नॉटिंगहॅमशायर, इंग्लंडमधील शेणाच्या तलावातून नवीन प्रकारचे ग्राम-नकारात्मक, एरोबिक, मीठ-सहिष्णु, सक्रिय, रॉड-आकाराचे आणि शिकारी जीवाणू ASxL5T वेगळे केले गेले आणि कॅम्पिलोबॅक्टरचा शिकार म्हणून वापर केला. त्यानंतर, इतर कॅम्पिलोबॅक्टर प्रजाती आणि एन्टरोबॅक्टेरिया कुटुंबातील सदस्यांना शिकार म्हणून शोधण्यात आले. यजमान पेशींशिवाय उपसंस्कृतीनंतर, ब्रेन हार्ट इन्फ्यूजन आगरवर कमकुवत ऍसेप्टिक वाढ झाली. इष्टतम वाढीची स्थिती 37 °C आणि pH 7 आहे. ट्रान्समिशन इलेक्ट्रॉन मायक्रोस्कोपीने शिकारच्या उपलब्धतेशी संबंधित काही अतिशय असामान्य आकृतिशास्त्रीय वैशिष्ट्ये उघड केली. 16S rRNA जनुक क्रम वापरून फायलोजेनेटिक विश्लेषणाने सूचित केले आहे की अलगाव मरीन स्पिरुलिना कुटुंबातील सदस्याशी संबंधित आहे, परंतु कोणत्याही ज्ञात वंशाचा सदस्य म्हणून स्पष्टपणे वर्गीकृत केले जाऊ शकत नाही. ASxL5T च्या संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमाने सागरी स्पिरोचेट्सच्या सदस्यांशी संबंधांची पुष्टी केली. डेटाबेस शोधातून असे दिसून आले आहे की अनेक ASxL5Ts 16S rRNA जनुकांचे अनुक्रम महासागर, जमिनीचा पृष्ठभाग आणि भूजलातील अनेक असंस्कृत जीवाणूंसह सामायिक करतात. आम्ही सुचवितो की ASxL5T हा स्ट्रेन नवीन वंशातील नवीन प्रजाती दर्शवतो. आम्ही Venatorbacter cucullus gen नावाची शिफारस करतो. नोव्हेंबर, सप. नोव्हेंबरमध्ये, ASxL5T प्रकार स्ट्रेन म्हणून वापरला गेला.
शिकारी जीवाणू हे जीवाणू आहेत जे बायोसिंथेटिक सामग्री आणि ऊर्जा मिळविण्यासाठी इतर जिवंत जीवाणूंची शिकार करण्याची आणि मारण्याची क्षमता प्रदर्शित करतात. हे मृत सूक्ष्मजीवांपासून पोषक तत्वांच्या सामान्य पुनर्प्राप्तीपेक्षा वेगळे आहे आणि हे परजीवी परस्परसंवादापेक्षा देखील वेगळे आहे, ज्यामध्ये जीवाणू त्यांना मारल्याशिवाय त्यांच्या यजमानाशी जवळचे नाते निर्माण करतात. शिकारी जीवाणू ज्या कोनाड्यांमध्ये आढळतात (जसे की सागरी अधिवास) तेथे मुबलक अन्न स्रोतांचा फायदा घेण्यासाठी विविध जीवन चक्र विकसित केले आहेत. ते वर्गीकरणानुसार वैविध्यपूर्ण गट आहेत, जे केवळ त्यांच्या अनन्य नसबंदी जीवन चक्राने जोडलेले आहेत. शिकारी जीवाणूंची उदाहरणे अनेक वेगवेगळ्या फिलामध्ये आढळून आली आहेत, ज्यात: प्रोटीओबॅक्टेरिया, बॅक्टेरॉइड्स आणि क्लोरेला.3. तथापि, सर्वात चांगले अभ्यासलेले शिकारी जीवाणू म्हणजे Bdellovibrio आणि Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs4). शिकारी जीवाणू हे नवीन जैविक दृष्ट्या सक्रिय संयुगे आणि बॅक्टेरियाच्या वाढीस प्रतिबंध करणारा पदार्थ एजंट्सचा एक आशादायक स्रोत आहेत.
शिकारी जीवाणू सूक्ष्मजीव विविधता वाढवतात आणि पर्यावरणीय आरोग्य, उत्पादकता आणि स्थिरतेवर सकारात्मक प्रभाव पाडतात असे मानले जाते. हे सकारात्मक गुणधर्म असूनही, जीवाणू संवर्धनाच्या अडचणीमुळे आणि त्यांचे जटिल जीवनचक्र समजून घेण्यासाठी पेशींच्या परस्परसंवादाचे काळजीपूर्वक निरीक्षण करण्याची गरज असल्यामुळे नवीन शिकारी जीवाणूंवर काही अभ्यास झाले आहेत. संगणकीय विश्लेषणातून ही माहिती मिळवणे सोपे नाही.
वाढत्या प्रतिजैविक प्रतिकाराच्या युगात, जीवाणूजन्य रोगजनकांना लक्ष्य करण्यासाठी नवीन धोरणांचा अभ्यास केला जात आहे, जसे की बॅक्टेरियोफेजेस आणि शिकारी जीवाणू 7,8 वापरणे. ASxL5T जीवाणू 2019 मध्ये नॉटिंगहॅम, नॉटिंगहॅमशायर विद्यापीठाच्या डेअरी सेंटरमधून गोळा केलेल्या शेणापासून फेज आयसोलेशन तंत्रज्ञानाचा वापर करून वेगळे केले गेले. जैविक नियंत्रण एजंट म्हणून क्षमता असलेल्या जीवांना वेगळे करणे हा तपासाचा उद्देश आहे. कॅम्पिलोबॅक्टर हायोइंटेस्टिनालिस हा एक झुनोटिक रोगजनक आहे, जो मानवी आतड्यांसंबंधी रोगांशी वाढत्या प्रमाणात संबंधित आहे. हे सीरममध्ये सर्वव्यापी आहे आणि लक्ष्य होस्ट म्हणून वापरले जाते.
ASxL5T जीवाणू बीफ जेलीपासून वेगळे करण्यात आले कारण असे आढळून आले की सी. हायोइंटेस्टिनालिसच्या लॉनवर जे फलक तयार होतात ते बॅक्टेरियोफेजेसद्वारे तयार केलेल्या प्लेक्ससारखेच होते. हा एक अनपेक्षित शोध आहे, कारण फेज अलगाव प्रक्रियेच्या भागामध्ये 0.2 µm फिल्टरद्वारे फिल्टर करणे समाविष्ट आहे, जे जीवाणू पेशी काढून टाकण्यासाठी डिझाइन केलेले आहे. प्लेकमधून काढलेल्या सामग्रीच्या सूक्ष्म तपासणीत असे दिसून आले की लहान ग्राम-नकारात्मक वक्र रॉड-आकाराचे बॅक्टेरिया पॉलीहायड्रॉक्सीब्युटीरेट (PHB) जमा करत नाहीत. शिकारी पेशींपासून स्वतंत्र ऍसेप्टिक संस्कृती समृद्ध घन माध्यमांवर (जसे की मेंदू हृदय इन्फ्यूजन अगर (बीएचआय) आणि रक्त आगर (बीए)) लक्षात येते आणि त्याची वाढ कमकुवत आहे. हेवी inoculum सुधारणा सह subculture नंतर प्राप्त आहे. हे मायक्रोएरोबिक (7% v/v ऑक्सिजन) आणि वायुमंडलीय ऑक्सिजन परिस्थितीत तितकेच चांगले वाढते, परंतु ॲनारोबिक वातावरणात नाही. 72 तासांनंतर, कॉलनीचा व्यास खूपच लहान होता, 2 मिमीपर्यंत पोहोचला आणि तो बेज, अर्धपारदर्शक, गोलाकार, बहिर्वक्र आणि चमकदार होता. मानक जैवरासायनिक चाचणीला बाधा येते कारण ASxL5T ची लिक्विड मीडियामध्ये विश्वसनीयरित्या संवर्धन करता येत नाही, जे सूचित करते की ते बायोफिल्म निर्मितीच्या जटिल जीवन चक्रावर अवलंबून असू शकते. तथापि, प्लेट सस्पेंशनने दर्शविले की ASxL5T एरोबिक आहे, ऑक्सिडेस आणि कॅटालेससाठी सकारात्मक आहे आणि 5% NaCl सहन करू शकते. ASxL5T 10 µg स्ट्रेप्टोमायसिनला प्रतिरोधक आहे, परंतु चाचणी केलेल्या इतर सर्व प्रतिजैविकांना संवेदनशील आहे. ASxL5T जिवाणू पेशींची तपासणी TEM द्वारे करण्यात आली (आकृती 1). BA वर शिकारी पेशींशिवाय वाढल्यावर, ASxL5T पेशी लहान कॅम्पिलोबॅक्टर असतात, त्यांची सरासरी लांबी 1.63 μm (± 0.4), रुंदी 0.37 μm (± 0.08), आणि एकच लांब (5 μm पर्यंत) पोल असते. लैंगिक फ्लॅगेला. अंदाजे 1.6% पेशींची रुंदी 0.2 μm पेक्षा कमी असल्याचे दिसून येते, जे फिल्टर उपकरणाद्वारे जाण्यास अनुमती देईल. फेअरिंग (लॅटिन क्युकुलस) प्रमाणेच काही पेशींच्या वर एक असामान्य संरचनात्मक विस्तार दिसून आला (1D, E, G मध्ये बाण पहा). हे अतिरिक्त बाह्य झिल्लीने बनलेले दिसते, जे पेरिप्लाज्मिक लिफाफ्याच्या आकारात झपाट्याने घट झाल्यामुळे असू शकते, तर बाह्य पडदा अबाधित राहतो, "सैल" स्वरूप दर्शवितो. ASxL5T पोषक तत्वांच्या अनुपस्थितीत (PBS मध्ये) 4°C वर दीर्घकाळ संवर्धन केल्याने बहुतेक (परंतु सर्व नाही) पेशी कॉकल मॉर्फोलॉजी (आकृती 1C) दर्शवितात. जेव्हा ASxL5T कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी सोबत 48 तास शिकार म्हणून वाढते, तेव्हा पेशींचा सरासरी आकार यजमानांशिवाय वाढलेल्या पेशींपेक्षा लक्षणीयरीत्या लांब आणि अरुंद असतो (सारणी 1 आणि आकृती 1E). याउलट, जेव्हा ASxL5T E. coli बरोबर 48 तास शिकार म्हणून वाढते, तेव्हा सेलचा सरासरी आकार हा शिकार न करता वाढतो तेव्हापेक्षा जास्त लांब आणि रुंद असतो (तक्ता 1), आणि सेलची लांबी परिवर्तनीय असते, सहसा फिलामेंटस (आकृती 1F) दर्शवते. कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी किंवा ई. कोलाईने 48 तास शिकार म्हणून उष्मायन केल्यावर, ASxL5T पेशींनी फ्लॅगेला अजिबात दाखवला नाही. तक्ता 1 ASxL5T च्या उपस्थिती, अनुपस्थिती आणि शिकार प्रकारावर आधारित सेल आकारातील बदलांचे निरिक्षण सारांशित करते.
ASx5LT चे TEM डिस्प्ले: (A) ASx5LT लांब चाबूक दाखवते; (ब) ठराविक ASx5LT बॅटरी; (C) पोषक तत्वांशिवाय दीर्घ उष्मायनानंतर cocci ASx5LT पेशी; (D) ASx5LT पेशींचा एक गट असामान्यता दर्शवितो (E) कॅम्पिलोबॅक्टर शिकार असलेल्या ASx5LT पेशींच्या गटाने शिकार वाढविल्याशिवाय पेशींच्या तुलनेत वाढलेली पेशींची लांबी दर्शविली (D) देखील शिखर रचना दर्शविली; (F) मोठ्या फिलामेंटस फ्लॅगेला, ASx5LT पेशी, E. coli शिकार सह उष्मायनानंतर; (G) E. coli सह उष्मायनानंतर एक एकल ASx5LT सेल, एक असामान्य शीर्ष रचना दर्शवितो. बार 1 μm दर्शवितो.
16S rRNA जनुक अनुक्रम (ॲक्सेसेशन क्रमांक MT636545.1) निर्धारित केल्याने गॅमाप्रोटोबॅक्टेरिया वर्गाप्रमाणेच क्रम स्थापित करण्यासाठी डेटाबेस शोध सक्षम होतो आणि सागरी स्पिरिलम कुटुंबातील (आकृती 2) सागरी जीवाणूंच्या सर्वात जवळचे असतात, आणि थॅसोलिटसचे सदस्य असतात. मरीनचा सर्वात जवळचा नातेवाईक बॅसिलस. 16S rRNA जनुक अनुक्रम Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) कुटुंबातील भक्षक जीवाणूंपेक्षा स्पष्टपणे भिन्न आहे. B. बॅक्टेरियोव्होरस HD100T (प्रकार स्ट्रेन, DSM 50701) आणि B. बॅक्टेरियोव्होरस DM11A ची जोडीनुसार तुलना 48.4% आणि 47.7% होती आणि B. एक्सोव्होरस JSS साठी ती 46.7% होती. ASxL5T बॅक्टेरियामध्ये 16S rRNA जनुकाच्या 3 प्रती असतात, त्यापैकी दोन एकमेकांशी एकसारखे असतात आणि तिसरे 3 बेस वेगळे असतात. दोन इतर शिकारी जिवाणू पृथक्करण (ASx5S आणि ASx5O; 16S rRNA जनुक प्रवेश क्रमांक अनुक्रमे MT636546.1 आणि MT636547.1 आहेत) एकाच ठिकाणाहून समान आकारविज्ञान आणि फेनोटाइपिक वैशिष्ट्यांसह एकसारखे नाहीत, परंतु ते बॅकटेरिअल आणि बॅकटेरिअल 5 पेक्षा वेगळे आहेत. डेटाबेस Oceanospirillaceae (आकृती 2) मधील इतर पिढ्यांसह अनुक्रम एकत्र केले जातात. ASxL5T चा संपूर्ण जीनोम क्रम NCBI डेटाबेसमध्ये निर्धारित आणि जतन केला गेला आहे आणि प्रवेश क्रमांक CP046056 आहे. ASxL5T च्या जीनोममध्ये 56.1% च्या G + C गुणोत्तरासह 2,831,152 bp च्या वर्तुळाकार गुणसूत्राचा समावेश आहे. जीनोम अनुक्रमात 2653 सीडीएस (एकूण) समाविष्ट आहेत, ज्यापैकी 2567 प्रथिने एन्कोड करण्याचा अंदाज आहे, त्यापैकी 1596 पुटेटिव्ह फंक्शन्स (60.2%) म्हणून नियुक्त केले जाऊ शकतात. जीनोममध्ये 67 आरएनए-कोडिंग जीन्स आहेत, ज्यात 9 आरआरएनए (5एस, 16एस आणि 23एससाठी प्रत्येकी 3) आणि 57 टीआरएनए समाविष्ट आहेत. ASxL5T च्या जीनोमिक वैशिष्ट्यांची तुलना 16S rRNA जनुक अनुक्रम (टेबल 2) वरून ओळखल्या गेलेल्या जवळच्या सापेक्ष प्रकारच्या स्ट्रेनच्या उपलब्ध जीनोमशी केली गेली. सर्व उपलब्ध थॅलासोलिटस जीनोमची ASxL5T शी तुलना करण्यासाठी अमिनो आम्ल ओळख (AAI) वापरा. AAI द्वारे निर्धारित केलेला सर्वात जवळचा उपलब्ध (अपूर्ण) जीनोम क्रम म्हणजे थॅलासोलिटस एसपी. C2-1 (NZ_VNIL01000001 जोडा). हा ताण मारियाना खंदकाच्या खोल-समुद्राच्या गाळापासून वेगळा करण्यात आला होता, परंतु तुलना करण्यासाठी सध्या या ताणाबद्दल कोणतीही फिनोटाइपिक माहिती नाही. ASxL5T च्या 2.82 Mb च्या तुलनेत, जीवाचा जीनोम 4.36 Mb वर मोठा आहे. सागरी स्पिरोचेट्सचा सरासरी जीनोम आकार सुमारे 4.16 Mb (± 1.1; n = 92 संपूर्ण संदर्भ जीनोम https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly वरून तपासला गेला), त्यामुळे ASxL5T चे जीनोम इतर सदस्यांच्या तुलनेत ऑर्डर खूपच कमी आहे. GToTree 1.5.54 चा वापर करून Gammaproteobacteria 11,12,13,165,14,172 एकल-कॉपी जनुकांच्या संरेखित आणि जोडलेल्या अमिनो ऍसिड अनुक्रमांचा वापर करून, जीनोम-आधारित अंदाजे जास्तीत जास्त संभाव्यता फिलोजेनेटिक ट्री (आकृती 3A) व्युत्पन्न करा. १७,१८. विश्लेषणात असे दिसून आले की ते थॅलासोलिटस, बॅक्टेरियल प्लेन आणि मरीन बॅक्टेरियम यांच्याशी जवळून संबंधित आहे. तथापि, हे डेटा सूचित करतात की ASxL5T हे मरीन स्पिरुलिनामधील त्याच्या नातेवाईकांपेक्षा वेगळे आहे आणि त्याचा जीनोम अनुक्रम डेटा उपलब्ध आहे.
16S rRNA जनुक अनुक्रम वापरून फायलोजेनेटिक वृक्ष ASxL5T, ASxO5 आणि ASxS5 स्ट्रेनची स्थिती (आतड्यांसह) सागरी स्पिरुलिनेसी मधील अशेषीत आणि सागरी जीवाणू स्ट्रेनच्या तुलनेत हायलाइट करते. Genbank प्रवेश क्रमांक कंसातील स्ट्रेन नावाचे अनुसरण करतो. क्रम संरेखित करण्यासाठी ClustalW चा वापर करा आणि फायलोजेनेटिक संबंधांचा अंदाज लावण्यासाठी जास्तीत जास्त संभाव्य पद्धती आणि Tamura-Nei मॉडेलचा वापर करा आणि MEGA X प्रोग्राममध्ये 1000 मार्गदर्शित प्रतिकृती करा. शाखेवरील संख्या सूचित करते की मार्गदर्शित प्रत मूल्य 50% पेक्षा जास्त आहे. Escherichia coli U/541T हे आउटग्रुप म्हणून वापरले गेले.
(A) जीनोमवर आधारित एक फायलोजेनेटिक वृक्ष, जो सागरी स्पायरोस्पायरेसी जीवाणू ASxL5T आणि त्याचे जवळचे नातेवाईक, E. coli U 5/41T यांच्यातील संबंध दर्शवितो. (B) T. oleivorans MIL-1T च्या तुलनेत, ASx5LT प्रोटीनच्या ऑर्थोलॉजस ग्रुप (COG) क्लस्टरच्या आधारे जनुकांच्या कार्यात्मक श्रेणी वितरणाचा अंदाज लावला जातो. डावीकडील आकृती प्रत्येक जीनोममधील प्रत्येक कार्यात्मक COG श्रेणीतील जनुकांची संख्या दर्शवते. उजवीकडील आलेख प्रत्येक कार्यात्मक COG गटामध्ये समाविष्ट असलेल्या जीनोमची टक्केवारी दर्शवितो. (C) T. oleiverans MIL-1T च्या तुलनेत, ASxL5T च्या संपूर्ण केईजीजी (क्योटो एनसायक्लोपीडिया ऑफ जीन्स अँड जीनोम्स) मॉड्यूलर मार्गाचे विश्लेषण.
ASxL5T जीनोममध्ये उपस्थित घटक जनुकांचे परीक्षण करण्यासाठी केईजीजी डेटाबेसचा वापर केल्याने एरोबिक गॅमा प्रोटीयसचा विशिष्ट चयापचय मार्ग उघड झाला. ASxL5T मध्ये जिवाणू मोटर प्रथिनांना नियुक्त केलेली एकूण 75 जीन्स आहेत, ज्यात केमोटॅक्सिस, फ्लॅगेला असेंब्ली आणि प्रकार IV फिम्ब्रिया प्रणालीमध्ये समाविष्ट असलेल्या जनुकांचा समावेश आहे. शेवटच्या श्रेणीमध्ये, 10 पैकी 9 जनुके इतर जीवांच्या चकचकीत हालचालीसाठी जबाबदार असतात. ASxL5T च्या जीनोममध्ये संपूर्ण टेट्राहाइड्रोपायरीमिडीन बायोसिंथेटिक मार्ग आहे जो ऑस्मोटिक तणाव 20 च्या संरक्षणात्मक प्रतिसादात भाग घेतो, हेलोफाइल्ससाठी अपेक्षेप्रमाणे. जीनोममध्ये रिबोफ्लेविन संश्लेषण मार्गांसह कोफॅक्टर्स आणि जीवनसत्त्वे यासाठी अनेक संपूर्ण मार्ग देखील समाविष्ट आहेत. ASxL5T मध्ये अल्केन 1-मोनोऑक्सिजनेज (alkB2) जनुक उपस्थित असला तरी, हायड्रोकार्बन वापराचा मार्ग पूर्ण नाही. ASxL5T च्या जीनोम क्रमामध्ये, T. oleiverans MIL-1T21 मधील हायड्रोकार्बन्सच्या ऱ्हासासाठी मुख्यत्वे जबाबदार म्हणून ओळखल्या जाणाऱ्या जनुकांचे होमोलॉग्स, जसे की TOL_2658 (alkB) आणि TOL_2772 (अल्कोहोल डिहायड्रोजनेज) हे स्पष्टपणे दिसून येते. आकृती 3B ASxL5T आणि ऑलिव्ह ऑइल MIL-1T मधील COG श्रेणीतील जनुक वितरणाची तुलना दर्शविते. एकूणच, लहान ASxL5T जीनोममध्ये मोठ्या संबंधित जीनोमच्या तुलनेत प्रत्येक COG श्रेणीतील प्रमाणानुसार कमी जीन्स असतात. जेव्हा प्रत्येक कार्यात्मक श्रेणीतील जनुकांची संख्या जीनोमची टक्केवारी म्हणून व्यक्त केली जाते, तेव्हा भाषांतरातील जीन्सची टक्केवारी, राइबोसोमल रचना आणि बायोजेनेसिस श्रेण्या आणि ऊर्जा उत्पादन आणि रूपांतरण कार्य श्रेणींमध्ये फरक लक्षात घेतला जातो, जे मोठ्या ASxL5T बनतात. जीनोम टक्केवारीची तुलना T. oleiverans MIL-1T जीनोममध्ये असलेल्या समान गटाशी केली जाते. याउलट, ASxL5T जीनोमच्या तुलनेत, T. oleivorans MIL-1T मध्ये प्रतिकृती, पुनर्संयोजन आणि दुरुस्ती आणि ट्रान्सक्रिप्शन श्रेणींमध्ये जनुकांची टक्केवारी जास्त आहे. विशेष म्हणजे, दोन जीनोमच्या प्रत्येक कार्यात्मक श्रेणीतील सामग्रीमधील सर्वात मोठा फरक म्हणजे ASxL5T (आकृती 3B) मध्ये उपस्थित अज्ञात जनुकांची संख्या. केईजीजी मॉड्यूल्सचे संवर्धन विश्लेषण केले गेले, जिथे प्रत्येक केईजीजी मॉड्यूल जीनोम अनुक्रम डेटाचे भाष्य आणि जैविक अर्थ लावण्यासाठी व्यक्तिचलितपणे परिभाषित कार्यात्मक युनिट्सचा संच दर्शवितो. ASxL5T आणि ऑलिव्ह MIL-1T च्या संपूर्ण KOG मॉड्यूल मार्गातील जनुक वितरणाची तुलना आकृती 3C मध्ये दर्शविली आहे. हे विश्लेषण असे दर्शविते की जरी ASxL5T मध्ये संपूर्ण सल्फर आणि नायट्रोजन चयापचय मार्ग आहे, T. oleiverans MIL-1T मध्ये नाही. याउलट, T. oleiverans MIL-1T मध्ये संपूर्ण सिस्टीन आणि मेथिओनाइन चयापचय मार्ग आहे, परंतु ASxL5T मध्ये तो अपूर्ण आहे. म्हणून, ASxL5T मध्ये सल्फेट आत्मसात करण्यासाठी एक वैशिष्ट्यपूर्ण मॉड्यूल आहे (जीन्सचा एक संच म्हणून परिभाषित जे फेनोटाइपिक मार्कर म्हणून वापरले जाऊ शकते, जसे की चयापचय क्षमता किंवा रोगजनकता; https://www.genome.jp/kegg/module.html) T मध्ये ओलिवेरन्स एमआयएल-1 टी. ASxL5T च्या जनुक सामग्रीची तुलना जीन्सच्या सूचीशी करणे जे शिकारी जीवनशैली सूचित करतात ते अनिर्णित आहे. जरी ओ अँटीजेन पॉलिसेकेराइडशी संबंधित लिगेस एन्कोडिंग waaL जनुक ASxL5T जीनोममध्ये उपस्थित आहे (परंतु अनेक ग्राम-नकारात्मक जीवाणूंमध्ये ते सामान्य आहे), ट्रिप्टोफॅन 2,3-डायऑक्सिजनेस (TDO) जनुकांमध्ये 60 एमिनोचा समावेश असू शकतो. आम्ल प्रदेश सामान्यतः शिकारी जीवाणूंमध्ये आढळतात जे उपस्थित नसतात. ASxL5T जीनोममध्ये इतर कोणतेही शिकारी वैशिष्ट्यपूर्ण जीन्स नाहीत, ज्यामध्ये मेव्हॅलोनेट मार्गामध्ये आयसोप्रीनॉइड बायोसिंथेसिसमध्ये सामील असलेल्या एन्कोडिंग एन्झाईमचा समावेश आहे. लक्षात घ्या की तपासलेल्या शिकारी गटामध्ये कोणतेही ट्रान्सक्रिप्शनल रेग्युलेटरी जीन जीएनटीआर नाही, परंतु ASxL5T मध्ये तीन जीएनटीआर सारखी जीन्स ओळखली जाऊ शकतात.
ASxL5T ची फिनोटाइपिक वैशिष्ट्ये सारणी 3 मध्ये सारांशित केली आहेत आणि साहित्यात नोंदवलेल्या संबंधित जनन 23, 24, 25, 26 आणि 27 च्या फेनोटाइपिक वैशिष्ट्यांशी तुलना केली आहे. T. marinus, T. olevorans, B. sanyensis आणि Oceanobacter kriegii मधील पृथक्करण सक्रिय, मीठ-सहिष्णु, ऑक्सिडेस-पॉझिटिव्ह रॉड-आकाराचे शरीर आहेत, परंतु ASxL5T सह इतर कोणतीही फिनोटाइपिक वैशिष्ट्ये नाहीत. समुद्राचा सरासरी pH 8.1 आहे (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77), जो T. marinus, T. olevorans, B. sanyensis आणि O मध्ये परावर्तित होतो. kriegii ASxL5T मोठ्या pH श्रेणीसाठी (4-9) वैशिष्ट्यपूर्ण गैर-सागरी प्रजातींसाठी योग्य आहे. थॅलासोलिटस एसपीची फिनोटाइपिक वैशिष्ट्ये. C2-1. अज्ञात. ASxL5T ची वाढ तापमान श्रेणी सामान्यतः सागरी स्ट्रेन (4–42 °C) पेक्षा जास्त असते, जरी काही परंतु सर्व T. marinus पृथक् उष्णता-सहिष्णु असतात. मटनाचा रस्सा मीडियामध्ये ASxL5T वाढण्यास असमर्थतेमुळे पुढील फिनोटाइपिक वैशिष्ट्यीकरण प्रतिबंधित होते. BA प्लेट, ONPG, आर्जिनिन डायहाइड्रोलेज, लाइसिन डिकार्बोक्लेझ, ऑर्निथिन डिकार्बोक्लेझ, सायट्रेट युटिलायझेशन, युरेस, ट्रिप्टोफॅन डीमिनेज, जिलेटिन हायड्रोलिसिस एन्झाईम, स्क्रॅप केलेल्या सामग्रीची चाचणी करण्यासाठी API 20E वापरा, चाचणीचे परिणाम सर्व नकारात्मक होते, परंतु एच 2 मध्ये कोणतेही प्रमाण निगेटिव्ह आले नाही. उत्पादन केले होते. आंबलेल्या कर्बोदकांमधे हे समाविष्ट आहे: ग्लुकोज, मॅनोज, इनॉसिटॉल, सॉर्बिटॉल, रॅमनोज, सुक्रोज, मेलिबायोज, अमिग्डालिन आणि अरेबिनोज. प्रकाशित संबंधित संदर्भ स्ट्रेनशी तुलना करता, ASxL5T स्ट्रेनचे सेल्युलर फॅटी ऍसिड प्रोफाइल टेबल 4 मध्ये दर्शविले आहे. मुख्य सेल्युलर फॅटी ऍसिड C16:1ω6c आणि/किंवा C16:1ω7c, C16:0 आणि C18:1ω9 आहेत. हायड्रोक्सी फॅटी ऍसिड C12:0 3-OH आणि C10:0 3-OH देखील अस्तित्वात आहेत. ASxL5T मध्ये C16:0 चे गुणोत्तर संबंधित पिढीच्या नोंदवलेल्या मूल्यापेक्षा जास्त आहे. याउलट, नोंदवलेल्या T. marinus IMCC1826TT च्या तुलनेत, ASxL5T मध्ये C18:1ω7c आणि/किंवा C18:1ω6c चे प्रमाण कमी झाले आहे. oleivorans MIL-1T आणि O. kriegii DSM 6294T, परंतु B. sanyensis KCTC 32220T मध्ये आढळले नाही. ASxL5T आणि ASxLS च्या फॅटी ऍसिड प्रोफाइलची तुलना केल्याने दोन प्रजातींमधील वैयक्तिक फॅटी ऍसिडच्या प्रमाणात सूक्ष्म फरक दिसून आला, जे समान प्रजातींच्या जीनोमिक डीएनए अनुक्रमाशी सुसंगत आहेत. सुदान ब्लॅक टेस्ट वापरून कोणतेही पॉली-3-हायड्रॉक्सीब्युटीरेट (PHB) कण आढळले नाहीत.
शिकारची श्रेणी निश्चित करण्यासाठी ASxL5T जीवाणूंच्या शिकार क्रियाकलापांचा अभ्यास केला गेला. हा जीवाणू कॅम्पिलोबॅक्टर प्रजातींवर फलक तयार करू शकतो, ज्यामध्ये खालील गोष्टींचा समावेश होतो: कॅम्पिलोबॅक्टर सुइस 11608T, कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी PT14, कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी 12662, कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी NCTC 11168T; Escherichia coli NCTC 12667; C. हेल्वेटिकस NCTC 12472; C lari NCTC 11458 आणि C. upsaliensis NCTC 11541T. ग्राम-नकारात्मक आणि ग्राम-पॉझिटिव्ह बॅक्टेरियांच्या विस्तृत श्रेणीची चाचणी करण्यासाठी पद्धतीच्या होस्ट श्रेणी निर्धारण विभागात सूचीबद्ध केलेल्या संस्कृतींचा वापर करा. परिणाम दर्शविते की ASxL5T चा वापर Escherichia coli NCTC 86 आणि Citrobacter freundii NCTC 9750T मध्ये देखील केला जाऊ शकतो. Klebsiella oxytoca 11466 वर तयार झालेले फलक. E. coli NCTC 86 सह TEM परस्परसंवाद आकृती 4A-D मध्ये दर्शविला आहे, आणि कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी PT14 आणि कॅम्पिलोबॅक्टर suis S12 सोबतचा परस्परसंवाद आकृती 4E-H मध्यभागी दर्शविला आहे. प्रत्येक ASxL5T सेलला एक किंवा अधिक E. coli पेशी जोडलेल्या आणि शोषणापूर्वी विस्तारित सेलच्या बाजूने स्थित असलेल्या शिकार प्रकारांमध्ये हल्ल्याची यंत्रणा वेगळी असल्याचे दिसते. याउलट, ASxL5T कॅम्पिलोबॅक्टरशी संपर्काच्या एकाच बिंदूद्वारे जोडलेले दिसते, सामान्यत: शिकारी पेशीच्या शिखराच्या संपर्कात आणि कॅम्पिलोबॅक्टर सेलच्या शिखराजवळ (आकृती 4H).
ASx5LT आणि शिकार यांच्यातील परस्परसंवाद दर्शवणारे TEM: (AD) आणि E. coli prey; (EH) आणि C. जेजुनी शिकार. (A) एक सामान्य ASx5LT सेल एकल E. coli (EC) सेलशी जोडलेला आहे; (ब) एकल EC सेलशी संलग्न एक फिलामेंटस ASx5LT; (C) एक फिलामेंटस ASx5LT सेल एकाधिक EC पेशींना जोडलेला आहे; (डी) संलग्नक लहान ASx5LT पेशी एकाच E. coli (EC) सेलवर; (ई) कॅम्पिलोबॅक्टर जेजुनी (सीजे) सेलशी जोडलेला एकच ASx5LT सेल; (F) ASx5LT C. hyointestinalis (CH) पेशींवर हल्ला करतो; (G) दोन एक ASx5LT सेलने CJ सेलवर हल्ला केला; (H) ASx5LT संलग्नक बिंदूचे क्लोज-अप दृश्य, CJ सेलच्या शिखराजवळ (बार 0.2 μm). बार 1 μm in (A-G) दर्शवतो.
शिकारीच्या मुबलक स्त्रोतांचा फायदा घेण्यासाठी शिकारी जीवाणू विकसित झाले आहेत. अर्थात, ते वेगवेगळ्या वातावरणात मोठ्या प्रमाणावर उपस्थित असतात. लोकसंख्येच्या सदस्यांच्या अरुंद आकारामुळे, फेज सेपरेशन पद्धतीचा वापर करून स्लरीमधून ASxL5T जीवाणू वेगळे करणे शक्य आहे. सागरी जीवाणूंच्या oceanospirillaceae कुटुंबातील सदस्यांसाठी ASxL5T ची जीनोमिक प्रासंगिकता आश्चर्यकारक आहे, जरी जीव मीठ-सहिष्णु आहे आणि 5% मीठ असलेल्या माध्यमावर वाढू शकतो. स्लरीच्या पाण्याच्या गुणवत्तेच्या विश्लेषणात सोडियम क्लोराईडचे प्रमाण 0.1% पेक्षा कमी असल्याचे दिसून आले. त्यामुळे, भौगोलिक आणि रासायनिक दोन्ही दृष्ट्या-सागरी वातावरणापासून चिखल खूप दूर आहे. एकाच स्त्रोतापासून तीन संबंधित परंतु भिन्न विलगांची उपस्थिती पुरावा देते की हे शिकारी या गैर-सागरी वातावरणात भरभराट करत आहेत. याव्यतिरिक्त, मायक्रोबायोम विश्लेषण (डेटा फाईल्स https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990 वरून उपलब्ध आहे) दर्शविते की समान 16S rRNA जनुक क्रम शीर्ष 50 सर्वात मुबलक ऑपरेशनल टॅक्सामध्ये स्थित आहे (OTU ) चिखलाच्या काही नमुन्याच्या अंतराने. जेनबँक डेटाबेसमध्ये अनेक असंस्कृत जीवाणू आढळले, ज्यात ASxL5T जीवाणू प्रमाणे 16S rRNA जनुक अनुक्रम आहेत. हे क्रम, ASxL5T, ASxS5 आणि ASxO5 च्या अनुक्रमांसह, थॅलासोलिटस आणि ओशनोबॅक्टर (आकृती 2) पासून विभक्त झालेल्या वेगवेगळ्या क्लेड्सचे प्रतिनिधित्व करतात असे दिसते. 2009 मध्ये दक्षिण आफ्रिकेच्या सोन्याच्या खाणीत तीन प्रकारचे असंस्कृत जीवाणू (GQ921362, GQ921357 आणि GQ921396) 1.3 किलोमीटर खोलीवर विदारक पाण्यापासून वेगळे केले गेले आणि इतर दोन (DQ256320 आणि DQ2000 ग्राउंड दक्षिण आफ्रिकेतील) मध्ये 2005). 16S rRNA जनुक अनुक्रम ASxL5T शी सर्वात जवळून संबंधित आहे हा 16S rRNA जनुक अनुक्रमाचा भाग आहे जो 2006 मध्ये उत्तर फ्रान्सच्या समुद्रकिनाऱ्यांवरून प्राप्त झालेल्या वालुकामय गाळाच्या संवर्धन संस्कृतीतून प्राप्त झाला आहे (ॲक्सेसन क्रमांक AM29240828). असंस्कृत जीवाणू HQ183822.1 पासून जवळून संबंधित आणखी एक 16S rRNA जनुक अनुक्रम चीनमधील म्युनिसिपल लँडफिलमधून लीच केलेल्या संकलन टाकीमधून प्राप्त झाला. साहजिकच, ASxL5T जीवाणू वर्गीकरणीय डेटाबेसमध्ये उच्च प्रतिनिधी नसतात, परंतु असंस्कृत जीवाणूंचे हे अनुक्रम ASxL5T सारख्या जीवांचे प्रतिनिधित्व करतात, जे सामान्यतः आव्हानात्मक वातावरणात जगभरात वितरीत केले जातात. संपूर्ण जीनोम फायलोजेनेटिक विश्लेषणावरून, ASxL5T चे सर्वात जवळचे नातेवाईक थॅलासोलिटस sp आहे. C2-1, T. marinus, T. oleivorans. आणि O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. थॅलासोलिटस हा सागरी बंधनकारक हायड्रोकार्बन फ्रॅगमेंटेशन बॅक्टेरिया (OHCB) चा सदस्य आहे, जो सागरी आणि स्थलीय वातावरणात व्यापक आहे आणि सामान्यतः हायड्रोकार्बन प्रदूषणाच्या घटनांनंतर प्रबळ होतो,3103. सागरी जीवाणू OHCB गटाचे सदस्य नाहीत, परंतु ते सागरी वातावरणापासून वेगळे आहेत.
फेनोटाइपिक डेटा सूचित करतो की ASxL5T ही एक नवीन प्रजाती आहे आणि सागरी स्पायरोस्पायरेसी कुटुंबातील पूर्वीच्या अपरिचित वंशातील सदस्य आहे. नवीन वंशाचे नवीन वंशामध्ये वर्गीकरण करण्यासाठी सध्या कोणतेही स्पष्ट मानक नाही. सार्वभौमिक वंशाच्या सीमा निश्चित करण्यासाठी प्रयत्न केले गेले आहेत, उदाहरणार्थ, पुराणमतवादी प्रथिने (POCP) च्या जीनोमच्या टक्केवारीवर आधारित, कट-ऑफ मूल्य संदर्भ स्ट्रेन 33 प्रमाणे 50% समान असावे अशी शिफारस केली जाते. इतर एएआय मूल्ये वापरण्याचा सल्ला देतात, ज्याचे POCP पेक्षा फायदे आहेत कारण ते अपूर्ण जीनोममधून मिळू शकतात34. लेखकाचा असा विश्वास आहे की जर मॉडेल प्रजातींच्या मॉडेल स्ट्रेनच्या तुलनेत AAI मूल्य 74% पेक्षा कमी असेल, तर हा ताण वेगळ्या पिढीचा प्रतिनिधी आहे. सागरी स्पिरिलासी मधील मॉडेल वंश सागरी स्पिरिलम आहे आणि मॉडेल स्ट्रेन O. लिनम ATCC 11336T आहे. ASxL5T आणि O. linum ATCC 11336T मधील AAI मूल्य 54.34% आहे, आणि ASxL5T आणि T. oleivorans MIL-1T (जीनस प्रकार स्ट्रॅन्स) मधील AAI मूल्य 67.61% आहे, हे दर्शविते की ASxL5T हे थालास वंशाच्या वेगळ्या जातीचे प्रतिनिधित्व करते. वर्गीकरण मानक म्हणून 16S rRNA जनुक क्रम वापरून, सूचित जीनस सीमांकन सीमा 94.5%35 आहे. ASxL5T थॅलासोलिटस वंशामध्ये ठेवली जाऊ शकते, 95.03% 16S rRNA अनुक्रम ओळख दर्शविते T. oleivorans MIL-1T आणि 96.17%. marinus IMCC1826T. तथापि, ते B. sanyensis NV9 सह 94.64% 16S rRNA जनुक ओळख असलेल्या बॅक्टेरॉइड्स जीनसमध्ये देखील ठेवले जाईल, हे दर्शविते की 16S rRNA जनुक सारख्या एकाच जनुकाच्या वापरामुळे अनियंत्रित वर्गीकरण आणि असाइनमेंट होऊ शकते. दुसरी सुचविलेली पद्धत ANI आणि Genome Alignment Score (AF) चा वापर करून सर्व प्रकारच्या डेटा पॉइंट्सच्या क्लस्टरिंगचे परीक्षण करते आणि सध्याच्या पिढीतील गैर-प्रकार स्ट्रेन. लेखकाने विश्लेषण केल्या जाणाऱ्या टॅक्सासाठी विशिष्ट अनुमानित वंशाच्या वळण बिंदूसह जीनस सीमा एकत्र करण्याची शिफारस केली आहे. तथापि, थॅलासोलिटस पृथक्यांतून पुरेसा पूर्ण जीनोम अनुक्रम नसल्यास, या पद्धतीद्वारे ASxL5T हे थॅलासोलिटस वंशाचे आहे की नाही हे निर्धारित करणे अशक्य आहे. विश्लेषणासाठी संपूर्ण जीनोम अनुक्रमांच्या मर्यादित उपलब्धतेमुळे, संपूर्ण जीनोम फायलोजेनेटिक वृक्षाचा सावधगिरीने अर्थ लावला पाहिजे. दुसरे म्हणजे, संपूर्ण जीनोम तुलना पद्धती तुलना केलेल्या जीनोमच्या आकारात लक्षणीय फरक दर्शवू शकत नाहीत. त्यांनी संबंधित पिढ्यांमधील संरक्षित कोर सिंगल-कॉपी जीन्सची समानता मोजली, परंतु ASxL5T च्या अगदी लहान जीनोममध्ये नसलेल्या मोठ्या संख्येने जनुकांचा विचार केला नाही. साहजिकच, ASxL5T आणि थॅलासोलिटुअस, ओशनोबॅक्टर आणि बॅक्टेरियोप्लॅन्ससह गटांमध्ये समान पूर्वज आहे, परंतु उत्क्रांतीने वेगळा मार्ग स्वीकारला आहे, ज्यामुळे जीनोममध्ये घट झाली आहे, जी कदाचित शिकारी जीवनशैलीशी जुळवून घेईल. हे T. oleivorans MIL-1T च्या विरुद्ध आहे, जे 28% मोठे आहे आणि हायड्रोकार्बन्स 23,30 वापरण्यासाठी विविध पर्यावरणीय दबावाखाली विकसित झाले आहे. रिकेटसिया, क्लॅमिडीया आणि बुकनेरा सारख्या बंधनकारक इंट्रासेल्युलर परजीवी आणि प्रतिकांसह एक मनोरंजक तुलना केली जाऊ शकते. त्यांचा जीनोम आकार सुमारे 1 Mb आहे. यजमान पेशींच्या चयापचयांचा वापर करण्याच्या क्षमतेमुळे जनुकांचे नुकसान होते, म्हणून महत्त्वपूर्ण उत्क्रांती जीनोमिक ऱ्हास झाला. समुद्री रासायनिक पोषक जीवांपासून शिकारी जीवनशैलीत उत्क्रांतीवादी बदलांमुळे जीनोम आकारात समान घट होऊ शकते. COG आणि KEGG विश्लेषण विशिष्ट कार्यांसाठी वापरल्या जाणाऱ्या जनुकांची संख्या आणि ASxL5T आणि T. oleivorans MIL-1T मधील जीनोमिक मार्गांमधील जागतिक फरक हायलाइट करते, जे मोबाइल अनुवांशिक घटकांच्या व्यापक उपलब्धतेमुळे नाही. ASxL5T च्या संपूर्ण जीनोममधील G + C गुणोत्तरातील फरक 56.1% आहे आणि T. oleivorans MIL-1T मधील फरक 46.6% आहे, जे देखील ते वेगळे असल्याचे सूचित करते.
ASxL5T जीनोमच्या कोडिंग सामग्रीची तपासणी फेनोटाइपिक वैशिष्ट्यांमध्ये कार्यात्मक अंतर्दृष्टी प्रदान करते. IV fimbriae (Tfp) एन्कोडिंग प्रकारातील जनुकांची उपस्थिती विशेष स्वारस्यपूर्ण आहे कारण ते पृष्ठभागावर फ्लॅगेला नसतानाही पेशींच्या हालचालींना प्रोत्साहन देतात, ज्याला सोशल ग्लाइडिंग किंवा आक्षेप म्हणतात. अहवालानुसार, Tfp ची इतर कार्ये आहेत, ज्यात शिकार, पॅथोजेनेसिस, बायोफिल्म निर्मिती, नैसर्गिक DNA अपटेक, स्वयंचलित सेल एकत्रीकरण आणि विकास यांचा समावेश आहे. ASxL5T जीनोममध्ये 18 जीन्स एन्कोडिंग diguanylate cyclase (एक एन्झाइम जे 2 guanosine triphosphate चे guanosine 2 phosphate आणि cyclic diGMP मध्ये रूपांतरित करते) आणि संबंधित diguanylate cyclase एन्कोडिंग करणारी 6 जीन्स असतात. एस्टेरेसचे जनुक (सायक्लिक डी-जीएमपी ते ग्वानोसिन मोनोफॉस्फेटचे ऱ्हास उत्प्रेरक करणे) मनोरंजक आहे कारण सायकल-डी-जीएमपी हा बायोफिल्म विकास आणि पृथक्करण, हालचाली, पेशी संलग्नक आणि विषाणू 39, 40 या प्रक्रियेत गुंतलेला एक महत्त्वाचा दुसरा संदेशवाहक आहे. हे देखील लक्षात घेतले पाहिजे की Bdellovibrio bacteriovorus मध्ये, चक्रीय दुहेरी GMP मुक्त जीवन आणि शिकारी जीवनशैली 41 मधील संक्रमण नियंत्रित करण्यासाठी दर्शविले गेले आहे.
शिकारी जीवाणूंवरील बहुतेक संशोधन Bdellovibrio, Bdellovibrio-सारखे जीव आणि Myxococcus प्रजातींवर केंद्रित आहे. शिकारी जीवाणूंची ही आणि इतर ज्ञात उदाहरणे विविध गट तयार करतात. ही विविधता असूनही, 11 ज्ञात शिकारी जीवाणूंच्या फेनोटाइपचे प्रतिबिंब दर्शविणारे वैशिष्ट्यपूर्ण प्रथिने कुटुंबांचे संच 3,22 ओळखले गेले आहेत. तथापि, केवळ O antigen ligase (waaL) एन्कोडिंग जनुक ओळखले गेले आहेत, जे विशेषतः ग्राम-नकारात्मक जीवाणूंमध्ये सामान्य आहे. विश्लेषणाचा हा प्रकार ASxL5T ला शिकारी म्हणून नियुक्त करण्यात उपयुक्त नाही, कारण कदाचित तो एक नवीन हल्ला धोरण वापरतो. अधिक वैविध्यपूर्ण शिकारी जिवाणू जीनोमची उपलब्धता गट सदस्यांमधील कार्यात्मक आणि पर्यावरणीय फरकांचे पुरावे विचारात घेणारे सूक्ष्म रिझोल्यूशन विश्लेषण विकसित करण्यात मदत करेल. या विश्लेषणात समाविष्ट नसलेल्या भक्षक जीवाणूंच्या उदाहरणांमध्ये कपरियाविडस नेकेटर 42 आणि ब्रॅडीमोनॅबॅक्टेरिया 43 सदस्यांचा समावेश आहे, कारण संशोधक विविध सूक्ष्मजीव समुदायांची तपासणी करत असताना, अधिक शिकारी टॅक्स स्थापित केला जातो.
TEM प्रतिमेद्वारे कॅप्चर केलेल्या ASxL5T बॅक्टेरियाचे सर्वात उल्लेखनीय वैशिष्ट्य म्हणजे त्याचे अद्वितीय आणि लवचिक आकारविज्ञान, जे शिकार जीवाणूंसह परस्परसंवादाला प्रोत्साहन देऊ शकते. पाहिल्या गेलेल्या परस्परसंवादाचा प्रकार इतर शिकारी जीवाणूंपेक्षा वेगळा आहे आणि पूर्वी शोधला गेला नाही किंवा नोंदवला गेला नाही. प्रस्तावित ASxL5T शिकारी जीवनचक्र आकृती 5 मध्ये दर्शविले आहे. आम्ही येथे नोंदवल्याप्रमाणे समान शिखर रचना असलेल्या साहित्यात काही उदाहरणे आहेत, परंतु या उदाहरणांमध्ये टेरासाकीस्पिरा पापहानोमोकुएकेन्सिस, अधूनमधून शिखर वाढणारा सागरी स्पिरिलम बॅक्टेरियम 44, आणि अल्फाप्रोटीला, टेरासाकीस्पिरा, टेरासाकीस्पिरा पॅपॅहॅनोमोकुएन्सिस यांचा समावेश आहे. , पूर्वी वंशाशी संबंधित Oceanospirillum, प्रदर्शित तथाकथित "ध्रुवीय फिल्म" 45. जुन्या संस्कृतींमध्ये कोकीचे स्वरूप अनेकदा पाळले जाते, विशेषत: व्हिब्रिओ, कॅम्पिलोबॅक्टर आणि हेलिकोबॅक्टर 46, 47, 48 सारख्या वक्र फॉर्म असलेल्या जीवाणूंसाठी, जे एखाद्या अवकृष्ट स्थितीचे प्रतिनिधित्व करू शकतात. ASxL5T जीवाणूंचे अचूक जीवनचक्र स्पष्ट करण्यासाठी पुढील कार्य करणे आवश्यक आहे. ते कसे पकडते आणि शिकार कसे करते आणि त्याचा जीनोम वैद्यकीय किंवा जैवतंत्रज्ञानासाठी वापरल्या जाणाऱ्या जैविक दृष्ट्या सक्रिय संयुगे एन्कोड करतो की नाही हे निर्धारित करण्यासाठी.
व्हेनेटरबॅक्टर जननचे वर्णन. नोव्हेंबर व्हेनेटरबॅक्टर (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. हे L. n. venator,'Hunter' आणि Gr. n. bacter,'a rod'. Venatorbacter,'a Hunting Rod' मधील व्हेनेटर्सचे बनलेले आहे. . पेशी एरोबिक, मीठ-सहिष्णु, वक्र ग्राम डाग नकारात्मक, व्यायाम रॉड आणि ऑक्सिडेस क्रियाकलाप सकारात्मक आहेत. पीएचबी 4 ते 42 डिग्री सेल्सिअस तापमानात जमा होत नाही :1ω7c, C16:0 आणि C18:1ω9; C12:0 3-OH आणि C10:0 3-OH हे ब्रॉथ मीडियामध्ये वाढत नाहीत. कुटुंब या वंशाची फायलोजेनेटिक स्थिती कुटुंबात आहे.
व्हेनेटरबॅक्टर ककुलस एसपीचे वर्णन. नोव्हेंबर व्हेनेटरबॅक्टर कुकुलस (cu'cull.us.; L. n. cucullus म्हणजे फेअरिंग).
या व्यतिरिक्त, या वंशाचे वर्णनात्मक वैशिष्ट्य म्हणजे जेव्हा BA किंवा BHI वर वाढतात तेव्हा पेशी 1.63 µm लांब आणि 0.37 µm रुंद असतात. BHI आगरवरील वसाहती खूप लहान आहेत, 72 तासांनंतर 2 मिमी व्यासापर्यंत पोहोचतात. ते बेज, अर्धपारदर्शक, गोल, बहिर्वक्र आणि चमकदार आहेत. या प्रजातीचे सदस्य Escherichia coli आणि Klebsiella वापरू शकतात. कॅम्पिलोबॅक्टर आणि इतर अनेक ग्राम-नकारात्मक जीवाणू शिकार म्हणून काम करतात.
नॉटिंगहॅमशायर, यूके मधील गोमांस दुधापासून विशिष्ट स्ट्रेन ASxL5T वेगळे केले गेले आणि नॅशनल टाईप कल्चर कलेक्शन (यूके) मध्ये जमा केले गेले: प्रवेश क्रमांक NCTC 14397 आणि नेदरलँड्स बॅक्टेरियल कल्चर कलेक्शन (NCCB) प्रवेश क्रमांक NCCB 1007 TheequomeTGen 1007 पूर्ण. केले आहे CP046056 च्या जोडणीनुसार Genbank मध्ये जमा केले.
फेज आयसोलेशन तंत्रज्ञान ९,४९ वापरून ASxL5T जीवाणू गोमांस दुधापासून वेगळे केले गेले. स्लरी SM बफरमध्ये 1:9 (w/v) पातळ करण्यात आली (50 mM Tris-HCl [pH 7.5], 0.1 M NaCl, 8 mM MgSO4.7H2O आणि 0.01% जिलेटिन; सिग्मा अल्ड्रिच, गिलिंगहॅम, यूके), नंतर इनक्यूबेट करा 24 तासांसाठी 4°C वर, एल्युट करण्यासाठी हळूहळू फिरत आहे बफर मध्ये शिकारी. निलंबन 3 मिनिटांसाठी 3000g वर सेंट्रीफ्यूज केले गेले. 5 मिनिटांसाठी दुसऱ्यांदा 13,000 ग्रॅम वर सुपरनॅटंट गोळा करून सेंट्रीफ्यूज करण्यात आले. त्यानंतर सर्व उरलेल्या जिवाणू पेशी काढून टाकण्यासाठी 0.45 µm मेम्ब्रेन फिल्टर (मिनिसार्ट; सारटोरियस, गॉटिंगेन, जर्मनी) आणि 0.2 µm मेम्ब्रेन फिल्टर (मिनिसार्ट) मधून सुपरनॅटंट पास केले गेले. ASxL5T हे फिल्टर पास करू शकते. त्याच स्लरीपासून कॅम्पिलोबॅक्टर एन्टरोसस S12 (NCBI ऍक्सेसन नंबर CP040464) चे मऊ अगर लॉन मानक तंत्र वापरून तयार केले गेले. फिल्टर केलेली स्लरी या प्रत्येक होस्ट सेल प्लेट्सवर 10 μl थेंबांमध्ये तिप्पट स्वरूपात वितरीत केली गेली आणि कोरडे होऊ दिले. प्लेट मायक्रोएरोबिक परिस्थितीत (5% O2, 5% H2, 10% CO2, आणि 80% N2) 48 तासांसाठी 37° सेल्सिअस तापमानात मायक्रोएरोफिलिक टाकीमध्ये उबविण्यात आली होती. प्राप्त झालेला दृश्य फलक एसएम बफरमध्ये काढण्यात आला आणि सी. हायोइंटेस्टिनालिस S12 च्या ताज्या लॉनमध्ये लाइसेड जीवांचा अधिक प्रसार करण्यासाठी हस्तांतरित करण्यात आला. जीवाणू हे लाइटिक प्लेकचे कारण आहेत आणि फेजचे कारण नाही हे निश्चित झाल्यावर, यजमानापासून स्वतंत्रपणे जीव वाढवण्याचा प्रयत्न करा आणि त्याचे वैशिष्ट्य बनवा. एरोबिक कल्चर 5% v/v डिफिब्रिनेटेड घोड्याच्या रक्ताने (TCS बायोसायन्सेस लेफ्टनंट, बकिंगहॅम, यूके, सप्लीमेंट) 37 °C वर केले गेले. नॅशनल क्लिनिकल स्टँडर्ड्स कमिटीच्या मार्गदर्शक तत्त्वांनुसार, बॅक्टेरियाच्या वाढीस प्रतिबंध करणारा पदार्थ संवेदनशीलता चाचणीसाठी डिस्क प्रसार पद्धत वापरली जाते. एरोबिक कल्चरसाठी खालील प्रतिजैविक (ऑक्सॉइड) असलेली डिस्क वापरून बीएचआय आगर 37 डिग्री सेल्सिअस तापमानात संवर्धन केले गेले: अमोक्सिसिलिन आणि क्लेव्हुलॅनिक ऍसिड 30 µg; cefotaxime 30 µg; स्ट्रेप्टोमायसिन 10 μg; ciprofloxacin 5 µg; Ceftazidime 30 µg Nalidixic acid 30 µg; इमिपेनेम 10 µg; अजिथ्रोमाइसिन 15 µg; क्लोरोम्फेनिकॉल 30 μg; सेफॉक्सिटिन 30 μg; टेट्रासाइक्लिन 30 μg; नायट्रोफुरंटोइन 300 μg; अझ्ट्रोनम 30 µg; एम्पिसिलीन 10 μg; Cefpodoxime 10 µg; ट्रायमेथोप्रिम-सल्फामेथॉक्साझोल 25 µg. बीएचआय आगर प्लेट्सवर 37 डिग्री सेल्सियस तापमानात एरोबिक उष्मायनाद्वारे मीठ सहनशीलता स्थापित केली गेली. BHI आगर प्लेट्समध्ये 10% w/v पर्यंत एकाग्रता श्रेणी प्रदान करण्यासाठी अतिरिक्त NaCl जोडले गेले. बीएचआय अगर प्लेट्सवरील एरोबिक कल्चरद्वारे pH श्रेणी 37°C वर निर्धारित केली जाते, जेथे pH श्रेणी निर्जंतुक HCl किंवा निर्जंतुकीकरण NaOH सह 4 आणि 9 दरम्यान समायोजित केली जाते आणि प्लेट ओतण्यापूर्वी लक्ष्य pH मूल्य सत्यापित केले जाते. सेल्युलर फॅटी ऍसिड विश्लेषणासाठी, ASxL5T BHI आगर वर 3 दिवस आणि एरोबिक 37 °C वर संवर्धन केले गेले. एफईआरए सायन्स लिमिटेड, (यॉर्क, यूके) च्या MIDI (शेरलॉक मायक्रोबियल आयडेंटिफिकेशन सिस्टम, आवृत्ती 6.10) मानक प्रोटोकॉलनुसार, सेल फॅटी ऍसिड काढले, तयार केले आणि विश्लेषण केले गेले.
TEM साठी, ASxL5T ला BA वर 37°C वर 24 तास एकसमान पसरवून एरोबिक संवर्धित केले गेले, आणि नंतर खोलीच्या तपमानावर 0.1 M cacodylate बफरमध्ये 1 मिली 3% (v/v) ग्लूटाराल्डिहाइडमध्ये कापणी केली गेली, 1 तासासाठी निश्चित करा, नंतर सेंट्रीफ्यूज करा 3 मिनिटांसाठी 10,000 ग्रॅम वर. नंतर हळुवारपणे 600 μl 0.1 M कॅकोडायलेट बफरमध्ये गोळ्याला पुन्हा सस्पेंड करा. फिक्स्ड ASxL5T सस्पेंशन फॉर्मवर/कार्बन फिल्ममध्ये 200 मेश कॉपर ग्रिडवर स्थानांतरित करा. जीवाणू 0.5% (w/v) युरेनिल एसीटेटने 1 मिनिटासाठी डागलेले होते आणि TEI Tecnai G2 12 Biotwin मायक्रोस्कोप वापरून TEM द्वारे तपासले गेले. वर नमूद केल्याप्रमाणे, NZCYM मटनाचा रस्सा (BD Difco™, Fisher Scientific UK Ltd, Loughborough) मध्ये शिकार आणि शिकारीची समान संख्या एकत्र करा आणि कॅम्पिलोबॅक्टर किंवा कॅम्पिलोबॅक्टरच्या मायक्रोएरोबिक परिस्थितीत 37 डिग्री सेल्सिअस तापमानात 48 तास उष्मायन करा, शिकारी आणि शिकारीचा परस्परसंवाद. TEM द्वारे देखील तपासले गेले. Escherichia coli साठी एरोबिक परिस्थिती. शिकारीमुळे सेल मॉर्फोलॉजीमध्ये कोणतेही बदल निश्चित करण्यासाठी शिकार आणि भक्षक जीवाणूंचे स्वतंत्रपणे परीक्षण करा. सुदान ब्लॅक पद्धत PHB संचयनाच्या ऑप्टिकल मायक्रोस्कोपीसाठी वापरली गेली.
ASxL5T रात्रभर बीएचआय किंवा बीए प्लेट्सवर निर्जंतुकीकरण स्राव वापरून वाढवा. ASxL5T पेशी गोळा करा आणि त्यांना MRD (CM0733, Oxoid) मध्ये निलंबित करा आणि नंतर पेशींना उपाशी ठेवण्यासाठी 7 दिवसांसाठी 4°C वर ठेवा. NCTC संदर्भ किंवा प्रयोगशाळेतील स्टॉक बॅक्टेरियल कल्चर BHI मटनाचा रस्सा किंवा क्रमांक 2 पोषक मटनाचा रस्सा (CM007, ऑक्सॉइड) मध्ये टोचण्यात आला, रात्रभर उष्मायन केले गेले, 13,000g वर सेंट्रीफ्यूज केले गेले आणि OD600 0.4 पर्यंत MRD मध्ये पुन्हा निलंबित केले गेले. संस्कृती: बॅसिलस सबटिलिस NCTC 3610T, Citrobacter freundii NCTC 9750T, Enterobacter aerogenes NCTC 10006T, Enterococcus faecalis NCTC 775T, Escherichia coli NCTC 86, Klebnostocyella6NCTC, Lebnostoccox14TC 10817, लिस्टेरिया स्पेशल बॅक्टेरिया NCTC 4885, Bacillus macerans NCTC 6355T, Providencia stuartsii NCTC 10318, Pseudomonas fluorescens SMDL, Rhodococcus पाणबुडी हॅम्बर्गर NCTC 1621T मधील मोनटेडेलेस्टिनाल 4885 टी, सॅल्मोनटेला 4885 टी. mucilage NCTC 10861, Staphylococcus aureus NCTC 8532T, Streptococcus pneumoniae NCTC 7465T, Yersinia enterocolitica NCTC 10460. कॅम्पिलोबॅक्टर यजमान BA 7 3 एसपीएड 3 एसपीएड प्लेट्समध्ये BA °C आणि एनसीटीएम प्लेट्समध्ये मायक्रोएरोबिकली उष्मायनित होते. चाचणी केलेले कॅम्पिलोबॅक्टर यजमान आहेत: C. coli 12667 NCTC, C. jejuni 12662, C. jejuni PT14, C. jejuni NCTC 11168T, C. helveticus NCTC 12472, C. lari NCTC 11458, C.5NCTC 11458, C.5NCTC. PT14, C... MRD मध्ये पेशी गोळा करा, 13,000g वर सेंट्रीफ्यूज करा आणि OD600 0.4 होईपर्यंत MRD मध्ये पुन्हा सस्पेंड करा. 5 मिली वितळलेल्या NZCYM टॉप आगर (0.6% आगर) मध्ये 0.5 मिली सस्पेन्शनचा ॲलिकोट जोडा आणि 1.2% NZCYM तळाच्या प्लेटवर घाला. क्युअरिंग आणि वाळवल्यानंतर, अनुक्रमे पातळ केलेले ASxL5T प्रत्येक लॉन बोर्डवर 20 μl थेंब म्हणून तिप्पट स्वरूपात वितरित केले गेले. कल्चर तापमान आणि वातावरण चाचणी जीवाणूंच्या गरजांवर अवलंबून असते.
GenElute™ बॅक्टेरियल जीनोमिक DNA किट (सिग्मा अल्ड्रिज) वापरा जिवाणू अलगाव पासून DNA तयार करण्यासाठी. डाई टर्मिनेशन केमिस्ट्री (युरोफिन व्हॅल्यू रीड सर्व्हिस, जर्मनी) वापरून 16S rRNA जनुकाचे PCR प्रवर्धन आणि उत्पादन अनुक्रम निर्धार करण्यासाठी मानक पद्धती वापरल्या गेल्या. या अनुक्रमांची तुलना इतर 16S rRNA जनुक अनुक्रमांशी जवळून संबंधित प्रजाती ओळखण्यासाठी आणि गोळा करण्यासाठी BLAST-N प्रोग्राम वापरा. हे MEGA X प्रोग्राममध्ये ClustalW वापरून संरेखित केले आहेत. 1000 मार्गदर्शित प्रतींसह, Tamura-Nei मॉडेलवर आधारित जास्तीत जास्त शक्यता पद्धती वापरून MEGA X वापरून फाइलोजेनेटिक झाडाची पुनर्रचना करण्यात आली. संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमासाठी DNA काढण्यासाठी PureLink™ जीनोमिक DNA किट (फिशर सायंटिफिक, लॉफबरो, यूके) वापरा. ASxL5T चा जीनोम क्रम Illumina MiSeq संयोजन वापरून निर्धारित केला गेला, ज्यामध्ये 250 bp डबल-एंडेड रीड्स असतात ज्यात नेक्स्टेरा लेबलिंग किट वापरून तयार केलेली लायब्ररी आणि PacBio प्लॅटफॉर्मवरून 2 ते 20 kb लांब रीड्स असतात. सेम्बिया विद्यापीठात जीनोमिक्स डीएनए सिक्वेन्सिंग संशोधन सुविधा. सीएलसी जीनोमिक्स वर्कबेंच 12.0.3 (कियाजेन, आरहस, डेन्मार्क) वापरून जीनोम एकत्र केले गेले. ASxL5T संस्कृती नॅशनल टाइप कल्चर कलेक्शन (यूके) आणि नेदरलँड्स बॅक्टेरियल कल्चर कलेक्शन (NCCB) मध्ये जमा केल्या जातात. तुलना करण्यासाठी वापरल्या जाणाऱ्या संबंधित जीवांचे जीनोम असे आहेत: थॅलासोलिटस ऑलिव्होरान्स एमआयएल-1टी (ॲक्सेसन क्रमांक HF680312, पूर्ण); बॅक्टेरियोप्लेनेस सॅन्येन्सिस KCTC 32220T (ॲक्सेसेशन नंबर BMYY01000001, अपूर्ण); Oceanobacter kriegii DSM 6294T (एक्सेसेशन नंबर NZ_AUGV00000000, अपूर्ण); Marinamonas समुदाय DSM 5604T (जोडले ASM436330v1, अपूर्ण), Oceanospirullum linum ATCC 11336T (जोडले MTSD02000001, अपूर्ण) आणि Thalassolituus sp. C2-1 (NZ_VNIL01000001 जोडा, अपूर्ण). संरेखन स्कोअर (AF) आणि सरासरी न्यूक्लिक ॲसिड ओळख (ANI) निर्धारित करण्यासाठी https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= येथे JGI जीनोम पोर्टल36 वापरा. जोड्यांमध्ये. एमिनो ॲसिड ओळख (AAI) निश्चित करण्यासाठी Rodriguez-R & Konstantinidis55 ची पद्धत वापरली गेली. GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 अंदाजे जास्तीत जास्त संभाव्य फिलोजेनेटिक ट्री निर्माण करण्यासाठी वापरा. उपलब्ध संदर्भ जीनोमचे प्रतिनिधित्व करणारा इनपुट जीनोम 16S rRNA फायलोजेनी मधील ASxL5T शी संबंधित म्हणून ओळखल्या जाणाऱ्या संदर्भ जनरामधून निवडला जातो. इंटरएक्टिव्ह ट्री ऑफ लाईफ ऑनलाइन टूल (https://itol.embl.de/) वापरून झाडावर भाष्य केले. ASxL5T जीनोमचे कार्यात्मक भाष्य आणि विश्लेषण केईजीजी (क्योटो एनसायक्लोपीडिया ऑफ जीन्स अँड जीनोम्स) मॉड्यूल समृद्धी वितरण वापरून ब्लास्टकोआला केईजीजी ऑनलाइन साधन वापरून केले जाते. COG श्रेणींचे वितरण (ऑर्थोलॉगस गट) eggNOG-mapper ऑनलाइन साधन वापरून निर्धारित केले जाते.
पेरेझ, जे., मोरालेडा-मुनोझ, ए., मार्कोस-टोरेस, एफजे आणि मुनोझ-डोराडो, जे. बॅक्टेरियाची शिकार: 75 वर्षे आणि ते सुरूच आहे! . वातावरण सूक्ष्मजीव 18, 766–779 (2016).
Linares-Otoya, L. इ. पेरूच्या किनारपट्टीवर भक्षक जीवाणूंची विविधता आणि प्रतिजैविक क्षमता. मार्च औषधे. 15. E308. https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017).
Pasternak, Z. et al. त्यांच्या जीन्सद्वारे, तुम्ही त्यांना समजू शकाल: शिकारी जीवाणूंची जीनोमिक वैशिष्ट्ये. ISME J. 7, 756–769 (2013).
सॉकेट, आरई बॅक्टेरियोफेज बीडेलोविब्रिओची शिकारी जीवनशैली. स्थापित करा. पास्टर सूक्ष्मजीव. ६३, ५२३–५३९ (२००९).
कॉर्प, जे., वेला गुरोविक, एमएस आणि नेट, एम. शिकारी जीवाणूपासून प्रतिजैविक. बेलस्टीन जे. हिस्टोकेमिस्ट्री 12, 594–607 (2016).
Johnke, J., Fraune, S., Bosch, TCG, Hentschel, U. आणि Schulenburg, H. Bdellovibrio आणि तत्सम जीव वेगवेगळ्या यजमान लोकसंख्येतील मायक्रोबायोम विविधतेचे भाकीत करणारे आहेत. सूक्ष्मजीव इकोलॉजी. ७९, २५२–२५७ (२०२०).
विला, जे., मोरेनो-मोरालेस, जे. आणि बॅलेस्टे-डेल्पिएरे, सी. नवीन बॅक्टेरियाच्या वाढीस प्रतिबंध करणारा पदार्थ एजंट्सची सद्यस्थिती शोधा. क्लिनिकल सूक्ष्मजीव संसर्ग. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019).
Hobley, L. et al. फेज आणि फेजची दुहेरी शिकार E. coli च्या शिकारीला एकच शिकार न करता नष्ट करू शकते. जे. बॅक्टेरिया. 202, e00629-19. https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020).
El-Shibiny, A., Connerton, PL आणि Connerton, IF फ्री-रेंज आणि सेंद्रिय कोंबडीच्या आहार चक्रादरम्यान कॅम्पिलोबॅक्टर आणि बॅक्टेरियोफेजेसची संख्या आणि विविधता वेगळी केली जाते. अर्ज वातावरण. सूक्ष्मजीव ७१, १२५९–१२६६ (२००५).
विल्किन्सन, डीए इ. कॅम्पिलोबॅक्टर स्वाइनचे जीनोमिक वर्गीकरण आणि महामारीविज्ञान अद्यतनित करा. विज्ञान प्रतिनिधी 8, 2393. https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018).
ली, MD GToTree: सिस्टम्स जीनोमिक्ससाठी वापरकर्ता-अनुकूल कार्यप्रवाह. बायोइन्फॉरमॅटिक्स 35, 4162–4164 (2019).
एडगर, आरसी मसल: एक एकाधिक अनुक्रम संरेखन पद्धत जी वेळ आणि जागेची जटिलता कमी करते. बीएमसी जैविक माहिती. 5, 113 (2004).
Capella-Gutierrez, S., Silla-Martínez, JM & Gabaldón, T. TrimAl: मोठ्या प्रमाणात फायलोजेनेटिक विश्लेषणामध्ये स्वयंचलित संरेखन आणि ट्रिमिंगसाठी एक साधन. बायोइन्फॉरमॅटिक्स 25, 1972-1973 (2009).
Hyatt, D., LoCascio, PF, Hauser, LJ & Uberbacher, EC जनुक आणि metagenomic sequence translation start site prediction. बायोइन्फर्मेटिक्स 28, 2223-2230 (2012).
शेन, डब्ल्यू. आणि झिओंग, जे. टॅक्सनकिट: क्रॉस-प्लॅटफॉर्म आणि कार्यक्षम NCBI वर्गीकरण टूलकिट. बायो Rxiv. (1 जून 2021 रोजी ऍक्सेस केलेले); https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019).
किंमत, MN, Dehal, PS & Arkin, AP FastTree 2-मोठ्या संरेखनासह अंदाजे जास्तीत जास्त शक्यता असलेले झाड. PLOS One 5, e9490 (2010).
टांगे, O. GNU समांतर. (1 जून 2021 रोजी ऍक्सेस केलेले); https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018).
Kanehisa, M. & Goto, S. KEGG: क्योटो एनसायक्लोपीडिया ऑफ जीन्स अँड जीनोम्स. न्यूक्लिक ॲसिड संशोधन. 28, 27-30 (2000).
झेक प्रजासत्ताक, एल. इ. एक्स्ट्रोमोलाइट्स एक्टोइन आणि हायड्रॉक्सीक्टोइनची भूमिका तणाव संरक्षक आणि पोषक म्हणून: आनुवंशिकी, प्रणाली जीनोमिक्स, बायोकेमिस्ट्री आणि संरचनात्मक विश्लेषण. जीन (बेसल). 9. E177. https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018).
Gregson, BH, Metodieva, G., Metodiev, MV, Golyshin, PN & McKew, BA विभेदक प्रथिने अभिव्यक्ती बंधनकारक सागरी हायड्रोकार्बन-डिग्रेजिंग बॅक्टेरियम थॅलासोलिटस ऑलिव्होरन्स एमआयएल-1 मध्यम आणि लांब साखळी अल्केनेसच्या वाढीदरम्यान. समोर सूक्ष्मजीव 9, 3130 (2018).
Pasternak, Z., Ben Sasson, T., Cohen, Y., Segev, E., आणि Jurkevitch, E. फेनोटाइपिक-विशिष्ट निर्देशक परिभाषित करण्यासाठी एक नवीन तुलनात्मक जीनोमिक्स पद्धत शिकारी जीवाणू चिन्हात विशिष्ट वारसा प्रकट करते. सार्वजनिक विज्ञान ग्रंथालय एक. 10. e0142933. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015).
याकिमोव्ह, एमएम, इ. थॅलासोलिटस ऑलिव्होरान्स जनुक. नोव्हेंबर, सप. nov., हायड्रोकार्बन्सच्या वापरामध्ये माहिर असलेल्या सागरी जीवाणूंचा एक नवीन प्रकार. आंतरराष्ट्रीयत्व जे. सिस्टम. उत्क्रांती सूक्ष्मजीव ५४, १४१–१४८ (२००४).
वांग, वाय., यू, एम., लिऊ, वाई., यांग, एक्स. आणि झांग, एक्सएच बॅक्टेरियोप्लॅनोइड्स पॅसिफिकम जेन. नोव्हेंबर, सप. नोव्हेंबरमध्ये, ते दक्षिण पॅसिफिकमध्ये फिरणाऱ्या समुद्राच्या पाण्यापासून वेगळे झाले. आंतरराष्ट्रीयत्व जे. सिस्टम. उत्क्रांती सूक्ष्मजीव 66, 5010–5015 (2016).