ಹೊಸ ರೀತಿಯ ಗ್ರಾಂ-ಋಣಾತ್ಮಕ, ಏರೋಬಿಕ್, ಉಪ್ಪು-ಸಹಿಷ್ಣು, ಸಕ್ರಿಯ, ರಾಡ್-ಆಕಾರದ ಮತ್ತು ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ASxL5T ಅನ್ನು ಇಂಗ್ಲೆಂಡ್‌ನ ನಾಟಿಂಗ್‌ಹ್ಯಾಮ್‌ಶೈರ್‌ನಲ್ಲಿರುವ ಹಸುವಿನ ಸಗಣಿ ಕೊಳದಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಅನ್ನು ಅದರ ಬೇಟೆಯಾಗಿ ಬಳಸಲಾಯಿತು. ತರುವಾಯ, ಇತರ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಪ್ರಭೇದಗಳು ಮತ್ತು ಎಂಟರ್‌ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಸಿ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರು ಬೇಟೆಯಾಗಿ ಪತ್ತೆಯಾದರು. ಆತಿಥೇಯ ಕೋಶಗಳಿಲ್ಲದ ಉಪಸಂಸ್ಕೃತಿಯ ನಂತರ, ಬ್ರೈನ್ ಹಾರ್ಟ್ ಇನ್ಫ್ಯೂಷನ್ ಅಗರ್ನಲ್ಲಿ ದುರ್ಬಲ ಅಸೆಪ್ಟಿಕ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಸಾಧಿಸಲಾಯಿತು. ಸೂಕ್ತವಾದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು 37 °C ಮತ್ತು pH 7. ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮಿಷನ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯು ಬೇಟೆಯ ಲಭ್ಯತೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕೆಲವು ಅಸಾಮಾನ್ಯ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನದ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಯು ಸಾಗರ ಸ್ಪಿರುಲಿನಾ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಯಾವುದೇ ತಿಳಿದಿರುವ ಕುಲದ ಸದಸ್ಯ ಎಂದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ASxL5T ಯ ಸಂಪೂರ್ಣ-ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಸಮುದ್ರ ಸ್ಪೈರೋಚೆಟ್‌ಗಳ ಸದಸ್ಯರೊಂದಿಗಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ದೃಢಪಡಿಸಿತು. ಒಂದು ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಹುಡುಕಾಟವು ಹಲವಾರು ASxL5T ಗಳು 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸಾಗರ, ಭೂ ಮೇಲ್ಮೈ ಮತ್ತು ಅಂತರ್ಜಲದಿಂದ ಹಲವಾರು ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಲ್ಲದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. ASxL5T ತಳಿಯು ಹೊಸ ಜಾತಿಯಲ್ಲಿ ಹೊಸ ಜಾತಿಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಾವು ಸೂಚಿಸುತ್ತೇವೆ. ನಾವು ವೆನೇಟರ್‌ಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕುಕ್ಯುಲಸ್ ಜೆನ್ ಹೆಸರನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತೇವೆ. ನವೆಂಬರ್, sp. ನವೆಂಬರ್‌ನಲ್ಲಿ, ASxL5T ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಸ್ಟ್ರೈನ್ ಆಗಿ ಬಳಸಲಾಯಿತು.
ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ವಸ್ತುಗಳು ಮತ್ತು ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಇತರ ಜೀವಂತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ಬೇಟೆಯಾಡುವ ಮತ್ತು ಕೊಲ್ಲುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಾಗಿವೆ. ಇದು ಸತ್ತ ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣುಜೀವಿಗಳಿಂದ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಸಾಮಾನ್ಯ ಚೇತರಿಕೆಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಪರಾವಲಂಬಿ ಸಂವಹನಗಳಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ತಮ್ಮ ಹೋಸ್ಟ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಅವುಗಳನ್ನು ಕೊಲ್ಲದೆ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಅವು ಕಂಡುಬರುವ ಗೂಡುಗಳಲ್ಲಿ ಹೇರಳವಾದ ಆಹಾರ ಮೂಲಗಳ ಲಾಭವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ವಿಭಿನ್ನ ಜೀವನ ಚಕ್ರಗಳನ್ನು ವಿಕಸನಗೊಳಿಸಿವೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಸಮುದ್ರದ ಆವಾಸಸ್ಥಾನಗಳು). ಅವು ಜೀವಿವರ್ಗೀಕರಣದ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಗುಂಪಾಗಿದ್ದು, ಅವುಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟ ಕ್ರಿಮಿನಾಶಕ ಜೀವನ ಚಕ್ರದಿಂದ ಮಾತ್ರ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿವೆ. ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಹಲವಾರು ವಿಭಿನ್ನ ಫೈಲಾಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಅವುಗಳೆಂದರೆ: ಪ್ರೋಟಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಾಯ್ಡ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಕ್ಲೋರೆಲ್ಲಾ.3. ಆದಾಗ್ಯೂ, Bdellovibrio ಮತ್ತು Bdellovibrio ಮತ್ತು ತರಹದ ಜೀವಿಗಳು (BALOs4) ಅತ್ಯಂತ ಚೆನ್ನಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾದ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಾಗಿವೆ. ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಹೊಸ ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿರುವ ಸಂಯುಕ್ತಗಳು ಮತ್ತು ಆಂಟಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಏಜೆಂಟ್‌ಗಳ ಭರವಸೆಯ ಮೂಲವಾಗಿದೆ.
ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಆರೋಗ್ಯ, ಉತ್ಪಾದಕತೆ ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ಧನಾತ್ಮಕ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಈ ಸಕಾರಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು ಬೆಳೆಸುವ ತೊಂದರೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀವನ ಚಕ್ರಗಳನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಜೀವಕೋಶದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಗಮನಿಸುವ ಅಗತ್ಯತೆಯಿಂದಾಗಿ ಹೊಸ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕುರಿತು ಕೆಲವು ಅಧ್ಯಯನಗಳಿವೆ. ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಈ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪಡೆಯುವುದು ಸುಲಭವಲ್ಲ.
ಆಂಟಿಮೈಕ್ರೊಬಿಯಲ್ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಯುಗದಲ್ಲಿ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ರೋಗಕಾರಕಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು ಹೊಸ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳ ಬಳಕೆ. ನಾಟಿಂಗ್‌ಹ್ಯಾಮ್‌ಶೈರ್‌ನ ನಾಟಿಂಗ್‌ಹ್ಯಾಮ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಡೈರಿ ಸೆಂಟರ್‌ನಿಂದ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಹಸುವಿನ ಸಗಣಿಯಿಂದ ಫೇಜ್ ಐಸೋಲೇಶನ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು 2019 ರಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ. ಜೈವಿಕ ನಿಯಂತ್ರಣ ಏಜೆಂಟ್‌ಗಳಾಗಿ ಸಂಭಾವ್ಯತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವುದು ತನಿಖೆಯ ಉದ್ದೇಶವಾಗಿದೆ. ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಹೈಯೋಂಟೆಸ್ಟಿನಾಲಿಸ್ ಒಂದು ಝೂನೋಟಿಕ್ ರೋಗಕಾರಕವಾಗಿದೆ, ಇದು ಮಾನವನ ಕರುಳಿನ ಕಾಯಿಲೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಸೀರಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಸರ್ವತ್ರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಟಾರ್ಗೆಟ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಆಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಅನ್ನು ಬೀಫ್ ಜೆಲ್ಲಿಯಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅದು C. ಹೈಯೋಂಟೆಸ್ಟಿನಾಲಿಸ್‌ನ ಹುಲ್ಲುಹಾಸಿನ ಮೇಲೆ ರೂಪುಗೊಂಡ ಪ್ಲೇಕ್‌ಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್‌ಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವಂತೆಯೇ ಇರುವುದನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಯಿತು. ಇದು ಅನಿರೀಕ್ಷಿತ ಆವಿಷ್ಕಾರವಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಫೇಜ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಭಾಗವು 0.2 µm ಫಿಲ್ಟರ್ ಮೂಲಕ ಫಿಲ್ಟರ್ ಮಾಡುವುದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕೋಶಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಲು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ಲೇಕ್‌ನಿಂದ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾದ ವಸ್ತುವಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕೀಯ ಪರೀಕ್ಷೆಯು ಸಣ್ಣ ಗ್ರಾಂ-ಋಣಾತ್ಮಕ ಬಾಗಿದ ರಾಡ್-ಆಕಾರದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವು ಪಾಲಿಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಬ್ಯುಟೈರೇಟ್ (PHB) ಅನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. ಬೇಟೆಯ ಕೋಶಗಳಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾದ ಅಸೆಪ್ಟಿಕ್ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯು ಶ್ರೀಮಂತ ಘನ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ (ಮೆದುಳಿನ ಹೃದಯದ ಇನ್ಫ್ಯೂಷನ್ ಅಗರ್ (BHI) ಮತ್ತು ರಕ್ತದ ಅಗರ್ (BA) ನಂತಹವುಗಳನ್ನು ಅರಿತುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು ದುರ್ಬಲವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಭಾರೀ ಇನಾಕ್ಯುಲಮ್ ಸುಧಾರಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಉಪಸಂಸ್ಕೃತಿಯ ನಂತರ ಇದನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಏರೋಬಿಕ್ (7% v/v ಆಮ್ಲಜನಕ) ಮತ್ತು ವಾಯುಮಂಡಲದ ಆಮ್ಲಜನಕದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಮನಾಗಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಆಮ್ಲಜನಕರಹಿತ ವಾತಾವರಣದಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ. 72 ಗಂಟೆಗಳ ನಂತರ, ವಸಾಹತು ವ್ಯಾಸವು ತುಂಬಾ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ, 2 ಮಿಮೀ ತಲುಪಿತು, ಮತ್ತು ಇದು ಬೀಜ್, ಅರೆಪಾರದರ್ಶಕ, ಸುತ್ತಿನಲ್ಲಿ, ಪೀನ ಮತ್ತು ಹೊಳೆಯುವಂತಿತ್ತು. ಪ್ರಮಾಣಿತ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಪರೀಕ್ಷೆಯು ಅಡಚಣೆಯಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ASxL5T ಅನ್ನು ದ್ರವ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹವಾಗಿ ಬೆಳೆಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ, ಇದು ಜೈವಿಕ ಫಿಲ್ಮ್ ರಚನೆಯ ಸಂಕೀರ್ಣ ಜೀವನ ಚಕ್ರವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪ್ಲೇಟ್ ಅಮಾನತು ASxL5T ಏರೋಬಿಕ್, ಆಕ್ಸಿಡೇಸ್ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಟಲೇಸ್‌ಗೆ ಧನಾತ್ಮಕವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು 5% NaCl ಅನ್ನು ಸಹಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಲ್ಲದು ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ASxL5T 10 µg ಸ್ಟ್ರೆಪ್ಟೊಮೈಸಿನ್‌ಗೆ ನಿರೋಧಕವಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದ ಎಲ್ಲಾ ಇತರ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಿಗೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕೋಶಗಳನ್ನು TEM (ಚಿತ್ರ 1) ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದೆ. BA ನಲ್ಲಿ ಬೇಟೆಯ ಕೋಶಗಳಿಲ್ಲದೆ ಬೆಳೆದಾಗ, ASxL5T ಕೋಶಗಳು ಸಣ್ಣ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಆಗಿದ್ದು, ಸರಾಸರಿ ಉದ್ದ 1.63 μm (± 0.4), ಅಗಲ 0.37 μm (± 0.08), ಮತ್ತು ಒಂದೇ ಉದ್ದದ (5 μm ವರೆಗೆ) ಧ್ರುವ. ಲೈಂಗಿಕ ಫ್ಲ್ಯಾಜೆಲ್ಲಾ. ಸರಿಸುಮಾರು 1.6% ಜೀವಕೋಶಗಳು 0.2 μm ಗಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಅಗಲವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವಂತೆ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಇದು ಫಿಲ್ಟರ್ ಸಾಧನದ ಮೂಲಕ ಹಾದುಹೋಗಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಕೋಶಗಳ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಅಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ರಚನಾತ್ಮಕ ವಿಸ್ತರಣೆಯನ್ನು ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಫೇರಿಂಗ್ (ಲ್ಯಾಟಿನ್ ಕುಕ್ಯುಲಸ್) ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ (1D, E, G ನಲ್ಲಿ ಬಾಣಗಳನ್ನು ನೋಡಿ). ಇದು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಹೊರ ಪೊರೆಯಿಂದ ಕೂಡಿದೆ ಎಂದು ತೋರುತ್ತದೆ, ಇದು ಪೆರಿಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಹೊದಿಕೆಯ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿನ ತ್ವರಿತ ಕಡಿತದ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿರಬಹುದು, ಆದರೆ ಹೊರಗಿನ ಪೊರೆಯು ಹಾಗೇ ಉಳಿದು "ಸಡಿಲ" ನೋಟವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ (PBS ನಲ್ಲಿ) 4 ° C ನಲ್ಲಿ ದೀರ್ಘಕಾಲದವರೆಗೆ ASxL5T ಅನ್ನು ಬೆಳೆಸುವುದರಿಂದ ಹೆಚ್ಚಿನ (ಆದರೆ ಎಲ್ಲಾ ಅಲ್ಲ) ಜೀವಕೋಶಗಳು ಕೋಕಲ್ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ (ಚಿತ್ರ 1C). 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ಬೇಟೆಯಾಗಿ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿಯೊಂದಿಗೆ ASxL5T ಬೆಳೆದಾಗ, ಸರಾಸರಿ ಜೀವಕೋಶದ ಗಾತ್ರವು ಹೋಸ್ಟ್ ಇಲ್ಲದೆ ಬೆಳೆದ ಕೋಶಗಳಿಗಿಂತ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಕಿರಿದಾಗಿರುತ್ತದೆ (ಕೋಷ್ಟಕ 1 ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ 1E). ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ASxL5T 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ಬೇಟೆಯಾಗಿ E. ಕೊಲಿಯೊಂದಿಗೆ ಬೆಳೆದಾಗ, ಸರಾಸರಿ ಜೀವಕೋಶದ ಗಾತ್ರವು ಬೇಟೆಯಿಲ್ಲದೆ ಬೆಳೆಯುವಾಗ (ಕೋಷ್ಟಕ 1) ಉದ್ದ ಮತ್ತು ಅಗಲವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶದ ಉದ್ದವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ತಂತುಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ 1F). ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿ ಅಥವಾ ಇ.ಕೋಲಿಯೊಂದಿಗೆ 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ಬೇಟೆಯಾಡಿದಾಗ, ASxL5T ಜೀವಕೋಶಗಳು ಯಾವುದೇ ಫ್ಲ್ಯಾಜೆಲ್ಲಾವನ್ನು ತೋರಿಸಲಿಲ್ಲ. ASxL5T ಯ ಉಪಸ್ಥಿತಿ, ಅನುಪಸ್ಥಿತಿ ಮತ್ತು ಬೇಟೆಯ ಪ್ರಕಾರದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಕೋಶದ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಅವಲೋಕನಗಳನ್ನು ಕೋಷ್ಟಕ 1 ಸಾರಾಂಶಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
ASx5LT ನ TEM ಪ್ರದರ್ಶನ: (A) ASx5LT ಉದ್ದವಾದ ಚಾವಟಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ; (B) ವಿಶಿಷ್ಟ ASx5LT ಬ್ಯಾಟರಿ; (C) ಪೋಷಕಾಂಶಗಳಿಲ್ಲದ ದೀರ್ಘ ಕಾವು ನಂತರ cocci ASx5LT ಜೀವಕೋಶಗಳು; (D) ASx5LT ಕೋಶಗಳ ಗುಂಪು ಅಸಹಜತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ (E) ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಬೇಟೆಯೊಂದಿಗೆ ಕಾವುಕೊಡಲಾದ ASx5LT ಜೀವಕೋಶದ ಗುಂಪು ಬೇಟೆಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಿಲ್ಲದ (D) ಜೊತೆಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಹೆಚ್ಚಿದ ಜೀವಕೋಶದ ಉದ್ದವನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ (D) ಸಹ ತುದಿಯ ರಚನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ; (F) ದೊಡ್ಡ ತಂತು ಫ್ಲ್ಯಾಜೆಲ್ಲಾ, ASx5LT ಜೀವಕೋಶಗಳು, E. ಕೊಲಿ ಬೇಟೆಯೊಂದಿಗೆ ಕಾವು ನಂತರ; (G) E. coli ಜೊತೆ ಕಾವು ಕೊಟ್ಟ ನಂತರ ಒಂದೇ ASx5LT ಕೋಶ, ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಮೇಲ್ಭಾಗದ ರಚನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಬಾರ್ 1 μm ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.
16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವುದು (ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ MT636545.1) Gammaproteobacteria ವರ್ಗದಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಹುಡುಕಾಟಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಾಗರ ಸ್ಪಿರಿಲಮ್ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿ ಸಮುದ್ರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಕ್ಕೆ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿದೆ (ಚಿತ್ರ 2), ಮತ್ತು Thalassolituus gen ನ ಸದಸ್ಯರು ಮೆರೈನ್ ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್‌ಗೆ ಹತ್ತಿರದ ಸಂಬಂಧಿ. Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಿಂದ 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. B. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊವೊರಸ್ HD100T (ಟೈಪ್ ಸ್ಟ್ರೈನ್, DSM 50701) ಮತ್ತು B. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊವೊರಸ್ DM11A ನ ಜೋಡಿಯಾಗಿ ಹೋಲಿಕೆಗಳು 48.4% ಮತ್ತು 47.7%, ಮತ್ತು B. exovorus JSS ಗೆ ಇದು 46.7% ಆಗಿತ್ತು. ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವು 16S rRNA ಜೀನ್‌ನ 3 ನಕಲುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡು ಒಂದಕ್ಕೊಂದು ಹೋಲುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಮೂರನೆಯದು 3 ಬೇಸ್‌ಗಳ ಅಂತರದಲ್ಲಿದೆ. ಎರಡು ಇತರ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಗಳು (ASx5S ಮತ್ತು ASx5O; 16S rRNA ಜೀನ್ ಸೇರ್ಪಡೆ ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಕ್ರಮವಾಗಿ MT636546.1 ಮತ್ತು MT636547.1) ಒಂದೇ ಸ್ಥಳದಿಂದ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಒಂದೇ ಆಗಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಅವು ASxL5T ಮತ್ತು ಅಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಇತರರೊಂದಿಗೆ ಒಟ್ಟಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಓಷಿಯಾನೋಸ್ಪಿರಿಲೇಸಿಯಲ್ಲಿನ ತಳಿಗಳು (ಚಿತ್ರ 2). ASxL5T ಯ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು NCBI ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಉಳಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ CP046056 ಆಗಿದೆ. ASxL5T ಯ ಜಿನೋಮ್ 56.1% ರ G + C ಅನುಪಾತದೊಂದಿಗೆ 2,831,152 bp ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು 2653 CDS (ಒಟ್ಟು) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ, ಅದರಲ್ಲಿ 2567 ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಎನ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಲು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅದರಲ್ಲಿ 1596 ಅನ್ನು ಪುಟೇಟಿವ್ ಫಂಕ್ಷನ್‌ಗಳಾಗಿ ನಿಯೋಜಿಸಬಹುದು (60.2%). ಜೀನೋಮ್ 67 RNA-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ 9 rRNAಗಳು (5S, 16S ಮತ್ತು 23S ಗೆ 3 ಪ್ರತಿ) ಮತ್ತು 57 tRNAಗಳು ಸೇರಿವೆ. ASxL5T ಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮದಿಂದ (ಕೋಷ್ಟಕ 2) ಗುರುತಿಸಲಾದ ಹತ್ತಿರದ ಸಂಬಂಧಿ ಪ್ರಕಾರದ ತಳಿಗಳ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಲಾಗಿದೆ. ಲಭ್ಯವಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಥಲಸೊಲಿಟಸ್ ಜಿನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ASxL5T ಗೆ ಹೋಲಿಸಲು ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಗುರುತನ್ನು (AAI) ಬಳಸಿ. AAI ನಿರ್ಧರಿಸಿದ ಹತ್ತಿರದ ಲಭ್ಯವಿರುವ (ಅಪೂರ್ಣ) ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು Thalassolituus sp ಆಗಿದೆ. C2-1 (NZ_VNIL01000001 ಸೇರಿಸಿ). ಈ ತಳಿಯನ್ನು ಮರಿಯಾನಾ ಕಂದಕದ ಆಳವಾದ ಸಮುದ್ರದ ಕೆಸರುಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಹೋಲಿಕೆಗಾಗಿ ಪ್ರಸ್ತುತ ಈ ತಳಿಯ ಬಗ್ಗೆ ಯಾವುದೇ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಮಾಹಿತಿ ಇಲ್ಲ. ASxL5T ಯ 2.82 Mb ಯೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ 4.36 Mb ನಲ್ಲಿ ದೊಡ್ಡದಾಗಿದೆ. ಸಾಗರ ಸ್ಪಿರೋಚೆಟ್‌ಗಳ ಸರಾಸರಿ ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರವು ಸುಮಾರು 4.16 Mb ಆಗಿದೆ (± 1.1; n = 92 ಸಂಪೂರ್ಣ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly ನಿಂದ ತನಿಖೆ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ), ಆದ್ದರಿಂದ ASxL5T ಯ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದೆ ಇತರ ಸದಸ್ಯರಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಆದೇಶವು ತುಂಬಾ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ. Gammaproteobacteria 11,12,13,14,15,16 ಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ 172 ಏಕ-ನಕಲು ಜೀನ್‌ಗಳ ಜೋಡಿಸಲಾದ ಮತ್ತು ಲಿಂಕ್ ಮಾಡಲಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಜೀನೋಮ್-ಆಧಾರಿತ ಅಂದಾಜು ಗರಿಷ್ಠ ಸಂಭವನೀಯ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವನ್ನು (ಚಿತ್ರ 3A) ಉತ್ಪಾದಿಸಲು GToTree 1.5.54 ಅನ್ನು ಬಳಸಿ. 17,18. ಇದು ಥಲಸೊಲಿಟಸ್, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಪ್ಲೇನ್ ಮತ್ತು ಮೆರೈನ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂಗೆ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ತೋರಿಸಿದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ಡೇಟಾವು ASxL5T ಸಮುದ್ರ ಸ್ಪಿರುಲಿನಾದಲ್ಲಿನ ಅದರ ಸಂಬಂಧಿಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾ ಲಭ್ಯವಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸುವ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವು ASxL5T, ASxO5, ಮತ್ತು ASxS5 ತಳಿಗಳ ಸ್ಥಾನವನ್ನು ಹೈಲೈಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ (ಧೈರ್ಯದೊಂದಿಗೆ) ಸಮುದ್ರ ಸ್ಪಿರುಲಿನೇಸಿಯಲ್ಲಿನ ಕೃಷಿ ಮಾಡದ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ. ಜೆನ್‌ಬ್ಯಾಂಕ್ ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಆವರಣದಲ್ಲಿರುವ ಸ್ಟ್ರೈನ್ ಹೆಸರನ್ನು ಅನುಸರಿಸುತ್ತದೆ. ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸಲು ClustalW ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಮತ್ತು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಗರಿಷ್ಠ ಸಂಭವನೀಯ ವಿಧಾನ ಮತ್ತು Tamura-Nei ಮಾದರಿಯನ್ನು ಬಳಸಿ ಮತ್ತು MEGA X ಪ್ರೋಗ್ರಾಂನಲ್ಲಿ 1000 ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಿ. ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ನಕಲು ಮೌಲ್ಯವು 50% ಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿದೆ ಎಂದು ಶಾಖೆಯಲ್ಲಿರುವ ಸಂಖ್ಯೆ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. Escherichia coli U/541T ಅನ್ನು ಹೊರಗುಂಪಾಗಿ ಬಳಸಲಾಯಿತು.
(A) ಜೀನೋಮ್ ಆಧಾರಿತ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ, ಸಮುದ್ರ ಸ್ಪಿರೋಸ್ಪೈರೇಸಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ASxL5T ಮತ್ತು ಅದರ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿಗಳಾದ E. coli U 5/41T ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊರಗುಂಪಾಗಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. (B) T. oleivorans MIL-1T ಯೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಜೀನ್‌ಗಳ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವರ್ಗದ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ASx5LT ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಆರ್ಥೋಲಾಜಸ್ ಗುಂಪಿನ (COG) ಕ್ಲಸ್ಟರ್‌ನ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಡಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಚಿತ್ರವು ಪ್ರತಿ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ COG ವರ್ಗದಲ್ಲಿನ ಜೀನ್‌ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಗ್ರಾಫ್ ಪ್ರತಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ COG ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿರುವ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಶೇಕಡಾವಾರು ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. (C) T. oleiverans MIL-1T ಯೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ASxL5T ಯ ಸಂಪೂರ್ಣ KEGG (ಕ್ಯೋಟೋ ಎನ್‌ಸೈಕ್ಲೋಪೀಡಿಯಾ ಆಫ್ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ಸ್) ಮಾಡ್ಯುಲರ್ ಮಾರ್ಗದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ.
ASxL5T ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿರುವ ಘಟಕ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು KEGG ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವುದರಿಂದ ಏರೋಬಿಕ್ ಗಾಮಾ ಪ್ರೋಟಿಯಸ್‌ನ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮೋಟಾರು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ನಿಯೋಜಿಸಲಾದ ಒಟ್ಟು 75 ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಕೀಮೋಟಾಕ್ಸಿಸ್, ಫ್ಲ್ಯಾಜೆಲ್ಲಾ ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಮತ್ತು ಟೈಪ್ IV ಫಿಂಬ್ರಿಯಾ ಸಿಸ್ಟಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಜೀನ್‌ಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಕೊನೆಯ ವರ್ಗದಲ್ಲಿ, 10 ರಲ್ಲಿ 9 ಜೀನ್‌ಗಳು ಇತರ ಜೀವಿಗಳ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯ ಸೆಳೆತದ ಚಲನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿವೆ. ASxL5T ಯ ಜೀನೋಮ್ ಸಂಪೂರ್ಣ ಟೆಟ್ರಾಹೈಡ್ರೊಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಹಾಲೋಫೈಲ್‌ಗಳಿಗೆ ನಿರೀಕ್ಷಿಸಿದಂತೆ ಆಸ್ಮೋಟಿಕ್ ಒತ್ತಡಕ್ಕೆ ರಕ್ಷಣಾತ್ಮಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುತ್ತದೆ20. ರಿಬೋಫ್ಲಾವಿನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಕೊಫ್ಯಾಕ್ಟರ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ವಿಟಮಿನ್‌ಗಳಿಗೆ ಅನೇಕ ಸಂಪೂರ್ಣ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಜಿನೋಮ್ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಆಲ್ಕೇನ್ 1-ಮೊನೊಆಕ್ಸಿಜೆನೇಸ್ (alkB2) ಜೀನ್ ASxL5T ಯಲ್ಲಿ ಇದ್ದರೂ, ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್ ಬಳಕೆಯ ಮಾರ್ಗವು ಪೂರ್ಣಗೊಂಡಿಲ್ಲ. ASxL5T ಯ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ, TOL_2658 (alkB) ಮತ್ತು TOL_2772 (ಆಲ್ಕೋಹಾಲ್ ಡಿಹೈಡ್ರೋಜಿನೇಸ್) ನಂತಹ T. ಒಲಿವೆರನ್ಸ್ MIL-1T21 ನಲ್ಲಿನ ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್‌ಗಳ ಅವನತಿಗೆ ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಕಾರಣವೆಂದು ಗುರುತಿಸಲಾದ ಜೀನ್‌ಗಳ ಹೋಮೊಲಾಗ್‌ಗಳು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಇರುವುದಿಲ್ಲ. ASxL5T ಮತ್ತು ಆಲಿವ್ ಎಣ್ಣೆ MIL-1T ನಡುವಿನ COG ವರ್ಗದಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ವಿತರಣೆಯ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಚಿತ್ರ 3B ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ, ಚಿಕ್ಕದಾದ ASxL5T ಜೀನೋಮ್ ದೊಡ್ಡ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಪ್ರತಿ COG ವರ್ಗದಿಂದ ಪ್ರಮಾಣಾನುಗುಣವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವರ್ಗದಲ್ಲಿರುವ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಜೀನೋಮ್‌ನ ಶೇಕಡಾವಾರು ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದಾಗ, ಅನುವಾದ, ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಬಯೋಜೆನೆಸಿಸ್ ವಿಭಾಗಗಳು ಮತ್ತು ಶಕ್ತಿ ಉತ್ಪಾದನೆ ಮತ್ತು ಪರಿವರ್ತನೆ ಕಾರ್ಯ ವಿಭಾಗಗಳಲ್ಲಿನ ಜೀನ್‌ಗಳ ಶೇಕಡಾವಾರು ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ದೊಡ್ಡ ASxL5T ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಜಿನೋಮ್ ಶೇಕಡಾವಾರು T. ಒಲಿವೆರನ್ಸ್ MIL-1T ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿರುವ ಅದೇ ಗುಂಪಿನೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ASxL5T ಜೀನೋಮ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, T. ಒಲಿವೊರನ್ಸ್ MIL-1T ಪ್ರತಿಕೃತಿ, ಮರುಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ದುರಸ್ತಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ವರ್ಗಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಶೇಕಡಾವಾರು ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಕುತೂಹಲಕಾರಿಯಾಗಿ, ಎರಡು ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವರ್ಗದ ವಿಷಯದಲ್ಲಿನ ದೊಡ್ಡ ವ್ಯತ್ಯಾಸವೆಂದರೆ ASxL5T (ಚಿತ್ರ 3B) ನಲ್ಲಿರುವ ಅಜ್ಞಾತ ಜೀನ್‌ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ. KEGG ಮಾಡ್ಯೂಲ್‌ಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸಲಾಯಿತು, ಅಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ KEGG ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾದ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಕ್ಕಾಗಿ ಹಸ್ತಚಾಲಿತವಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಘಟಕಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ASxL5T ಮತ್ತು ಆಲಿವ್ MIL-1T ಯ ಸಂಪೂರ್ಣ KOG ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಜೀನ್ ವಿತರಣೆಯ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಚಿತ್ರ 3C ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ASxL5T ಸಂಪೂರ್ಣ ಸಲ್ಫರ್ ಮತ್ತು ಸಾರಜನಕ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, T. ಒಲಿವೆರನ್ಸ್ MIL-1T ಹೊಂದಿಲ್ಲ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, T. ಒಲಿವೆರನ್ಸ್ MIL-1T ಸಂಪೂರ್ಣ ಸಿಸ್ಟೈನ್ ಮತ್ತು ಮೆಥಿಯೋನಿನ್ ಚಯಾಪಚಯ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಆದರೆ ಇದು ASxL5T ನಲ್ಲಿ ಅಪೂರ್ಣವಾಗಿದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ASxL5T ಸಲ್ಫೇಟ್ ಸಮೀಕರಣಕ್ಕೆ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (ಮೆಟಬಾಲಿಕ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಅಥವಾ ರೋಗಕಾರಕತೆಯಂತಹ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಮಾರ್ಕರ್‌ಗಳಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದಾದ ಜೀನ್‌ಗಳ ಒಂದು ಸೆಟ್ ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿದೆ; https://www.genome.jp/kegg/module.html) T ನಲ್ಲಿ ಒಲಿವೆರನ್ಸ್ MIL-1T. ಪರಭಕ್ಷಕ ಜೀವನಶೈಲಿಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುವ ಜೀನ್‌ಗಳ ಪಟ್ಟಿಯೊಂದಿಗೆ ASxL5T ಯ ಜೀನ್ ವಿಷಯವನ್ನು ಹೋಲಿಸುವುದು ಅನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿದೆ. ಓ ಆಂಟಿಜೆನ್ ಪಾಲಿಸ್ಯಾಕರೈಡ್‌ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಲಿಗೇಸ್ ಅನ್ನು ಕೋರ್‌ಗೆ ಎನ್‌ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುವ waaL ಜೀನ್ ASxL5T ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿದೆ (ಆದರೆ ಇದು ಅನೇಕ ಗ್ರಾಂ-ಋಣಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿದೆ), ಟ್ರಿಪ್ಟೊಫಾನ್ 2,3-ಡೈಆಕ್ಸಿಜೆನೇಸ್ (TDO ) ಜೀನ್‌ಗಳು 60 ಅಮೈನೋಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು. ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುವ ಆಮ್ಲ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಇರುವುದಿಲ್ಲ. ASxL5T ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಇತರ ಪರಭಕ್ಷಕ ವಿಶಿಷ್ಟ ಜೀನ್‌ಗಳಿಲ್ಲ, ಮೆವಲೋನೇಟ್ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಐಸೊಪ್ರೆನಾಯ್ಡ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎನ್‌ಕೋಡಿಂಗ್ ಕಿಣ್ವಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ. ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದ ಪರಭಕ್ಷಕ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಪ್ರತಿಲೇಖನಾತ್ಮಕ ನಿಯಂತ್ರಕ ಜೀನ್ gntR ಇಲ್ಲ ಎಂಬುದನ್ನು ಗಮನಿಸಿ, ಆದರೆ ASxL5T ನಲ್ಲಿ ಮೂರು gntR ತರಹದ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು.
ASxL5T ಯ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಕೋಷ್ಟಕ 3 ರಲ್ಲಿ ಸಂಕ್ಷೇಪಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ವರದಿ ಮಾಡಲಾದ ಸಂಬಂಧಿತ ಕುಲಗಳ 23, 24, 25, 26 ಮತ್ತು 27 ರ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. T. Marinus, T. olevorans, B. Sanyensis, ಮತ್ತು Oceanobacter kriegii ಯಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲ್ಪಟ್ಟವುಗಳು ಸಕ್ರಿಯ, ಉಪ್ಪು-ಸಹಿಷ್ಣು, ಆಕ್ಸಿಡೇಸ್-ಧನಾತ್ಮಕ ರಾಡ್-ಆಕಾರದ ದೇಹಗಳಾಗಿವೆ, ಆದರೆ ASxL5T ಯೊಂದಿಗೆ ಯಾವುದೇ ಇತರ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಸಾಗರದ ಸರಾಸರಿ pH 8.1 ಆಗಿದೆ (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77), ಇದು T. ಮರಿನಸ್, T. ಒಲೆವೊರನ್ಸ್, B. ಸ್ಯಾನೆನ್ಸಿಸ್ ಮತ್ತು O ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಫಲಿಸುತ್ತದೆ. ಕ್ರೀಗಿ. ASxL5T ಸಮುದ್ರೇತರ ಜಾತಿಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ದೊಡ್ಡ pH ಶ್ರೇಣಿಗೆ (4-9) ಸೂಕ್ತವಾಗಿದೆ. ಥಲಸೊಲಿಟಸ್ ಎಸ್ಪಿಯ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು. C2-1. ಅಜ್ಞಾತ. ASxL5T ಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ತಾಪಮಾನದ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಮುದ್ರದ ತಳಿಗಳಿಗಿಂತ (4-42 °C) ವಿಶಾಲವಾಗಿದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಕೆಲವು ಆದರೆ ಎಲ್ಲಾ T. ಮಾರಿನಸ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಗಳು ಶಾಖ-ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಸಾರು ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ASxL5T ಅನ್ನು ಬೆಳೆಯಲು ಅಸಮರ್ಥತೆಯು ಮತ್ತಷ್ಟು ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ. BA ಪ್ಲೇಟ್, ONPG, ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಡೈಹೈಡ್ರೊಲೇಸ್, ಲೈಸಿನ್ ಡೆಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲೇಸ್, ಆರ್ನಿಥೈನ್ ಡಿಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲೇಸ್, ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಬಳಕೆ, ಯೂರೇಸ್, ಟ್ರಿಪ್ಟೊಫಾನ್ ಡೀಮಿನೇಸ್, ಜೆಲಾಟಿನ್ ಹೈಡ್ರೊಲಿಸಿಸ್ ಎಂಜೈಮ್‌ನಿಂದ ಸ್ಕ್ರ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಿದ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು API 20E ಅನ್ನು ಬಳಸಿ, ಪರೀಕ್ಷಾ ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ಋಣಾತ್ಮಕವಾಗಿವೆ, ಆದರೆ H2 aceto indole ಉತ್ಪಾದಿಸಲಾಯಿತು. ಹುದುಗದ ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್‌ಗಳು ಸೇರಿವೆ: ಗ್ಲೂಕೋಸ್, ಮನ್ನೋಸ್, ಇನೋಸಿಟಾಲ್, ಸೋರ್ಬಿಟೋಲ್, ರಾಮ್ನೋಸ್, ಸುಕ್ರೋಸ್, ಮೆಲಿಬಿಯೋಸ್, ಅಮಿಗ್ಡಾಲಿನ್ ಮತ್ತು ಅರಾಬಿನೋಸ್. ಪ್ರಕಟಿತ ಸಂಬಂಧಿತ ಉಲ್ಲೇಖ ತಳಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ASxL5T ಸ್ಟ್ರೈನ್‌ನ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಫ್ಯಾಟಿ ಆಸಿಡ್ ಪ್ರೊಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಕೋಷ್ಟಕ 4 ರಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮುಖ್ಯ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳು C16:1ω6c ಮತ್ತು/ಅಥವಾ C16:1ω7c, C16:0 ಮತ್ತು C18:1ω9. ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳು C12:0 3-OH ಮತ್ತು C10:0 3-OH ಸಹ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ. ASxL5T ನಲ್ಲಿ C16:0 ರ ಅನುಪಾತವು ಸಂಬಂಧಿತ ಕುಲಗಳ ವರದಿ ಮೌಲ್ಯಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ವರದಿಯಾದ T. ಮರಿನಸ್ IMCC1826TT ಯೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ASxL5T ನಲ್ಲಿ C18:1ω7c ಮತ್ತು/ಅಥವಾ C18:1ω6c ಅನುಪಾತವು ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ. oleivorans MIL-1T ಮತ್ತು O. kriegii DSM 6294T, ಆದರೆ B. ಸ್ಯಾನೆನ್ಸಿಸ್ KCTC 32220T ನಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಯಾಗಿಲ್ಲ. ASxL5T ಮತ್ತು ASxLS ನ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲ ಪ್ರೊಫೈಲ್‌ಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸಿದಾಗ ಎರಡು ತಳಿಗಳ ನಡುವಿನ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಒಂದೇ ಜಾತಿಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್‌ಎ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಸುಡಾನ್ ಕಪ್ಪು ಪರೀಕ್ಷೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಯಾವುದೇ ಪಾಲಿ-3-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಬ್ಯುಟೈರೇಟ್ (PHB) ಕಣಗಳು ಪತ್ತೆಯಾಗಿಲ್ಲ.
ಬೇಟೆಯ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪರಭಕ್ಷಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ಈ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜಾತಿಗಳ ಮೇಲೆ ಪ್ಲೇಕ್‌ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಬಹುದು, ಅವುಗಳೆಂದರೆ: ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಸೂಯಿಸ್ 11608 ಟಿ, ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿ ಪಿಟಿ 14, ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿ 12662, ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿ ಎನ್‌ಸಿಟಿಸಿ 11168 ಟಿ; ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿ NCTC 12667; C. ಹೆಲ್ವೆಟಿಕಸ್ NCTC 12472; ಸಿ ಲಾರಿ NCTC 11458 ಮತ್ತು C. upsaliensis NCTC 11541T. ಗ್ರಾಂ-ಋಣಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಗ್ರಾಂ-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವ್ಯಾಪಕ ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ವಿಧಾನದ ಹೋಸ್ಟ್ ಶ್ರೇಣಿಯ ನಿರ್ಣಯ ವಿಭಾಗದಲ್ಲಿ ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡಲಾದ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ. ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ASxL5T ಅನ್ನು Escherichia coli NCTC 86 ಮತ್ತು Citrobacter freundii NCTC 9750T ನಲ್ಲಿಯೂ ಬಳಸಬಹುದು ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಕ್ಲೆಬ್ಸಿಯೆಲ್ಲಾ ಆಕ್ಸಿಟೋಕಾ 11466 ನಲ್ಲಿ ರೂಪುಗೊಂಡ ಪ್ಲೇಕ್‌ಗಳು. E. ಕೊಲಿ NCTC 86 ರೊಂದಿಗಿನ TEM ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಚಿತ್ರ 4A-D ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿ PT14 ಮತ್ತು Campylobacter suis S12 ಜೊತೆಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಚಿತ್ರ 4E-H ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿ ASxL5T ಕೋಶಕ್ಕೆ ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ E. ಕೊಲಿ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಲಗತ್ತಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೊರಹೀರುವಿಕೆಗೆ ಮೊದಲು ವಿಸ್ತೃತ ಕೋಶದ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಪಾರ್ಶ್ವವಾಗಿ ಇರಿಸಲಾದ ಬೇಟೆಯ ಪ್ರಕಾರಗಳ ನಡುವೆ ದಾಳಿಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಎಂದು ತೋರುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ASxL5T ಸಂಪರ್ಕದ ಒಂದು ಬಿಂದುವಿನ ಮೂಲಕ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್‌ಗೆ ಲಗತ್ತಿಸುವಂತೆ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪರಭಕ್ಷಕ ಕೋಶದ ತುದಿಯೊಂದಿಗೆ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕೋಶದ ತುದಿಯ ಬಳಿ ಸಂಪರ್ಕದಲ್ಲಿದೆ (ಚಿತ್ರ 4H).
ASx5LT ಮತ್ತು ಬೇಟೆಯ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುವ TEM: (AD) ಮತ್ತು E. ಕೋಲಿ ಬೇಟೆ; (EH) ಮತ್ತು C. ಜೆಜುನಿ ಬೇಟೆ. (A) ಒಂದೇ E. coli (EC) ಕೋಶಕ್ಕೆ ಸಂಪರ್ಕಗೊಂಡಿರುವ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ASx5LT ಕೋಶ; (B) ಒಂದೇ EC ಕೋಶಕ್ಕೆ ಲಗತ್ತಿಸಲಾದ ತಂತುರೂಪದ ASx5LT; (C) ಬಹು EC ಕೋಶಗಳಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕಗೊಂಡಿರುವ ತಂತು ASx5LT ಕೋಶ; (D) ಒಂದೇ E. ಕೊಲಿ (EC) ಕೋಶದಲ್ಲಿ ಚಿಕ್ಕದಾದ ASx5LT ಕೋಶಗಳನ್ನು ಲಗತ್ತಿಸುವುದು; (E) ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜೆಜುನಿ (CJ) ಕೋಶಕ್ಕೆ ಸಂಪರ್ಕಗೊಂಡಿರುವ ಒಂದೇ ASx5LT ಕೋಶ; (F) ASx5LT ದಾಳಿ C. ಹೈಯೋಇಂಟೆಸ್ಟಿನಾಲಿಸ್ (CH) ಜೀವಕೋಶಗಳು; (G) ಎರಡು ಒಂದು ASx5LT ಕೋಶಗಳು CJ ಸೆಲ್ ಮೇಲೆ ದಾಳಿ ಮಾಡಿತು; (H) ASx5LT ಅಟ್ಯಾಚ್‌ಮೆಂಟ್ ಪಾಯಿಂಟ್‌ನ ಕ್ಲೋಸ್-ಅಪ್ ನೋಟ, CJ ಸೆಲ್‌ನ ತುದಿಯ ಬಳಿ (ಬಾರ್ 0.2 μm). ಬಾರ್ 1 μm in (A-G) ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.
ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಬೇಟೆಯ ಹೇರಳವಾದ ಮೂಲಗಳ ಲಾಭವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ. ನಿಸ್ಸಂಶಯವಾಗಿ, ಅವು ವಿವಿಧ ಪರಿಸರಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಸದಸ್ಯರ ಕಿರಿದಾದ ಗಾತ್ರದ ಕಾರಣ, ಫೇಜ್ ಬೇರ್ಪಡಿಕೆ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸ್ಲರಿಯಿಂದ ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿದೆ. ಸಮುದ್ರದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಓಸಿನೊಸ್ಪಿರಿಲೇಸಿ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಿಗೆ ASxL5T ಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರಸ್ತುತತೆ ಆಶ್ಚರ್ಯಕರವಾಗಿದೆ, ಆದರೂ ಜೀವಿ ಉಪ್ಪು-ಸಹಿಷ್ಣುವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು 5% ಉಪ್ಪನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯಬಹುದು. ಸ್ಲರಿಯ ನೀರಿನ ಗುಣಮಟ್ಟದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸೋಡಿಯಂ ಕ್ಲೋರೈಡ್ ಅಂಶವು 0.1% ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆಯಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಮಣ್ಣು ಸಮುದ್ರ ಪರಿಸರದಿಂದ ದೂರವಿದೆ - ಭೌಗೋಳಿಕವಾಗಿ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕವಾಗಿ. ಒಂದೇ ಮೂಲದಿಂದ ಮೂರು ಸಂಬಂಧಿತ ಆದರೆ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ಈ ಪರಭಕ್ಷಕಗಳು ಈ ಸಾಗರೇತರ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಹೊಂದುತ್ತಿವೆ ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಪುರಾವೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990 ನಿಂದ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಡೇಟಾ ಫೈಲ್‌ಗಳು) ಅದೇ 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಟಾಪ್ 50 ಅತ್ಯಂತ ಹೇರಳವಾಗಿರುವ ಕಾರ್ಯಾಚರಣೆಯ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾ (OTU) ನಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ) ಮಣ್ಣಿನ ಕೆಲವು ಮಾದರಿ ಮಧ್ಯಂತರಗಳಲ್ಲಿ. ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಂತೆಯೇ 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ Genbank ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಲ್ಲದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ. ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳು, ASxL5T, ASxS5, ಮತ್ತು ASxO5 ನ ಅನುಕ್ರಮಗಳೊಂದಿಗೆ, ಥಲಸೊಲಿಟಸ್ ಮತ್ತು ಓಷಿಯಾನೊಬ್ಯಾಕ್ಟರ್‌ನಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾದ ವಿಭಿನ್ನ ಕ್ಲಾಡ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತವೆ (ಚಿತ್ರ 2). 2009 ರಲ್ಲಿ ದಕ್ಷಿಣ ಆಫ್ರಿಕಾದ ಚಿನ್ನದ ಗಣಿಯಲ್ಲಿ 1.3 ಕಿಲೋಮೀಟರ್ ಆಳದಲ್ಲಿ ಬಿರುಕು ನೀರಿನಿಂದ ಮೂರು ವಿಧದ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಲ್ಲದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು (GQ921362, GQ921357 ಮತ್ತು GQ921396) ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲ್ಪಟ್ಟವು ಮತ್ತು ಇತರ ಎರಡು (DQ256320 ಮತ್ತು DQ337006 ದಕ್ಷಿಣ ಆಫ್ರಿಕಾದ ಅಂತರ್ಜಲದಿಂದ) 2005 ರಲ್ಲಿ). 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವು ASxL5T ಗೆ ಅತ್ಯಂತ ನಿಕಟವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ, ಇದು 2006 ರಲ್ಲಿ ಉತ್ತರ ಫ್ರಾನ್ಸ್‌ನ ಕಡಲತೀರಗಳಿಂದ ಪಡೆದ ಮರಳಿನ ಕೆಸರುಗಳ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಂದ ಪಡೆದ 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಭಾಗವಾಗಿದೆ (ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ AM29240828). ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಲ್ಲದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ HQ183822.1 ನಿಂದ ಮತ್ತೊಂದು ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಚೀನಾದ ಪುರಸಭೆಯ ಭೂಕುಸಿತದಿಂದ ಸೋರಿಕೆಯಾದ ಸಂಗ್ರಹ ಟ್ಯಾಂಕ್‌ನಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ನಿಸ್ಸಂಶಯವಾಗಿ, ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿಕ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಅಸಂಸ್ಕೃತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಿಂದ ಬರುವ ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ASxL5T ಯಂತೆಯೇ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ, ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸವಾಲಿನ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಪ್ರಪಂಚದಾದ್ಯಂತ ವಿತರಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ, ASxL5T ಗೆ ಹತ್ತಿರದ ಸಂಬಂಧಿ ಥಲಸ್ಸೊಲಿಟಸ್ ಎಸ್ಪಿ. C2-1, T. ಮಾರಿನಸ್, T. ಒಲಿವೊರನ್ಸ್. ಮತ್ತು O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. ಥಲಸೊಲಿಟಸ್ ಸಮುದ್ರದ ಕಡ್ಡಾಯ ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್ ವಿಘಟನೆಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ (OHCB) ಸದಸ್ಯ, ಇದು ಸಮುದ್ರ ಮತ್ತು ಭೂಮಿಯ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಹರಡಿದೆ ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್ ಮಾಲಿನ್ಯದ ಘಟನೆಗಳ ನಂತರ ಪ್ರಬಲವಾಗುತ್ತದೆ. ಸಾಗರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು OHCB ಗುಂಪಿನ ಸದಸ್ಯರಲ್ಲ, ಆದರೆ ಸಮುದ್ರ ಪರಿಸರದಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿರುತ್ತವೆ.
ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಡೇಟಾವು ASxL5T ಹೊಸ ಜಾತಿಯಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಮುದ್ರ ಸ್ಪಿರೋಸ್ಪಿರೇಸಿ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿ ಹಿಂದೆ ಗುರುತಿಸದ ಕುಲದ ಸದಸ್ಯ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಹೊಸದಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾದ ತಳಿಗಳನ್ನು ಹೊಸ ಕುಲಕ್ಕೆ ವರ್ಗೀಕರಿಸಲು ಪ್ರಸ್ತುತ ಯಾವುದೇ ಸ್ಪಷ್ಟ ಮಾನದಂಡವಿಲ್ಲ. ಸಾರ್ವತ್ರಿಕ ಕುಲದ ಗಡಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸಂಪ್ರದಾಯವಾದಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ (POCP) ಯ ಜಿನೋಮ್‌ನ ಶೇಕಡಾವಾರು ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಆಧರಿಸಿ, ಕಟ್-ಆಫ್ ಮೌಲ್ಯವು ಉಲ್ಲೇಖದ ಸ್ಟ್ರೈನ್‌ಗೆ 50% ಒಂದೇ ಆಗಿರಬೇಕು ಎಂದು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗಿದೆ33. ಇತರರು AAI ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಲು ಸಲಹೆ ನೀಡುತ್ತಾರೆ, ಇದು POCP ಗಿಂತ ಪ್ರಯೋಜನಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳನ್ನು ಅಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಿಂದ ಪಡೆಯಬಹುದು34. ಮಾದರಿ ಜಾತಿಗಳ ಮಾದರಿ ತಳಿಯೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ AAI ಮೌಲ್ಯವು 74% ಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆಯಿದ್ದರೆ, ತಳಿಯು ವಿಭಿನ್ನ ಕುಲದ ಪ್ರತಿನಿಧಿಯಾಗಿದೆ ಎಂದು ಲೇಖಕರು ನಂಬುತ್ತಾರೆ. ಸಾಗರ ಸ್ಪಿರಿಲೇಸಿಯ ಮಾದರಿಯ ಕುಲವು ಸಮುದ್ರ ಸ್ಪಿರಿಲಮ್ ಆಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಮಾದರಿಯ ತಳಿಯು O. ಲಿನಮ್ ATCC 11336T ಆಗಿದೆ. ASxL5T ಮತ್ತು O. ಲಿನಮ್ ATCC 11336T ನಡುವಿನ AAI ಮೌಲ್ಯವು 54.34% ಆಗಿದೆ, ಮತ್ತು ASxL5T ಮತ್ತು T. ಒಲಿವೊರನ್ಸ್ MIL-1T (ಜೆನಸ್ ಪ್ರಕಾರದ ತಳಿಗಳು) ನಡುವಿನ AAI ಮೌಲ್ಯವು 67.61% ಆಗಿದೆ. 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ವರ್ಗೀಕರಣ ಮಾನದಂಡವಾಗಿ ಬಳಸುವುದರಿಂದ, ಸೂಚಿಸಲಾದ ಕುಲದ ಡಿಲಿಮಿಟೇಶನ್ ಗಡಿಯು 94.5%35 ಆಗಿದೆ. ASxL5T ಅನ್ನು ಥಲಸ್ಸೊಲಿಟಸ್ ಕುಲದಲ್ಲಿ ಇರಿಸಬಹುದು, ಇದು T. ಒಲಿವೊರನ್ಸ್ MIL-1T ಮತ್ತು 96.17% ನೊಂದಿಗೆ 95.03% 16S rRNA ಅನುಕ್ರಮದ ಗುರುತನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಮರಿನಸ್ IMCC1826T. ಆದಾಗ್ಯೂ, B. ಸ್ಯಾನಿಯೆನ್ಸಿಸ್ NV9 ನೊಂದಿಗೆ 94.64% 16S rRNA ಜೀನ್ ಗುರುತನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ Bacteroides ಕುಲದಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, 16S rRNA ಜೀನ್‌ನಂತಹ ಒಂದೇ ಜೀನ್‌ನ ಬಳಕೆಯು ಅನಿಯಂತ್ರಿತ ವರ್ಗೀಕರಣ ಮತ್ತು ನಿಯೋಜನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಮತ್ತೊಂದು ಸಲಹೆ ವಿಧಾನವು ANI ಮತ್ತು ಜೀನೋಮ್ ಅಲೈನ್‌ಮೆಂಟ್ ಸ್ಕೋರ್ (AF) ಅನ್ನು ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರಕಾರಗಳಿಂದ ಡೇಟಾ ಪಾಯಿಂಟ್‌ಗಳ ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಮತ್ತು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಕುಲಗಳ ಪ್ರಕಾರವಲ್ಲದ ತಳಿಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲ್ಪಡುವ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ಅಂದಾಜು ಕುಲದ ವಿಭಕ್ತಿ ಬಿಂದುದೊಂದಿಗೆ ಕುಲದ ಗಡಿಯನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಲೇಖಕರು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತಾರೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಥಲಸ್ಸೊಲಿಟಸ್ ಐಸೊಲೇಟ್‌ಗಳಿಂದ ಸಾಕಷ್ಟು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಲ್ಲದಿದ್ದರೆ, ಈ ವಿಧಾನದಿಂದ ASxL5T ಥಲಾಸೊಲಿಟಸ್ ಕುಲಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆಯೇ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಅಸಾಧ್ಯ. ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಸೀಮಿತ ಲಭ್ಯತೆಯಿಂದಾಗಿ, ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಅರ್ಥೈಸಿಕೊಳ್ಳಬೇಕು. ಎರಡನೆಯದಾಗಿ, ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಹೋಲಿಕೆ ವಿಧಾನಗಳು ಹೋಲಿಸಿದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಗಣನೀಯ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಸಂಬಂಧಿತ ಕುಲಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಕೋರ್ ಏಕ-ನಕಲು ಜೀನ್‌ಗಳ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಅವರು ಅಳೆಯುತ್ತಾರೆ, ಆದರೆ ASxL5T ಯ ಚಿಕ್ಕ ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಇಲ್ಲದ ದೊಡ್ಡ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಗಣನೆಗೆ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲಿಲ್ಲ. ನಿಸ್ಸಂಶಯವಾಗಿ, ASxL5T ಮತ್ತು ಥಲಸೊಲಿಟಸ್, ಓಷಿಯಾನೊಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಪ್ಲೇನ್ಸ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಗುಂಪುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಜರನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಆದರೆ ವಿಕಸನವು ವಿಭಿನ್ನ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಂಡಿದೆ, ಇದು ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿನ ಕಡಿತಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಪರಭಕ್ಷಕ ಜೀವನಶೈಲಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಇದು T. ಒಲಿವೊರನ್ಸ್ MIL-1T ಗೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿದೆ, ಇದು 28% ದೊಡ್ಡದಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್ 23,30 ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲು ವಿಭಿನ್ನ ಪರಿಸರದ ಒತ್ತಡದಲ್ಲಿ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿದೆ. ರಿಕೆಟ್ಸಿಯಾ, ಕ್ಲಮೈಡಿಯ ಮತ್ತು ಬುಚ್ನೆರಾ ಮುಂತಾದ ಕಡ್ಡಾಯ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಮತ್ತು ಸಹಜೀವಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಆಸಕ್ತಿದಾಯಕ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಮಾಡಬಹುದು. ಅವುಗಳ ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರವು ಸುಮಾರು 1 Mb ಆಗಿದೆ. ಹೋಸ್ಟ್ ಸೆಲ್ ಮೆಟಾಬಾಲೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಜೀನ್ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಗಮನಾರ್ಹವಾದ ವಿಕಸನೀಯ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಅವನತಿಗೆ ಒಳಗಾಯಿತು. ಸಾಗರ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪೋಷಕಾಂಶ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಪರಭಕ್ಷಕ ಜೀವನಶೈಲಿಗಳಿಗೆ ವಿಕಸನೀಯ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಜೀನೋಮ್ ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಕಡಿತಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. COG ಮತ್ತು KEGG ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕಾರ್ಯಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಜೀನ್‌ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಎತ್ತಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ASxL5T ಮತ್ತು T. ಒಲಿವೊರನ್ಸ್ MIL-1T ನಡುವಿನ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಮಾರ್ಗಗಳಲ್ಲಿನ ಜಾಗತಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಮೊಬೈಲ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಅಂಶಗಳ ವ್ಯಾಪಕ ಲಭ್ಯತೆಯ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿಲ್ಲ. ASxL5T ಯ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್‌ನ G + C ಅನುಪಾತದಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು 56.1%, ಮತ್ತು T. ಒಲಿವೊರಾನ್‌ಗಳ MIL-1T 46.6% ಆಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ASxL5T ಜೀನೋಮ್‌ನ ಕೋಡಿಂಗ್ ವಿಷಯದ ಪರೀಕ್ಷೆಯು ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀನ್‌ಗಳ ಎನ್‌ಕೋಡಿಂಗ್ ಟೈಪ್ IV ಫಿಂಬ್ರಿಯಾ (Tfp) ಯ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆಸಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳು ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿ ಫ್ಲ್ಯಾಜೆಲ್ಲಾ ಇಲ್ಲದೆ ಸಾಮಾಜಿಕ ಗ್ಲೈಡಿಂಗ್ ಅಥವಾ ಸೆಳೆತ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಜೀವಕೋಶದ ಚಲನೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತವೆ. ವರದಿಗಳ ಪ್ರಕಾರ, Tfp ಪರಭಕ್ಷಕ, ರೋಗೋತ್ಪತ್ತಿ, ಜೈವಿಕ ಫಿಲ್ಮ್ ರಚನೆ, ನೈಸರ್ಗಿಕ DNA ಗ್ರಹಿಕೆ, ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಕೋಶ ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಸೇರಿದಂತೆ ಇತರ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ASxL5T ಜೀನೋಮ್ ಡಿಗ್ವಾನಿಲೇಟ್ ಸೈಕ್ಲೇಸ್ ಅನ್ನು ಎನ್‌ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುವ 18 ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ (2 ಗ್ವಾನೋಸಿನ್ ಟ್ರೈಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಅನ್ನು ಗ್ವಾನೋಸಿನ್ 2 ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಮತ್ತು ಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಡಿಜಿಎಂಪಿ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ಕಿಣ್ವ) ಮತ್ತು 6 ಜೀನ್‌ಗಳು ಅನುಗುಣವಾದ ಡಿಗ್ವಾನಿಲೇಟ್ ಸೈಕ್ಲೇಸ್ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಅನ್ನು ಎನ್‌ಕೋಡಿಂಗ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಟೆರೇಸ್‌ನ ಜೀನ್ (ಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಡಿ-ಜಿಎಂಪಿಯ ಅವನತಿಯನ್ನು ಗ್ವಾನೋಸಿನ್ ಮೊನೊಫಾಸ್ಫೇಟ್‌ಗೆ ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ) ಏಕೆಂದರೆ ಸೈಕ್ಲಿಕ್-ಡಿ-ಜಿಎಂಪಿಯು ಜೈವಿಕ ಫಿಲ್ಮ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆ, ಚಲನೆ, ಕೋಶದ ಲಗತ್ತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ವೈರಲೆನ್ಸ್ 39, 40 ರಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರಮುಖ ಎರಡನೇ ಸಂದೇಶವಾಹಕವಾಗಿದೆ. Bdellovibrio ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊವೊರಸ್ನಲ್ಲಿ, ಆವರ್ತಕ ಡಬಲ್ GMP ಮುಕ್ತ ಜೀವನ ಮತ್ತು ಪರಭಕ್ಷಕ ಜೀವನಶೈಲಿಯ ನಡುವಿನ ಪರಿವರ್ತನೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸಹ ಗಮನಿಸಬೇಕು.
ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮೇಲಿನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಗಳು Bdellovibrio, Bdellovibrio ತರಹದ ಜೀವಿಗಳು ಮತ್ತು Myxococcus ಜಾತಿಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದೆ. ಇವುಗಳು ಮತ್ತು ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಇತರ ಉದಾಹರಣೆಗಳು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಗುಂಪನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, 11 ತಿಳಿದಿರುವ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫಿನೋಟೈಪ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುವ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳ ಗುಂಪನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ3,22. ಆದಾಗ್ಯೂ, O antigen ligase (waaL) ಎನ್‌ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಗ್ರಾಮ್-ಋಣಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿದೆ. ASxL5T ಅನ್ನು ಪರಭಕ್ಷಕ ಎಂದು ಗೊತ್ತುಪಡಿಸುವಲ್ಲಿ ಈ ರೀತಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸಹಾಯಕವಾಗುವುದಿಲ್ಲ, ಬಹುಶಃ ಇದು ಕಾದಂಬರಿ ದಾಳಿ ತಂತ್ರವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಲಭ್ಯತೆಯು ಗುಂಪಿನ ಸದಸ್ಯರ ನಡುವಿನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಪರಿಸರದ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಪುರಾವೆಗಳನ್ನು ಗಣನೆಗೆ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾದ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸದ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಕ್ಯುಪ್ರಿಯಾವಿಡಸ್ ನೆಕೇಟರ್ 42 ಮತ್ತು ಬ್ರಾಡಿಮೊನಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ 43 ಸದಸ್ಯರನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಸಂಶೋಧಕರು ವಿವಿಧ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮುದಾಯಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಿದಂತೆ, ಹೆಚ್ಚು ಪರಭಕ್ಷಕ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾವನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ.
TEM ಚಿತ್ರದಿಂದ ಸೆರೆಹಿಡಿಯಲಾದ ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಅತ್ಯಂತ ಗಮನಾರ್ಹ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ಅದರ ವಿಶಿಷ್ಟ ಮತ್ತು ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ, ಇದು ಬೇಟೆಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದೊಂದಿಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ. ಗಮನಿಸಿದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯು ಇತರ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹಿಂದೆ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಗಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ವರದಿ ಮಾಡಲಾಗಿಲ್ಲ. ಪ್ರಸ್ತಾವಿತ ASxL5T ಪರಭಕ್ಷಕ ಜೀವನ ಚಕ್ರವನ್ನು ಚಿತ್ರ 5 ರಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ನಾವು ಇಲ್ಲಿ ವರದಿ ಮಾಡಿದಂತೆ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಅಪಿಕಲ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಉದಾಹರಣೆಗಳಿವೆ, ಆದರೆ ಈ ಉದಾಹರಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಟೆರಾಸಾಕಿಸ್ಪಿರಾ ಪಾಪಹನುಮೋಕುಕೇನ್ಸಿಸ್, ಸಾಂದರ್ಭಿಕ ತುದಿ ಹಿಗ್ಗುವಿಕೆ 44 ಹೊಂದಿರುವ ಸಾಗರ ಸ್ಪಿರಿಲಮ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಮತ್ತು ಆಲ್ಫಾಪ್ರೊಟಿಯೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಟೆರಾಸಾಕಿಯೊಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಸೇರಿವೆ. , ಹಿಂದೆ ಕುಲಕ್ಕೆ ಸೇರಿದವರು ಓಷಿಯಾನೋಸ್ಪಿರಿಲಮ್, "ಪೋಲಾರ್ ಫಿಲ್ಮ್" ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವದನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ 45. ಹಳೆಯ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳಲ್ಲಿ ಕೋಕಿ ರೂಪಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಗಮನಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ವಿಬ್ರಿಯೊ, ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಮತ್ತು ಹೆಲಿಕೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ 46, 47, 48 ನಂತಹ ಬಾಗಿದ ರೂಪಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಿಗೆ, ಇದು ಅವನತಿ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ನಿಖರವಾದ ಜೀವನ ಚಕ್ರವನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟಪಡಿಸಲು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕೆಲಸದ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಅದು ಹೇಗೆ ಸೆರೆಹಿಡಿಯುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬೇಟೆಯಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ವೈದ್ಯಕೀಯ ಅಥವಾ ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದ ಉದ್ದೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದಾದ ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿರುವ ಸಂಯುಕ್ತಗಳನ್ನು ಅದರ ಜೀನೋಮ್ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆಯೇ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು.
ವೆನೇಟರ್‌ಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಜನ್ ವಿವರಣೆ. ನವೆಂಬರ್ ವೆನೆಟರ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. L. n. venator,'Hunter' ಮತ್ತು Gr. n. ಬ್ಯಾಕ್ಟರ್,'a rod'. Venatorbacter,'a hunting Rod' ನಿಂದ ವೆನೇಟರ್‌ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ. ಕೋಶಗಳು ಏರೋಬಿಕ್, ಉಪ್ಪು-ಸಹಿಷ್ಣು, ಬಾಗಿದ ಗ್ರಾಂ ಸ್ಟೇನ್ ಋಣಾತ್ಮಕ, ಕ್ಯಾಟಲೇಸ್ ಮತ್ತು ಆಕ್ಸಿಡೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆ PHB 4 ರಿಂದ 42 °C ವರೆಗಿನ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ ಶೇಖರಗೊಳ್ಳುವುದಿಲ್ಲ. ಅಥವಾ C16:1ω7c, C16:0 ಮತ್ತು C18:1ω9 ; C12:0 3-OH ಮತ್ತು C10:0 3-OH ಗಳು ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಅವು ಸಾರು ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುವುದಿಲ್ಲ, ಈ ಕುಲದ ಸದಸ್ಯರು 56.1 mol% ರಷ್ಟು ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಮತ್ತು ಎಂಟರ್‌ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರನ್ನು ವಿರೋಧಿಸುತ್ತಾರೆ. ಈ ಕುಲದ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಸ್ಥಾನವು ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿದೆ.
ವೆನೇಟರ್‌ಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕುಕ್ಯುಲಸ್ ಎಸ್ಪಿ ವಿವರಣೆ. ನವೆಂಬರ್ ವೆನೆಟರ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕುಕ್ಯುಲಸ್ (cu'cull.us.; L. n. cucullus ಎಂದರೆ ಫೇರಿಂಗ್ ಎಂದರ್ಥ).
ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, ಈ ಕುಲದ ವಿವರಣಾತ್ಮಕ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯವೆಂದರೆ BA ಅಥವಾ BHI ಯಲ್ಲಿ ಬೆಳೆದಾಗ, ಜೀವಕೋಶಗಳು 1.63 µm ಉದ್ದ ಮತ್ತು 0.37 µm ಅಗಲವಾಗಿರುತ್ತದೆ. BHI ಅಗರ್‌ನಲ್ಲಿರುವ ವಸಾಹತುಗಳು ತುಂಬಾ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ, 72 ಗಂಟೆಗಳ ನಂತರ 2 ಮಿಮೀ ವ್ಯಾಸವನ್ನು ತಲುಪುತ್ತದೆ. ಅವು ಬೀಜ್, ಅರೆಪಾರದರ್ಶಕ, ಸುತ್ತಿನಲ್ಲಿ, ಪೀನ ಮತ್ತು ಹೊಳೆಯುವವು. ಈ ಜಾತಿಯ ಸದಸ್ಯರು ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿ ಮತ್ತು ಕ್ಲೆಬ್ಸಿಲ್ಲಾಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಇತರ ಗ್ರಾಂ-ಋಣಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಬೇಟೆಯಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ.
ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಸ್ಟ್ರೈನ್ ASxL5T ಅನ್ನು ಯುಕೆ ನಾಟಿಂಗ್‌ಹ್ಯಾಮ್‌ಶೈರ್‌ನಲ್ಲಿ ದನದ ಹಾಲಿನಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ನ್ಯಾಷನಲ್ ಟೈಪ್ ಕಲ್ಚರ್ ಕಲೆಕ್ಷನ್‌ನಲ್ಲಿ (UK): ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ NCTC 14397 ಮತ್ತು ನೆದರ್‌ಲ್ಯಾಂಡ್ಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಕಲ್ಚರ್ ಕಲೆಕ್ಷನ್ (NCCB) ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ NCCB 100775 ರ ಸಂಪೂರ್ಣ genome5T. ನಲ್ಲಿ ಠೇವಣಿ ಇಡಲಾಗಿದೆ CP046056 ಸೇರ್ಪಡೆಯ ಪ್ರಕಾರ Genbank.
ASxL5T ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು ಫೇಜ್ ಐಸೋಲೇಶನ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಗೋಮಾಂಸ ಹಾಲಿನಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲಾಗಿದೆ 9,49. ಸ್ಲರಿಯನ್ನು SM ಬಫರ್‌ನಲ್ಲಿ (50 mM Tris-HCl [pH 7.5], 0.1 M NaCl, 8 mM MgSO4.7H2O ಮತ್ತು 0.01% ಜೆಲಾಟಿನ್; ಸಿಗ್ಮಾ ಆಲ್ಡ್ರಿಚ್, ಗಿಲ್ಲಿಂಗ್‌ಹ್ಯಾಮ್, UK) ನಲ್ಲಿ 1:9 (w/v) ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಲಾಯಿತು, ನಂತರ ಕಾವುಕೊಡಿ 24 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ 4 ° C ನಲ್ಲಿ, ಪರಭಕ್ಷಕಗಳನ್ನು ಒಳಕ್ಕೆ ತಿರುಗಿಸಲು ನಿಧಾನವಾಗಿ ತಿರುಗುತ್ತದೆ ಬಫರ್. 3 ನಿಮಿಷಗಳ ಕಾಲ 3000 ಗ್ರಾಂನಲ್ಲಿ ಅಮಾನತುಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸೂಪರ್ನಾಟಂಟ್ ಅನ್ನು 5 ನಿಮಿಷಗಳ ಕಾಲ ಎರಡನೇ ಬಾರಿಗೆ 13,000 ಗ್ರಾಂನಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಕೇಂದ್ರಾಪಗಾಮಿಗೊಳಿಸಲಾಯಿತು. ಸೂಪರ್ನಾಟಂಟ್ ಅನ್ನು ನಂತರ 0.45 µm ಮೆಂಬರೇನ್ ಫಿಲ್ಟರ್ (ಮಿನಿಸಾರ್ಟ್; ಸಾರ್ಟೋರಿಯಸ್, ಗಾಟ್ಟಿಂಗನ್, ಜರ್ಮನಿ) ಮತ್ತು 0.2 µm ಮೆಂಬರೇನ್ ಫಿಲ್ಟರ್ (ಮಿನಿಸಾರ್ಟ್) ಮೂಲಕ ಯಾವುದೇ ಉಳಿದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕೋಶಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಲಾಯಿತು. ASxL5T ಈ ಫಿಲ್ಟರ್‌ಗಳನ್ನು ರವಾನಿಸಬಹುದು. ಅದೇ ಸ್ಲರಿಯಿಂದ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಎಂಟ್ರೊಸಸ್ S12 (NCBI ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ CP040464) ನ ಮೃದುವಾದ ಅಗರ್ ಹುಲ್ಲುಹಾಸನ್ನು ಪ್ರಮಾಣಿತ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ತಯಾರಿಸಲಾಯಿತು. ಫಿಲ್ಟರ್ ಮಾಡಿದ ಸ್ಲರಿಯನ್ನು ಈ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಹೋಸ್ಟ್ ಸೆಲ್ ಪ್ಲೇಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ 10 µl ಹನಿಗಳಲ್ಲಿ ಮೂರು ಬಾರಿ ವಿತರಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಒಣಗಲು ಬಿಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೈಕ್ರೋಏರೋಬಿಕ್ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ (5% O2, 5% H2, 10% CO2, ಮತ್ತು 80% N2) 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ 37 ° C ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ ಪ್ಲೇಟ್ ಅನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಎರೋಫಿಲಿಕ್ ಟ್ಯಾಂಕ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಾವುಕೊಡಲಾಯಿತು. ಪಡೆದ ಗೋಚರ ಪ್ಲೇಕ್ ಅನ್ನು SM ಬಫರ್‌ಗೆ ಹೊರತೆಗೆಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಲೈಸ್ಡ್ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಪ್ರಚಾರ ಮಾಡಲು C. ಹೈಯೋಂಟೆಸ್ಟಿನಾಲಿಸ್ S12 ನ ತಾಜಾ ಹುಲ್ಲುಹಾಸಿಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಲಾಯಿತು. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವು ಲೈಟಿಕ್ ಪ್ಲೇಕ್‌ಗೆ ಕಾರಣ ಮತ್ತು ಫೇಜ್ ಅಲ್ಲ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಿದ ನಂತರ, ಆತಿಥೇಯರಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಬೆಳೆಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ನಿರೂಪಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ. ಏರೋಬಿಕ್ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯನ್ನು 37 °C ನಲ್ಲಿ 5% v/v ಡಿಫೈಬ್ರಿನೇಟೆಡ್ ಕುದುರೆ ರಕ್ತದೊಂದಿಗೆ ನಡೆಸಲಾಯಿತು (TCS ಬಯೋಸೈನ್ಸ್ Lt, ಬಕಿಂಗ್ಹ್ಯಾಮ್, UK, ಪೂರಕ). ನ್ಯಾಶನಲ್ ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಸ್ಟ್ಯಾಂಡರ್ಡ್ಸ್ ಕಮಿಟಿಯ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳ ಪ್ರಕಾರ, ಡಿಸ್ಕ್ ಡಿಫ್ಯೂಷನ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ವಿರೋಧಿ ಸಂವೇದನೆ ಪರೀಕ್ಷೆಗೆ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಏರೋಬಿಕ್ ಕಲ್ಚರ್‌ಗಾಗಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳನ್ನು (ಆಕ್ಸಾಯ್ಡ್) ಹೊಂದಿರುವ ಡಿಸ್ಕ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು BHI ಅಗರ್ ಅನ್ನು 37 °C ನಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಸಲಾಯಿತು: ಅಮೋಕ್ಸಿಸಿಲಿನ್ ಮತ್ತು ಕ್ಲಾವುಲಾನಿಕ್ ಆಮ್ಲ 30 µg; ಸೆಫೋಟಾಕ್ಸಿಮ್ 30 μg; ಸ್ಟ್ರೆಪ್ಟೊಮೈಸಿನ್ 10 μg; ಸಿಪ್ರೊಫ್ಲೋಕ್ಸಾಸಿನ್ 5 μg; ಸೆಫ್ಟಾಜಿಡೈಮ್ 30 µg ನಲಿಡಿಕ್ಸಿಕ್ ಆಮ್ಲ 30 μg; ಇಮಿಪೆನೆಮ್ 10 μg; ಅಜಿತ್ರೊಮೈಸಿನ್ 15 μg; ಕ್ಲೋರಂಫೆನಿಕೋಲ್ 30 μg; ಸೆಫಾಕ್ಸಿಟಿನ್ 30 μg; ಟೆಟ್ರಾಸೈಕ್ಲಿನ್ 30 μg; ನೈಟ್ರೋಫುರಾಂಟೊಯಿನ್ 300 μg; ಅಜ್ಟ್ರಿಯೋನಮ್ 30 μg; ಆಂಪಿಸಿಲಿನ್ 10 μg; ಸೆಫೊಡಾಕ್ಸಿಮ್ 10 μg; ಟ್ರೈಮೆಥೋಪ್ರಿಮ್-ಸಲ್ಫಮೆಥೋಕ್ಸಜೋಲ್ 25 μg. 37 °C ನಲ್ಲಿ BHI ಅಗರ್ ಪ್ಲೇಟ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಏರೋಬಿಕ್ ಇನ್ಕ್ಯುಬೇಶನ್ ಮೂಲಕ ಉಪ್ಪು ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಯಿತು. 10% w/v ವರೆಗಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸಲು BHI ಅಗರ್ ಪ್ಲೇಟ್‌ಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚುವರಿ NaCl ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಯಿತು. 37 °C ನಲ್ಲಿ BHI ಅಗರ್ ಪ್ಲೇಟ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಏರೋಬಿಕ್ ಕಲ್ಚರ್‌ನಿಂದ pH ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ pH ಶ್ರೇಣಿಯನ್ನು 4 ಮತ್ತು 9 ರ ನಡುವೆ ಬರಡಾದ HCl ಅಥವಾ ಸ್ಟೆರೈಲ್ NaOH ನೊಂದಿಗೆ ಹೊಂದಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಪ್ಲೇಟ್ ಅನ್ನು ಸುರಿಯುವ ಮೊದಲು ಗುರಿಯ pH ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ, ASxL5T ಅನ್ನು BHI ಅಗರ್‌ನಲ್ಲಿ 3 ದಿನಗಳವರೆಗೆ ಮತ್ತು ಏರೋಬಿಕ್‌ನಲ್ಲಿ 37 °C ನಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಸಲಾಯಿತು. MIDI (Sherlock Microbial Identification System, Version 6.10) FERA Science Ltd, (York, UK) ಪ್ರಮಾಣಿತ ಪ್ರೋಟೋಕಾಲ್ ಪ್ರಕಾರ, ಜೀವಕೋಶದ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯಲಾಯಿತು, ತಯಾರಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
TEM ಗಾಗಿ, 24 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ 37 ° C ನಲ್ಲಿ BA ನಲ್ಲಿ ಏಕರೂಪವಾಗಿ ಹರಡುವ ಮೂಲಕ ASxL5T ಅನ್ನು ಏರೋಬಿಕ್ ಕಲ್ಚರ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ನಂತರ 1 ಮಿಲಿ 3% (v/v) ಗ್ಲುಟರಾಲ್ಡಿಹೈಡ್‌ನಲ್ಲಿ 0.1 M ಕ್ಯಾಕೋಡೈಲೇಟ್ ಬಫರ್‌ನಲ್ಲಿ ಕೊಠಡಿ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ 1 ಗಂಟೆಗೆ ಸರಿಪಡಿಸಿ, ನಂತರ ಕೇಂದ್ರಾಪಗಾಮಿ 3 ನಿಮಿಷಗಳ ಕಾಲ 10,000 ಗ್ರಾಂನಲ್ಲಿ. ನಂತರ 600 μl 0.1 M ಕ್ಯಾಕೋಡಿಲೇಟ್ ಬಫರ್‌ನಲ್ಲಿ ಪೆಲೆಟ್ ಅನ್ನು ನಿಧಾನವಾಗಿ ಮರುಹೊಂದಿಸಿ. 200 ಮೆಶ್ ಕಾಪರ್ ಗ್ರಿಡ್‌ನಲ್ಲಿ ಫಾರ್ಮ್‌ವರ್/ಕಾರ್ಬನ್ ಫಿಲ್ಮ್‌ಗೆ ಸ್ಥಿರವಾದ ASxL5T ಅಮಾನತುವನ್ನು ವರ್ಗಾಯಿಸಿ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು 1 ನಿಮಿಷಕ್ಕೆ 0.5% (w/v) ಯುರೇನಿಲ್ ಅಸಿಟೇಟ್‌ನಿಂದ ಬಣ್ಣಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು TEI Tecnai G2 12 Biotwin ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು TEM ನಿಂದ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಯಿತು. ಮೇಲೆ ತಿಳಿಸಿದಂತೆ, NZCYM ಸಾರು (BD ಡಿಫ್ಕೊ™, ಫಿಶರ್ ಸೈಂಟಿಫಿಕ್ UK Ltd, Loughborough) ನಲ್ಲಿ ಅದೇ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಬೇಟೆ ಮತ್ತು ಪರಭಕ್ಷಕವನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಿ ಮತ್ತು 37 ° C ನಲ್ಲಿ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಅಥವಾ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್‌ನ ಮೈಕ್ರೋಎರೋಬಿಕ್ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ 48 ಗಂಟೆಗಳ ಕಾಲ ಕಾವುಕೊಡಿ , ಪರಭಕ್ಷಕನ ಪೂರ್ವ ಸಂವಹನ TEM ನಿಂದ ಕೂಡ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಯಿತು. ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿಗೆ ಏರೋಬಿಕ್ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು. ಬೇಟೆಯ ಕಾರಣದಿಂದ ಜೀವಕೋಶದ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿನ ಯಾವುದೇ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಬೇಟೆ ಮತ್ತು ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಿ. PHB ಶೇಖರಣೆಯ ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಗಾಗಿ ಸುಡಾನ್ ಕಪ್ಪು ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಲಾಯಿತು.
ಸ್ಟೆರೈಲ್ ಸ್ವ್ಯಾಬ್‌ನೊಂದಿಗೆ BHI ಅಥವಾ BA ಪ್ಲೇಟ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಸ್ಮೀಯರ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ASxL5T ರಾತ್ರಿಯ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳನ್ನು ಬೆಳೆಸಿಕೊಳ್ಳಿ. ASxL5T ಕೋಶಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು MRD (CM0733, Oxoid) ನಲ್ಲಿ ಅಮಾನತುಗೊಳಿಸಿ, ತದನಂತರ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಹಸಿವಿನಿಂದ 7 ದಿನಗಳವರೆಗೆ 4 ° C ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಿ. NCTC ಉಲ್ಲೇಖ ಅಥವಾ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಸ್ಟಾಕ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯನ್ನು BHI ಸಾರು ಅಥವಾ ನಂ. 2 ಪೌಷ್ಟಿಕಾಂಶದ ಸಾರು (CM007, ಆಕ್ಸಾಯ್ಡ್) ಗೆ ಚುಚ್ಚುಮದ್ದು ಮಾಡಲಾಯಿತು, ರಾತ್ರಿಯಿಡೀ ಕಾವುಕೊಡಲಾಗುತ್ತದೆ, 13,000g ನಲ್ಲಿ ಕೇಂದ್ರಾಪಗಾಮಿಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು OD600 0.4 ರವರೆಗೆ MRD ನಲ್ಲಿ ಮರುಹೊಂದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸಂಸ್ಕೃತಿ: ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ NCTC 3610T, Citrobacter freundii NCTC 9750T, ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಏರೋಜೆನೆಸ್ NCTC 10006T, ಎಂಟರೊಕೊಕಸ್ ಫೇಕಾಲಿಸ್ NCTC 775T, ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿ NCTC 811, ಕ್ಲೆಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಲೆಬ್ಸಿ 811 NCTC 10817, ಲಿಸ್ಟೇರಿಯಾ ವಿಶೇಷ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ NCTC 4885, ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಮ್ಯಾಸೆರನ್ಸ್ NCTC 6355T, ಪ್ರಾವಿಡೆನ್ಸಿಯಾ ಸ್ಟುವರ್ಟ್ಸಿ NCTC 10318, ಸ್ಯೂಡೋಮೊನಾಸ್ ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ SMDL, ರೋಡೋಕಾಕಸ್ ಜಲಾಂತರ್ಗಾಮಿ ಹ್ಯಾಂಬರ್ಗರ್ NCTC 5747, ಲೋಳೆಪೊರೆಯ NCTC 10861, ಸ್ಟ್ಯಾಫಿಲೋಕೊಕಸ್ ಔರೆಸ್ NCTC 8532T, ಸ್ಟ್ರೆಪ್ಟೋಕೊಕಸ್ NCTC 7465T, ಯೆರ್ಸಿನಿಯಾ ಎಂಟ್ರೊಕೊಲಿಟಿಕಾ NCTC 10460. ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಅನ್ನು ಮೈಕ್ರೋಎರೋಬಿಕಲಿ 7CC 7C ನಲ್ಲಿ ಪ್ಲೇಟ್ 3 °C ನಲ್ಲಿ ಅಮಾನತುಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ ಸಾರು. ಪರೀಕ್ಷಿತ ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಹೋಸ್ಟ್‌ಗಳು: C. ಕೋಲಿ 12667 NCTC, C. jejuni 12662, C. jejuni PT14, C. jejuni NCTC 11168T, C. ಹೆಲ್ವೆಟಿಕಸ್ NCTC 12472, C. ಲಾರಿ NCTC, C.1450ri48CTC, C.145ri jejuni PT14, C... MRD ಯಲ್ಲಿ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ, 13,000g ನಲ್ಲಿ ಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಮತ್ತು OD600 0.4 ಆಗುವವರೆಗೆ MRD ನಲ್ಲಿ ಮರುಹೊಂದಿಸಿ. 5 ಮಿಲಿ ಕರಗಿದ NZCYM ಟಾಪ್ ಅಗರ್ (0.6% ಅಗರ್) ಗೆ 0.5 ಮಿಲಿ ಸಸ್ಪೆನ್ಶನ್‌ನ ಆಲ್ಕೋಟ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು 1.2% NZCYM ಬಾಟಮ್ ಪ್ಲೇಟ್‌ಗೆ ಸುರಿಯಿರಿ. ಕ್ಯೂರಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಒಣಗಿಸಿದ ನಂತರ, ಸತತವಾಗಿ ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಿದ ASxL5T ಅನ್ನು 20 µl ಹನಿಗಳಾಗಿ ಪ್ರತಿ ಲಾನ್ ಬೋರ್ಡ್‌ನಲ್ಲಿ ಮೂರು ಬಾರಿ ವಿತರಿಸಲಾಯಿತು. ಸಂಸ್ಕೃತಿಯ ತಾಪಮಾನ ಮತ್ತು ವಾತಾವರಣವು ಪರೀಕ್ಷಾ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಅವಶ್ಯಕತೆಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ.
ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಗಳಿಂದ ಡಿಎನ್‌ಎ ತಯಾರಿಸಲು GenElute™ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಜೀನೋಮಿಕ್ DNA ಕಿಟ್ (ಸಿಗ್ಮಾ ಆಲ್ಡ್ರಿಡ್ಜ್) ಬಳಸಿ. 16S ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಜೀನ್‌ನ ಪಿಸಿಆರ್ ವರ್ಧನೆ ಮತ್ತು ಡೈ ಟರ್ಮಿನೇಷನ್ ಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ (ಯೂರೋಫಿನ್ಸ್ ವ್ಯಾಲ್ಯೂ ರೀಡ್ ಸರ್ವಿಸ್, ಜರ್ಮನಿ) ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಉತ್ಪನ್ನದ ಅನುಕ್ರಮ ನಿರ್ಣಯಕ್ಕಾಗಿ ಪ್ರಮಾಣಿತ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಮತ್ತು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲು ಇತರ 16S rRNA ಜೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸಲು BLAST-N ಪ್ರೋಗ್ರಾಂ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ. MEGA X ಪ್ರೋಗ್ರಾಂನಲ್ಲಿ ClustalW ಬಳಸಿ ಇವುಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ. 1000 ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿ ಪ್ರತಿಗಳೊಂದಿಗೆ, ತಮುರಾ-ನೀ ಮಾದರಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಗರಿಷ್ಠ ಸಂಭವನೀಯ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು MEGA X ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಮರವನ್ನು ಪುನರ್ನಿರ್ಮಿಸಲಾಯಿತು. ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ಡಿಎನ್‌ಎಯನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯಲು ಪ್ಯೂರ್‌ಲಿಂಕ್™ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಡಿಎನ್‌ಎ ಕಿಟ್ (ಫಿಶರ್ ಸೈಂಟಿಫಿಕ್, ಲೌಬರೋ, ಯುಕೆ) ಬಳಸಿ. ASxL5T ಯ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು Illumina MiSeq ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಯಿತು, ಇದು Nextera ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಕಿಟ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಿದ ಲೈಬ್ರರಿಯಿಂದ ಸಂಯೋಜಿಸಲ್ಪಟ್ಟ 250 bp ಡಬಲ್-ಎಂಡೆಡ್ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು PacBio ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ನಿಂದ 2 ರಿಂದ 20 kb ಉದ್ದದ ಓದುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಸೆಂಬಿಯಾ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಡಿಎನ್‌ಎ ಅನುಕ್ರಮ ಸಂಶೋಧನಾ ಸೌಲಭ್ಯ. ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು CLC ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವರ್ಕ್‌ಬೆಂಚ್ 12.0.3 (ಕಿಯಾಗೆನ್, ಆರ್ಹಸ್, ಡೆನ್ಮಾರ್ಕ್) ಬಳಸಿ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ASxL5T ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳನ್ನು ನ್ಯಾಷನಲ್ ಟೈಪ್ ಕಲ್ಚರ್ ಕಲೆಕ್ಷನ್ (UK) ಮತ್ತು ನೆದರ್ಲ್ಯಾಂಡ್ಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಕಲ್ಚರ್ ಕಲೆಕ್ಷನ್ (NCCB) ನಲ್ಲಿ ಠೇವಣಿ ಇಡಲಾಗಿದೆ. ಹೋಲಿಕೆಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳೆಂದರೆ: ಥಲಸ್ಸೊಲಿಟಸ್ ಒಲಿವೊರಾನ್ಸ್ MIL-1T (ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ HF680312, ಸಂಪೂರ್ಣ); ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಪ್ಲೇನ್ಸ್ ಸ್ಯಾನೆನ್ಸಿಸ್ KCTC 32220T (ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ BMYY01000001, ಅಪೂರ್ಣ); Oceanobacter kriegii DSM 6294T (ಪ್ರವೇಶ ಸಂಖ್ಯೆ NZ_AUGV00000000, ಅಪೂರ್ಣ); ಮರಿನಾಮೊನಾಸ್ ಸಮುದಾಯ DSM 5604T (ASM436330v1 ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅಪೂರ್ಣ), ಓಷಿಯಾನೋಸ್ಪಿರುಲಮ್ ಲಿನಮ್ ATCC 11336T (MTSD02000001 ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅಪೂರ್ಣ) ಮತ್ತು Thalassolituus sp. C2-1 (NZ_VNIL01000001 ಸೇರಿಸಿ, ಅಪೂರ್ಣ). ಜೋಡಣೆ ಸ್ಕೋರ್ (AF) ಮತ್ತು ಸರಾಸರಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲದ ಗುರುತನ್ನು (ANI) ನಿರ್ಧರಿಸಲು https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= ನಲ್ಲಿ JGI ಜೀನೋಮ್ ಪೋರ್ಟಲ್36 ಅನ್ನು ಬಳಸಿ. ಜೋಡಿಯಾಗಿ. ಅಮೈನೋ ಆಸಿಡ್ ಗುರುತನ್ನು (AAI) ನಿರ್ಧರಿಸಲು Rodriguez-R & Konstantinidis55 ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಅಂದಾಜು ಗರಿಷ್ಟ ಸಂಭವನೀಯತೆ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ಟ್ರೀ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಿ. ಲಭ್ಯವಿರುವ ಉಲ್ಲೇಖ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಇನ್‌ಪುಟ್ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು 16S rRNA ಫೈಲೋಜೆನಿಯಿಂದ ASxL5T ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ಗುರುತಿಸಲಾದ ಉಲ್ಲೇಖ ಕುಲದಿಂದ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಸಂವಾದಾತ್ಮಕ ಟ್ರೀ ಆಫ್ ಲೈಫ್ ಆನ್‌ಲೈನ್ ಟೂಲ್ (https://itol.embl.de/) ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮರವನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ASxL5T ಜೀನೋಮ್‌ನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು BlastKOALA KEGG ಆನ್‌ಲೈನ್ ಉಪಕರಣವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು KEGG (ಕ್ಯೋಟೋ ಎನ್‌ಸೈಕ್ಲೋಪೀಡಿಯಾ ಆಫ್ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಜಿನೋಮ್‌ಗಳು) ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ಪುಷ್ಟೀಕರಣ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕೈಗೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. COG ವಿಭಾಗಗಳ (ಆರ್ಥೋಲಾಜಸ್ ಗುಂಪುಗಳು) ವಿತರಣೆಯನ್ನು eggNOG-ಮ್ಯಾಪರ್ ಆನ್‌ಲೈನ್ ಉಪಕರಣವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
Pérez, J., Moraleda-Muñoz, A., Marcos-Torres, FJ ಮತ್ತು Muñoz-Dorado, J. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಬೇಟೆ: 75 ವರ್ಷಗಳು ಮತ್ತು ಇದು ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ! . ಪರಿಸರ. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. 18, 766–779 (2016).
ಲಿನಾರೆಸ್-ಒಟೊಯಾ, ಎಲ್. ಇತ್ಯಾದಿ. ಪೆರುವಿಯನ್ ಕರಾವಳಿಯಲ್ಲಿ ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ವಿರೋಧಿ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ. ಮಾರ್ಚ್ ಔಷಧಗಳು. 15. E308. https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017).
ಪಾಸ್ಟರ್ನಾಕ್, Z. ಮತ್ತು ಇತರರು. ಅವರ ಜೀನ್‌ಗಳ ಮೂಲಕ, ನೀವು ಅವುಗಳನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುವಿರಿ: ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು. ISME J. 7, 756–769 (2013).
ಸಾಕೆಟ್, RE ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್ Bdellovibrio ನ ಪರಭಕ್ಷಕ ಜೀವನಶೈಲಿ. ಸ್ಥಾಪಿಸಿ. ಪಾಸ್ಟರ್ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು. 63, 523–539 (2009).
Korp, J., Vela Gurovic, MS & Nett, M. ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಿಂದ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳು. ಬೀಲ್‌ಸ್ಟೈನ್ ಜೆ. ಹಿಸ್ಟೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ 12, 594–607 (2016).
ಜಾನ್ಕೆ, ಜೆ., ಫ್ರೌನೆ, ಎಸ್., ಬಾಷ್, ಟಿಸಿಜಿ, ಹೆಂಟ್ಶೆಲ್, ಯು. & ಶುಲೆನ್‌ಬರ್ಗ್, ಎಚ್. ಬಿಡೆಲೋವಿಬ್ರಿಯೊ ಮತ್ತು ಅಂತಹುದೇ ಜೀವಿಗಳು ವಿವಿಧ ಅತಿಥೇಯ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಮುನ್ಸೂಚಕಗಳಾಗಿವೆ. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. ಪರಿಸರ ವಿಜ್ಞಾನ. 79, 252–257 (2020).
Vila, J., Moreno-Morales, J. ಮತ್ತು Ballesté-Delpierre, C. ಹೊಸ ಆಂಟಿಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಏಜೆಂಟ್‌ಗಳ ಪ್ರಸ್ತುತ ಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. ಸೋಂಕು. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019).
ಹೋಬ್ಲಿ, ಎಲ್. ಮತ್ತು ಇತರರು. ಫೇಜ್ ಮತ್ತು ಫೇಜ್‌ನ ಡ್ಯುಯಲ್ ಬೇಟೆಯು ಇ.ಕೋಲಿ ಬೇಟೆಯನ್ನು ಒಂದೇ ಬೇಟೆಯಿಲ್ಲದೆ ನಿರ್ಮೂಲನೆ ಮಾಡಬಹುದು. ಜೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ. 202, e00629-19. https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020).
El-Shibiny, A., Connerton, PL & Connerton, IF ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್‌ಗಳ ಎಣಿಕೆ ಮತ್ತು ವೈವಿಧ್ಯತೆಯು ಮುಕ್ತ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಮತ್ತು ಸಾವಯವ ಕೋಳಿಗಳ ಆಹಾರ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ಪರಿಸರ. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. 71, 1259–1266 (2005).
ವಿಲ್ಕಿನ್ಸನ್, ಡಿಎ ಇತ್ಯಾದಿ. ಕ್ಯಾಂಪಿಲೋಬ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಹಂದಿಗಳ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ ಮತ್ತು ಎಪಿಡೆಮಿಯಾಲಜಿಯನ್ನು ನವೀಕರಿಸಿ. ವಿಜ್ಞಾನ. ಪ್ರತಿನಿಧಿ 8, 2393. https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018).
ಲೀ, MD GToTree: ಸಿಸ್ಟಮ್ಸ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್‌ಗಾಗಿ ಬಳಕೆದಾರ ಸ್ನೇಹಿ ವರ್ಕ್‌ಫ್ಲೋ. ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ 35, 4162–4164 (2019).
ಎಡ್ಗರ್, ಆರ್ಸಿ ಸ್ನಾಯು: ಸಮಯ ಮತ್ತು ಜಾಗದ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ವಿಧಾನ. BMC ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ. 5, 113 (2004).
Capella-Gutiérrez, S., Silla-Martínez, JM & Gabaldón, T. TrimAl: ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಫೈಲೋಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಮ್ಮಿಂಗ್‌ಗಾಗಿ ಒಂದು ಸಾಧನ. ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ 25, 1972–1973 (2009).
Hyatt, D., LoCascio, PF, Hauser, LJ & Uberbacher, EC ಜೀನ್ ಮತ್ತು ಮೆಟಾಜೆನೊಮಿಕ್ ಅನುಕ್ರಮ ಅನುವಾದ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸೈಟ್ ಭವಿಷ್ಯ. ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ 28, 2223-2230 (2012).
ಶೆನ್, ಡಬ್ಲ್ಯೂ. & ಕ್ಸಿಯಾಂಗ್, ಜೆ. ಟ್ಯಾಕ್ಸನ್‌ಕಿಟ್: ಕ್ರಾಸ್-ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಮತ್ತು ಸಮರ್ಥ ಎನ್‌ಸಿಬಿಐ ವರ್ಗೀಕರಣ ಟೂಲ್‌ಕಿಟ್. ಬಯೋ Rxiv. (ಜೂನ್ 1, 2021 ರಂದು ಪ್ರವೇಶಿಸಲಾಗಿದೆ); https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019).
ಬೆಲೆ, MN, Dehal, PS & Arkin, AP FastTree 2-ದೊಡ್ಡ ಜೋಡಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಅಂದಾಜು ಗರಿಷ್ಠ ಸಂಭವನೀಯ ಮರ. PLoS One 5, e9490 (2010).
ಟಾಂಗೆ, O. GNU ಸಮಾನಾಂತರ. (ಜೂನ್ 1, 2021 ರಂದು ಪ್ರವೇಶಿಸಲಾಗಿದೆ); https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018).
ಕನೆಹಿಸಾ, M. & ಗೊಟೊ, S. KEGG: ಕ್ಯೋಟೋ ಎನ್‌ಸೈಕ್ಲೋಪೀಡಿಯಾ ಆಫ್ ಜೀನ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಜಿನೋಮ್ಸ್. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಸಂಶೋಧನೆ. 28, 27-30 (2000).
ಜೆಕ್ ರಿಪಬ್ಲಿಕ್, ಎಲ್. ಇತ್ಯಾದಿ. ಒತ್ತಡದ ರಕ್ಷಕಗಳು ಮತ್ತು ಪೋಷಕಾಂಶಗಳಾಗಿ ಎಕ್ಸ್ಟ್ರೀಮೋಲೈಟ್ಸ್ ಎಕ್ಟೋಯಿನ್ ಮತ್ತು ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಯೆಕ್ಟೊಯಿನ್ ಪಾತ್ರ: ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್, ಸಿಸ್ಟಮ್ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್, ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ. ಜೀನ್ (ಬಾಸೆಲ್). 9. E177. https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018).
Gregson, BH, Metodieva, G., Metodiev, MV, Golyshin, PN & McKew, BA ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮಧ್ಯಮ ಮತ್ತು ದೀರ್ಘ ಸರಣಿ ಆಲ್ಕೇನ್ಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕಡ್ಡಾಯ ಸಾಗರ ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್-ಡಿಗ್ರೇಡಿಂಗ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ Thalassolituus oleivorans MIL-1 ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ . ಮುಂಭಾಗ. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. 9, 3130 (2018).
Pasternak, Z., Ben Sasson, T., Cohen, Y., Segev, E., ಮತ್ತು Jurkevitch, E. ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸೂಚಕಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುವ ಹೊಸ ತುಲನಾತ್ಮಕ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ವಿಧಾನವು ಪರಭಕ್ಷಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಗುರುತುಗಳಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುವಂಶಿಕತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಸಾರ್ವಜನಿಕ ವಿಜ್ಞಾನ ಗ್ರಂಥಾಲಯ ಒಂದು. 10. e0142933. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015).
Yakimov, MM, ಇತ್ಯಾದಿ. Thalassolituus oleivorans ಜೀನ್. ನವೆಂಬರ್, sp. ನವೆಂಬರ್., ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್‌ಗಳ ಬಳಕೆಯಲ್ಲಿ ಪರಿಣತಿ ಹೊಂದಿರುವ ಹೊಸ ರೀತಿಯ ಸಾಗರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ. ಅಂತರಾಷ್ಟ್ರೀಯತೆ. ಜೆ. ಸಿಸ್ಟಮ್. ವಿಕಾಸ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. 54, 141–148 (2004).
ವಾಂಗ್, ವೈ., ಯು, ಎಂ., ಲಿಯು, ವೈ., ಯಾಂಗ್, ಎಕ್ಸ್. & ಝಾಂಗ್, XH ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಪ್ಲಾನಾಯ್ಡ್ಸ್ ಪೆಸಿಫಿಕಮ್ ಜೆನ್. ನವೆಂಬರ್, sp. ನವೆಂಬರ್ನಲ್ಲಿ, ಇದು ದಕ್ಷಿಣ ಪೆಸಿಫಿಕ್ನಲ್ಲಿ ಪರಿಚಲನೆಯಲ್ಲಿರುವ ಸಮುದ್ರದ ನೀರಿನಿಂದ ಬೇರ್ಪಟ್ಟಿತು. ಅಂತರಾಷ್ಟ್ರೀಯತೆ. ಜೆ. ಸಿಸ್ಟಮ್. ವಿಕಾಸ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ. 66, 5010–5015 (2016).