ဂရမ်-အနုတ်လက္ခဏာ၊ အေရိုးဗစ်၊ ဆားဒဏ်ခံနိုင်သော၊ တက်ကြွသော၊ တုတ်ချောင်းပုံသဏ္ဍာန်နှင့် သားကောင်ပေါက်တတ်သော ဘက်တီးရီးယား ASxL5T ကို အင်္ဂလန်နိုင်ငံ၊ Nottinghamshire ရှိ နွားချေးကန်မှ သီးခြားခွဲထုတ်ပြီး ၎င်း၏သားကောင်အဖြစ် Campylobacter ကို အသုံးပြုခဲ့သည်။ နောက်ပိုင်းတွင် အခြားသော Campylobacter မျိုးစိတ်များနှင့် Enterobacteriaceae မျိုးနွယ်ဝင်များကို သားကောင်အဖြစ် ရှာဖွေတွေ့ရှိခဲ့သည်။ သားအိမ်ဆဲလ်များမပါဘဲ ယဉ်ကျေးမှုခွဲပြီးနောက်တွင် ဦးနှောက်နှလုံးသွင်းဖျော်ရည်တွင် အားနည်းသောပိုးမွှားကြီးထွားမှုကို ရရှိခဲ့သည်။ အကောင်းဆုံးကြီးထွားမှုအခြေအနေမှာ ၃၇ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်ဖြစ်ပြီး pH သည် 7 ဖြစ်သည်။ Transmission electron microscopy သည် သားကောင်ရရှိမှုနှင့်ပတ်သက်သည့် အလွန်ပုံမှန်မဟုတ်သော အသွင်အပြင်လက္ခဏာအချို့ကို တွေ့ရှိခဲ့သည်။ အထီးကျန်မှုသည် Marine Spirulina မိသားစု၏ အဖွဲ့ဝင်တစ်ဦးနှင့် သက်ဆိုင်ကြောင်း 16S rRNA ဗီဇအစီအစဥ်ကို အသုံးပြု၍ Phylogenetic ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် ဖော်ပြခဲ့သည်၊ သို့သော် လူသိများသော genus ၏ အဖွဲ့ဝင်အဖြစ် ရှင်းရှင်းလင်းလင်း မခွဲခြားနိုင်ပါ။ ASxL5T ၏ ဂျီနိုအာလုံး စီစစ်မှုသည် အဏ္ဏဝါ spirochetes အဖွဲ့ဝင်များနှင့် ဆက်စပ်မှုကို အတည်ပြုခဲ့သည်။ ဒေတာဘေ့စ်ရှာဖွေမှုတစ်ခုတွင် ASxL5Ts အများအပြားသည် 16S rRNA ဗီဇအစီအစဥ်များကို သမုဒ္ဒရာ၊ ကုန်းမြေမျက်နှာပြင်နှင့် မြေအောက်ရေတို့မှ မမွေးမြူနိုင်သော ဘက်တီးရီးယားများစွာဖြင့် မျှဝေကြောင်း တွေ့ရှိရပါသည်။ မျိုးစိတ်သစ် ASxL5T သည် မျိုးစိတ်အသစ်ကို ကိုယ်စားပြုသည်ဟု ကျွန်ုပ်တို့အကြံပြုအပ်ပါသည်။ Venatorbacter cucullus gen အမည်ကို ကျွန်ုပ်တို့ အကြံပြုအပ်ပါသည်။ နိုဝင်ဘာ၊ sp နိုဝင်ဘာလတွင် ASxL5T ကို အမျိုးအစား strain အဖြစ် အသုံးပြုခဲ့သည်။
Predatory bacteria များသည် biosynthetic ပစ္စည်းများနှင့် စွမ်းအင်များရရှိရန် အခြားသက်ရှိဘက်တီးရီးယားများကို လိုက်လံသတ်ဖြတ်နိုင်သည့် စွမ်းရည်ပြသသည့် ဘက်တီးရီးယားများဖြစ်သည်။ ၎င်းသည် သေဆုံးသွားသော အဏုဇီဝသက်ရှိများ၏ ယေဘုယျအားဖြင့် အာဟာရပြန်လည်ရရှိခြင်းနှင့် ကွာခြားပြီး ၎င်းသည် ဘက်တီးရီးယားများကို မသတ်ဘဲ ၎င်းတို့၏အိမ်ရှင်နှင့် နီးကပ်သောဆက်ဆံရေးရှိသည့် ကပ်ပါးတုံ့ပြန်မှုများနှင့်လည်း ကွာခြားပါသည်။ သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားများသည် ၎င်းတို့တွေ့ရှိသည့်နေရာများတွင် ပေါများသောအစားအစာအရင်းအမြစ်များ (အဏ္ဏဝါနေထိုင်ရာများကဲ့သို့) ကို အခွင့်ကောင်းယူရန် မတူညီသောဘဝသံသရာများ ပြောင်းလဲလာကြသည်။ ၎င်းတို့သည် ၎င်းတို့၏ထူးခြားသော ပိုးသတ်ခြင်းဘဝစက်ဝန်း 1 ဖြင့်သာ ချိတ်ဆက်ထားသော လူမျိုးစုအလိုက် ကွဲပြားသောအုပ်စုဖြစ်သည်။ ပရိုတီယိုဘက်တီးရီးယား၊ ဘက်တီးရီးယား နှင့် ကလိုရီလာ.၃ အပါအဝင် မတူညီသော phyla အများအပြားတွင် သားကောင်များကို ဖမ်းစားနိုင်သော ဘက်တီးရီးယား နမူနာများကို တွေ့ရှိထားသည်။ သို့သော် ကောင်းစွာလေ့လာထားသော သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားအများစုမှာ Bdellovibrio နှင့် Bdellovibrio နှင့်တူသောသက်ရှိများ (BALOs4) ဖြစ်သည်။ ကျက်စားသော ဘက်တီးရီးယားများသည် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ တက်ကြွသောဒြပ်ပေါင်းများနှင့် ဘက်တီးရီးယားပိုးမွှားများကို ဆန့်ကျင်ဘက်တီးရီးယားအသစ်များ၏ အလားအလာရှိသော အရင်းအမြစ်တစ်ခုဖြစ်သည်။
သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားများသည် အဏုဇီဝမျိုးစုံမျိုးကွဲများကို မြှင့်တင်ပေးပြီး ဂေဟစနစ်ကျန်းမာရေး၊ ကုန်ထုတ်စွမ်းအားနှင့် တည်ငြိမ်မှုတို့အပေါ် အပြုသဘောဆောင်သော သက်ရောက်မှုများရှိသည်ဟု ယုံကြည်ကြသည်။ ဤအပြုသဘောဆောင်သည့် အရည်အချင်းများရှိနေသော်လည်း၊ ဘက်တီးရီးယားများ မွေးမြူရန် ခက်ခဲခြင်းနှင့် ၎င်းတို့၏ ရှုပ်ထွေးသော ဘဝသံသရာများကို နားလည်ရန် ဆဲလ်အပြန်အလှန် ဆက်သွယ်မှုများကို ဂရုတစိုက် စောင့်ကြည့်လေ့လာရန် လိုအပ်သောကြောင့် သားကောင်များ ဘက်တီးရီးယားအသစ်များနှင့် ပတ်သက်၍ လေ့လာမှုအနည်းငယ်သာ ရှိသေးသည်။ ဒီအချက်အလက်တွေကို ကွန်ပြူတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကနေ ရရှိဖို့ မလွယ်ပါဘူး။
ပိုးသတ်ဆေးယဉ်ပါးမှု တိုးများလာသည့်ခေတ်တွင်၊ ဘက်တီးရီးယားပိုးမွှားများကို ပစ်မှတ်ထားရန် ဗျူဟာအသစ်များဖြစ်သည့် ဘက်တီးရီးယားပိုးမွှားများကို အသုံးပြုခြင်းနှင့် သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယား ၇၊၈ တို့ကို အသုံးပြုခြင်းကဲ့သို့သော ဗျူဟာသစ်များကို လေ့လာလျက်ရှိသည်။ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများကို 2019 ခုနှစ်တွင် သီးခြားခွဲထုတ်ခဲ့ပြီး University of Nottingham, Nottinghamshire ရှိ နွားချေးမှ စုဆောင်းထားသော နွားချေးမှ phage isolation နည်းပညာကို အသုံးပြုခဲ့သည်။ စုံစမ်းစစ်ဆေးမှု၏ ရည်ရွယ်ချက်မှာ ဇီဝထိန်းချုပ်မှု အေးဂျင့်များအဖြစ် အလားအလာရှိသော သက်ရှိများကို သီးခြားခွဲထုတ်ရန်ဖြစ်သည်။ Campylobacter hyointestinalis သည် လူ့အူလမ်းကြောင်းဆိုင်ရာ ရောဂါများနှင့် ပိုမိုဆက်စပ်နေသည့် zoonotic ရောဂါပိုးတစ်မျိုးဖြစ်သည်။ ၎င်းကို သွေးရည်ကြည်တွင် နေရာအနှံ့တွင်ရှိပြီး ပစ်မှတ်အိမ်ရှင်အဖြစ် အသုံးပြုသည်။
ASxL5T ဘက်တီးရီးယားကို အမဲသားဂျယ်လီနှင့် ခွဲထုတ်ထားသောကြောင့် C. hyointestinalis ၏မြက်ခင်းပြင်တွင် ဖြစ်ပေါ်သော plaque များသည် bacteriophages မှထုတ်သော အမျိုးအစားများနှင့် ဆင်တူကြောင်း တွေ့ရှိရသောကြောင့်ဖြစ်သည်။ phage isolation လုပ်ငန်းစဉ်၏ တစ်စိတ်တစ်ပိုင်းအနေဖြင့် ဘက်တီးရီးယားဆဲလ်များကို ဖယ်ရှားရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည့် 0.2 µm စစ်ထုတ်မှုမှတစ်ဆင့် စစ်ထုတ်ခြင်းပါ၀င်သောကြောင့် ၎င်းသည် မမျှော်လင့်ထားသောတွေ့ရှိမှုတစ်ခုဖြစ်သည်။ plaque မှထုတ်နုတ်သည့်ပစ္စည်းကို အဏုကြည့်စစ်ဆေးခြင်းတွင် သေးငယ်သော gram-negative curved rod-shaped ဘက်တီးရီးယားများသည် polyhydroxybutyrate (PHB) မစုပုံထားကြောင်း တွေ့ရှိရပါသည်။ သားကောင်ဆဲလ်များ ကင်းစင်သော ပိုးသတ်ဆေးယဉ်ကျေးမှုကို ကြွယ်ဝသော အစိုင်အခဲအလယ်အလတ် (ဥပမာ- ဦးနှောက်နှလုံးသွင်းဖျော်ရည်ဖျော်ရည် (BHI) နှင့် သွေးပိုးမွှား (BA)) တွင် သိရှိပြီး ၎င်း၏ကြီးထွားမှု အားနည်းသည်။ ၎င်းသည် လေးလံသော inoculum တိုးတက်ကောင်းမွန်သဖြင့် ယဉ်ကျေးမှုခွဲပြီးနောက် ရရှိသည်။ ၎င်းသည် microaerobic (7% v/v အောက်ဆီဂျင်) နှင့် လေထုအောက်ဆီဂျင်အခြေအနေများအောက်တွင် အညီအမျှ ကောင်းစွာကြီးထွားသော်လည်း anaerobic လေထုထဲတွင် မရှိပါ။ 72 နာရီကြာပြီးနောက်၊ ကိုလိုနီ၏အချင်းသည် အလွန်သေးငယ်ပြီး 2 မီလီမီတာအထိရှိပြီး ၎င်းသည် အဝါနုရောင်ရှိသော၊ ဖောက်ပြန်၊ အဝိုင်း၊ ခုံးနှင့် တောက်ပြောင်နေပါသည်။ ASxL5T အား အရည်မီဒီယာတွင် ယုံကြည်စိတ်ချစွာ မွေးမြူနိုင်ခြင်းမရှိသောကြောင့် စံဇီဝဓာတုစမ်းသပ်မှုကို အဟန့်အတားဖြစ်စေပြီး ၎င်းသည် ဇီဝဖလင်ဖွဲ့စည်းခြင်း၏ ရှုပ်ထွေးသောဘဝသံသရာအပေါ်တွင် မှီခိုနေနိုင်သည်ဟု အကြံပြုထားသည်။ သို့သော်၊ ပန်းကန်ဆိုင်းထိန်းစနစ်သည် ASxL5T သည် အေရိုးဗစ်၊ oxidase နှင့် catalase အတွက် အပေါင်းလက္ခဏာဖြစ်ပြီး 5% NaCl ကို ခံနိုင်ရည်ရှိကြောင်း ပြသခဲ့သည်။ ASxL5T သည် 10 µg streptomycin ကို ခံနိုင်ရည်ရှိသော်လည်း စမ်းသပ်ထားသည့် အခြားသော ပဋိဇီဝဆေးများအားလုံးတွင် ထိလွယ်ရှလွယ်ဖြစ်သည်။ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားဆဲလ်များကို TEM (ပုံ 1) ဖြင့် စစ်ဆေးခဲ့သည်။ BA တွင် သားကောင်ဆဲလ်များမပါဘဲ ကြီးထွားလာသောအခါ ASxL5T ဆဲလ်များသည် ပျမ်းမျှအလျား 1.63 μm (± 0.4)၊ အကျယ် 0.37 μm (± 0.08) နှင့် အရှည် (5 μm) အထိ ဝါးလုံးတစ်လုံးသာရှိသည်။ လိင်ပိုင်းဆိုင်ရာ flagella ။ ခန့်မှန်းခြေအားဖြင့် ဆဲလ်များ၏ 1.6% သည် 0.2 μm ထက်နည်းသော အကျယ်ရှိပုံပေါ်သည်၊ ၎င်းသည် စစ်ထုတ်ကိရိယာမှတဆင့် ဖြတ်သန်းနိုင်မည်ဖြစ်သည်။ ပုံမှန်မဟုတ်သော ဖွဲ့စည်းတည်ဆောက်ပုံဆိုင်ရာ အဆက်အစပ်ကို ဆဲလ်အချို့၏ထိပ်တွင် တွေ့ရသည်မှာ မျှား (လက်တင် ကျူကုလာ) (1D၊ E, ​​G တွင် မြှားများကိုကြည့်ပါ)။ ၎င်းသည် ပိုလျှံနေသော အပြင်ဘက်အမြှေးပါးဖြင့် ဖွဲ့စည်းထားပုံရပြီး၊ ၎င်းသည် periplasmic စာအိတ်၏ အရွယ်အစား လျင်မြန်စွာ လျော့ကျသွားခြင်းကြောင့် ဖြစ်နိုင်ပြီး အပြင်ဘက်အမြှေးပါးသည် နဂိုအတိုင်း ကျန်ရှိနေကာ "ဖြည်" သည့် အသွင်အပြင်ကို ပြသနေသည်။ 4°C တွင် အာဟာရဓာတ်များ (PBS တွင်) အချိန်ကြာမြင့်စွာမရှိခြင်း၌ ASxL5T ကို မွေးမြူခြင်းသည် ဆဲလ်အများစု (သို့သော်အားလုံးမဟုတ်) coccal morphology (ပုံ 1C) ကိုပြသသည့်ရလဒ်ဖြစ်သည်။ ASxL5T သည် ၄၈ နာရီကြာ သားကောင်အဖြစ် Campylobacter jejuni နှင့် ကြီးထွားလာသောအခါ၊ ပျမ်းမျှဆဲလ်အရွယ်အစားသည် အိမ်ရှင်မပါဘဲ ကြီးထွားလာသည့်ဆဲလ်များထက် သိသိသာသာ ပိုရှည်သည် (ဇယား 1 နှင့် ပုံ 1E)။ ဆန့်ကျင်ဘက်အနေနှင့်၊ ASxL5T သည် သားကောင်အဖြစ် ၄၈ နာရီကြာ E. coli ဖြင့် ကြီးထွားလာသောအခါ၊ ပျမ်းမျှဆဲလ်အရွယ်အစားသည် သားကောင်မပါဘဲ ကြီးထွားလာသောအခါ (ဇယား 1) ထက် ပိုရှည်ပြီး ဆဲလ်အလျားသည် ပြောင်းလဲနိုင်သည်၊ အများအားဖြင့် အမျှင်များထွက်နေသည် (ပုံ 1F)။ Campylobacter jejuni သို့မဟုတ် E. coli ဖြင့် သားကောင်အဖြစ် ၄၈ နာရီကြာ ပေါက်ဖွားသောအခါ ASxL5T ဆဲလ်များသည် flagella လုံးဝမပြပါ။ ဇယား 1 သည် ASxL5T ၏တည်ရှိမှု၊ မရှိမှုနှင့် သားကောင်အမျိုးအစားအပေါ်အခြေခံ၍ ဆဲလ်အရွယ်အစားပြောင်းလဲမှုများ၏ လေ့လာတွေ့ရှိချက်များကို အကျဉ်းချုပ်ဖော်ပြသည်။
ASx5LT ၏ TEM မျက်နှာပြင်- (A) ASx5LT သည် ရှည်လျားသော ကြာပွတ်ကို ပြသသည်။ (ခ) ပုံမှန် ASx5LT ဘက်ထရီ၊ (ဂ) cocci ASx5LT ဆဲလ်များသည် အာဟာရမရှိဘဲ ကြာရှည်စွာပေါက်ဖွားပြီးနောက်၊ (ဃ) ASx5LT ဆဲလ်အုပ်စုတစ်ခုသည် မူမမှန်မှုကိုပြသခြင်း (E) Campylobacter သားကောင်ဖြင့်ပေါက်ဖွားသော ASx5LT ဆဲလ်အုပ်စုသည် သားကောင်ကြီးထွားမှုမရှိသော (D) နှင့်နှိုင်းယှဉ်ပါက ဆဲလ်အရှည်ကိုပြသခဲ့သည် (စ) E. coli သားကောင်ဖြင့် ပေါက်ဖွားပြီးနောက် ကြီးမားသော Filamentous flagella၊ ASx5LT ဆဲလ်များ၊ (ဆ) E. coli ဖြင့်ပေါက်ဖွားပြီးနောက် တစ်ခုတည်းသော ASx5LT ဆဲလ်တစ်ခုသည် ပုံမှန်မဟုတ်သော ထိပ်တန်းဖွဲ့စည်းပုံကိုပြသသည်။ ဘားသည် 1 μm ကိုကိုယ်စားပြုသည်။
16S rRNA မျိုးရိုးဗီဇအစီအစဥ်ကို သတ်မှတ်ခြင်း (အသုံးပြုခွင့်နံပါတ် MT636545.1) သည် ဒေတာဘေ့စ်ရှာဖွေမှုများကို Gammaproteobacteria အတန်းအစားရှိ အလားတူအစီအစဥ်များကို ဖော်ထုတ်နိုင်စေပြီး marine spirillum မိသားစု (ပုံ 2) တွင် အဏ္ဏဝါဘက်တီးရီးယားများနှင့် အနီးစပ်ဆုံးဖြစ်ပြီး gen Thalasussolituus ၏ အဖွဲ့ဝင်များဖြစ်သည်။ Marine Bacillus နှင့် အနီးစပ်ဆုံးဆွေမျိုး။ 16S rRNA မျိုးရိုးဗီဇအစီအစဥ်သည် Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) မိသားစုတွင်ရှိသော သားကောင်များဖြစ်သော သားရဲဘက်တီးရီးယားများနှင့် သိသိသာသာကွဲပြားသည်။ B. bacteriovorus HD100T (အမျိုးအစား strain၊ DSM 50701) နှင့် B. bacteriovorus DM11A တို့၏ အတွဲလိုက် နှိုင်းယှဉ်ချက်များမှာ 48.4% နှင့် 47.7% ရှိပြီး B. exovorus JSS အတွက် 46.7% ဖြစ်သည်။ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားတွင် 16S rRNA ဗီဇ၏ မိတ္တူ 3 ခု ရှိသည်၊ နှစ်ခုသည် တစ်ခုနှင့်တစ်ခု တူညီနေပြီး တတိယတစ်ခုသည် အခြေ 3 ခု ခြားသည်။ အခြားသော ရိုင်းစိုင်းသော ဘက်တီးရီးယား အထီးကျန် နှစ်ခု (ASx5S နှင့် ASx5O; 16S rRNA ဗီဇပါဝင်မှု နံပါတ်များသည် MT636546.1 နှင့် MT636547.1 အသီးသီး) အသီးသီး) တူညီသော တည်နေရာမှ ရုပ်ပုံသဏ္ဍာန်နှင့် ဖီနိုတီပီသွင်ပြင်လက္ခဏာများသည် တူညီကြသည်မဟုတ်ပါ၊ သို့သော် ၎င်းတို့သည် ASxtured နှင့် မတူကွဲပြားသော Bacterial နှင့် ကွဲပြားပါသည်။ database sequence များကို အခြားသော genera များနှင့်အတူ စုစည်းထားသည်။ Oceanospirillaceae (ပုံ 2)။ ASxL5T ၏ genome sequence တစ်ခုလုံးကို NCBI ဒေတာဘေ့စ်တွင် ဆုံးဖြတ်ပြီး သိမ်းဆည်းထားပြီး ချိတ်ဆက်မှုနံပါတ်မှာ CP046056 ဖြစ်သည်။ ASxL5T ၏ ဂျီနိုမီတွင် G+C အချိုး 56.1% ရှိသော စက်ဝိုင်းခရိုမိုဆုန်း 2,831,152 bp ပါဝင်သည်။ ဂျီနိုမ်အစီအစဥ်တွင် 2653 CDS (စုစုပေါင်း) ပါ၀င်ပြီး ၎င်းတို့အနက် 2567 ခုသည် ပရိုတင်းများကို encode လုပ်ရန် ခန့်မှန်းထားပြီး ၎င်းတို့ထဲမှ 1596 ခုကို putative functions (60.2%) အဖြစ် သတ်မှတ်ပေးနိုင်ပါသည်။ ဂျီနိုမ်တွင် rRNA 9 မျိုး (5S၊ 16S နှင့် 23S အတွက် 3 ခုစီ) နှင့် 57 tRNA အပါအဝင် RNA-coding gene 67 ခု ပါရှိသည်။ ASxL5T ၏ မျိုးဗီဇဝိသေသလက္ခဏာများကို 16S rRNA မျိုးရိုးဗီဇအစီအစဉ် (ဇယား 2) မှဖော်ထုတ်ထားသော အနီးစပ်ဆုံးဆွေမျိုးအမျိုးအစား၏ရရှိနိုင်သောမျိုးကွဲမျိုးကွဲများနှင့် နှိုင်းယှဉ်ခဲ့သည်။ ရရှိနိုင်သော Thalassolituus ဂျီနိုမ်အားလုံးကို ASxL5T နှင့် နှိုင်းယှဉ်ရန် အမိုင်နိုအက်ဆစ်အထောက်အထား (AAI) ကိုသုံးပါ။ AAI မှသတ်မှတ်ထားသော အနီးစပ်ဆုံးရရှိနိုင်သော (မပြည့်စုံသော) ဂျီနိုမ်စီးရီးသည် Thalassolituus sp ဖြစ်သည်။ C2-1 (NZ_VNIL01000001) ကိုထည့်ပါ။ ဤမျိုးကွဲကို Mariana Trench ၏ပင်လယ်ရေနက်အနည်အနှစ်များမှ သီးခြားခွဲထုတ်ထားသော်လည်း ယခုအချိန်တွင် နှိုင်းယှဉ်ရန်အတွက် ဤမျိုးကွဲနှင့်ပတ်သက်သည့် phenotypic အချက်အလက်မရှိပါ။ ASxL5T ၏ 2.82 Mb နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက သက်ရှိ၏ genome သည် 4.36 Mb တွင် ပိုကြီးသည်။ marine spirochetes ၏ပျမ်းမျှဂျီနိုမ်အရွယ်အစားသည် 4.16 Mb ခန့် (± 1.1; n = 92 အပြည့်အစုံကို https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly မှ စုံစမ်းထားသည်)၊ ထို့ကြောင့် ASxL5T ၏ ဂျီနိုမ်သည် ၎င်းနှင့် ကိုက်ညီပါသည်။ အခြားအဖွဲ့ဝင်များနှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက အလွန်သေးငယ်ပါသည်။ GToTree 1.5.54 ကို အသုံးပြု၍ Gammaproteobacteria 11,12,13,14,14,15,16 ၏ တစ်ခုတည်းသော ဗီဇ 11,12,13,14,14,15,16၊ ၁၇ ၊၁၈။ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအရ ၎င်းသည် Thalassolituus၊ Bacterial Plane နှင့် Marine Bacterium တို့နှင့် နီးကပ်စွာဆက်စပ်နေကြောင်း ပြသခဲ့သည်။ သို့သော်၊ ဤအချက်အလက်များသည် ASxL5T သည် Marine Spirulina ရှိ ၎င်း၏ဆွေမျိုးများနှင့် ကွဲပြားပြီး ၎င်း၏ ဂျီနိုမ်အစီအစဥ်ဒေတာကို ရရှိနိုင်ပါသည်။
16S rRNA ဗီဇအစီအစဥ်ကို အသုံးပြုထားသော ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇသစ်ပင်သည် Marine Spirulinaceae ရှိ မစိုက်ပျိုးရသေးသော အဏ္ဏဝါဘက်တီးရီးယားမျိုးကွဲများနှင့် ဆက်စပ်သော ASxL5T၊ ASxO5 နှင့် ASxS5 မျိုးကွဲများ (အူများနှင့်အတူ) ၏အနေအထားကို မီးမောင်းထိုးပြသည်။ Genbank ချိတ်ဆက်မှုနံပါတ်သည် ကွင်းအတွင်းရှိ strain name ကို လိုက်နာသည်။ ပေါင်းစပ်မှုများကို ချိန်ညှိရန် ClustalW ကိုသုံးပါ၊ ဖြစ်နိုင်ခြေအများဆုံးနည်းလမ်းနှင့် Tamura-Nei မော်ဒယ်လ်ကို အသုံးပြု၍ ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ ဆက်ဆံရေးများကို ရည်ညွှန်းကာ MEGA X ပရိုဂရမ်တွင် လမ်းညွှန်ထားသည့် ထပ်တူပွားမှု 1000 ကို လုပ်ဆောင်ပါ။ ဌာနခွဲရှိ နံပါတ်သည် လမ်းညွှန်မိတ္တူတန်ဖိုး 50% ထက် ပိုများကြောင်း ညွှန်ပြသည်။ Escherichia coli U/541T ကို အဖွဲ့ခွဲတစ်ခုအဖြစ် အသုံးပြုခဲ့သည်။
(က) အဏ္ဏဝါ Spirospiraceae ဘက်တီးရီးယား ASxL5T နှင့် ၎င်း၏ ဆွေမျိုးနီးစပ် E. coli U 5/41T အကြား ဆက်နွယ်မှုကို ပြသသော ဂျီနိုမ်အပေါ် အခြေခံထားသော ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇသစ်ပင်။ (ခ) T. oleivorans MIL-1T နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက ASx5LT ပရိုတိန်း၏ orthologous group (COG) အစုအဝေးအပေါ် အခြေခံ၍ မျိုးဗီဇများ၏ လုပ်ဆောင်နိုင်သော အမျိုးအစားခွဲဝေမှုကို ခန့်မှန်းထားသည်။ ဘယ်ဘက်ရှိပုံသည် genome တစ်ခုစီရှိ functional COG အမျိုးအစားတစ်ခုစီရှိ genes အရေအတွက်ကို ပြသသည်။ ညာဘက်ရှိ ဂရပ်သည် အလုပ်လုပ်နိုင်သော COG အုပ်စုတစ်ခုစီတွင်ပါရှိသော ဂျီနိုမ်ရာခိုင်နှုန်းကို ပြသည်။ (ဂ) T. oleiverans MIL-1T နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက ASxL5T ၏ အင်္ဂါရပ်နှင့် ဗီဇဆိုင်ရာ မော်ဂျူလာလမ်းကြောင်း အပြည့်အစုံဖြစ်သော KEGG (Kyoto Encyclopedia and Genomes) ၏ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု။
KEGG ဒေတာဘေ့စ်ကို အသုံးပြု၍ ASxL5T ဂျီနိုမ်တွင် ပါရှိသည့် အစိတ်အပိုင်း ဗီဇများကို စစ်ဆေးရန်အတွက် အေရိုးဘစ်ဂမ်မာပရိုတီယပ်စ်၏ ပုံမှန်ဇီဝဖြစ်စဉ်လမ်းကြောင်းကို ဖော်ထုတ်ပြသခဲ့သည်။ ASxL5T တွင် ဓာတုဗေဒပစ္စည်း၊ flagella စုဝေးမှုနှင့် type IV fimbriae စနစ်တွင်ပါ၀င်သော ဗီဇများအပါအဝင် ဘက်တီးရီးယားမော်တာပရိုတိန်းများအတွက် သတ်မှတ်ထားသော ဗီဇစုစုပေါင်း ၇၅ ခု ပါဝင်သည်။ နောက်ဆုံးအမျိုးအစားတွင်၊ မျိုးဗီဇ ၁၀ ခုတွင် ၉ ခုသည် အခြားသက်ရှိများစွာ၏ လှုပ်လှုပ်ရှားရှားလှုပ်ရှားမှုအတွက် တာဝန်ရှိသည်။ ASxL5T ၏ genome တွင် halophiles အတွက် မျှော်လင့်ထားသည့်အတိုင်း osmotic stress20 ကို ကာကွယ်သည့်တုံ့ပြန်မှုတွင် ပါဝင်သည့် tetrahydropyrimidine biosynthetic pathway အပြည့်အစုံပါရှိသည်။ ဂျီနိုမ်တွင် riboflavin ပေါင်းစပ်မှုလမ်းကြောင်းများအပါအဝင် cofactors နှင့် ဗီတာမင်များအတွက် ပြီးပြည့်စုံသောလမ်းကြောင်းများစွာပါရှိသည်။ အယ်လကိန်း 1-monooxygenase (alkB2) ဗီဇသည် ASxL5T တွင်ရှိနေသော်လည်း ဟိုက်ဒရိုကာဗွန်အသုံးပြုမှုလမ်းကြောင်းသည် ပြီးပြည့်စုံခြင်းမရှိပါ။ ASxL5T ၏ ဂျီနိုမ်အစီအစဥ်တွင်၊ T. oleiverans MIL-1T21 တွင် ဟိုက်ဒရိုကာဗွန်များ ယိုယွင်းပျက်စီးမှုအတွက် အဓိကအားဖြင့် တာဝန်ရှိသည်ဟုသတ်မှတ်ထားသော မျိုးရိုးဗီဇများဖြစ်သည့် T. oleiverans MIL-1T21 ဖြစ်သည့် TOL_2658 (alkB) နှင့် TOL_2772 (alcohol dehydrogenase) တို့မှာ သိသိသာသာ မရှိတော့ပါ။ ပုံ 3B သည် ASxL5T နှင့် သံလွင်ဆီ MIL-1T အကြား COG အမျိုးအစားရှိ မျိုးဗီဇဖြန့်ဖြူးမှုကို နှိုင်းယှဉ်ပြသထားသည်။ ယေဘုယျအားဖြင့်၊ သေးငယ်သော ASxL5T ဂျီနိုမ်တွင် ပိုကြီးသောဆက်စပ်ဂျီနိုမ်နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက COG အမျိုးအစားတစ်ခုစီမှ အချိုးကျနည်းသော ဗီဇများပါရှိသည်။ လုပ်ဆောင်ချက်အမျိုးအစားတစ်ခုစီရှိ ဗီဇအရေအတွက်ကို ဂျီနိုမ်၏ ရာခိုင်နှုန်းတစ်ခုအဖြစ် ဖော်ပြသောအခါ၊ ဘာသာပြန်ခြင်းရှိ ဗီဇရာခိုင်နှုန်း၊ ribosomal ဖွဲ့စည်းပုံနှင့် biogenesis အမျိုးအစားများနှင့် ပိုမိုကြီးမားသော ASxL5T တို့ကို ဖွဲ့စည်းထားသည့် စွမ်းအင်ထုတ်လုပ်မှုနှင့် ပြောင်းလဲခြင်းလုပ်ငန်းအမျိုးအစားများတွင် ကွဲပြားမှုများကို မှတ်သားထားသည်။ ဂျီနိုမ် ရာခိုင်နှုန်းသည် T. oleiverans MIL-1T ဂျီနိုမ်တွင်ရှိသော တူညီသောအုပ်စုနှင့် နှိုင်းယှဉ်သည်။ ဆန့်ကျင်ဘက်အားဖြင့်၊ ASxL5T ဂျီနိုမ်နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက T. oleivorans MIL-1T တွင် မျိုးပွားခြင်း၊ ပြန်လည်ပေါင်းစပ်ခြင်းနှင့် ပြုပြင်ခြင်းနှင့် စာသားမှတ်တမ်းအမျိုးအစားများတွင် မျိုးဗီဇရာခိုင်နှုန်း ပိုများသည်။ စိတ်ဝင်စားစရာမှာ၊ ဂျီနိုမ်နှစ်ခု၏ လုပ်ငန်းဆောင်တာအမျိုးအစားတစ်ခုစီ၏ အကြောင်းအရာတစ်ခုစီ၏ အကြီးမားဆုံးကွာခြားချက်မှာ ASxL5T (ပုံ 3B) တွင် ရှိနေသည့် အမည်မသိမျိုးရိုးဗီဇအရေအတွက်ဖြစ်သည်။ KEGG မော်ဂျူးများ၏ ကြွယ်ဝမှုဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို လုပ်ဆောင်ခဲ့ပြီး၊ KEGG မော်ဂျူးတစ်ခုစီသည် မှတ်ချက်နှင့် ဂျီနိုမ်အစီအစဥ်အချက်အလက်များ၏ ဇီဝဗေဒဘာသာပြန်ဆိုချက်များအတွက် ကိုယ်တိုင်သတ်မှတ်ထားသော လုပ်ဆောင်နိုင်သော ယူနစ်အစုံကို ကိုယ်စားပြုသည်။ ASxL5T နှင့် သံလွင် MIL-1T ၏ ပြီးပြည့်စုံသော KOG module လမ်းကြောင်းရှိ မျိုးဗီဇဖြန့်ဖြူးမှု နှိုင်းယှဉ်ချက်ကို ပုံ 3C တွင် ပြထားသည်။ ASxL5T တွင် ဆာလဖာနှင့် နိုက်ထရိုဂျင် ဇီဝဖြစ်စဉ်လမ်းကြောင်း အပြည့်အစုံရှိသော်လည်း T. oleiverans MIL-1T တွင် မပါရှိကြောင်း၊ ဆန့်ကျင်ဘက်အနေနှင့်၊ T. oleiverans MIL-1T တွင် cysteine ​​​​နှင့် methionine ဇီဝဖြစ်စဉ်လမ်းကြောင်း အပြည့်အစုံရှိသော်လည်း ASxL5T တွင် မပြည့်စုံပါ။ ထို့ကြောင့်၊ ASxL5T တွင် sulfate assimilation အတွက် ဝိသေသန module တစ်ခုရှိသည် (ဇီဝဖြစ်စဉ်စွမ်းရည် သို့မဟုတ် ရောဂါဖြစ်ပွားနိုင်မှုကဲ့သို့သော phenotypic အမှတ်အသားများအဖြစ် အသုံးပြုနိုင်သော မျိုးဗီဇအစုအဝေးတစ်ခုအဖြစ် သတ်မှတ်ထားသည်၊ https://www.genome.jp/kegg/module.html) T တွင် Oleiverans MIL-1T။ ASxL5T ၏ ဗီဇအကြောင်းအရာကို ရိုင်းစိုင်းသောလူနေမှုပုံစံကို ညွှန်ပြသည့် ဗီဇများစာရင်းနှင့် နှိုင်းယှဉ်ခြင်းသည် အကျုံးမဝင်ပါ။ core သို့ O antigen polysaccharide နှင့်ဆက်စပ်နေသော ligase နှင့်ဆက်စပ်နေသော waaL ဗီဇသည် ASxL5T ဂျီနိုမ်တွင် ရှိနေသော်လည်း (သို့သော်၎င်းသည် ဂရမ်-အနုတ်လက္ခဏာဘက်တီးရီးယားများစွာတွင်အဖြစ်များပါသည်)၊ tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO) ဗီဇတွင် အမိုင်နို 60 ပါဝင်နိုင်သည်။ မတည်ရှိသော သားရဲ ဘက်တီးရီးယားများတွင် တွေ့ရများသော အက်ဆစ်နယ်မြေများ။ mevalonate လမ်းကြောင်းရှိ isoprenoid biosynthesis ပါ၀င်သော encoding အင်ဇိုင်းများ အပါအဝင် ASxL5T ဂျီနိုမ်တွင် အခြားသော ရိုင်းစိုင်းသော လက္ခဏာမျိုးဗီဇများ မရှိပါ။ ဆန်းစစ်ထားသော သားကောင်အုပ်စုတွင် ကူးယူဖော်ပြသည့် စည်းမျဉ်းဆိုင်ရာ ဗီဇ gntR မရှိသည်ကို သတိပြုပါ၊ သို့သော် gntR ကဲ့သို့သော ဗီဇသုံးမျိုးကို ASxL5T တွင် ဖော်ထုတ်နိုင်ပါသည်။
ASxL5T ၏ ဖီနိုတီပုံသွင်ပြင်လက္ခဏာများကို ဇယား 3 တွင် အကျဉ်းချုံးပြီး စာပေတွင်ဖော်ပြထားသော ဆက်စပ်မျိုးဆက် 23၊ 24၊ 25၊ 26 နှင့် 27 တို့၏ ဖီနိုတီရုပ်လက္ခဏာများနှင့် နှိုင်းယှဉ်ထားသည်။ T. marinus၊ T. olevorans၊ B. sanyensis နှင့် Oceanobacter kriegii တို့မှ အထီးကျန်များသည် တက်ကြွသော၊ ဆားဒဏ်ခံနိုင်သော၊ oxidase-positive rod ပုံသဏ္ဍာန်ကောင်များဖြစ်သည်၊ သို့သော် ASxL5T နှင့် အခြားသော phenotypic လက္ခဏာများ နီးပါးမရှိပါ။ သမုဒ္ဒရာ၏ပျမ်းမျှ pH သည် 8.1 (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77) ဖြစ်ပြီး T. marinus၊ T. olevorans၊ B. sanyensis နှင့် O တို့တွင် ထင်ဟပ်သည်။ kriegii ASxL5T သည် အဏ္ဏဝါမဟုတ်သောမျိုးစိတ်များ၏ ပိုကြီးသော pH အကွာအဝေး (4-9) အတွက် သင့်လျော်သည်။ Thalassolituus sp ၏ Phenotypic လက္ခဏာများ C2-1။ မသိ။ ASxL5T ၏ကြီးထွားမှုအပူချိန်အကွာအဝေးသည် ယေဘုယျအားဖြင့် အဏ္ဏဝါမျိုးကွဲများ (4-42 ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်) ထက် ယေဘုယျအားဖြင့် T. marinus isolates အချို့သော်လည်းကောင်း အပူဒဏ်ခံနိုင်ရည်ရှိမည်မဟုတ်သော်လည်း၊ ဟင်းရည်မီဒီယာတွင် ASxL5T ကို ကြီးထွားအောင် မစွမ်းဆောင်နိုင်ခြင်းကြောင့် နောက်ထပ် phenotypic characterization ကို တားဆီးခဲ့သည်။ BA ပန်းကန်၊ ONPG၊ arginine dihydrolase၊ lysine decarboxylase၊ ornithine decarboxylase၊ citrate အသုံးချမှု၊ urease၊ tryptophan deaminase၊ gelatin hydrolysis Enzyme မှ ခြစ်ထုတ်ထားသော ပစ္စည်းများ စမ်းသပ်ရန် API 20E ကို အသုံးပြု၍ စမ်းသပ်မှု ရလဒ်များသည် အနုတ်လက္ခဏာ ဖြစ်သော်လည်း indole၊ H2Stoin မရှိပါ။ ထုတ်လုပ်ခဲ့ကြသည်။ အချဉ်ဖောက်ထားသော ကာဗိုဟိုက်ဒရိတ် ပါဝင်သည်- ဂလူးကို့စ်၊ မန်နိုစ်၊ အိုင်နိုဆီတိုလ်၊ ဆောဘစ်တိုလ်၊ ရီဟမ်နိုစ်၊ ဆူဂရို့စ်၊ မီလီဘီရိုစ၊ အေမီဂဒလင်နှင့် အာဘင်နိုစ့်တို့ ပါဝင်သည်။ ထုတ်ပြန်ထားသော ဆက်စပ်ရည်ညွှန်းမျိုးကွဲများနှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက ASxL5T မျိုးကွဲ၏ ဆယ်လူလာဖက်တီးအက်ဆစ်ပရိုဖိုင်ကို ဇယား 4 တွင်ပြသထားသည်။ အဓိကဆယ်လူလာဖက်တီးအက်ဆစ်များမှာ C16:1ω6c နှင့်/သို့မဟုတ် C16:1ω7c၊ C16:0 နှင့် C18:1ω9။ Hydroxy ဖက်တီးအက်ဆစ် C12:0 3-OH နှင့် C10:0 3-OH တို့လည်း ရှိပါသည်။ ASxL5T ရှိ C16:0 ၏အချိုးသည် ဆက်စပ်မျိုးနွယ်၏ ဖော်ပြချက်တန်ဖိုးထက် ပိုများသည်။ ဆန့်ကျင်ဘက်အားဖြင့်၊ အစီရင်ခံထားသော T. marinus IMCC1826TT နှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက ASxL5T ရှိ C18:1ω7c နှင့်/သို့မဟုတ် C18:1ω6c အချိုးသည် လျော့ကျသွားပါသည်။ oleivorans MIL-1T နှင့် O. kriegii DSM 6294T၊ သို့သော် B. sanyensis KCTC 32220T တွင် ရှာမတွေ့ပါ။ ASxL5T နှင့် ASxLS ၏ ဖက်တီးအက်ဆစ်ပရိုဖိုင်များကို နှိုင်းယှဉ်ခြင်းသည် မျိုးစိတ်နှစ်ခု၏ မျိုးရိုးဗီဇ DNA အမျိုးအစားနှင့် ကိုက်ညီသည့် မျိုးစိတ်နှစ်ခုကြားရှိ တစ်ဦးချင်းစီ ဖက်တီးအက်ဆစ်ပမာဏ၏ သိမ်မွေ့သော ကွဲပြားမှုကို ထင်ရှားစေသည်။ ဆူဒန်အနက်ရောင်စမ်းသပ်မှုဖြင့် poly-3-hydroxybutyrate (PHB) အမှုန်အမွှားများကိုမတွေ့ပါ။
သားကောင်၏အကွာအဝေးကိုဆုံးဖြတ်ရန် ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများ၏ ချေမှုန်းခြင်းလုပ်ဆောင်ချက်ကို လေ့လာခဲ့သည်။ Campylobacter suis 11608T၊ Campylobacter jejuni PT14၊ Campylobacter jejuni 12662၊ Campylobacter jejuni NCTC 11168T အပါအဝင်၊ Escherichia coli NCTC 12667; C. helveticus NCTC 12472; C lari NCTC 11458 နှင့် C. upsaliensis NCTC 11541T။ ဂရမ်-အနုတ်လက္ခဏာနှင့် ဂရမ်-အပြုသဘော ဘက်တီးရီးယားများ၏ ကျယ်ပြန့်သောအကွာအဝေးကို စမ်းသပ်ရန်အတွက် နည်းလမ်း၏အိမ်ရှင်အပိုင်းအခြားသတ်မှတ်ခြင်းကဏ္ဍတွင် ဖော်ပြထားသော ယဉ်ကျေးမှုများကို အသုံးပြုပါ။ ရလဒ်များက ASxL5T ကို Escherichia coli NCTC 86 နှင့် Citrobacter freundii NCTC 9750T တို့တွင်လည်း အသုံးပြုနိုင်ကြောင်း ပြသထားသည်။ Klebsiella oxytoca 11466 တွင်ဖွဲ့စည်းထားသော ကမ္ပည်းများ။ E. coli NCTC 86 နှင့် TEM အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှုကို ပုံ 4A-D တွင်ပြသထားပြီး Campylobacter jejuni PT14 နှင့် Campylobacter suis S12 နှင့် အပြန်အလှန်အကျိုးသက်ရောက်မှုကို ပုံ 4E-H အလယ်တွင် ပြထားသည်။ တိုက်ခိုက်မှုယန္တရားသည် ASxL5T ဆဲလ်တစ်ခု သို့မဟုတ် တစ်ခုထက်ပိုသော E. coli ဆဲလ်များကို စုပ်ယူခြင်းမပြုမီ ချဲ့ထွင်ထားသောဆဲလ်တစ်လျှောက် ဘေးတိုက်နေရာချထားခြင်းဖြင့် စမ်းသပ်ထားသော သားကောင်အမျိုးအစားများကြားတွင် ကွဲပြားပုံရသည်။ ဆန့်ကျင်ဘက်အနေနှင့်၊ ASxL5T သည် ထိတွေ့မှုတစ်ခုတည်းမှတစ်ဆင့် Campylobacter ထံ တွယ်ကပ်နေပုံရပြီး၊ များသောအားဖြင့် သားကောင်များ၏ အထွတ်အထိပ်နှင့် Campylobacter ဆဲလ်၏ အထွတ်အနီး (ပုံ 4H) နှင့် ထိတွေ့သည်။
ASx5LT နှင့် သားကောင်ကြား အပြန်အလှန်အကျိုးသက်ရောက်မှုကို ပြသသည့် TEM- (AD) နှင့် E. coli သားကောင်; (EH) နှင့် C. jejuni သားကောင်။ (က) ပုံမှန် ASx5LT ဆဲလ်တစ်ခုသည် E. coli (EC) ဆဲလ်တစ်ခုသို့ ချိတ်ဆက်ထားသည်။ (ခ) တစ်ခုတည်းသော EC ဆဲလ်တစ်ခုနှင့် ချိတ်တွဲထားသော အသွင်အပြင်ရှိသော ASx5LT၊ (ဂ) EC ဆဲလ်များစွာနှင့် ချိတ်ဆက်ထားသော အသွင်အပြင်ရှိသော ASx5LT ဆဲလ်တစ်ခု၊ (ဃ) တစ်ခုတည်းသော E. coli (EC) ဆဲလ်များပေါ်တွင် သေးငယ်သော ASx5LT ဆဲလ်များကို ပူးတွဲပါရှိသည်။ (င) Campylobacter jejuni (CJ) ဆဲလ်တစ်ခုနှင့် ချိတ်ဆက်ထားသော တစ်ခုတည်းသော ASx5LT ဆဲလ်၊ (စ) ASx5LT သည် C. hyointestinalis (CH) ဆဲလ်များကို တိုက်ခိုက်သည်၊ (ဆ) ASx5LT ဆဲလ်တစ်ခုသည် CJ ဆဲလ်တစ်ခုအား တိုက်ခိုက်ခဲ့သည်။ (H) CJ ဆဲလ်၏အထွတ်အနီး (ဘား 0.2 μm) အနီးရှိ ASx5LT ပူးတွဲပါအချက်၏ အနီးကပ်မြင်ကွင်း။ ဘားသည် (A–G) တွင် 1 μm ကို ကိုယ်စားပြုသည်။
သားကောင်များ ပေါများသော ရင်းမြစ်များကို အခွင့်ကောင်းယူရန် ကျက်စားသော ဘက်တီးရီးယားများ တိုးတက်လာသည်။ ထင်ရှားသည်မှာ၊ ၎င်းတို့သည် မတူညီသော ပတ်ဝန်းကျင်များစွာတွင် တွင်ကျယ်စွာ ရှိနေပါသည်။ လူဦးရေ၏ ကျဉ်းမြောင်းသော အရွယ်အစားကြောင့်၊ phage ခွဲခြားခြင်းနည်းလမ်းကို အသုံးပြု၍ slurry မှ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများကို ခွဲထုတ်နိုင်သည်။ အဏ္ဏဝါဘက်တီးရီးယားများ၏ ASxL5T ၏မျိုးရိုးဗီဇဆက်စပ်မှုသည် အံ့သြစရာကောင်းသော်လည်း၊ သက်ရှိများသည် ဆားခံနိုင်ရည်ရှိပြီး ဆား 5% ပါဝင်သော ကြားခံတွင် ပေါက်ပွားနိုင်သော်လည်း၊ slurry ၏ ရေအရည်အသွေး ဆန်းစစ်ချက်တွင် ဆိုဒီယမ် ကလိုရိုက် ပါဝင်မှုသည် 0.1% ထက်နည်းကြောင်း ပြသခဲ့သည်။ ထို့ကြောင့် ရွှံ့များသည် ပထဝီဝင်အရရော ဓာတုဗေဒအရရော အဏ္ဏဝါပတ်ဝန်းကျင်နှင့် ဝေးကွာသည်။ တူညီသောအရင်းအမြစ်မှ ဆက်စပ်သော်လည်း ကွဲပြားသော သီးခြားအထီးကျန်သုံးခုရှိနေခြင်းသည် ဤသားကောင်များသည် ဤပင်လယ်မဟုတ်သောပတ်ဝန်းကျင်တွင် ရှင်သန်ကြီးထွားနေကြောင်း သက်သေပြပါသည်။ ထို့အပြင်၊ microbiome ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990) မှ ရရှိနိုင်သော ဒေတာဖိုင်များသည် တူညီသော 16S rRNA မျိုးရိုးဗီဇအစီအစဥ်သည် ထိပ်တန်းအပေါများဆုံး လုပ်ငန်းလည်ပတ်မှုခွန် (OTU 50) တွင် တည်ရှိကြောင်း ပြသခဲ့သည်။ ) ရွှံ့နမူနာအနည်းငယ်ကြားကာလတွင်။ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားနှင့် ဆင်တူသည့် 16S rRNA မျိုးရိုးဗီဇ အမျိုးအစားများပါရှိသော Genbank ဒေတာဘေ့စ်တွင် မမွေးမြူထားသော ဘက်တီးရီးယား အများအပြားကို တွေ့ရှိခဲ့သည်။ ASxL5T၊ ASxS5၊ နှင့် ASxO5 တို့၏ အတွဲများနှင့်အတူ ဤ sequences များသည် Thalassolituus နှင့် Oceanobacter တို့မှ ခွဲထုတ်ထားသော မတူညီသော clades များကို ကိုယ်စားပြုပုံရသည် (ပုံ 2)။ မမွေးမြူနိုင်သော ဘက်တီးရီးယားသုံးမျိုး (GQ921362၊ GQ921357 နှင့် GQ921396) ကို 2009 ခုနှစ်တွင် တောင်အာဖရိကရွှေတွင်းရှိ အနက် 1.3 ကီလိုမီတာတွင် ကွဲအက်နေသောရေမှ ခွဲထုတ်ခဲ့ပြီး ကျန်နှစ်ခု (DQ256320 နှင့် DQ337006) တောင်အာဖရိကရှိ မြေအောက်ရေများမှ ဖြစ်သည် ။ 2005)။ 16S rRNA ဗီဇစီးရီးသည် ASxL5T နှင့် အနီးစပ်ဆုံးဆက်စပ်နေသည့် 16S rRNA ဗီဇအစီအစဉ်၏ တစ်စိတ်တစ်ပိုင်းဖြစ်ပြီး 2006 ခုနှစ်တွင် ပြင်သစ်မြောက်ပိုင်းကမ်းခြေများမှရရှိသော သဲအနည်အနှစ်များ (ဝင်ရောက်ခွင့်နံပါတ် AM29240828)။ တရုတ်နိုင်ငံရှိ မြူနီစီပယ်အမှိုက်ပုံမှ စွန့်ပစ်ထားသော အမှိုက်ပုံးမှ စွန့်ပစ်ထားသော သိုလှောင်ကန်တစ်ခုမှ မမွေးမြူထားသော ဘက်တီးရီးယား HQ183822.1 မှ နောက်ထပ် အနီးကပ်ဆက်စပ်နေသော 16S rRNA ဗီဇ စီးရီးကို ရယူခဲ့သည်။ ထင်ရှားသည်မှာ၊ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများသည် အခွန်ဆိုင်ရာဒေတာဘေ့စ်များတွင် မြင့်မားစွာကိုယ်စားပြုခြင်းမဟုတ်သော်လည်း ယဉ်ကျေးမှုမရှိသောဘက်တီးရီးယားများမှ အဆိုပါဆက်ဆက်များသည် များသောအားဖြင့် စိန်ခေါ်မှုရှိသောပတ်ဝန်းကျင်များတွင် ကမ္ဘာအနှံ့ဖြန့်ဝေနေသည့် ASxL5T နှင့်ဆင်တူသောသက်ရှိများကိုကိုယ်စားပြုဖွယ်ရှိသည်။ ဂျီနိုမ် ဇီဝကမ္မ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု တစ်ခုလုံးမှ ASxL5T နှင့် အနီးစပ်ဆုံး ဆက်စပ်သည် Thalassolituus sp ဖြစ်သည်။ C2-1၊ T. marinus၊ T. oleivorans။ O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. Thalassolituus သည် marine obligate hydrocarbon fragmentation bacteria (OHCB) ၏ အဖွဲ့ဝင်ဖြစ်ပြီး အဏ္ဏဝါနှင့် ကုန်းမြေပတ်ဝန်းကျင်များတွင် ပျံ့နှံ့နေပြီး များသောအားဖြင့် ဟိုက်ဒရိုကာဗွန် ညစ်ညမ်းမှု ဖြစ်စဉ်များ 30၊31 အပြီးတွင် လွှမ်းမိုးမှုဖြစ်လာသည်။ အဏ္ဏဝါဘက်တီးရီးယားများသည် OHCB အဖွဲ့၏ အဖွဲ့ဝင်များမဟုတ်သော်လည်း အဏ္ဏဝါပတ်ဝန်းကျင်မှ သီးခြားဖြစ်သည်။
Phenotypic အချက်အလက်များအရ ASxL5T သည် မျိုးစိတ်အသစ်ဖြစ်ပြီး အဏ္ဏဝါ spirospiraceae မိသားစုရှိ ယခင်က အသိအမှတ်ပြုမထားသော မျိုးစိတ်တစ်ခု၏ အဖွဲ့ဝင်ဖြစ်ကြောင်း ဖော်ပြသည်။ လောလောဆယ်တွင် သီးခြားခွဲထုတ်ထားသော မျိုးစိတ်များကို အမျိုးအစားအသစ်အဖြစ် ခွဲခြားသတ်မှတ်ရန် ရှင်းလင်းပြတ်သားသော စံနှုန်းမရှိပါ။ ဥပမာအားဖြင့်၊ ကွန်ဆာဗေးတစ်ပရိုတင်း (POCP) ၏ ဗီဇရာခိုင်နှုန်းအပေါ်အခြေခံ၍ universal genera boundaries များကို ဆုံးဖြတ်ရန် ကြိုးပမ်းခဲ့ပြီး၊ ဖြတ်တောက်မှုတန်ဖိုးသည် ကိုးကားချက်အမျိုးအစား 33 နှင့် 50% ထပ်တူဖြစ်ကြောင်း အကြံပြုထားသည်။ အခြားသူများက ၎င်းတို့သည် မပြည့်စုံသောမျိုးရိုးဗီဇများ34 မှရနိုင်သောကြောင့် POCP ထက် အားသာချက်ရှိသည့် AAI တန်ဖိုးများကို အသုံးပြုရန် အကြံပြုထားသည်။ AAI တန်ဖိုးသည် မော်ဒယ်မျိုးစိတ်များ၏ မော်ဒယ်မျိုးစိတ်များနှင့် နှိုင်းယှဉ်ပါက 74% ထက်နည်းပါက၊ မျိုးစိတ်သည် မတူညီသောမျိုးစိတ်တစ်ခု၏ ကိုယ်စားပြုဖြစ်သည်ဟု စာရေးသူက ယုံကြည်သည်။ marine spirillaceae ရှိ စံပြမျိုးစုမှာ marine spirillum ဖြစ်ပြီး မော်ဒယ်မျိုးကွဲမှာ O. linum ATCC 11336T ဖြစ်သည်။ ASxL5T နှင့် O. linum ATCC 11336T အကြား AAI တန်ဖိုးသည် 54.34% ရှိပြီး ASxL5T နှင့် T. oleivorans MIL-1T (မျိုးစိတ်အမျိုးအစားမျိုးကွဲ) အကြား AAI တန်ဖိုးသည် 67.61% ဖြစ်သည်ကို ညွှန်ပြသည်မှာ ASxL5T သည် ကွဲပြားသောမျိုးစိတ်အသစ်ကို ကိုယ်စားပြုသည်ဟု ဖော်ပြသည်။ Thalassol 16S rRNA gene sequence ကို အမျိုးအစားခွဲခြင်းစံအဖြစ် အသုံးပြု၍ အကြံပြုထားသော genus ပိုင်းခြားသတ်မှတ်မှုနယ်နိမိတ်သည် 94.5% 35 ဖြစ်သည်။ ASxL5T ကို T. oleivorans MIL-1T နှင့် 96.17% ပါရှိသော 95.03% 16S rRNA စီစဉ်အထောက်အထားကို ပြသသော Thalassolituus genus တွင် ထားရှိနိုင်ပါသည်။ marinus IMCC1826T။ သို့ရာတွင်၊ ၎င်းကို B. sanyensis NV9 နှင့် 94.64% 16S rRNA ဗီဇအထောက်အထားပါရှိသော Bacteroides genus တွင် ထားရှိမည်ဖြစ်ပြီး၊ 16S rRNA ဗီဇကဲ့သို့သော တစ်ခုတည်းသော ဗီဇကိုအသုံးပြုခြင်းသည် မထင်သလို အမျိုးအစားခွဲခြင်းနှင့် တာဝန်ပေးခြင်းတို့ကို ဦးတည်သွားစေနိုင်ကြောင်း ညွှန်ပြပါမည်။ အခြားအကြံပြုထားသောနည်းလမ်းသည် ANI နှင့် Genome Alignment Score (AF) ကို အသုံးပြု၍ အမျိုးအစားအားလုံးမှ ဒေတာအမှတ်များ အစုလိုက်အပြုံလိုက်နှင့် ရှိပြီးသား genera ၏ အမျိုးအစားမဟုတ်သော အမျိုးအစားအားလုံးမှ ဒေတာအချက်များ အစုလိုက်အပြုံလိုက်ကို စစ်ဆေးရန် အသုံးပြုပါသည်။ စာရေးဆရာသည် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာနေသည့် taxa အတွက် သတ်သတ်မှတ်မှတ် ခန့်မှန်းထားသော genus ၏ inflection point နှင့် genus နယ်နိမိတ်ကို ပေါင်းစပ်ရန် အကြံပြုထားသည်။ သို့သော်၊ Thalassolituus အထီးကျန်များမှ ပြည့်စုံသော ဂျီနိုအာစီစဉ်များ မလုံလောက်ပါက၊ ASxL5T သည် Thalassolituus genus နှင့် သက်ဆိုင်ခြင်းရှိမရှိ ဆုံးဖြတ်ရန် မဖြစ်နိုင်ပေ။ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာရန်အတွက် ပြီးပြည့်စုံသော ဂျီနိုအစီအစဥ်များ အကန့်အသတ်ဖြင့် ရရှိနိုင်မှုကြောင့်၊ ဂျီနိုမ် ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇသစ်ပင်တစ်ခုလုံးကို သတိဖြင့် အဓိပ္ပာယ်ပြန်ဆိုသင့်သည်။ ဒုတိယအနေနှင့်၊ ဂျီနိုမ်နှိုင်းယှဥ်မှုနည်းလမ်းတစ်ခုလုံးသည် နှိုင်းယှဉ်ထားသော ဂျီနိုမ်များ၏ အရွယ်အစားအတွက် ကြီးမားသောကွာခြားချက်များကို ထည့်သွင်းစဉ်းစား၍မရပါ။ ၎င်းတို့သည် ဆက်စပ်မျိုးဗီဇများကြားတွင် ထိန်းသိမ်းထားသော ပင်မတစ်ခုတည်း-မိတ္တူဗီဇများ၏ တူညီမှုကို တိုင်းတာသော်လည်း ASxL5T ၏ ပိုသေးငယ်သော ဂျီနိုမ်တွင် မပါဝင်သည့် ဗီဇအများအပြားကို ထည့်သွင်းစဉ်းစားခြင်းမရှိပေ။ ထင်ရှားသည်မှာ၊ ASxL5T နှင့် Thalassolituus၊ Oceanobacter နှင့် Bacterioplanes အပါအဝင် အုပ်စုများသည် ဘုံဘိုးဘွားတစ်ဦးရှိသော်လည်း ဆင့်ကဲပြောင်းလဲမှုသည် မတူညီသောလမ်းကြောင်းတစ်ခုသို့ ပြောင်းလဲသွားကာ ဂျီနိုမ်ကို လျော့ပါးသွားစေကာ ရက်စက်ကြမ်းကြုတ်သောဘဝပုံစံသို့ လိုက်လျောညီထွေဖြစ်စေမည့် ဂျီနိုမ်ကို လျော့ပါးစေသည်။ ၎င်းသည် T. oleivorans MIL-1T နှင့် ဆန့်ကျင်ဘက်ဖြစ်ပြီး ဟိုက်ဒရိုကာဗွန် ၂၃၊၃၀ ကို အသုံးပြုရန် မတူညီသောပတ်ဝန်းကျင်ဆိုင်ရာ ဖိအားများအောက်တွင် ပြောင်းလဲလာခဲ့သည်။ Rickettsia၊ Chlamydia နှင့် Buchnera ကဲ့သို့သော ဆဲလ်အတွင်းပိုင်းကပ်ပါးများနှင့် ပေါင်းစပ်ပါဝင်မှုများဖြင့် စိတ်ဝင်စားစရာကောင်းသော နှိုင်းယှဉ်မှုကို ပြုလုပ်နိုင်သည်။ သူတို့ရဲ့ genome အရွယ်အစားက 1 Mb လောက်ရှိပါတယ်။ host cell metabolites များကို အသုံးချနိုင်မှုသည် genes ဆုံးရှုံးမှုကို ဖြစ်စေသည်၊ ထို့ကြောင့် သိသာထင်ရှားသော ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ် မျိုးဗီဇ ပျက်စီးခြင်းသို့ ရောက်သွားသည်။ အဏ္ဏဝါဓာတု အာဟာရ ဇီဝသက်ရှိများမှ ကျက်စားသော လူနေမှုပုံစံများအထိ ဆင့်ကဲပြောင်းလဲမှုများသည် ဂျီနိုမ်အရွယ်အစားကို အလားတူ လျော့ကျစေနိုင်သည်။ COG နှင့် KEGG ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုသည် သီးခြားလုပ်ဆောင်မှုများအတွက် အသုံးပြုသည့် မျိုးဗီဇအရေအတွက်နှင့် ASxL5T နှင့် T. oleivorans MIL-1T ကြားရှိ မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ လမ်းကြောင်းများတွင် အသုံးပြုသည့် မျိုးဗီဇဆိုင်ရာ ကွဲပြားမှုများကို မီးမောင်းထိုးပြထားသည်။ ASxL5T ၏ ဂျီနိုအာတစ်ခုလုံး၏ G+C အချိုးတွင် ကွာခြားချက်မှာ 56.1% ဖြစ်ပြီး T. oleivorans MIL-1T သည် 46.6% ဖြစ်သည်၊ ၎င်းကို ခွဲခြားထားကြောင်းလည်း ညွှန်ပြသည်။
ASxL5T ဂျီနိုမီ၏ coding အကြောင်းအရာကို စစ်ဆေးခြင်းသည် phenotypic လက္ခဏာများဆိုင်ရာ လုပ်ဆောင်ချက်ဆိုင်ရာ ထိုးထွင်းသိမြင်မှုကို ပေးပါသည်။ အမျိုးအစား IV fimbriae (Tfp) သည် မျက်နှာပြင်ပေါ်ရှိ flagella မပါဘဲ လူမှုလှုပ်ရှားမှုဟုခေါ်သော ဆဲလ်လှုပ်ရှားမှုကို မြှင့်တင်ပေးသောကြောင့် ဗီဇကုဒ်သွင်းခြင်းအမျိုးအစား IV fimbriae (Tfp) ရှိနေခြင်းကို အထူးစိတ်ဝင်စားပါသည်။ အစီရင်ခံစာများအရ Tfp တွင် သတ်ဖြတ်ခြင်း၊ ရောဂါဖြစ်ပွားခြင်း၊ ဇီဝဖလင်ဖွဲ့စည်းခြင်း၊ သဘာဝ DNA စုပ်ယူခြင်း၊ အလိုအလျောက်ဆဲလ်များ စုစည်းခြင်းနှင့် ဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်ခြင်း 38 အပါအဝင် အခြားသော လုပ်ဆောင်ချက်များ ပါရှိသည်။ ASxL5T ဂျီနိုမ်တွင် diguanylate cyclase (guanosine triphosphate 2 မှ guanosine 2 phosphate နှင့် cyclic diGMP အဖြစ်သို့ပြောင်းလဲခြင်းကို လှုံ့ဆော်ပေးသည့် ဗီဇ 18 မျိုး) နှင့် ဆက်စပ် diguanylate cyclase diguanylate phosphate diguanylate. cyclic di-GMP ၏ ​​guanosine monophosphate သို့ cyclic di-GMP ၏ပြိုကွဲမှုကို လှုံ့ဆော်ပေးသည့် gene သည် စိတ်ဝင်စားစရာကောင်းသောကြောင့် cycl-di-GMP သည် biofilm ဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုနှင့် ခွဲခြားခြင်း၊ လှုပ်ရှားမှု၊ ဆဲလ်ပူးတွဲမှုနှင့် ဗိုင်းရပ်စ် 39, 40 လုပ်ငန်းစဉ်တွင် အရေးကြီးသော ဒုတိယတမန်တစ်ခုဖြစ်သောကြောင့် စိတ်ဝင်စားစရာဖြစ်သည်။ Bdellovibrio bacteriovorus တွင်၊ အလကားနှစ်ဆ GMP သည် လွတ်လပ်သောဘဝနှင့် ရက်စက်ကြမ်းကြုတ်သောဘဝနေထိုင်မှုပုံစံ 41 အကြားအကူးအပြောင်းကို ထိန်းချုပ်နိုင်ကြောင်းကိုလည်း သတိပြုသင့်သည်။
သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားဆိုင်ရာ သုတေသနအများစုသည် Bdellovibrio၊ Bdellovibrio ကဲ့သို့သော သက်ရှိများနှင့် Myxococcus မျိုးစိတ်များကို အာရုံစိုက်ထားသည်။ ဤနှင့် အခြားသော ကျက်စားသော ဘက်တီးရီးယားများ၏ လူသိများသော ဥပမာများသည် ကွဲပြားသော အုပ်စုတစ်ခုဖြစ်သည်။ ဤကွဲပြားမှုများရှိသော်လည်း၊ လူသိများသော သားရဲဘက်တီးရီးယား 11 မျိုး၏ phenotypes များကို ထင်ဟပ်စေသည့် ဝိသေသပရိုတိန်းနွယ်စုတစ်စုကို ဖော်ထုတ်တွေ့ရှိခဲ့သည်။ သို့ရာတွင်၊ အထူးသဖြင့် ဂရမ်အနုတ်လက္ခဏာဘက်တီးရီးယားများတွင် အဖြစ်များသည့် O antigen ligase (waaL) ကို ကုဒ်လုပ်ထားသော မျိုးဗီဇများကိုသာ ဖော်ထုတ်ခဲ့သည်။ ဤခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုပုံစံသည် ASxL5T ကို သားကောင်များအဖြစ် သတ်မှတ်ရာတွင် အထောက်အကူမဖြစ်ပါ၊ ၎င်းသည် ဆန်းသစ်သောတိုက်ခိုက်မှုဗျူဟာကို အသုံးပြုသောကြောင့် ဖြစ်နိုင်သည်။ မတူကွဲပြားသော သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားမျိုးရိုးဗီဇများ ရရှိနိုင်မှုသည် အဖွဲ့၀င်များကြားတွင် လုပ်ဆောင်နိုင်စွမ်းနှင့် ပတ်ဝန်းကျင်ဆိုင်ရာ ကွာခြားချက်များကို ထည့်သွင်းစဉ်းစားသည့် ပိုမိုကောင်းမွန်သော ကြည်လင်ပြတ်သားမှုဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုများကို ဖော်ထုတ်ရာတွင် ကူညီပေးပါမည်။ ဤခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် မပါဝင်သော သားရဲကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယား နမူနာများတွင် Cupriavidus necator42 နှင့် Bradymonabacteria43 အဖွဲ့ဝင်များ ပါ၀င်သည်၊ အဘယ်ကြောင့်ဆိုသော် သုတေသီများသည် မတူညီသော အဏုဇီဝအသိုင်းအဝိုင်းများကို စူးစမ်းလေ့လာသောအခါတွင် ရိုင်းစိုင်းသောအခွန်များ ပိုမိုဖွဲ့စည်းထားပါသည်။
TEM ပုံမှဖမ်းယူထားသော ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများ၏ အထင်ရှားဆုံးအင်္ဂါရပ်မှာ ၎င်း၏ထူးခြားပြီး လိုက်လျောညီထွေရှိသော အသွင်သဏ္ဌာန်ဖြစ်ပြီး သားကောင်ဘက်တီးရီးယားများနှင့် အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှုကို မြှင့်တင်ပေးနိုင်သည်။ တွေ့ရှိရသော အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှု အမျိုးအစားသည် အခြားသော သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားများနှင့် ကွဲပြားပြီး ယခင်က ရှာဖွေတွေ့ရှိခြင်း သို့မဟုတ် အစီရင်ခံခြင်း မရှိသေးပါ။ အဆိုပြုထားသော ASxL5T သားကောင်များဘဝစက်ဝန်းကို ပုံ 5 တွင်ပြထားသည်။ ဤနေရာတွင် ကျွန်ုပ်တို့တင်ပြသည့်အတိုင်း အလားတူ apical တည်ဆောက်ပုံများပါရှိသော စာပေများတွင် ဥပမာအနည်းငယ်ရှိပါသည်၊ သို့သော် ဤဥပမာများတွင် Terasakiispira papahanaumokuakeensis၊ ရံဖန်ရံခါ အထစ်ကျယ်ခြင်း 44 ရှိသော marine spirillum ဘက်တီးရီးယား၊ နှင့် Alphaproteoellabacteria၊ ယခင်က genus နှင့်သက်ဆိုင်သည်။ Oceanospirillum ဟုခေါ်သော "ဝင်ရိုးစွန်းရုပ်ရှင်" 45 ကိုပြသထားသည်။ Cocci ပုံစံများကို အသက်ကြီးသောယဉ်ကျေးမှုများတွင် တွေ့ရလေ့ရှိပြီး အထူးသဖြင့် Vibrio၊ Campylobacter နှင့် Helicobacter 46၊ 47၊ 48 ကဲ့သို့သော ကွေးညွှတ်သောပုံစံရှိသော ဘက်တီးရီးယားများအတွက် Cocci ပုံစံများကို တွေ့ရတတ်သည်။ ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများ၏ တိကျသောဘဝသံသရာကို ရှင်းလင်းရန် နောက်ထပ်လုပ်ဆောင်ရန် လိုအပ်ပါသည်။ ၎င်းသည် ဖမ်းယူဖမ်းယူနည်းကို ဆုံးဖြတ်ရန်နှင့် ၎င်း၏ဂျီနိုမ်သည် ဆေးဘက်ဆိုင်ရာ သို့မဟုတ် ဇီဝနည်းပညာဆိုင်ရာ ရည်ရွယ်ချက်များအတွက် အသုံးပြုနိုင်သည့် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ တက်ကြွသောဒြပ်ပေါင်းများကို ကုဒ်လုပ်ခြင်းရှိမရှိ ဆုံးဖြတ်ရန်။
Venatorbacter gen ၏ ရှင်းလင်းချက် နိုဝင်ဘာလ Venatorbacter (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. သည် L. n. venator,'hunter' နှင့် Gr. n. bacter,'a rod'။ Venatorbacter,'a hunter Rod' ဆဲလ်များသည် အေရိုးဗစ်၊ ဆားဒဏ်ခံနိုင်သော၊ ကွေးညွှတ်သော Gram အစွန်းအထင်း၊ လေ့ကျင့်ခန်းပြုလုပ်သော တုတ်တံနှင့် oxidase တို့သည် အပေါင်းလက္ခဏာဆောင်သည်။ အပူချိန် 4 မှ 42 ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင် ပေါက်နေသော pH သည် အဏ္ဏဝါခရုများတွင် ပုံမှန်မဟုတ်သော အက်ဆစ် pH အများစုမှာ C16:1ω6c နှင့်/သို့မဟုတ် C16:1ω7c ဖြစ်သည်။ , C16:0 နှင့် C18:1ω9 ; C12:0 3-OH နှင့် C10:0 3-OH တို့ဖြစ်သည်။ ဟိုက်ဒရိုစီအက်ဆစ်အဖြစ် ၎င်းတို့သည် ဟင်းရည်မီဒီယာတွင် ပေါက်ပွားခြင်းမရှိသည့် DNA G+C ပါဝင်မှုသည် ဤမျိုးစု၏အဖွဲ့ဝင်များသည် Campylobacter ကိုခံနိုင်ရည်ရှိပြီး Enterobacteriaceae မိသားစု၏ ဇီဝကမ္မအနေအထားကို ပြသသည်။ မိသားစုထဲမှာရှိတယ်။
Venatorbacter cucullus sp ၏ ရှင်းလင်းချက် နိုဝင်ဘာ Venatorbacter cucullus (cu'cull.us.; L. n. cucullus ဆိုသည်မှာ fairing)။
ထို့အပြင်၊ ဤမျိုးစိတ်၏ဖော်ပြချက်အင်္ဂါရပ်မှာ BA သို့မဟုတ် BHI တွင် ကြီးထွားလာသောအခါ ဆဲလ်များသည် 1.63 µm ရှည်ပြီး 0.37 µm ကျယ်သောကြောင့်ဖြစ်သည်။ BHI agar ပေါ်ရှိ ကိုလိုနီများသည် အလွန်သေးငယ်ပြီး 72 နာရီအကြာတွင် အချင်း 2 မီလီမီတာအထိရှိသည်။ ၎င်းတို့သည် အဝါနုရောင်ရှိသော၊ ဖောက်ပြန်၊ အဝိုင်း၊ ခုံးနှင့် တောက်ပြောင်သည်။ ဤမျိုးစိတ်၏အဖွဲ့ဝင်များသည် Escherichia coli နှင့် Klebsiella ကိုသုံးနိုင်သည်။ Campylobacter နှင့် အခြား Gram-negative ဘက်တီးရီးယား အများအပြားသည် သားကောင်အဖြစ် လုပ်ဆောင်ကြသည်။
ပုံမှန်မျိုးကွဲ ASxL5T ကို ယူကေ၊ Nottinghamshire ရှိ အမဲသားနို့မှ ခွဲထုတ်ပြီး အမျိုးသားအမျိုးအစား ယဉ်ကျေးမှု စုဆောင်းခြင်း (UK) တွင် အပ်နှံထားသည်- ဝင်ခွင့်နံပါတ် NCTC 14397 နှင့် နယ်သာလန် ဘက်တီးရီးယား ယဉ်ကျေးမှု စုဆောင်းခြင်း (NCCB) ချိတ်ဆက်မှု နံပါတ် NCCB 100775။ AEXL5T ၏ ဂျီနိုမ် အမျိုးအစား အပြည့်အစုံ ထပ်တိုးမှုအရ Genbank တွင် အပ်နှံထားသည်။ CP046056။
ASxL5T ဘက်တီးရီးယားများကို phage isolation technology9,49 ကို အသုံးပြု၍ အမဲသားနို့မှ ခွဲထုတ်ခဲ့သည်။ slurry ကို SM ကြားခံ (50 mM Tris-HCl [pH 7.5]၊ 0.1 M NaCl၊ 8 mM MgSO4.7H2O နှင့် 0.01% gelatin၊ Sigma Aldrich၊ Gillingham၊ UK) တွင် slurry ကို 1:9 (w/v) ကို မှေးမှိန်သွားသည်၊ ထို့နောက် သားဖောက်ပါ။ 4°C တွင် 24 နာရီကြာအောင် ဖြည်းညှင်းစွာ လှည့်ပါ။ ကြားခံထဲသို့ သားကောင်များ။ ဆိုင်းထိန်းစနစ်ကို 3000g တွင် 3 မိနစ်ကြာ ဗဟိုပြုထားသည်။ အဆိုပါ supernatant ကို 13,000g တွင် စုစည်းပြီး 5 မိနစ်ကြာ ဒုတိယ အကြိမ်အဖြစ် ဗဟိုပြုခဲ့သည်။ ထို့နောက် supernatant အား 0.45 µm အမြှေးပါးဇကာ (Minisart; Sartorius, Gottingen, Germany) နှင့် 0.2 µm အမြှေးပါးဇကာ (Minisart) မှတဆင့် ကျန်ရှိသော ဘက်တီးရီးယားဆဲလ်များကို ဖယ်ရှားပေးပါသည်။ ASxL5T သည် ဤစစ်ထုတ်မှုများကို ကျော်ဖြတ်နိုင်သည်။ တူညီသော slurry မှ Campylobacter enterosus S12 (NCBI ချိတ်ဆက်မှုနံပါတ် CP040464) ၏ ပျော့ပျောင်းသော agar မြက်ခင်းကို စံနည်းစနစ်များကို အသုံးပြု၍ ပြင်ဆင်ခဲ့ပါသည်။ စစ်ထုတ်ထားသော slurry ကို triplicate ဖြင့် 10 µl အစက်များဖြင့် ဤအိမ်ရှင်ဆဲလ်ပြားတစ်ခုစီတွင် ဖြန့်ဝေပြီး ခြောက်ရန်ခွင့်ပြုထားသည်။ ပန်းကန်ပြားအား 37°C တွင် မိုက်ခရိုအေရိုးဗစ်အခြေအနေများ (5% O2၊ 5% H2၊ 10% CO2 နှင့် 80% N2) တွင် 48 နာရီကြာ microaerophilic tank တွင် ပေါက်ဖွားခဲ့သည်။ ရရှိလာသော မြင်သာသော plaque ကို SM ကြားခံအဖြစ်သို့ ထုတ်ယူပြီး C. hyointestinalis S12 ၏ လတ်ဆတ်သော မြက်ခင်းပြင်သို့ ရွေ့လျားကာ lysed organisms များ ပိုမိုပြန့်ပွားလာစေရန်။ ဘက်တီးရီးယားများသည် lytic plaque ၏အကြောင်းရင်းဖြစ်ပြီး phage မဟုတ်ကြောင်းဆုံးဖြတ်ပြီးသည်နှင့်၊ ၎င်းကိုအိမ်ရှင်နှင့်အမှီအခိုကင်းစွာကြီးထွားရန်ကြိုးစားပြီး၎င်းကိုထပ်မံဖော်ပြပါ။ အေရိုးဗစ်ယဉ်ကျေးမှုကို 37°C တွင် 5% v/v defibrinated မြင်းသွေး (TCS Biosciences Lt, Buckingham, UK, supplement) ဖြင့် ပြုလုပ်ခဲ့သည်။ အမျိုးသားဆေးဘက်ဆိုင်ရာစံချိန်စံညွှန်းကော်မတီ၏လမ်းညွှန်ချက်များအရ၊ disc ပျံ့နှံ့မှုနည်းလမ်းကို antibacterial ခံနိုင်ရည်စစ်ဆေးမှုအတွက်အသုံးပြုသည်။ BHI agar သည် အေရိုးဗစ်ယဉ်ကျေးမှုအတွက် အောက်ပါပဋိဇီဝဆေးများ (Oxoid) ပါဝင်သော disc ကိုအသုံးပြု၍ အပူချိန် 37°C တွင် မွေးမြူခဲ့သည်- amoxicillin နှင့် clavulanic acid 30 µg; cefotaxime 30 µg; streptomycin 10 µg; ciprofloxacin 5 µg; Ceftazidime 30 µg Nalidixic acid 30 µg; Imipenem 10 µg; Azithromycin 15 µg; Chloramphenicol 30 µg; Cefoxitin 30 µg; တက်ထရာဆိုက်ကလင်း 30 µg; Nitrofurantoin 300 µg; Aztreonam 30 µg; Ampicillin 10 µg ; Cefpodoxime 10 µg; Trimethoprim-Sulfamethoxazole 25 µg၊ ဆားခံနိုင်ရည်ကို ၃၇ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင် BHI ကျောက်ကပ်ပြားများတွင် အေရိုးဗစ်ပေါက်ပွားခြင်းဖြင့် တည်ရှိသည်။ အာရုံစူးစိုက်မှုအကွာအဝေး 10% w/v အထိပေးစွမ်းရန် အပို NaCl ကို BHI agar plates များထဲသို့ ထည့်ထားသည်။ pH အကွာအဝေးကို 37°C တွင် BHI agar plates တွင် aerobic culture မှဆုံးဖြတ်ပြီး pH range ကို 4 နှင့် 9 ကြားတွင် sterile HCl သို့မဟုတ် sterile NaOH ဖြင့် ချိန်ညှိထားပြီး ပစ်မှတ် pH တန်ဖိုးကို ပန်းကန်မလောင်းမီ စစ်ဆေးအတည်ပြုပါသည်။ ဆဲလ်လူလာဖက်တီးအက်ဆစ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအတွက် ASxL5T ကို BHI agar တွင် ၃ ရက်ကြာ မွေးမြူပြီး ၃၇ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင် အေရိုးဗစ်။ MIDI (Sherlock Microbial Identification System၊ ဗားရှင်း 6.10) သည် FERA Science Ltd၊ (York၊ UK) ၏ စံပရိုတိုကောအရ၊ ဆဲလ်ဖက်တီးအက်ဆစ်များကို ထုတ်ယူ၊ ပြင်ဆင်ပြီး ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခဲ့သည်။
TEM အတွက်၊ ASxL5T အား BA တွင် 37°C တွင် 24 နာရီကြာ တစ်ပုံစံတည်း ပျံ့နှံ့ခြင်းဖြင့် အေရိုးဗစ်ကို မွေးမြူကာ 1 ml ၏ 3% (v/v) glutaraldehyde အဖြစ်သို့ ရိတ်သိမ်းပြီး 0.1 M cacodylate ကြားခံကို အခန်းအပူချိန်တွင် 1 နာရီကြာ Fix ပြီးနောက် centrifuge 10,000 ဂရမ်တွင် 3 မိနစ်။ ထို့နောက် 600 μl 0.1 M cacodylate ကြားခံတွင် အမှုန့်ကို ညင်သာစွာ ပြန်ရပ်ပါ။ ပုံသေ ASxL5T ဆိုင်းထိန်းစနစ်ကို 200 mesh ကြေးနီဇယားတွင် Formvar/carbon ဖလင်သို့ လွှဲပြောင်းပါ။ ဘက်တီးရီးယားများကို 0.5% (w/v) uranyl acetate ဖြင့် 1 မိနစ်ကြာ စွန်းထင်းခဲ့ပြီး TEM မှ TEI Tecnai G2 12 Biotwin microscope ကို အသုံးပြု၍ စစ်ဆေးခဲ့သည်။ အထက်ဖော်ပြပါအတိုင်း၊ NZCYM ဟင်းရည် (BD Difco™၊ Fisher Scientific UK Ltd၊ Loughborough) တွင် သားကောင်နှင့် သားကောင်အရေအတွက်တူကို ပေါင်းစပ်ပြီး Campylobacter သို့မဟုတ် Campylobacter ၏ အပူချိန် ၃၇ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင် ၄၈ နာရီကြာ သားဖောက်၊ သားကောင်နှင့် သားကောင်များ၏ အပြန်အလှန်အကျိုးပြုမှု။ TEM မှလည်း စစ်ဆေးခဲ့သည်။ Escherichia coli အတွက် အေရိုးဗစ်အခြေအနေ။ ဖောက်ပြန်မှုကြောင့် ဆဲလ်ပုံသဏ္ဍာန်ပြောင်းလဲမှုများကို ဆုံးဖြတ်ရန် သားကောင်နှင့် သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားများကို သီးခြားစစ်ဆေးပါ။ ဆူဒန်လူမည်းနည်းလမ်းကို PHB စုဆောင်းမှု၏ optical microscopy အတွက်အသုံးပြုခဲ့သည်။
BHI သို့မဟုတ် BA ပြားများပေါ်တွင် ပိုးသတ်ဆေးဖြင့် သုတ်လိမ်းခြင်းဖြင့် ASxL5T နေ့ချင်းညချင်း ယဉ်ကျေးမှုများကို မွေးမြူပါ။ ASxL5T ဆဲလ်များကို စုဆောင်းပြီး ၎င်းတို့ကို MRD (CM0733၊ Oxoid) တွင် ဆိုင်းငံ့ထားပြီး ဆဲလ်များကို အစာငတ်စေရန် 4°C တွင် 7 ရက်ထားပါ။ NCTC ရည်ညွှန်းချက် သို့မဟုတ် ဓာတ်ခွဲခန်းစတော့ရှယ်ယာ ဘက်တီးရီးယားယဉ်ကျေးမှုကို BHI ဟင်းရည် သို့မဟုတ် နံပါတ် 2 အာဟာရဟင်းရည် (CM007၊ Oxoid) တွင် ညတွင်းချင်းပေါက်ဖွားပြီး 13,000 ဂရမ်တွင် ဗဟိုပြု၍ MRD တွင် OD600 တွင် 0.4 အထိ ပြန်လည်ထည့်သွင်းထားသည်။ ယဉ်ကျေးမှု- Bacillus subtilis NCTC 3610T၊ Citrobacter freundii NCTC 9750T၊ Enterobacter aerogenes NCTC 10006T၊ Enterococcus faecalis NCTC 775T၊ Escherichia coli NCTC 86၊ Klebsiella 46ocostca၊ 10817၊ Listeria အထူးဘက်တီးရီးယား NCTC 4885၊ Bacillus macerans NCTC 6355T၊ Providencia stuartsii NCTC 10318၊ Pseudomonas fluorescens SMDL၊ Rhodococcus ရေငုပ်သင်္ဘော ဟမ်ဘာဂါ NCTC 1621NC၊ Salmonella5TC 7TC7 intestinal ဘက်တီးရီးယား၊ NCTC 10861၊ Staphylococcus aureus NCTC 8532T၊ Streptococcus pneumoniae NCTC 7465T၊ Yersinia enterocolitica NCTC 10460။ Campylobacter လက်ခံသူသည် 37°C တွင် BA ပန်းကန်ပြားများပေါ်တွင် မိုက်ခရိုလေရောဗက်များဖြင့် ပေါက်ဖွားခဲ့သည်။ စမ်းသပ်ထားသော Campylobacter host များမှာ- C. coli 12667 NCTC, C. jejuni 12662, C. jejuni PT14, C. jejuni NCTC 11168T, C. helveticus NCTC 12472, C. lari NCTC 11458NC5TC, C. lari PT14၊ C... MRD တွင် ဆဲလ်များကို စုဆောင်းပါ၊ 13,000g တွင် ဗဟိုပြု၍ OD600 သည် 0.4 အထိ MRD တွင် ပြန်ရပ်သည်။ 5 ml အရည်ကျိုထားသော NZCYM ထိပ်တန်းကျောက်ကျော (0.6% agar) သို့ 0.5 ml suspension ၏ aliquot ကိုထည့်ကာ 1.2% NZCYM အောက်ခြေပန်းကန်ပေါ်သို့ လောင်းထည့်ပါ။ ကုသပြီး အခြောက်ခံပြီးနောက်၊ စဉ်ဆက်မပြတ် အရောဝင်ထားသော ASxL5T အား မြက်ခင်းဘုတ်တစ်ခုစီတွင် 20 µl အမှုန်အမွှားများအဖြစ် triplicate ဖြင့် ဖြန့်ဝေခဲ့သည်။ ယဉ်ကျေးမှု အပူချိန်နှင့် လေထုသည် စမ်းသပ်ဘက်တီးရီးယားများ၏ လိုအပ်ချက်များပေါ်တွင် မူတည်ပါသည်။
ဘက်တီးရီးယားအထီးကျန်များမှ DNA ကိုပြင်ဆင်ရန် GenElute™ ဘက်တီးရီးယားမျိုးရိုးဗီဇ DNA Kit (Sigma Aldridge) ကိုသုံးပါ။ စံနည်းလမ်းများကို 16S rRNA gene ၏ PCR ချဲ့ထွင်ခြင်းနှင့် ဆိုးဆေးဖြတ်ခြင်းဓာတုဗေဒ (Eurofins Value Read Service၊ Germany) ကို အသုံးပြု၍ ထုတ်ကုန် sequence ပြဌာန်းခြင်းအတွက် စံနည်းလမ်းများကို အသုံးပြုခဲ့သည်။ အနီးကပ်ဆက်နွယ်သောမျိုးစိတ်များကိုခွဲခြားသတ်မှတ်ရန်နှင့်စုဆောင်းရန်အတွက်အခြား 16S rRNA ဗီဇအစီအစဉ်များနှင့် BLAST-N ပရိုဂရမ်ကိုအသုံးပြုပါ။ ၎င်းတို့သည် MEGA X ပရိုဂရမ်ရှိ ClustalW ကို အသုံးပြု၍ ချိန်ညှိထားသည်။ Tamura-Nei မော်ဒယ်ကို အခြေခံ၍ 1000 ပဲ့ထိန်းအုပ်ရေ 54 ဖြင့် ဇီဝကမ္မသစ်ပင်ကို MEGA X ဖြင့် ပြန်လည်တည်ဆောက်ခဲ့သည်။ PureLink™ Genomic DNA Kit (Fisher Scientific၊ Loughborough၊ UK) ကို အသုံးပြု၍ ဂျီနိုမ် စီစီခြင်းအတွက် DNA ကို ထုတ်ယူပါ။ ASxL5T ၏ ဂျီနိုမီအစီအစဥ်အား Nextera တံဆိပ်တပ်ခြင်းကိရိယာကို အသုံးပြု၍ ပြင်ဆင်ထားသည့် စာကြည့်တိုက်တစ်ခုဖြင့် ဖွဲ့စည်းထားသည့် 250 bp နှစ်ဆဖတ်သည့် Illumina MiSeq ပေါင်းစပ်မှုကို အသုံးပြု၍ ဆုံးဖြတ်ခဲ့သည်၊ Sembia တက္ကသိုလ်ရှိ Genomics DNA Sequencing Research Facility ဂျီနိုမ်ကို CLC Genomics Workbench 12.0.3 (Qiagen၊ Aarhus၊ Denmark) ကို အသုံးပြု၍ စုစည်းထားသည်။ ASxL5T ယဉ်ကျေးမှုများကို National Type Culture Collection (UK) နှင့် Netherlands Bacterial Culture Collection (NCCB) တွင် အပ်နှံထားသည်။ နှိုင်းယှဉ်ရန်အတွက်အသုံးပြုသောဆက်စပ်သက်ရှိများ၏ genomes များမှာ- Thalassolituus oleivorans MIL-1T (အသုံးပြုခွင့်နံပါတ် HF680312၊ ပြီးပြည့်စုံ); Bacterioplanes sanyensis KCTC 32220T (အသုံးပြုခွင့်နံပါတ် BMYY01000001၊ မပြည့်စုံ); Oceanobacter kriegii DSM 6294T (အသုံးပြုခွင့်နံပါတ် NZ_AUGV00000000၊ မပြည့်စုံ); Marinamonas အသိုင်းအဝိုင်း DSM 5604T (ထပ်ထည့်ထားသော ASM436330v1၊ မပြည့်စုံ)၊ Oceanospirullum linum ATCC 11336T (ထည့်သွင်းထားသော MTSD02000001၊ မပြည့်စုံ) နှင့် Thalassolituus sp။ C2-1 (NZ_VNIL01000001 ထည့်ပါ၊ မပြည့်စုံပါ)။ JGI Genome Portal36 ကို https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= တွင် ချိန်ညှိမှုရမှတ် (AF) နှင့် ပျမ်းမျှ nucleic acid အထောက်အထား (ANI) ကို ဆုံးဖြတ်ရန်။ အတွဲ။ အမိုင်နိုအက်ဆစ်အထောက်အထား (AAI) ကိုဆုံးဖြတ်ရန် Rodriguez-R & Konstantinidis55 ကိုအသုံးပြုခဲ့သည်။ ခန့်မှန်းခြေ အများဆုံးဖြစ်နိုင်ချေရှိသော ဇီဝမျိုးဗီဇသစ်ပင်ကို ထုတ်လုပ်ရန် GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 ကို အသုံးပြုပါ။ ရရှိနိုင်သောရည်ညွှန်းဂျီနိုမ်ကိုကိုယ်စားပြုသည့်ထည့်သွင်းခြင်းဂျီနိုမ်ကို 16S rRNA phylogeny မှ ASxL5T နှင့်ဆက်စပ်သည်ဟုသတ်မှတ်ထားသောအကိုးအကားအမျိုးအစားမှရွေးချယ်ထားသည်။ အပြန်အလှန်အကျိုးပြုသောသက်ရှိသစ်ပင်အွန်လိုင်းတူးလ် (https://itol.embl.de/) ကို အသုံးပြု၍ သစ်ပင်ကို အမှတ်အသားပြုထားသည်။ ASxL5T ဂျီနိုမ်၏ လုပ်ဆောင်ချက်ဆိုင်ရာ မှတ်ချက်နှင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းကို KEGG (မျိုးရိုးဗီဇနှင့် မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ စွယ်စုံကျမ်း) မော်ဂျူးကို အသုံးပြု၍ BlastKOALA KEGG အွန်လိုင်းတူးလ်ကို အသုံးပြု၍ လုပ်ဆောင်သည်။ COG အမျိုးအစားများ ဖြန့်ဖြူးခြင်းကို eggNOG-mapper အွန်လိုင်းတူးလ်ကို အသုံးပြု၍ ဆုံးဖြတ်သည်။
Pérez, J., Moraleda-Muñoz, A., Marcos-Torres, FJ နှင့် Muñoz-Dorado, J. Bacterial predation: 75 နှစ်ကြာပြီး ဆက်လက်တည်ရှိနေပါသည်။ . ပတ်ဝန်းကျင်။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ ၁၈၊ ၇၆၆–၇၇၉ (၂၀၁၆)။
Linares-Otoya, L. စသည်တို့။ ပီရူးကမ်းရိုးတန်းရှိ သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားများ၏ ကွဲပြားမှုနှင့် ဘက်တီးရီးယားပိုးများ အလားအလာ။ မတ်ဆေးများ။ 15. E308။ https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017)။
Pasternak, Z. et al. ၎င်းတို့၏ မျိုးဗီဇများမှတဆင့်၊ သင်သည် ၎င်းတို့အား နားလည်နိုင်လိမ့်မည်- သားကောင်များဖြစ်သော ဘက်တီးရီးယားများ၏ မျိုးဗီဇလက္ခဏာများ။ ISME J. 7၊ 756–769 (2013)။
Sockett, RE bacteriophage Bdellovibrio ၏ ရိုင်းစိုင်းသော နေထိုင်မှုပုံစံ။ install လုပ်ပါ။ သင်းအုပ်ဆရာ အဏုဇီဝ။ 63၊ 523–539 (2009)။
Korp, J., Vela Gurovic, MS & Nett, M. အကောင်ကြီးသော ဘက်တီးရီးယားများမှ ပဋိဇီဝဆေးများ။ Beilstein J. Histochemistry 12၊ 594–607 (2016)။
Johnke, J., Fraune, S., Bosch, TCG, Hentschel, U. & Schulenburg, H. Bdellovibrio နှင့် အလားတူသောသက်ရှိများသည် မတူညီသောအိမ်ရှင်လူဦးရေအတွက် microbiome ကွဲပြားမှုကို ကြိုတင်ခန့်မှန်းသူများဖြစ်သည်။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ ဂေဟဗေဒ။ 79၊ 252–257 (2020)။
Vila, J., Moreno-Morales, J. နှင့် Ballesté-Delpierre, C. ဘက်တီးရီးယားပိုးသတ်ဆေးအသစ်များ၏ လက်ရှိအခြေအနေကို ရှာဖွေပါ။ ဆေးခန်း။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ ကူးစက်သည်။ https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019)။
Hobley, L. et al. phage နှင့် phage ၏နှစ်ထပ်သားကောင်သည် တစ်ကြိမ်မျှမသတ်ဘဲ E. coli သားကောင်ကို ချေမှုန်းနိုင်သည်။ ဂျေဘက်တီးရီးယား။ 202၊ e00629-19။ https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020)။
El-Shibiny, A., Connerton, PL & Connerton, IF အခမဲ့-အကွာအဝေးနှင့် အော်ဂဲနစ်ကြက်များကို အစာကျွေးသည့်စက်ဝန်းအတွင်း သီးခြားခွဲထားသော Campylobacter နှင့် ဘက်တီးရီးယားပိုးမွှားများ၏ အရေအတွက်နှင့် ကွဲပြားမှု။ လျှောက်လွှာပတ်ဝန်းကျင်။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ 71၊ 1259–1266 (2005)။
Wilkinson၊ DA စသည်တို့သည် Campylobacter ဝက်၏ မျိုးဗီဇဆိုင်ရာ စည်းကြပ်မှုနှင့် ကူးစက်ရောဂါဗေဒကို အပ်ဒိတ်လုပ်ပါ။ သိပ္ပံပညာ။ ကိုယ်စားလှယ် 8, 2393. https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018)။
Lee၊ MD GToTree- စနစ်မျိုးရိုးဗီဇအတွက် အသုံးပြုရလွယ်ကူသော အလုပ်အသွားအလာ။ ဇီဝနည်းပညာ 35၊ 4162–4164 (2019)။
Edgar၊ RC MUSCLE- အချိန်နှင့် နေရာ ရှုပ်ထွေးမှုကို လျှော့ချပေးသည့် ဆက်တိုက် ချိန်ညှိမှု အများအပြား နည်းလမ်း။ BMC ဇီဝအချက်အလက်။ 5, 113 (2004)။
Capella-Gutiérrez, S., Silla-Martínez, JM & Gabaldón, T. TrimAl- အကြီးစား phylogenetic ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် အလိုအလျောက် ချိန်ညှိခြင်းနှင့် ချုံ့ခြင်းအတွက် ကိရိယာတစ်ခု။ ဇီဝသတင်းအချက်အလက် 25၊ 1972–1973 (2009)။
Hyatt, D., LoCascio, PF, Hauser, LJ & Uberbacher, EC gene နှင့် metagenomic sequence ဘာသာပြန်ဆိုမှု စတင်သည့် site ခန့်မှန်းချက်။ Bioinformatics 28၊ 2223-2230 (2012)။
Shen, W. & Xiong, J. TaxonKit- ဖြတ်ကျော်ပလပ်ဖောင်းနှင့် ထိရောက်သော NCBI အမျိုးအစားခွဲခြားခြင်းကိရိယာအစုံ။ Bio Rxiv (ဇွန်လ 1 ရက်၊ 2021 တွင်ဝင်ရောက်ခဲ့သည်); https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019)။
စျေးနှုန်း၊ MN၊ Dehal၊ PS & Arkin၊ AP FastTree 2- အနီးစပ်ဆုံး ဖြစ်နိုင်ခြေအများဆုံးသစ်ပင်။ PLoS One 5၊ e9490 (2010)။
Tange၊ O. GNU Parallel (ဇွန်လ 1 ရက်၊ 2021 တွင်ဝင်ရောက်ခဲ့သည်); https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018)။
Kanehisa, M. & Goto, S. KEGG: ကျိုတို ဗီဇနှင့် မျိုးရိုးဗီဇစွယ်စုံကျမ်း။ Nucleic acid သုတေသန။ 28, 27-30 (2000)။
ချက်သမ္မတနိုင်ငံ၊ L. စသည်တို့။ ဖိစီးမှုအား ကာကွယ်ရန်နှင့် အာဟာရအဖြစ် extremolytes ectoine နှင့် hydroxyectoine တို့၏ အခန်းကဏ္ဍ- မျိုးရိုးဗီဇ၊ စနစ်မျိုးရိုးဗီဇ၊ ဇီဝဓာတုဗေဒနှင့် ဖွဲ့စည်းပုံဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု။ ဗီဇ (ဘေဆယ်)။ 9. E177။ https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018)။
Gregson, BH, Metodieva, G., Metodiev, MV, Golyshin, PN & McKew, BA ကွဲပြားသောပရိုတင်းဖော်ပြချက်သည် အဏ္ဏဝါဟိုက်ဒရိုကာဗွန်-ကျဆင်းစေသော ဘက်တီးရီးယား Thalassolituus oleivorans MIL-1 ကြီးထွားစဉ်အတွင်း အလတ်စားနှင့် ရှည်လျားသောကွင်းဆက် alkanes ကြီးထွားလာစဉ်။ ရှေ့။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ ၉း၃၁၃၀ (၂၀၁၈)။
Pasternak, Z., Ben Sasson, T., Cohen, Y., Segev, E., and Jurkevitch, E. သည် phenotypic-specific indicators များကို သတ်မှတ်ခြင်းအတွက် နှိုင်းယှဉ်ထားသော မျိုးရိုးဗီဇနည်းလမ်းအသစ်တစ်ခုသည် ရိုင်းစိုင်းသော ဘက်တီးရီးယား အမှတ်အသား၏ အမွေဆက်ခံမှုကို ဖော်ပြသည်။ Public Science Library One။ 10. e0142933။ https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015)။
Yakimov, MM စသည်တို့သည် Thalassolituus oleivorans မျိုးဗီဇဖြစ်သည်။ နိုဝင်ဘာ၊ sp နို၀င်ဘာလ၊ ဟိုက်ဒရိုကာဗွန်များကို အသုံးပြုရာတွင် အထူးပြုသည့် အဏ္ဏဝါဘက်တီးရီးယား အမျိုးအစားသစ်။ နိုင်ငံတကာ။ J. စနစ်။ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ ၅၄၊ ၁၄၁–၁၄၈ (၂၀၀၄)။
Wang, Y., Yu, M., Liu, Y., Yang, X. & Zhang, XH Bacterioplanoides pacificum gen. နိုဝင်ဘာ၊ sp နိုဝင်ဘာလတွင် တောင်ပစိဖိတ်သမုဒ္ဒရာအတွင်း ပျံ့နှံ့နေသော ပင်လယ်ရေမှ ခွဲထွက်ခဲ့သည်။ နိုင်ငံတကာ။ J. စနစ်။ ဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်။ သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ။ 66၊ 5010–5015 (2016)။