं छोटी कैम्पिलोबैक्टर होती हैं, जिनकी औसत लंबाई 1.63 μm (± 0.4), चौड़ाई 0.37 μm (± 0.08) और एक लंबा (5 μm तक) ध्रुव होता है। यौन कशाभिका. ऐसा प्रतीत होता है कि लगभग 1.6% कोशिकाओं की चौड़ाई 0.2 μm से कम है, जो फ़िल्टर डिवाइस से गुजरने की अनुमति देगी। कुछ कोशिकाओं के शीर्ष पर फेयरिंग (लैटिन कुकुलस) के समान एक असामान्य संरचनात्मक विस्तार देखा गया (1डी, ई, जी में तीर देखें)। ऐसा लगता है कि यह अतिरिक्त बाहरी झिल्ली से बना है, जो पेरिप्लास्मिक लिफाफे के आकार में तेजी से कमी के कारण हो सकता है, जबकि बाहरी झिल्ली बरकरार रहती है, जो "ढीला" रूप दिखाती है। 4°C पर लंबे समय तक पोषक तत्वों की अनुपस्थिति (पीबीएस में) में ASxL5T का संवर्धन करने के परिणामस्वरूप अधिकांश (लेकिन सभी नहीं) कोशिकाओं में कोकल आकृति विज्ञान (चित्र 1C) दिखाई देता है। जब ASxL5T कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी के साथ 48 घंटों तक शिकार के रूप में बढ़ता है, तो औसत कोशिका का आकार मेजबान के बिना विकसित हुई कोशिकाओं की तुलना में काफी लंबा और संकीर्ण होता है (तालिका 1 और चित्र 1ई)। इसके विपरीत, जब ASxL5T 48 घंटों तक शिकार के रूप में ई. कोली के साथ बढ़ता है, तो औसत कोशिका का आकार शिकार के बिना बढ़ने की तुलना में लंबा और चौड़ा होता है (तालिका 1), और कोशिका की लंबाई परिवर्तनशील होती है, जो आमतौर पर फिलामेंटस दिखाती है (चित्रा 1एफ)। जब कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी या ई. कोली को 48 घंटों तक शिकार के रूप में रखा गया, तो ASxL5T कोशिकाओं में कोई फ्लैगेला नहीं दिखा। तालिका 1 ASxL5T की उपस्थिति, अनुपस्थिति और शिकार के प्रकार के आधार पर कोशिका आकार में परिवर्तन के अवलोकन का सारांश प्रस्तुत करती है।
ASx5LT का TEM डिस्प्ले: (ए) ASx5LT लंबा व्हिप दिखाता है; (बी) विशिष्ट ASx5LT बैटरी; (सी) पोषक तत्वों के बिना लंबे समय तक ऊष्मायन के बाद कोक्सी ASx5LT कोशिकाएं; (डी) ASx5LT कोशिकाओं के एक समूह में असामान्यता दिखाई देती है (E) कैम्पिलोबैक्टर शिकार के साथ ऊष्मायन किए गए ASx5LT कोशिका समूह में शिकार की वृद्धि के बिना कोशिकाओं की तुलना में कोशिका की लंबाई में वृद्धि देखी गई (D) ने शीर्ष संरचना भी दिखाई; (एफ) ई. कोली शिकार के साथ ऊष्मायन के बाद बड़ी फिलामेंटस फ्लैगेल्ला, एएसएक्स5एलटी कोशिकाएं; (जी) ई. कोली के साथ ऊष्मायन के बाद एक एकल ASx5LT कोशिका, एक असामान्य शीर्ष संरचना दिखा रही है। बार 1 μm का प्रतिनिधित्व करता है।
16एस आरआरएनए जीन अनुक्रम (परिग्रहण संख्या एमटी636545.1) का निर्धारण डेटाबेस खोजों को गैमप्रोटोबैक्टीरिया वर्ग के समान अनुक्रम स्थापित करने में सक्षम बनाता है, और समुद्री स्पिरिलम परिवार (चित्र 2) में समुद्री बैक्टीरिया के सबसे करीब है, और थैलासोलिटस जीनस के सदस्य हैं। समुद्री बैसिलस का निकटतम रिश्तेदार। 16एस आरआरएनए जीन अनुक्रम स्पष्ट रूप से बीडेलविब्रियोनेसी (डेल्टाप्रोटोबैक्टीरिया) परिवार से संबंधित शिकारी बैक्टीरिया से अलग है। B. बैक्टीरियोवोरस HD100T (टाइप स्ट्रेन, DSM 50701) और B. बैक्टीरियोवोरस DM11A की जोड़ीवार तुलना 48.4% और 47.7% थी, और B. एक्सोवोरस JSS के लिए यह 46.7% थी। ASxL5T बैक्टीरिया में 16S rRNA जीन की 3 प्रतियां होती हैं, जिनमें से दो एक दूसरे के समान होती हैं, और तीसरी 3 आधार अलग होती है। एक ही स्थान से समान रूपात्मक और फेनोटाइपिक विशेषताओं वाले दो अन्य हिंसक जीवाणु आइसोलेट्स (ASx5S और ASx5O; 16S rRNA जीन परिग्रहण संख्या क्रमशः MT636546.1 और MT636547.1 हैं) समान नहीं हैं, लेकिन वे ASxL5T और असंस्कृत जीवाणु से भिन्न हैं ओशनोस्पिरिलेसी में डेटाबेस अनुक्रमों को अन्य जेनेरा के साथ क्लस्टर किया गया है (चित्र 2)। ASxL5T के पूरे जीनोम अनुक्रम को एनसीबीआई डेटाबेस में निर्धारित और सहेजा गया है, और परिग्रहण संख्या CP046056 है। ASxL5T के जीनोम में 56.1% के G + C अनुपात के साथ 2,831,152 bp का एक गोलाकार गुणसूत्र होता है। जीनोम अनुक्रम में 2653 सीडीएस (कुल) शामिल हैं, जिनमें से 2567 प्रोटीन को एनकोड करने के लिए अनुमानित हैं, जिनमें से 1596 को अनुमानित कार्यों (60.2%) के रूप में सौंपा जा सकता है। जीनोम में 67 आरएनए-कोडिंग जीन होते हैं, जिनमें 9 आरआरएनए (5एस, 16एस और 23एस के लिए प्रत्येक 3) और 57 टीआरएनए शामिल हैं। ASxL5T की जीनोमिक विशेषताओं की तुलना 16S rRNA जीन अनुक्रम (तालिका 2) से पहचाने गए निकटतम सापेक्ष प्रकार के उपभेदों के उपलब्ध जीनोम के साथ की गई थी। सभी उपलब्ध थैलासोलिटस जीनोम की ASxL5T से तुलना करने के लिए अमीनो एसिड पहचान (एएआई) का उपयोग करें। एएआई द्वारा निर्धारित निकटतम उपलब्ध (अपूर्ण) जीनोम अनुक्रम थैलासोलिटस एसपी है। C2-1 (NZ_VNIL01000001 जोड़ें)। इस स्ट्रेन को मारियाना ट्रेंच के गहरे समुद्र तलछट से अलग किया गया था, लेकिन तुलना के लिए इस स्ट्रेन के बारे में वर्तमान में कोई फेनोटाइपिक जानकारी नहीं है। ASxL5T के 2.82 एमबी की तुलना में, जीव का जीनोम 4.36 एमबी से बड़ा है। समुद्री स्पाइरोकेट्स का औसत जीनोम आकार लगभग 4.16 एमबी (± 1.1; एन = 92 पूर्ण संदर्भ जीनोम https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly से जांचा गया) है, इसलिए ASxL5T का जीनोम इसके अनुरूप है अन्य सदस्यों की तुलना में यह काफी छोटा है। गैमप्रोटोबैक्टीरिया 11,12,13,14,15,16 के लिए विशिष्ट 172 सिंगल-कॉपी जीनों के संरेखित और जुड़े अमीनो एसिड अनुक्रमों का उपयोग करके, जीनोम-आधारित अनुमानित अधिकतम संभावना फ़ाइलोजेनेटिक ट्री (चित्रा 3 ए) उत्पन्न करने के लिए जीटीओट्री 1.5.54 का उपयोग करें। 17 ,18. विश्लेषण से पता चला कि इसका थैलासोलिटस, बैक्टीरियल प्लेन और समुद्री बैक्टीरिया से गहरा संबंध है। हालाँकि, इन आंकड़ों से संकेत मिलता है कि ASxL5T समुद्री स्पिरुलिना में अपने रिश्तेदारों से अलग है और इसका जीनोम अनुक्रम डेटा उपलब्ध है।
16S rRNA जीन अनुक्रम का उपयोग करने वाला फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ समुद्री स्पाइरुलिनेसी में असिंचित और समुद्री बैक्टीरिया उपभेदों के सापेक्ष ASxL5T, ASxO5, और ASxS5 उपभेदों (आंत के साथ) की स्थिति पर प्रकाश डालता है। जेनबैंक परिग्रहण संख्या कोष्ठक में स्ट्रेन नाम का अनुसरण करती है। अनुक्रमों को संरेखित करने के लिए ClustalW का उपयोग करें, और फ़ाइलोजेनेटिक संबंधों का अनुमान लगाने के लिए अधिकतम संभावना विधि और तमुरा-नेई मॉडल का उपयोग करें, और MEGA X प्रोग्राम में 1000 निर्देशित प्रतिकृतियां निष्पादित करें। शाखा पर संख्या इंगित करती है कि निर्देशित प्रतिलिपि मूल्य 50% से अधिक है। एस्चेरिचिया कोली यू/541टी का उपयोग एक आउटग्रुप के रूप में किया गया था।
(ए) जीनोम पर आधारित एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़, जो समुद्री स्पिरोस्पिरेसी जीवाणु ASxL5T और उसके करीबी रिश्तेदारों, ई. कोली यू 5/41T के बीच एक बाह्य समूह के रूप में संबंध दर्शाता है। (बी) टी. ऑलिवोरन्स एमआईएल-1टी की तुलना में, एएसएक्स5एलटी प्रोटीन के ऑर्थोलॉगस समूह (सीओजी) क्लस्टर के आधार पर जीन के कार्यात्मक श्रेणी वितरण की भविष्यवाणी की जाती है। बाईं ओर का आंकड़ा प्रत्येक जीनोम में प्रत्येक कार्यात्मक COG श्रेणी में जीन की संख्या दर्शाता है। दाईं ओर का ग्राफ़ प्रत्येक कार्यात्मक COG समूह में निहित जीनोम का प्रतिशत दिखाता है। (सी) टी. ऑलिवेरन्स एमआईएल-1टी की तुलना में, एएसएक्सएल5टी के संपूर्ण केईजीजी (जीन और जीनोम के क्योटो विश्वकोश) मॉड्यूलर मार्ग का विश्लेषण।
ASxL5T जीनोम में मौजूद घटक जीन की जांच करने के लिए KEGG डेटाबेस का उपयोग करने से एरोबिक गामा प्रोटियस के विशिष्ट चयापचय मार्ग का पता चला। ASxL5T में बैक्टीरियल मोटर प्रोटीन को सौंपे गए कुल 75 जीन शामिल हैं, जिनमें केमोटैक्सिस, फ्लैगेला असेंबली और टाइप IV फ़िम्ब्रिए सिस्टम में शामिल जीन शामिल हैं। अंतिम श्रेणी में, 10 में से 9 जीन कई अन्य जीवों की हिलने-डुलने की गति के लिए जिम्मेदार हैं। ASxL5T के जीनोम में एक पूर्ण टेट्राहाइड्रोपाइरीमिडीन बायोसिंथेटिक मार्ग शामिल है जो आसमाटिक तनाव20 के लिए सुरक्षात्मक प्रतिक्रिया में भाग लेता है, जैसा कि हेलोफाइल के लिए अपेक्षित है। जीनोम में राइबोफ्लेविन संश्लेषण पथ सहित सहकारकों और विटामिनों के लिए कई संपूर्ण मार्ग भी शामिल हैं। यद्यपि एल्केन 1-मोनोऑक्सीजिनेज (alkB2) जीन ASxL5T में मौजूद है, हाइड्रोकार्बन उपयोग मार्ग पूरा नहीं हुआ है। ASxL5T के जीनोम अनुक्रम में, T. oleiverans MIL-1T21 में हाइड्रोकार्बन के क्षरण के लिए मुख्य रूप से जिम्मेदार जीन के समरूप, जैसे TOL_2658 (alkB) और TOL_2772 (अल्कोहल डिहाइड्रोजनेज) स्पष्ट रूप से अनुपस्थित हैं। चित्र 3बी ASxL5T और जैतून तेल MIL-1T के बीच COG श्रेणी में जीन वितरण की तुलना दिखाता है। कुल मिलाकर, छोटे ASxL5T जीनोम में बड़े संबंधित जीनोम की तुलना में प्रत्येक COG श्रेणी से आनुपातिक रूप से कम जीन होते हैं। जब प्रत्येक कार्यात्मक श्रेणी में जीन की संख्या को जीनोम के प्रतिशत के रूप में व्यक्त किया जाता है, तो अनुवाद, राइबोसोमल संरचना और जैवजनन श्रेणियों, और ऊर्जा उत्पादन और रूपांतरण फ़ंक्शन श्रेणियों में जीन के प्रतिशत में अंतर नोट किया जाता है, जो बड़े ASxL5T का गठन करते हैं। जीनोम प्रतिशत की तुलना T. oleiverans MIL-1T जीनोम में मौजूद समान समूह से की जाती है। इसके विपरीत, ASxL5T जीनोम की तुलना में, T. oleivorans MIL-1T में प्रतिकृति, पुनर्संयोजन और मरम्मत और प्रतिलेखन श्रेणियों में जीन का प्रतिशत अधिक है। दिलचस्प बात यह है कि दोनों जीनोम की प्रत्येक कार्यात्मक श्रेणी की सामग्री में सबसे बड़ा अंतर ASxL5T (चित्रा 3बी) में मौजूद अज्ञात जीन की संख्या है। केईजीजी मॉड्यूल का एक संवर्धन विश्लेषण किया गया था, जहां प्रत्येक केईजीजी मॉड्यूल जीनोम अनुक्रम डेटा के एनोटेशन और जैविक व्याख्या के लिए मैन्युअल रूप से परिभाषित कार्यात्मक इकाइयों के एक सेट का प्रतिनिधित्व करता है। ASxL5T और ऑलिव MIL-1T के संपूर्ण KOG मॉड्यूल मार्ग में जीन वितरण की तुलना चित्र 3C में दिखाई गई है। इस विश्लेषण से पता चलता है कि यद्यपि ASxL5T में पूर्ण सल्फर और नाइट्रोजन चयापचय मार्ग है, T. oleiverans MIL-1T में नहीं है। इसके विपरीत, टी. ऑलिवरन्स MIL-1T में पूर्ण सिस्टीन और मेथियोनीन चयापचय मार्ग है, लेकिन ASxL5T में यह अधूरा है। इसलिए, ASxL5T में सल्फेट आत्मसात के लिए एक विशिष्ट मॉड्यूल है (जीन के एक सेट के रूप में परिभाषित किया गया है जिसे फेनोटाइपिक मार्कर के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है, जैसे कि चयापचय क्षमता या रोगजनकता; https://www.genome.jp/kegg/module.html) टी में ऑलीवेरन्स MIL-1T। ASxL5T की जीन सामग्री की उन जीनों की सूची से तुलना करना जो हिंसक जीवनशैली का सुझाव देते हैं, अनिर्णायक है। यद्यपि कोर में O एंटीजन पॉलीसेकेराइड से जुड़े लिगेज को एन्कोड करने वाला waal जीन ASxL5T जीनोम में मौजूद है (लेकिन यह कई ग्राम-नेगेटिव बैक्टीरिया में आम है), ट्रिप्टोफैन 2,3-डाइऑक्सीजिनेज (TDO) जीन में 60 एमिनो शामिल हो सकते हैं अम्ल क्षेत्र आमतौर पर शिकारी जीवाणुओं में पाए जाते हैं जो मौजूद नहीं होते हैं। ASxL5T जीनोम में कोई अन्य शिकारी विशेषता वाले जीन नहीं हैं, जिनमें मेवलोनेट मार्ग में आइसोप्रेनॉइड जैवसंश्लेषण में शामिल एन्कोडिंग एंजाइम भी शामिल हैं। ध्यान दें कि जांचे गए शिकारी समूह में कोई ट्रांसक्रिप्शनल नियामक जीन जीएनटीआर नहीं है, लेकिन एएसएक्सएल5टी में तीन जीएनटीआर जैसे जीन की पहचान की जा सकती है।
ASxL5T की फेनोटाइपिक विशेषताओं को तालिका 3 में संक्षेपित किया गया है और साहित्य में रिपोर्ट की गई संबंधित जेनेरा 23, 24, 25, 26 और 27 की फेनोटाइपिक विशेषताओं के साथ तुलना की गई है। टी. मेरिनस, टी. ओलेवोरन्स, बी. सैन्येंसिस, और ओशनोबैक्टर क्रिएगी के आइसोलेट्स सक्रिय, नमक-सहिष्णु, ऑक्सीडेज-पॉजिटिव रॉड के आकार के शरीर हैं, लेकिन ASxL5T के साथ लगभग कोई अन्य फेनोटाइपिक विशेषताएं नहीं हैं। महासागर का औसत पीएच 8.1 (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrate/ocean-acidification#section_77) है, जो टी. मेरिनस, टी. ओलेवोरन्स, बी. सेनयेन्सिस और ओ में परिलक्षित होता है। kriegii. ASxL5T गैर-समुद्री प्रजातियों की विशिष्ट बड़ी पीएच रेंज (4-9) के लिए उपयुक्त है। थैलासोलिटस एसपी की फेनोटाइपिक विशेषताएं। सी2-1. अज्ञात। ASxL5T की वृद्धि तापमान सीमा आम तौर पर समुद्री उपभेदों (4-42 डिग्री सेल्सियस) की तुलना में व्यापक है, हालांकि कुछ नहीं बल्कि सभी टी. मेरिनस आइसोलेट्स गर्मी-सहिष्णु हैं। ब्रोथ मीडिया में ASxL5T को विकसित करने में असमर्थता ने आगे फेनोटाइपिक लक्षण वर्णन को रोक दिया। बीए प्लेट, ओएनपीजी, आर्जिनिन डाइहाइड्रोलेज़, लाइसिन डिकार्बोक्सिलेज़, ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेज़, साइट्रेट उपयोग, यूरेज़, ट्रिप्टोफैन डेमिनेज़, जिलेटिन हाइड्रोलिसिस एंजाइम से स्क्रैप की गई सामग्री का परीक्षण करने के लिए एपीआई 20 ई का उपयोग करें, परीक्षण के परिणाम सभी नकारात्मक थे, लेकिन कोई इंडोल, एसीटोइन और एच 2 एस नहीं थे। का उत्पादन किया गया. अकिण्वित कार्बोहाइड्रेट में शामिल हैं: ग्लूकोज, मैनोज, इनोसिटोल, सोर्बिटोल, रैम्नोज, सुक्रोज, मेलिबियोज, एमिग्डालिन और अरेबिनोज। प्रकाशित संबंधित संदर्भ उपभेदों की तुलना में, ASxL5T स्ट्रेन का सेलुलर फैटी एसिड प्रोफाइल तालिका 4 में दिखाया गया है। मुख्य सेलुलर फैटी एसिड C16:1ω6c और/या C16:1ω7c, C16:0 और C18:1ω9 हैं। हाइड्रॉक्सी फैटी एसिड C12:0 3-OH और C10:0 3-OH भी मौजूद हैं। ASxL5T में C16:0 का अनुपात संबंधित जेनेरा के रिपोर्ट किए गए मूल्य से अधिक है। इसके विपरीत, रिपोर्ट की गई टी. मेरिनस IMCC1826TT की तुलना में, ASxL5T में C18:1ω7c और/या C18:1ω6c का अनुपात कम हो गया है। ऑलिवोरन्स MIL-1T और O. kriegii DSM 6294T, लेकिन B. sanyensis KCTC 32220T में नहीं पाया गया। ASxL5T और ASxLS के फैटी एसिड प्रोफाइल की तुलना करने से दो उपभेदों के बीच व्यक्तिगत फैटी एसिड की मात्रा में सूक्ष्म अंतर का पता चला, जो एक ही प्रजाति के जीनोमिक डीएनए अनुक्रम के अनुरूप हैं। सूडान ब्लैक परीक्षण का उपयोग करके कोई पॉली-3-हाइड्रॉक्सीब्यूटाइरेट (पीएचबी) कणों का पता नहीं लगाया गया।
शिकार की सीमा निर्धारित करने के लिए ASxL5T बैक्टीरिया की शिकार गतिविधि का अध्ययन किया गया था। यह जीवाणु कैम्पिलोबैक्टर प्रजातियों पर सजीले टुकड़े बना सकता है, जिनमें शामिल हैं: कैम्पिलोबैक्टर सुइस 11608टी, कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी पीटी14, कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी 12662, कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी एनसीटीसी 11168टी; एस्चेरिचिया कोलाई एनसीटीसी 12667; सी. हेल्वेटिकस एनसीटीसी 12472; सी लारी एनसीटीसी 11458 और सी. अपसैलेंसिस एनसीटीसी 11541टी। ग्राम-नकारात्मक और ग्राम-पॉजिटिव बैक्टीरिया की एक विस्तृत श्रृंखला का परीक्षण करने के लिए विधि के मेजबान सीमा निर्धारण अनुभाग में सूचीबद्ध संस्कृतियों का उपयोग करें। नतीजे बताते हैं कि ASxL5T का उपयोग एस्चेरिचिया कोली एनसीटीसी 86 और सिट्रोबैक्टर फ्रींडी एनसीटीसी 9750टी में भी किया जा सकता है। क्लेबसिएला ऑक्सीटोका 11466 पर बनी सजीले टुकड़े। ई. कोली एनसीटीसी 86 के साथ टीईएम इंटरेक्शन को चित्र 4ए-डी में दिखाया गया है, और कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी पीटी14 और कैंपिलोबैक्टर सुइस एस12 के साथ इंटरेक्शन को चित्र 4ई-एच मध्य में दिखाया गया है। परीक्षण किए गए शिकार प्रकारों के बीच हमले का तंत्र अलग-अलग प्रतीत होता है, प्रत्येक ASxL5T सेल से एक या अधिक ई. कोली कोशिकाएं जुड़ी होती हैं और सोखने से पहले विस्तारित सेल के साथ पार्श्व में स्थित होती हैं। इसके विपरीत, ASxL5T संपर्क के एक बिंदु के माध्यम से कैम्पिलोबैक्टर से जुड़ता हुआ प्रतीत होता है, आमतौर पर शिकारी कोशिका के शीर्ष के संपर्क में और कैम्पिलोबैक्टर कोशिका के शीर्ष के पास (चित्र 4H)।
TEM ASx5LT और शिकार के बीच परस्पर क्रिया दिखा रहा है: (AD) और ई. कोली शिकार; (ईएच) और सी. जेजुनी शिकार। (ए) एक एकल ई. कोली (ईसी) सेल से जुड़ा एक विशिष्ट ASx5LT सेल; (बी) एकल ईसी सेल से जुड़ा एक फिलामेंटस ASx5LT; (सी) कई ईसी कोशिकाओं से जुड़ा एक फिलामेंटस ASx5LT सेल; (डी) एकल ई. कोलाई (ईसी) सेल पर छोटी ASx5LT कोशिकाएं संलग्न करें; (ई) कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी (सीजे) सेल से जुड़ा एक एकल ASx5LT सेल; (एफ) एएसएक्स5एलटी सी. हयोइंटेस्टाइनलिस (सीएच) कोशिकाओं पर हमला करता है; (जी) दो एक ASx5LT सेल ने एक CJ सेल पर हमला किया; (एच) सीजे सेल (बार 0.2 माइक्रोन) के शीर्ष के पास ASx5LT अनुलग्नक बिंदु का एक नज़दीकी दृश्य। बार (ए-जी) में 1 माइक्रोन का प्रतिनिधित्व करता है।
शिकारी बैक्टीरिया शिकार के प्रचुर स्रोतों का लाभ उठाने के लिए विकसित हुए हैं। जाहिर है, वे कई अलग-अलग वातावरणों में व्यापक रूप से मौजूद हैं। जनसंख्या सदस्यों के संकीर्ण आकार के कारण, फ़ेज़ पृथक्करण विधि का उपयोग करके ASxL5T बैक्टीरिया को घोल से अलग करना संभव है। समुद्री बैक्टीरिया के ओशियनोस्पिरिलेसी परिवार के सदस्यों के लिए ASxL5T की जीनोमिक प्रासंगिकता आश्चर्यजनक है, हालांकि जीव नमक-सहिष्णु है और 5% नमक वाले माध्यम पर बढ़ सकता है। घोल के जल गुणवत्ता विश्लेषण से पता चला कि सोडियम क्लोराइड की मात्रा 0.1% से कम थी। इसलिए, कीचड़ समुद्री पर्यावरण से भौगोलिक और रासायनिक दोनों ही दृष्टि से बहुत दूर है। एक ही स्रोत से तीन संबंधित लेकिन अलग-अलग आइसोलेट्स की उपस्थिति इस बात का सबूत देती है कि ये शिकारी इस गैर-समुद्री वातावरण में पनप रहे हैं। इसके अलावा, माइक्रोबायोम विश्लेषण (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990 से उपलब्ध डेटा फ़ाइलें) से पता चला कि वही 16S rRNA जीन अनुक्रम शीर्ष 50 सबसे प्रचुर परिचालन टैक्सा (OTU) में स्थित है ) कीचड़ के कुछ नमूने अंतराल में। जेनबैंक डेटाबेस में कई असंस्कृत बैक्टीरिया पाए गए, जिनमें ASxL5T बैक्टीरिया के समान 16S rRNA जीन अनुक्रम हैं। ये अनुक्रम, ASxL5T, ASxS5, और ASxO5 के अनुक्रमों के साथ, थैलासोलिटस और ओशनोबैक्टर (चित्र 2) से अलग किए गए विभिन्न समूहों का प्रतिनिधित्व करते प्रतीत होते हैं। तीन प्रकार के असंवर्धित बैक्टीरिया (GQ921362, GQ921357 और GQ921396) 2009 में दक्षिण अफ्रीकी सोने की खदान में 1.3 किलोमीटर की गहराई पर दरार के पानी से अलग किए गए थे, और अन्य दो (DQ256320 और DQ337006) भूजल से थे (दक्षिण अफ्रीका में भी) 2005 में)। ASxL5T से सबसे अधिक निकटता से संबंधित 16S rRNA जीन अनुक्रम 2006 में उत्तरी फ्रांस के समुद्र तटों (परिग्रहण संख्या AM29240828) से प्राप्त रेतीले तलछट की संवर्धन संस्कृति से प्राप्त 16S rRNA जीन अनुक्रम का हिस्सा है। असंवर्धित जीवाणु HQ183822.1 से एक और निकटता से संबंधित 16S rRNA जीन अनुक्रम चीन में एक नगरपालिका लैंडफिल से निक्षालित संग्रह टैंक से प्राप्त किया गया था। जाहिर है, ASxL5T बैक्टीरिया टैक्सोनोमिक डेटाबेस में अत्यधिक प्रतिनिधि नहीं हैं, लेकिन असंस्कृत बैक्टीरिया के ये अनुक्रम ASxL5T के समान जीवों का प्रतिनिधित्व करने की संभावना रखते हैं, जो पूरी दुनिया में वितरित होते हैं, आमतौर पर चुनौतीपूर्ण वातावरण में। संपूर्ण जीनोम फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण से, ASxL5T का निकटतम रिश्तेदार थैलासोलिटस एसपी है। सी2-1, टी. मेरिनस, टी. ऑलिवोरन्स। और O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. थैलासोलिटस समुद्री बाध्य हाइड्रोकार्बन विखंडन बैक्टीरिया (OHCB) का एक सदस्य है, जो समुद्री और स्थलीय वातावरण में व्यापक है, और आमतौर पर हाइड्रोकार्बन प्रदूषण की घटनाओं 30,31 के बाद प्रमुख हो जाता है। समुद्री बैक्टीरिया ओएचसीबी समूह के सदस्य नहीं हैं, लेकिन समुद्री पर्यावरण से अलग हैं।
फेनोटाइपिक डेटा से संकेत मिलता है कि ASxL5T एक नई प्रजाति है और समुद्री स्पिरोस्पिरेसी परिवार में पहले से मान्यता प्राप्त जीनस का सदस्य है। नए पृथक उपभेदों को नए जीनस में वर्गीकृत करने के लिए वर्तमान में कोई स्पष्ट मानक नहीं है। सार्वभौमिक जेनेरा सीमाओं को निर्धारित करने का प्रयास किया गया है, उदाहरण के लिए, एक रूढ़िवादी प्रोटीन (पीओसीपी) के जीनोम के प्रतिशत के आधार पर, यह अनुशंसा की जाती है कि कट-ऑफ मान संदर्भ स्ट्रेन33 के समान 50% है। अन्य लोग एएआई मूल्यों का उपयोग करने का सुझाव देते हैं, जिनके पीओसीपी पर फायदे हैं क्योंकि उन्हें अपूर्ण जीनोम34 से प्राप्त किया जा सकता है। लेखक का मानना ​​है कि यदि मॉडल प्रजाति के मॉडल स्ट्रेन की तुलना में एएआई मान 74% से कम है, तो स्ट्रेन एक अलग जेनेरा का प्रतिनिधि है। समुद्री स्पिरिलसी में मॉडल जीनस समुद्री स्पिरिलम है, और मॉडल स्ट्रेन O. लिनम ATCC 11336T है। ASxL5T और O. लिनम ATCC 11336T के बीच AAI मान 54.34% है, और ASxL5T और T. oleivorans MIL-1T (जीनस प्रकार के उपभेद) के बीच AAI मान 67.61% है, जो दर्शाता है कि ASxL5T थैलासोलिटस से अलग एक नए जीनस का प्रतिनिधित्व करता है। वर्गीकरण मानक के रूप में 16एस आरआरएनए जीन अनुक्रम का उपयोग करते हुए, सुझाई गई जीनस परिसीमन सीमा 94.5%35 है। ASxL5T को थैलासोलिटस जीनस में रखा जा सकता है, जो टी. ऑलिवोरन्स MIL-1T और 96.17% के साथ 95.03% 16S rRNA अनुक्रम पहचान दर्शाता है। मेरिनस IMCC1826T. हालाँकि, इसे बैक्टेरॉइड्स जीनस में भी रखा जाएगा जिसमें 94.64% 16S rRNA जीन की पहचान B. sanyensis NV9 के साथ है, जो दर्शाता है कि 16S rRNA जीन जैसे एकल जीन के उपयोग से मनमाना वर्गीकरण और असाइनमेंट हो सकता है। एक अन्य सुझाई गई विधि मौजूदा जेनेरा के सभी प्रकार और गैर-प्रकार के उपभेदों से डेटा बिंदुओं की क्लस्टरिंग की जांच करने के लिए एएनआई और जीनोम एलाइनमेंट स्कोर (एएफ) का उपयोग करती है। लेखक विश्लेषण किए जा रहे टैक्सा के लिए विशिष्ट अनुमानित जीनस के विभक्ति बिंदु के साथ जीनस सीमा को संयोजित करने की सिफारिश करता है। हालाँकि, यदि थैलासोलिटस आइसोलेट्स से पर्याप्त पूर्ण जीनोम अनुक्रम नहीं हैं, तो इस विधि से यह निर्धारित करना असंभव है कि ASxL5T थैलासोलिटस जीनस से संबंधित है या नहीं। विश्लेषण के लिए संपूर्ण जीनोम अनुक्रमों की सीमित उपलब्धता के कारण, संपूर्ण जीनोम फ़ाइलोजेनेटिक वृक्ष की सावधानी से व्याख्या की जानी चाहिए। दूसरे, संपूर्ण जीनोम तुलना विधियां तुलना किए गए जीनोम के आकार में पर्याप्त अंतर का कारण नहीं बन सकती हैं। उन्होंने संबंधित जेनेरा के बीच संरक्षित कोर सिंगल-कॉपी जीन की समानता को मापा, लेकिन बड़ी संख्या में जीनों को ध्यान में नहीं रखा जो ASxL5T के बहुत छोटे जीनोम में मौजूद नहीं हैं। जाहिर है, ASxL5T और थैलासोलिटस, ओशनोबैक्टर और बैक्टीरियोप्लेन सहित समूहों का एक सामान्य पूर्वज है, लेकिन विकास ने एक अलग रास्ता अपनाया है, जिससे जीनोम में कमी आई है, जो एक शिकारी जीवन शैली के अनुकूल हो सकता है। यह T. oleivorans MIL-1T के विपरीत है, जो 28% बड़ा है और हाइड्रोकार्बन23,30 का उपयोग करने के लिए विभिन्न पर्यावरणीय दबावों के तहत विकसित हुआ है। रिकेट्सिया, क्लैमाइडिया और बुचनेरा जैसे बाध्य इंट्रासेल्युलर परजीवियों और सहजीवन के साथ एक दिलचस्प तुलना की जा सकती है। इनके जीनोम का आकार लगभग 1 एमबी है। मेजबान सेल मेटाबोलाइट्स का उपयोग करने की क्षमता से जीन हानि होती है, इसलिए महत्वपूर्ण विकासवादी जीनोमिक गिरावट आई है। समुद्री रासायनिक पोषक जीवों से लेकर शिकारी जीवनशैली तक के विकासवादी परिवर्तनों के परिणामस्वरूप जीनोम आकार में समान कमी हो सकती है। COG और KEGG विश्लेषण विशिष्ट कार्यों के लिए उपयोग किए जाने वाले जीनों की संख्या और ASxL5T और T. oleivorans MIL-1T के बीच जीनोमिक मार्गों में वैश्विक अंतर पर प्रकाश डालता है, जो मोबाइल आनुवंशिक तत्वों की व्यापक उपलब्धता के कारण नहीं हैं। ASxL5T के पूरे जीनोम के G + C अनुपात में अंतर 56.1% है, और T. oleivorans MIL-1T का अंतर 46.6% है, जो यह भी दर्शाता है कि इसे अलग किया गया है।
ASxL5T जीनोम की कोडिंग सामग्री की जांच फेनोटाइपिक विशेषताओं में कार्यात्मक अंतर्दृष्टि प्रदान करती है। प्रकार IV फ़िम्ब्रिए (टीएफपी) को एन्कोड करने वाले जीन की उपस्थिति विशेष रुचि रखती है क्योंकि वे सतह पर फ्लैगेल्ला के बिना, कोशिका गति को बढ़ावा देते हैं, जिसे सामाजिक ग्लाइडिंग या ऐंठन कहा जाता है। रिपोर्टों के अनुसार, टीएफपी के अन्य कार्य भी हैं, जिनमें परभक्षण, रोगजनन, बायोफिल्म निर्माण, प्राकृतिक डीएनए ग्रहण, स्वचालित कोशिका एकत्रीकरण और विकास38 शामिल हैं। ASxL5T जीनोम में डिगुआनाइलेट साइक्लेज़ को एन्कोड करने वाले 18 जीन होते हैं (एक एंजाइम जो 2 ग्वानोसिन ट्राइफॉस्फेट को ग्वानोसिन 2 फॉस्फेट और चक्रीय diGMP में परिवर्तित करता है) और 6 जीन संबंधित डिगुआनाइलेट साइक्लेज़ फॉस्फेट डिगुआनाइलेट को एन्कोडिंग करते हैं। एस्टरेज़ के लिए जीन (गुआनोसिन मोनोफॉस्फेट में चक्रीय डी-जीएमपी के क्षरण को उत्प्रेरित करता है) दिलचस्प है क्योंकि साइक्ल-डी-जीएमपी बायोफिल्म विकास और पृथक्करण, आंदोलन, सेल लगाव और प्रक्रिया में विषाणु 39, 40 में शामिल एक महत्वपूर्ण दूसरा संदेशवाहक है। यह भी ध्यान दिया जाना चाहिए कि बीडेलोविब्रियो बैक्टीरियोवोरस में, चक्रीय डबल जीएमपी को मुक्त जीवन और शिकारी जीवनशैली41 के बीच संक्रमण को नियंत्रित करने के लिए दिखाया गया है।
शिकारी जीवाणुओं पर अधिकांश शोध बीडेलोविब्रियो, बीडेलोविब्रियो जैसे जीवों और मायक्सोकोकस प्रजातियों पर केंद्रित हैं। शिकारी बैक्टीरिया के ये और अन्य ज्ञात उदाहरण एक विविध समूह बनाते हैं। इस विविधता के बावजूद, विशिष्ट प्रोटीन परिवारों के एक समूह की पहचान की गई है जो 11 ज्ञात शिकारी जीवाणुओं के फेनोटाइप को दर्शाते हैं। हालाँकि, केवल O एंटीजन लिगेज (waaL) को एन्कोडिंग करने वाले जीन की पहचान की गई है, जो विशेष रूप से ग्राम-नेगेटिव बैक्टीरिया में आम है। विश्लेषण का यह रूप ASxL5T को एक शिकारी के रूप में नामित करने में सहायक नहीं है, शायद इसलिए क्योंकि यह एक नई हमले की रणनीति का उपयोग करता है। अधिक विविध शिकारी जीवाणु जीनोम की उपलब्धता बेहतर रिज़ॉल्यूशन विश्लेषण विकसित करने में मदद करेगी जो समूह के सदस्यों के बीच कार्यात्मक और पर्यावरणीय मतभेदों के साक्ष्य को ध्यान में रखेगी। इस विश्लेषण में शामिल नहीं किए गए शिकारी बैक्टीरिया के उदाहरणों में क्यूप्रियाविडस नेकेटर42 और ब्रैडीमोनबैक्टीरिया43 के सदस्य शामिल हैं, क्योंकि जैसे-जैसे शोधकर्ता विभिन्न माइक्रोबियल समुदायों की जांच करते हैं, अधिक शिकारी टैक्सा स्थापित होते हैं।
TEM छवि द्वारा कैप्चर किए गए ASxL5T बैक्टीरिया की सबसे उल्लेखनीय विशेषता इसकी अनूठी और लचीली आकृति विज्ञान है, जो शिकार बैक्टीरिया के साथ बातचीत को बढ़ावा दे सकती है। देखी गई अंतःक्रिया का प्रकार अन्य शिकारी जीवाणुओं से भिन्न है और इसे पहले खोजा या रिपोर्ट नहीं किया गया है। प्रस्तावित ASxL5T शिकारी जीवन चक्र को चित्र 5 में दिखाया गया है। जैसा कि हम यहां रिपोर्ट कर रहे हैं, साहित्य में समान शीर्ष संरचनाओं वाले कुछ उदाहरण हैं, लेकिन इन उदाहरणों में टेरासाकीस्पिरा पपाहानामोकुकेनसिस, कभी-कभी शीर्ष वृद्धि 44 के साथ एक समुद्री स्पिरिलम जीवाणु, और अल्फाप्रोटोबैक्टीरिया, टेरासाकिएला पुसिला शामिल हैं। , पूर्व में जीनस ओसियोस्पिरिलम से संबंधित, तथाकथित "ध्रुवीय फिल्म" का प्रदर्शन 45. कोक्सी रूप अक्सर पुरानी संस्कृतियों में देखे जाते हैं, विशेष रूप से घुमावदार रूपों वाले बैक्टीरिया के लिए, जैसे विब्रियो, कैम्पिलोबैक्टर, और हेलिकोबैक्टर 46, 47, 48, जो एक अपमानित अवस्था का प्रतिनिधित्व कर सकते हैं। ASxL5T बैक्टीरिया के सटीक जीवन चक्र को स्पष्ट करने के लिए और काम करने की आवश्यकता है। यह निर्धारित करने के लिए कि यह कैसे पकड़ता है और शिकार करता है, और क्या इसका जीनोम जैविक रूप से सक्रिय यौगिकों को एनकोड करता है जिनका उपयोग चिकित्सा या जैव प्रौद्योगिकी उद्देश्यों के लिए किया जा सकता है।
वेनेटोरबैक्टर जीन का विवरण। नवंबर वेनेटोरबैक्टर (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. L. n. venator,'शिकारी' और Gr. n.bacter,'एक छड़ी' से वेनेटरों से बना है। वेनेटोरबैक्टर,'एक शिकार रॉड' कोशिकाएं एरोबिक, नमक-सहिष्णु, घुमावदार ग्राम दाग नकारात्मक, कैटालेज़ और ऑक्सीडेज गतिविधि 4 के तापमान सीमा में जमा नहीं होती हैं 42 डिग्री सेल्सियस तक अंतर्वर्धित। 4-9 की पीएच सीमा असामान्य है। समुद्री घोंघे में, अधिकांश अम्लीय पीएच के प्रति असहिष्णु होते हैं। मुख्य फैटी एसिड C16:1ω6c और/या C16:1ω7c, C16:0 और C18:1ω9 हैं; C12:0 3-OH और C10:0 3-OH हाइड्रॉक्सी फैटी एसिड के रूप में पाए जाते हैं। वे ब्रोथ मीडिया में नहीं बढ़ते हैं डीएनए जी + सी सामग्री 56.1 एमओएल% है। इस जीनस के सदस्य कैम्पिलोबैक्टर के प्रति प्रतिरोध दिखाते हैं और एंटरोबैक्टीरियासी परिवार के सदस्यों का शिकार व्यवहार परिवार में है।
वेनेटोरबैक्टर कुकुलस एसपी का विवरण। नवंबर वेनेटोरबैक्टर क्यूकुलस (cu'cull.us.; एल. एन. क्यूकुलस का अर्थ है गोरा होना)।
इसके अलावा, इस जीनस की वर्णनात्मक विशेषता यह है कि जब बीए या बीएचआई पर उगाया जाता है, तो कोशिकाएं 1.63 µm लंबी और 0.37 µm चौड़ी होती हैं। बीएचआई अगर पर कॉलोनियां बहुत छोटी हैं, जिनका व्यास 72 घंटों के बाद 2 मिमी तक पहुंच जाता है। वे बेज, पारभासी, गोल, उत्तल और चमकदार हैं। इस प्रजाति के सदस्य एस्चेरिचिया कोली और क्लेबसिएला का उपयोग कर सकते हैं। कैम्पिलोबैक्टर और कई अन्य ग्राम-नेगेटिव बैक्टीरिया शिकार के रूप में काम करते हैं।
विशिष्ट स्ट्रेन ASxL5T को यूके के नॉटिंघमशायर में गोमांस के दूध से अलग किया गया था, और नेशनल टाइप कल्चर कलेक्शन (यूके) में जमा किया गया था: परिग्रहण संख्या NCTC 14397 और नीदरलैंड्स बैक्टीरियल कल्चर कलेक्शन (NCCB) परिग्रहण संख्या NCCB 100775। ASxL5T का पूरा जीनोम अनुक्रम CP046056 के जोड़ के अनुसार जेनबैंक में जमा किया गया है।
ASxL5T बैक्टीरिया को फेज आइसोलेशन तकनीक9,49 का उपयोग करके गोमांस के दूध से अलग किया गया था। घोल को एसएम बफर (50 एमएम ट्रिस-एचसीएल [पीएच 7.5], 0.1 एम NaCl, 8 एमएम एमजीएसओ4.7एच2ओ और 0.01% जिलेटिन; सिग्मा एल्ड्रिच, गिलिंघम, यूके) में 1:9 (w/v) पतला किया गया, फिर इनक्यूबेट किया गया 24 घंटों के लिए 4 डिग्री सेल्सियस पर, शिकारियों को बफर में भगाने के लिए धीरे-धीरे घूमते हुए। सस्पेंशन को 3 मिनट के लिए 3000 ग्राम पर सेंट्रीफ्यूज किया गया। सतह पर तैरनेवाला एकत्र किया गया और 5 मिनट के लिए दूसरी बार 13,000 ग्राम पर सेंट्रीफ्यूज किया गया। फिर किसी भी शेष जीवाणु कोशिकाओं को हटाने के लिए सतह पर तैरनेवाला को 0.45 µm झिल्ली फिल्टर (मिनीसार्ट; सार्टोरियस, गोटिंगेन, जर्मनी) और 0.2 µm झिल्ली फिल्टर (मिनीसार्ट) से गुजारा गया। ASxL5T इन फ़िल्टर को पास कर सकता है। मानक तकनीकों का उपयोग करके उसी घोल से कैम्पिलोबैक्टर एंटरोसस एस12 (एनसीबीआई परिग्रहण संख्या सीपी040464) का एक नरम अगर लॉन तैयार किया गया था। फ़िल्टर किए गए घोल को इन मेजबान सेल प्लेटों में से प्रत्येक पर 10 μl बूंदों में तीन प्रतियों में वितरित किया गया और सूखने दिया गया। प्लेट को माइक्रोएरोबिक परिस्थितियों (5% O2, 5% H2, 10% CO2 और 80% N2) के तहत 48 घंटों के लिए 37°C पर एक माइक्रोएरोफिलिक टैंक में इनक्यूबेट किया गया था। प्राप्त दृश्य पट्टिका को एसएम बफर में निकाला गया और लीज्ड जीवों को आगे बढ़ाने के लिए सी. ह्योइंटेस्टाइनलिस एस12 के ताजा लॉन में स्थानांतरित किया गया। एक बार जब यह निर्धारित हो जाता है कि बैक्टीरिया लिटिक प्लाक का कारण है, न कि फ़ेज़, तो मेजबान से स्वतंत्र रूप से जीव को विकसित करने का प्रयास करें और इसे और अधिक विशिष्ट बनाएं। एरोबिक कल्चर 37 डिग्री सेल्सियस पर 5% वी/वी डिफाइब्रिनेटेड घोड़े के रक्त (टीसीएस बायोसाइंसेज लेफ्टिनेंट, बकिंघम, यूके, पूरक) के साथ किया गया था। राष्ट्रीय नैदानिक ​​मानक समिति के दिशानिर्देशों के अनुसार, जीवाणुरोधी संवेदनशीलता परीक्षण के लिए डिस्क प्रसार विधि का उपयोग किया जाता है। बीएचआई अगर को एरोबिक कल्चर के लिए निम्नलिखित एंटीबायोटिक्स (ऑक्सॉइड) युक्त डिस्क का उपयोग करके 37 डिग्री सेल्सियस पर सुसंस्कृत किया गया था: एमोक्सिसिलिन और क्लैवुलैनिक एसिड 30 माइक्रोग्राम; सेफ़ोटैक्सिम 30 माइक्रोग्राम; स्ट्रेप्टोमाइसिन 10 माइक्रोग्राम; सिप्रोफ्लोक्सासिन 5 माइक्रोग्राम; सेफ्टाज़िडाइम 30 माइक्रोग्राम नेलिडिक्सिक एसिड 30 माइक्रोग्राम; इमिपेनेम 10 माइक्रोग्राम; एज़िथ्रोमाइसिन 15 माइक्रोग्राम; क्लोरैम्फेनिकॉल 30 माइक्रोग्राम; सेफ़ॉक्सिटिन 30 माइक्रोग्राम; टेट्रासाइक्लिन 30 माइक्रोग्राम; नाइट्रोफ्यूरेंटोइन 300 माइक्रोग्राम; एज़्ट्रोनम 30 माइक्रोग्राम; एम्पीसिलीन 10 माइक्रोग्राम; सेफपोडोक्साइम 10 माइक्रोग्राम; ट्राइमेथोप्रिम-सल्फामेथोक्साज़ोल 25 माइक्रोग्राम। 37 डिग्री सेल्सियस पर बीएचआई अगर प्लेटों पर एरोबिक ऊष्मायन द्वारा नमक सहिष्णुता स्थापित की गई थी। 10% w/v तक की सांद्रता सीमा प्रदान करने के लिए BHI agar प्लेटों में अतिरिक्त NaCl जोड़ा गया था। पीएच रेंज 37 डिग्री सेल्सियस पर बीएचआई अगर प्लेटों पर एरोबिक संस्कृति द्वारा निर्धारित की जाती है, जहां पीएच रेंज को स्टेराइल एचसीएल या स्टेराइल NaOH के साथ 4 और 9 के बीच समायोजित किया गया है, और प्लेट डालने से पहले लक्ष्य पीएच मान सत्यापित किया जाता है। सेलुलर फैटी एसिड विश्लेषण के लिए, ASxL5T को 3 दिनों के लिए BHI अगर और 37 डिग्री सेल्सियस पर एरोबिक पर सुसंस्कृत किया गया था। FERA साइंस लिमिटेड, (यॉर्क, यूके) के MIDI (शरलॉक माइक्रोबियल आइडेंटिफिकेशन सिस्टम, संस्करण 6.10) मानक प्रोटोकॉल के अनुसार, सेल फैटी एसिड निकाले गए, तैयार किए गए और उनका विश्लेषण किया गया।
टीईएम के लिए, ASxL5T को 24 घंटे के लिए 37°C पर BA पर समान रूप से फैलाकर एरोबिक संवर्धित किया गया, और फिर कमरे के तापमान पर 0.1 M कैकोडायलेट बफर में 3% (v/v) ग्लूटाराल्डिहाइड के 1 मिलीलीटर में काटा गया, 1 घंटे के लिए ठीक करें, फिर सेंट्रीफ्यूज करें 3 मिनट के लिए 10,000 ग्राम पर। फिर धीरे से गोली को 600 μl 0.1 एम कैकोडायलेट बफर में पुनः निलंबित करें। निश्चित ASxL5T सस्पेंशन को 200 मेश कॉपर ग्रिड पर फॉर्मवार/कार्बन फिल्म में स्थानांतरित करें। बैक्टीरिया को 1 मिनट के लिए 0.5% (w/v) यूरेनिल एसीटेट से रंगा गया और टीईआई टेक्नाई जी2 12 बायोट्विन माइक्रोस्कोप का उपयोग करके टीईएम द्वारा जांच की गई। जैसा कि ऊपर उल्लेख किया गया है, एनजेडसीवाईएम शोरबा (बीडी डिफ्को™, फिशर साइंटिफिक यूके लिमिटेड, लॉफबोरो) में शिकार और शिकारी की समान संख्या को मिलाएं और 37 डिग्री सेल्सियस पर कैम्पिलोबैक्टर या कैम्पिलोबैक्टर की माइक्रोएरोबिक स्थितियों के तहत 48 घंटों के लिए सेते हैं, शिकारी और शिकार की परस्पर क्रिया टीईएम द्वारा भी जांच की गई। एस्चेरिचिया कोलाई के लिए एरोबिक स्थितियाँ। शिकार के कारण कोशिका आकृति विज्ञान में किसी भी परिवर्तन को निर्धारित करने के लिए शिकार और शिकारी बैक्टीरिया की स्वतंत्र रूप से जांच करें। पीएचबी संचय की ऑप्टिकल माइक्रोस्कोपी के लिए सूडान ब्लैक विधि का उपयोग किया गया था।
एक बाँझ झाड़ू के साथ BHI या BA प्लेटों पर वृद्धि को धब्बा करके ASxL5T संस्कृतियों को रातोंरात उगाएं। ASxL5T कोशिकाओं को इकट्ठा करें और उन्हें MRD (CM0733, ऑक्सॉइड) में निलंबित करें, और फिर कोशिकाओं को भूखा रखने के लिए उन्हें 7 दिनों के लिए 4°C पर रखें। एनसीटीसी संदर्भ या प्रयोगशाला स्टॉक बैक्टीरियल कल्चर को बीएचआई शोरबा या नंबर 2 पोषक तत्व शोरबा (सीएम007, ऑक्सॉइड) में टीका लगाया गया था, रात भर ऊष्मायन किया गया था, 13,000 ग्राम पर सेंट्रीफ्यूज किया गया था और ओडी 600 0.4 होने तक एमआरडी में फिर से निलंबित कर दिया गया था। संस्कृति: बैसिलस सबटिलिस एनसीटीसी 3610टी, सिट्रोबैक्टर फ्रींडी एनसीटीसी 9750टी, एंटरोबैक्टर एरोजेन्स एनसीटीसी 10006टी, एंटरोकोकस फेकेलिस एनसीटीसी 775टी, एस्चेरिचिया कोली एनसीटीसी 86, क्लेबसिएला ऑक्सीटोका 11466, ल्यूकोनोस्टोक एनसीटीसी 10817, लिस्टेरिया स्पेशल बैक्टीरिया एनसीटीसी 4885, बैसिलस मैकेरन्स एनसीटीसी 6355टी, प्रोविडेंसिया स्टुअर्ट्सि एनसीटीसी 10318, स्यूडोमोनास फ्लोरेसेंस एसएमडीएल, रोडोकोकस सबमरीन हैमबर्गर एनसीटीसी 1621टी, साल्मोनेला आंत्र बैक्टीरिया मोंडेविले एनसीटीसी 5747, म्यूसिलेज एनसीटीसी 10861, स्टैफिलोकोकस ऑरियस एनसीटीसी 8532टी, स्ट्रेप्टोकोकस न्यूमोनिया एनसीटीसी 7465टी, यर्सिनिया एंटरोकोलिटिका एनसीटीसी 10460। कैम्पिलोबैक्टर होस्ट को 37 डिग्री सेल्सियस पर बीए प्लेटों पर माइक्रोएरोबिक रूप से इनक्यूबेट किया गया और एनजेडसीवाईएम शोरबा में निलंबित कर दिया गया। परीक्षण किए गए कैम्पिलोबैक्टर होस्ट हैं: सी. कोलाई 12667 एनसीटीसी, सी. जेजुनी 12662, सी. जेजुनी पीटी14, सी. जेजुनी एनसीटीसी 11168टी, सी. हेल्वेटिकस एनसीटीसी 12472, सी. लारी एनसीटीसी 11458, सी. लारी एनसीटीसी 11458, सी. जेजुनी पीटी14, सी... एमआरडी में कोशिकाओं को इकट्ठा करें, 13,000 ग्राम पर सेंट्रीफ्यूज करें और एमआरडी में तब तक फिर से निलंबित करें जब तक कि ओडी600 0.4 न हो जाए। 5 मिली पिघले हुए एनजेडसीवाईएम टॉप एगर (0.6% एगर) में 0.5 मिली सस्पेंशन का एलिकोट मिलाएं और इसे 1.2% एनजेडसीवाईएम बॉटम प्लेट पर डालें। इलाज और सुखाने के बाद, क्रमिक रूप से पतला ASxL5T को तीन प्रतियों में प्रत्येक लॉन बोर्ड पर 20 μl बूंदों के रूप में वितरित किया गया था। संस्कृति का तापमान और वातावरण परीक्षण बैक्टीरिया की आवश्यकताओं पर निर्भर करता है।
बैक्टीरियल आइसोलेट्स से डीएनए तैयार करने के लिए GenElute™ बैक्टीरियल जीनोमिक डीएनए किट (सिग्मा एल्ड्रिज) का उपयोग करें। डाई टर्मिनेशन केमिस्ट्री (यूरोफिन्स वैल्यू रीड सर्विस, जर्मनी) का उपयोग करके 16एस आरआरएनए जीन के पीसीआर प्रवर्धन और उत्पाद अनुक्रम निर्धारण के लिए मानक तरीकों का उपयोग किया गया था। निकट संबंधी प्रजातियों की पहचान करने और उन्हें एकत्र करने के लिए अन्य 16S rRNA जीन अनुक्रमों के साथ इन अनुक्रमों की तुलना करने के लिए BLAST-N प्रोग्राम का उपयोग करें। इन्हें MEGA X प्रोग्राम में ClustalW का उपयोग करके संरेखित किया गया है। 1000 निर्देशित प्रतियों54 के साथ तमूरा-नेई मॉडल के आधार पर अधिकतम संभावना विधि का उपयोग करके MEGA संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण के लिए डीएनए निकालने के लिए प्योरलिंक™ जीनोमिक डीएनए किट (फिशर साइंटिफिक, लॉफबोरो, यूके) का उपयोग करें। ASxL5T का जीनोम अनुक्रम इलुमिना MiSeq संयोजन का उपयोग करके निर्धारित किया गया था, जिसमें नेक्सटेरा लेबलिंग किट का उपयोग करके तैयार लाइब्रेरी से बना 250 बीपी डबल-एंडेड रीड्स और PacBio प्लेटफ़ॉर्म से 2 से 20 केबी लंबे रीड्स शामिल हैं। सेम्बिया विश्वविद्यालय में जीनोमिक्स डीएनए अनुक्रमण अनुसंधान सुविधा। जीनोम को सीएलसी जीनोमिक्स वर्कबेंच 12.0.3 (क्यूजेन, आरहूस, डेनमार्क) का उपयोग करके इकट्ठा किया गया था। ASxL5T संस्कृतियों को नेशनल टाइप कल्चर कलेक्शन (यूके) और नीदरलैंड्स बैक्टीरियल कल्चर कलेक्शन (एनसीसीबी) में जमा किया जाता है। तुलना के लिए उपयोग किए जाने वाले संबंधित जीवों के जीनोम हैं: थैलासोलिटस ऑलिवोरन्स MIL-1T (परिग्रहण संख्या HF680312, पूर्ण); बैक्टीरियोप्लेन्स सेनेंसिस KCTC 32220T (परिग्रहण संख्या BMYY01000001, अपूर्ण); ओशनोबैक्टर क्रिगी डीएसएम 6294टी (परिग्रहण संख्या NZ_AUGV00000000, अपूर्ण); मैरिनामोनास समुदाय डीएसएम 5604टी (एएसएम436330वी1 जोड़ा गया, अधूरा), ओशनोस्पिरुलम लाइनम एटीसीसी 11336टी (एमटीएसडी02000001 जोड़ा गया, अधूरा) और थैलासोलिटस एसपी। C2-1 (NZ_VNIL01000001 जोड़ें, अपूर्ण)। संरेखण स्कोर (एएफ) और औसत न्यूक्लिक एसिड पहचान (एएनआई) निर्धारित करने के लिए https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= पर जेजीआई जीनोम पोर्टल36 का उपयोग करें। जोंड़ों में। अमीनो एसिड पहचान (एएआई) निर्धारित करने के लिए रोड्रिग्ज-आर और कॉन्स्टेंटिनिडिस55 की विधि का उपयोग किया गया था। अनुमानित अधिकतम संभावना फ़ाइलोजेनेटिक ट्री उत्पन्न करने के लिए GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 का उपयोग करें। उपलब्ध संदर्भ जीनोम का प्रतिनिधित्व करने वाले इनपुट जीनोम को 16S rRNA फाइलोजेनी से ASxL5T से संबंधित होने के रूप में पहचाने जाने वाले संदर्भ जेनेरा से चुना जाता है। इंटरैक्टिव ट्री ऑफ लाइफ ऑनलाइन टूल (https://itol.embl.de/) का उपयोग करके पेड़ को एनोटेट किया। ASxL5T जीनोम का कार्यात्मक एनोटेशन और विश्लेषण KEGG (क्योटो इनसाइक्लोपीडिया ऑफ जीन्स एंड जीनोम्स) मॉड्यूल संवर्धन वितरण का उपयोग करके ब्लास्टकोआला KEGG ऑनलाइन टूल का उपयोग करके किया जाता है। सीओजी श्रेणियों (ऑर्थोलॉगस समूह) का वितरण एगएनओजी-मैपर ऑनलाइन टूल का उपयोग करके निर्धारित किया जाता है।
पेरेज़, जे., मोरालेडा-मुअनोज़, ए., मार्कोस-टोरेस, एफजे और मुनोज़-डोरैडो, जे. जीवाणु शिकार: 75 वर्ष और यह जारी है! . पर्यावरण। सूक्ष्मजीव. 18, 766-779 (2016)।
लिनारेस-ओटोया, एल. आदि। पेरू के समुद्र तट पर शिकारी बैक्टीरिया की विविधता और जीवाणुरोधी क्षमता। मार्च ड्रग्स. 15.ई308. https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017)।
पास्टर्नक, जेड एट अल। उनके जीन के माध्यम से, आप उन्हें समझेंगे: शिकारी बैक्टीरिया की जीनोमिक विशेषताएं। आईएसएमई जे. 7, 756-769 (2013)।
सॉकेट, आरई बैक्टीरियोफेज बीडेलोविब्रियो की शिकारी जीवनशैली। स्थापित करना। पादरी सूक्ष्म जीव. 63, 523-539 (2009)।
कोर्प, जे., वेला गुरोविक, एमएस और नेट, एम. शिकारी बैक्टीरिया से एंटीबायोटिक्स। बीलस्टीन जे. हिस्टोकेमिस्ट्री 12, 594-607 (2016)।
जॉनके, जे., फ्रौने, एस., बॉश, टीसीजी, हेंटशेल, यू. और शुलेनबर्ग, एच. बेडेलोविब्रियो और इसी तरह के जीव विभिन्न मेजबान आबादी में माइक्रोबायोम विविधता के भविष्यवक्ता हैं। सूक्ष्मजीव. पारिस्थितिकी। 79, 252-257 (2020)।
विला, जे., मोरेनो-मोरालेस, जे. और बैलेस्टे-डेलपिएरे, सी. नए जीवाणुरोधी एजेंटों की वर्तमान स्थिति की खोज करें। नैदानिक. सूक्ष्मजीव. संक्रमित. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019)।
होबली, एल. एट अल. फेज और फेज का दोहरा शिकार एक भी शिकार के बिना ई. कोली शिकार को खत्म कर सकता है। जे. बैक्टीरिया. 202, ई00629-19. https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020)।
एल-शिबिनी, ए., कॉनर्टन, पीएल और कॉनर्टन, आईएफ फ्री-रेंज और जैविक मुर्गियों के भोजन चक्र के दौरान अलग किए गए कैम्पिलोबैक्टर और बैक्टीरियोफेज की गिनती और विविधता। अनुप्रयोग वातावरण. सूक्ष्मजीव. 71, 1259-1266 (2005)।
विल्किंसन, डीए आदि कैम्पिलोबैक्टर स्वाइन की जीनोमिक वर्गीकरण और महामारी विज्ञान को अद्यतन करें। विज्ञान। प्रतिनिधि 8, 2393. https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018)।
ली, एमडी जीटीओट्री: सिस्टम जीनोमिक्स के लिए उपयोगकर्ता के अनुकूल वर्कफ़्लो। जैव सूचना विज्ञान 35, 4162-4164 (2019)।
एडगर, आरसी मसल: एक बहु अनुक्रम संरेखण विधि जो समय और स्थान की जटिलता को कम करती है। बीएमसी जैविक जानकारी। 5, 113 (2004)।
कैपेला-गुतिरेज़, एस., सिला-मार्टिनेज़, जेएम और गैबल्डन, टी. ट्रिमएएल: बड़े पैमाने पर फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण में स्वचालित संरेखण और ट्रिमिंग के लिए एक उपकरण। जैव सूचना विज्ञान 25, 1972-1973 (2009)।
हयात, डी., लोकासियो, पीएफ, हाउजर, एलजे और उबरबैकर, ईसी जीन और मेटागेनोमिक अनुक्रम अनुवाद प्रारंभ साइट भविष्यवाणी। जैव सूचना विज्ञान 28, 2223-2230 (2012)।
शेन, डब्लू. और ज़िओंग, जे. टैक्सोनकिट: क्रॉस-प्लेटफ़ॉर्म और कुशल एनसीबीआई वर्गीकरण टूलकिट। बायो Rxiv. (1 जून, 2021 को एक्सेस किया गया); https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019)।
प्राइस, एमएन, देहल, पीएस और आर्किन, एपी फास्टट्री 2-बड़े संरेखण के साथ अनुमानित अधिकतम संभावना वाला पेड़। पीएलओएस वन 5, ई9490 (2010)।
तांगे, ओ. जीएनयू समानांतर। (1 जून, 2021 को एक्सेस किया गया); https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018)।
कनेहिसा, एम. और गोटो, एस. केईजीजी: जीन और जीनोम का क्योटो विश्वकोश। न्यूक्लिक एसिड अनुसंधान. 28, 27-30 (2000)।
चेक गणराज्य, एल. आदि। तनाव रक्षक और पोषक तत्वों के रूप में एक्सट्रीमोलाइट्स एक्टोइन और हाइड्रोक्सीएक्टोइन की भूमिका: आनुवंशिकी, सिस्टम जीनोमिक्स, जैव रसायन, और संरचनात्मक विश्लेषण। जीन (बेसल)। 9. ई177. https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018)।
ग्रेगसन, बीएच, मेटोडिएवा, जी., मेटोडिएव, एमवी, गोलिशिन, पीएन और मैकक्यू, बीए मध्यम और लंबी श्रृंखला वाले अल्केन्स के विकास के दौरान बाध्य समुद्री हाइड्रोकार्बन-डिग्रेडिंग जीवाणु थैलासोलिटस ऑलिवोरन्स एमआईएल -1 के विकास के दौरान विभेदक प्रोटीन अभिव्यक्ति। सामने। सूक्ष्मजीव. 9, 3130 (2018)।
पास्टर्नक, जेड., बेन सैसन, टी., कोहेन, वाई., सेगेव, ई., और जर्केविच, ई. फेनोटाइपिक-विशिष्ट संकेतकों को परिभाषित करने के लिए एक नई तुलनात्मक जीनोमिक्स विधि शिकारी बैक्टीरिया चिह्न में विशिष्ट विरासत का खुलासा करती है। सार्वजनिक विज्ञान पुस्तकालय एक. 10. e0142933. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015)।
याकिमोव, एमएम, आदि थैलासोलिटस ऑलिवोरन्स जीन। नवंबर, एसपी. नवंबर, एक नए प्रकार का समुद्री बैक्टीरिया जो हाइड्रोकार्बन के उपयोग में माहिर है। अंतर्राष्ट्रीयता. जे. प्रणाली. विकास। सूक्ष्मजीव. 54, 141-148 (2004)।
वांग, वाई., यू, एम., लियू, वाई., यांग, एक्स. और झांग, एक्सएच बैक्टीरियोप्लानोइड्स पेसिफिकम जीन। नवंबर, एसपी. नवंबर में, यह दक्षिण प्रशांत में बहने वाले समुद्री जल से अलग हो गया। अंतर्राष्ट्रीयता. जे. प्रणाली. विकास। सूक्ष्मजीव. 66, 5010-5015 (2016)।