नयाँ प्रकारको ग्राम-नेगेटिभ, एरोबिक, नुन-सहिष्णु, सक्रिय, रड आकारको, र शिकारी ब्याक्टेरिया ASxL5T नटिङ्घमशायर, इङ्गल्याण्डको गाईको गोबर पोखरीबाट अलग गरिएको थियो र यसको शिकारको रूपमा क्याम्पिलोब्याक्टर प्रयोग गरियो। पछि, अन्य क्याम्पिलोब्याक्टर प्रजातिहरू र Enterobacteriaceae परिवारका सदस्यहरू शिकारको रूपमा पत्ता लगाइयो। मेजबान कोशिकाहरू बिना सबकल्चर पछि, ब्रेन हार्ट इन्फ्यूजन आगरमा कमजोर एसेप्टिक वृद्धि हासिल गरियो। इष्टतम वृद्धि अवस्थाहरू 37 °C र pH 7 हो। ट्रान्समिशन इलेक्ट्रोन माइक्रोस्कोपीले शिकारको उपलब्धतासँग सम्बन्धित केही धेरै असामान्य रूपात्मक विशेषताहरू प्रकट गर्‍यो। 16S rRNA जीन अनुक्रम प्रयोग गरी फाइलोजेनेटिक विश्लेषणले संकेत गर्यो कि आइसोलेट समुद्री स्पिरुलिना परिवारको सदस्यसँग सम्बन्धित छ, तर स्पष्ट रूपमा कुनै पनि ज्ञात जीनसको सदस्यको रूपमा वर्गीकृत गर्न सकिँदैन। ASxL5T को पूर्ण-जीनोम अनुक्रमणले समुद्री स्पाइरोचेट्सका सदस्यहरूसँगको सम्बन्ध पुष्टि गर्‍यो। एक डाटाबेस खोजले पत्ता लगायो कि धेरै ASxL5Ts ले 16S rRNA जीन अनुक्रमहरू समुद्र, जमिनको सतह र भूमिगत पानीबाट धेरै असंस्कृत ब्याक्टेरियाहरूसँग साझेदारी गर्दछ। हामी सुझाव दिन्छौं कि तनाव ASxL5T ले नयाँ प्रजातिमा नयाँ प्रजाति प्रतिनिधित्व गर्दछ। हामी Venatorbacter cucullus gen नाम सिफारिस गर्छौं। मंसिर, एसपी। नोभेम्बरमा, ASxL5T प्रकारको तनावको रूपमा प्रयोग गरिएको थियो।
शिकारी ब्याक्टेरिया ब्याक्टेरिया हो जसले जैविक संश्लेषण सामग्री र ऊर्जा प्राप्त गर्न अन्य जीवित ब्याक्टेरियाहरूलाई शिकार गर्ने र मार्ने क्षमता प्रदर्शन गर्दछ। यो मृत सूक्ष्मजीवहरूबाट पोषक तत्वहरूको सामान्य रिकभरी भन्दा फरक छ, र यो परजीवी अन्तरक्रियाहरू भन्दा पनि फरक छ, जसमा ब्याक्टेरियाहरूले उनीहरूलाई नमारकन आफ्नो होस्टसँग घनिष्ठ सम्बन्ध बनाउँछन्। शिकारी ब्याक्टेरियाहरूले विभिन्न जीवन चक्रहरू विकसित गरेका छन् जहाँ तिनीहरू भेटिन्छन् (जस्तै समुद्री बासस्थान) मा प्रशस्त खाद्य स्रोतहरूको फाइदा लिन। तिनीहरू वर्गीकरणको रूपमा विविध समूह हुन्, जुन तिनीहरूको अद्वितीय नसबंदी जीवन चक्र १ द्वारा मात्र जोडिएका छन्। शिकारी ब्याक्टेरियाका उदाहरणहरू धेरै फरक फिलामा फेला परेका छन्, जसमा: प्रोटोब्याक्टेरिया, ब्याक्टेरोइड्स, र क्लोरेला।3। यद्यपि, सबैभन्दा राम्रोसँग अध्ययन गरिएका शिकारी ब्याक्टेरियाहरू Bdellovibrio र Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs4) हुन्। शिकारी ब्याक्टेरियाहरू नयाँ जैविक रूपमा सक्रिय यौगिकहरू र एन्टिब्याक्टेरियल एजेन्टहरूको आशाजनक स्रोत हुन्।
शिकारी ब्याक्टेरियाले माइक्रोबियल विविधता बढाउने र इकोसिस्टमको स्वास्थ्य, उत्पादकता र स्थिरतामा सकारात्मक प्रभाव पार्छ भन्ने विश्वास गरिन्छ। यी सकारात्मक विशेषताहरूको बावजुद, नयाँ सिकारी ब्याक्टेरियामा ब्याक्टेरियाहरू खेती गर्न कठिनाइ र तिनीहरूको जटिल जीवन चक्र बुझ्न कोशिकाको अन्तरक्रियालाई सावधानीपूर्वक अवलोकन गर्नुपर्ने आवश्यकताका कारण केही अध्ययनहरू छन्। यो जानकारी कम्प्युटर विश्लेषणबाट प्राप्त गर्न सजिलो छैन।
बढ्दो एन्टिमाइक्रोबियल प्रतिरोधको युगमा, ब्याक्टेरिया रोगजनकहरूलाई लक्षित गर्न नयाँ रणनीतिहरू अध्ययन भइरहेको छ, जस्तै ब्याक्टेरियोफेज र शिकारी ब्याक्टेरिया 7,8 को प्रयोग। ASxL5T ब्याक्टेरियालाई 2019 मा नटिङ्घमशायर विश्वविद्यालयको डेयरी सेन्टरबाट संकलन गरिएको गाईको गोबरबाट फेज आइसोलेसन टेक्नोलोजी प्रयोग गरी पृथक गरिएको थियो। अनुसन्धानको उद्देश्य जैविक नियन्त्रण एजेन्टको रूपमा सम्भावना भएका जीवहरूलाई अलग गर्नु हो। Campylobacter hyointestinalis एक zoonotic रोगजनक हो, जो बढ्दो मानव आन्द्रा रोगहरु संग सम्बन्धित छ। यो सीरममा सर्वव्यापी छ र लक्षित होस्टको रूपमा प्रयोग गरिन्छ।
ASxL5T ब्याक्टेरियमलाई बीफ जेलीबाट अलग गरिएको थियो किनभने यसले C. hyointestinalis को ल्यानमा बनाइएका फलकहरू ब्याक्टेरियोफेजले उत्पादन गरेको जस्तै थिए। यो एक अप्रत्याशित खोज हो, किनकि फेज अलगाव प्रक्रिया को एक भाग मा 0.2 μm फिल्टर को माध्यम बाट फिल्टर शामिल छ, जो ब्याक्टेरिया कोशिकाहरु लाई हटाउन डिजाइन गरिएको छ। प्लाकबाट निकालिएको सामग्रीको माइक्रोस्कोपिक परीक्षणले सानो ग्राम-नेगेटिभ घुमाउरो रड आकारको ब्याक्टेरियाले पोलीहाइड्रोक्सीब्युटाइरेट (PHB) जम्मा नगरेको खुलासा भयो। शिकार कोशिकाहरूबाट स्वतन्त्र एसेप्टिक संस्कृति समृद्ध ठोस माध्यम (जस्तै मस्तिष्क हृदय इन्फ्यूजन अगर (BHI) र रक्त अगर (BA)) मा महसुस गरिन्छ, र यसको वृद्धि कमजोर हुन्छ। यो भारी inoculum सुधार संग subculture पछि प्राप्त हुन्छ। यो माइक्रोएरोबिक (7% v/v अक्सिजन) र वायुमण्डलीय अक्सिजन अवस्थाहरूमा समान रूपमा बढ्छ, तर एनारोबिक वातावरणमा होइन। 72 घण्टा पछि, उपनिवेशको व्यास धेरै सानो थियो, 2 मिमी पुग्यो, र यो बेज, पारदर्शी, गोलाकार, उत्तल र चम्किलो थियो। मानक बायोकेमिकल परीक्षण बाधित छ किनभने ASxL5T तरल मिडियामा भरपर्दो रूपमा कल्चर गर्न सकिँदैन, जसले सुझाव दिन्छ कि यो बायोफिल्म गठनको जटिल जीवन चक्रमा निर्भर हुन सक्छ। यद्यपि, प्लेट निलम्बनले देखायो कि ASxL5T एरोबिक छ, अक्सिडेज र क्याटालेजको लागि सकारात्मक छ, र 5% NaCl सहन सक्छ। ASxL5T 10 µg स्ट्रेप्टोमाइसिन प्रतिरोधी छ, तर परीक्षण गरिएका अन्य सबै एन्टिबायोटिकहरूप्रति संवेदनशील छ। ASxL5T ब्याक्टेरिया कोशिकाहरू TEM (चित्र 1) द्वारा जाँच गरियो। जब BA मा शिकार कोषहरू बिना हुर्किन्छ, ASxL5T कोशिकाहरू साना क्याम्पिलोब्याक्टर हुन्छन्, जसको औसत लम्बाइ 1.63 μm (± 0.4), 0.37 μm (± 0.08) को चौडाइ र एकल लामो (5 μm सम्म) पोल हुन्छ। यौन फ्ल्यागेला। लगभग 1.6% कोशिकाहरू 0.2 μm भन्दा कम चौडाइ भएको देखिन्छ, जसले फिल्टर उपकरण मार्फत पारित गर्न अनुमति दिन्छ। फेयरिङ (ल्याटिन ककुलस) जस्तै (1D, E, G मा तीरहरू हेर्नुहोस्) जस्तै केही कक्षहरूको शीर्षमा एउटा असामान्य संरचनात्मक विस्तार देखियो। यो अतिरिक्त बाहिरी झिल्लीबाट बनेको देखिन्छ, जुन पेरिप्लाज्मिक खामको आकारमा तीव्र कमीको कारण हुन सक्छ, जबकि बाहिरी झिल्ली अक्षुण्ण रहन्छ, "ढिला" उपस्थिति देखाउँदै। ASxL5T को पोषक तत्वहरूको अनुपस्थितिमा (PBS मा) लामो समयसम्म 4°C मा संवर्धन गर्दा धेरैजसो (तर सबै होइन) कोशिकाहरूले कोकल मोर्फोलजी (चित्र 1C) देखाउँछन्। जब ASxL5T Campylobacter jejuni सँग 48 घण्टाको लागि शिकारको रूपमा बढ्छ, औसत कोषको आकार होस्ट बिना बढेको कोशिकाहरू भन्दा धेरै लामो र साँघुरो हुन्छ (तालिका 1 र चित्र 1E)। यसको विपरित, जब ASxL5T 48 घण्टाको लागि शिकारको रूपमा E. coli सँग बढ्छ, औसत कोष आकार लामो र फराकिलो हुन्छ जब यो शिकार बिना बढ्छ (तालिका 1), र सेल लम्बाइ परिवर्तनशील हुन्छ, सामान्यतया फिलामेन्टस (चित्र 1F) देखाउँछ। क्याम्पिलोब्याक्टर जेजुनी वा ई. कोलाई 48 घण्टाको लागि शिकारको रूपमा इन्क्युबेटेड हुँदा, ASxL5T कोशिकाहरूले कुनै पनि फ्ल्यागेला देखाएनन्। तालिका 1 ले ASxL5T को उपस्थिति, अनुपस्थिति, र शिकार प्रकारको आधारमा सेल आकारमा परिवर्तनहरूको अवलोकनहरू संक्षेप गर्दछ।
ASx5LT को TEM प्रदर्शन: (A) ASx5LT ले लामो ह्विप देखाउँछ; (B) विशिष्ट ASx5LT ब्याट्री; (C) कोक्सी ASx5LT कोशिकाहरू पोषक तत्व बिना लामो इन्क्युबेशन पछि; (D) ASx5LT कोशिकाहरूको समूहले असामान्यता देखाउँदछ (E) ASx5LT कोशिका समूहले क्याम्पिलोब्याक्टर शिकारसँग इन्क्युबेटेड कोषको लम्बाइ बढेको देखाएको छ जसको तुलनामा शिकार वृद्धि नभएको (D) ले पनि शिखर संरचना देखायो; (F) ठूलो फिलामेन्टस फ्ल्यागेला, ASx5LT कोशिकाहरू, ई. कोलाई शिकारको साथ इन्क्युबेशन पछि; (G) E. coli संग इन्क्युबेशन पछि एकल ASx5LT सेल, असामान्य शीर्ष संरचना देखाउँदै। पट्टी 1 μm प्रतिनिधित्व गर्दछ।
16S rRNA जीन अनुक्रम (एक्सेसन नम्बर MT636545.1) निर्धारण गर्नाले डाटाबेस खोजहरूलाई Gammaproteobacteria वर्गमा जस्तै क्रमहरू स्थापना गर्न सक्षम बनाउँछ, र समुद्री स्पिरिलम परिवार (चित्र 2) मा समुद्री ब्याक्टेरियाको सबैभन्दा नजिक छ, र थैलासस्युलसको सदस्यहरू हुन्। मरीनको सबैभन्दा नजिकको नातेदार ब्यासिलस। 16S rRNA जीन अनुक्रम Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) परिवारसँग सम्बन्धित शिकारी ब्याक्टेरिया भन्दा स्पष्ट रूपमा फरक छ। B. ब्याक्टेरियोभोरस HD100T (टाइप स्ट्रेन, DSM 50701) र B. ब्याक्टेरियोभोरस DM11A को जोडी तुलना 48.4% र 47.7% थियो, र B. exovorus JSS को लागि यो 46.7% थियो। ASxL5T ब्याक्टेरियासँग 16S rRNA जीनको 3 प्रतिहरू छन्, जसमध्ये दुई एक अर्कासँग समान छन्, र तेस्रो 3 आधारहरू अलग छन्। दुई अन्य हिंसक ब्याक्टेरियल आइसोलेट्स (ASx5S र ASx5O; 16S rRNA जीन एकेसन नम्बरहरू क्रमशः MT636546.1 र MT636547.1 हुन्) एउटै स्थानबाट समान मोर्फोलॉजिकल र फेनोटाइपिक विशेषताहरू एउटै होइनन्, तर तिनीहरू बेकटेरिअल र बेल्टेरिअलबाट भिन्न छन्। डाटाबेस Oceanospirillaceae (चित्र 2) मा अन्य जेनेरासँग अनुक्रमहरू क्लस्टर गरिएका छन्। ASxL5T को सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रम निर्धारण गरिएको छ र NCBI डाटाबेसमा सुरक्षित गरिएको छ, र पहुँच नम्बर CP046056 हो। ASxL5T को जीनोममा 56.1% को G + C अनुपातको साथ 2,831,152 bp को गोलाकार क्रोमोजोम हुन्छ। जीनोम अनुक्रमले 2653 सीडीएस (कुल) समावेश गर्दछ, जसमध्ये 2567 प्रोटिनहरू इन्कोड गर्ने भविष्यवाणी गरिएको छ, जसमध्ये 1596 लाई पुटेटिभ प्रकार्यहरू (60.2%) को रूपमा तोक्न सकिन्छ। जीनोममा 67 RNA-कोडिङ जीनहरू छन्, जसमा 9 rRNA (3 प्रत्येक 5S, 16S, र 23S को लागि) र 57 tRNA हरू छन्। ASxL5T को जीनोमिक विशेषताहरू 16S rRNA जीन अनुक्रम (तालिका 2) बाट पहिचान गरिएको निकटतम सापेक्ष प्रकारको स्ट्रेनहरूको उपलब्ध जीनोमहरूसँग तुलना गरिएको थियो। एमिनो एसिड पहिचान (AAI) प्रयोग गर्नुहोस् सबै उपलब्ध थालासोलिटस जीनोमहरू ASxL5T सँग तुलना गर्न। AAI द्वारा निर्धारित सबैभन्दा नजिकको उपलब्ध (अपूर्ण) जीनोम अनुक्रम थालासोलिटस एसपी हो। C2-1 (NZ_VNIL01000001 थप्नुहोस्)। यो तनाव मारियाना ट्रेन्चको गहिरो-समुद्रको तलछटबाट अलग गरिएको थियो, तर तुलनाको लागि हाल यस तनावको बारेमा कुनै फेनोटाइपिक जानकारी छैन। ASxL5T को 2.82 Mb सँग तुलना गर्दा, जीवको जीनोम 4.36 Mb मा ठूलो छ। समुद्री spirochetes को औसत जीनोम आकार लगभग 4.16 Mb (± 1.1; n = 92 पूर्ण सन्दर्भ जीनोमहरू https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly बाट अनुसन्धान गरिएको छ) हो, त्यसैले ASxL5T को जीनोम अनुरूप छ। अर्डर अन्य सदस्यहरूको तुलनामा, यो एकदम सानो छ। GToTree 1.5.54 प्रयोग गर्नुहोस् जीनोम-आधारित अनुमानित अधिकतम सम्भावना फाइलोजेनेटिक रूख (चित्र 3A) उत्पन्न गर्न, Gammaproteobacteria 11,12,13,165,14, 172 एकल-प्रतिलिपि जीनको पङ्क्तिबद्ध र लिङ्क गरिएको एमिनो एसिड अनुक्रमहरू प्रयोग गरेर। १७,१८। विश्लेषणले यो थालासोलिटस, ब्याक्टेरियल प्लेन र समुद्री ब्याक्टेरियमसँग नजिकको सम्बन्ध रहेको देखाएको छ। यद्यपि, यी तथ्याङ्कहरूले संकेत गर्दछ कि ASxL5T समुद्री स्पिरुलिनामा रहेका आफ्ना आफन्तहरू भन्दा फरक छ र यसको जीनोम अनुक्रम डेटा उपलब्ध छ।
16S rRNA जीन अनुक्रम प्रयोग गरी फाइलोजेनेटिक रूखले ASxL5T, ASxO5, र ASxS5 स्ट्रेन (गट सहित) को स्थितिलाई हाइलाइट गर्दछ समुद्री स्पाइरुलिनेसीमा अकृषित र समुद्री ब्याक्टेरिया स्ट्रेनको सापेक्ष। Genbank Access number ले कोष्ठकहरूमा स्ट्रेन नामलाई पछ्याउँछ। अनुक्रमहरू पङ्क्तिबद्ध गर्न ClustalW प्रयोग गर्नुहोस्, र फाइलोजेनेटिक सम्बन्धहरू अनुमान गर्न अधिकतम सम्भावना विधि र Tamura-Nei मोडेल प्रयोग गर्नुहोस्, र MEGA X कार्यक्रममा 1000 निर्देशित प्रतिकृतिहरू प्रदर्शन गर्नुहोस्। शाखामा रहेको संख्याले निर्देशित प्रतिलिपि मान ५०% भन्दा बढी छ भनी संकेत गर्छ। Escherichia coli U/541T आउटसमूहको रूपमा प्रयोग गरिएको थियो।
(A) जीनोममा आधारित एक फाइलोजेनेटिक रूख, समुद्री Spirospiraceae ब्याक्टेरियम ASxL5T र यसको नजिकका नातेदारहरू, E. coli U 5/41T बीचको सम्बन्धलाई आउटसमूहको रूपमा देखाउँदै। (B) T. oleivorans MIL-1T सँग तुलना गर्दा, जीनको कार्यात्मक श्रेणी वितरण ASx5LT प्रोटिनको अर्थोलोगस समूह (COG) क्लस्टरको आधारमा भविष्यवाणी गरिएको छ। बायाँको चित्रले प्रत्येक जीनोममा प्रत्येक कार्यात्मक COG कोटीमा जीनहरूको संख्या देखाउँछ। दायाँको ग्राफले प्रत्येक कार्यात्मक COG समूहमा निहित जीनोमहरूको प्रतिशत देखाउँछ। (C) T. oleiverans MIL-1T सँग तुलना गरी, ASxL5T को पूर्ण KEGG (क्योटो इन्साइक्लोपीडिया अफ जिन्स एन्ड जेनोम्स) मोड्युलर मार्गको विश्लेषण।
ASxL5T जीनोममा उपस्थित कम्पोनेन्ट जीनहरू जाँच गर्न केईजीजी डाटाबेस प्रयोग गरेर एरोबिक गामा प्रोटियसको विशिष्ट मेटाबोलिक मार्ग पत्ता लाग्यो। ASxL5T ले ब्याक्टेरिया मोटर प्रोटिनहरूलाई तोकिएको कुल 75 जीनहरू समावेश गर्दछ, जसमा केमोट्याक्सिस, फ्लाजेला असेंबली, र टाइप IV फिम्ब्रिया प्रणालीमा संलग्न जीनहरू समावेश छन्। अन्तिम श्रेणीमा, 10 मध्ये 9 जीनहरू अन्य जीवहरूको दायरा घुमाउने आन्दोलनको लागि जिम्मेवार छन्। ASxL5T को जीनोममा पूर्ण tetrahydropyrimidine biosynthetic pathway हुन्छ जुन halophiles को लागि अपेक्षित रूपमा, osmotic stress20 को सुरक्षात्मक प्रतिक्रियामा भाग लिन्छ। जीनोममा रिबोफ्लेभिन संश्लेषण मार्गहरू सहित कोफ्याक्टरहरू र भिटामिनहरूको लागि धेरै पूर्ण मार्गहरू समावेश गर्दछ। यद्यपि alkane 1-monooxygenase (alkB2) जीन ASxL5T मा अवस्थित छ, हाइड्रोकार्बन उपयोग मार्ग पूर्ण छैन। ASxL5T को जीनोम अनुक्रममा, TOL_2658 (alkB) र TOL_2772 (अल्कोहल डिहाइड्रोजनेज) जस्ता T. oleiverans MIL-1T21 मा हाइड्रोकार्बनको ह्रासको लागि मुख्य रूपमा जिम्मेवारका रूपमा पहिचान गरिएका जीनहरूको समरूपताहरू स्पष्ट रूपमा स्पष्ट छन्। चित्र 3B ले ASxL5T र जैतूनको तेल MIL-1T बीच COG श्रेणीमा जीन वितरणको तुलना देखाउँछ। समग्रमा, सानो ASxL5T जीनोमले ठूला सम्बन्धित जीनोमको तुलनामा प्रत्येक COG श्रेणीबाट समानुपातिक रूपमा कम जीनहरू समावेश गर्दछ। जब प्रत्येक कार्यात्मक श्रेणीमा जीनको संख्यालाई जीनोमको प्रतिशतको रूपमा व्यक्त गरिन्छ, अनुवादमा जीनहरूको प्रतिशत, राइबोसोमल संरचना र बायोजेनेसिस कोटीहरू, र ऊर्जा उत्पादन र रूपान्तरण प्रकार्य कोटीहरूमा भिन्नताहरू उल्लेख गरिन्छ, जसले ठूलो ASxL5T गठन गर्दछ। जीनोम प्रतिशतलाई T. oleiverans MIL-1T जीनोममा रहेको एउटै समूहसँग तुलना गरिएको छ। यसको विपरित, ASxL5T जीनोमको तुलनामा, T. oleivorans MIL-1T को प्रतिकृति, पुन: संयोजन र मर्मत, र ट्रान्सक्रिप्शन कोटीहरूमा जीनहरूको उच्च प्रतिशत छ। चाखलाग्दो कुरा के छ भने, दुई जीनोमहरूको प्रत्येक कार्यात्मक श्रेणीको सामग्रीमा सबैभन्दा ठूलो भिन्नता ASxL5T (चित्र 3B) मा अवस्थित अज्ञात जीनको संख्या हो। KEGG मोड्युलहरूको एक संवर्धन विश्लेषण प्रदर्शन गरिएको थियो, जहाँ प्रत्येक KEGG मोड्युलले एनोटेसन र जीनोम अनुक्रम डेटाको जैविक व्याख्याको लागि म्यानुअल रूपमा परिभाषित कार्यात्मक एकाइहरूको सेट प्रतिनिधित्व गर्दछ। ASxL5T र जैतून MIL-1T को पूर्ण KOG मोड्युल मार्गमा जीन वितरणको तुलना चित्र 3C मा देखाइएको छ। यस विश्लेषणले देखाउँछ कि ASxL5T मा पूर्ण सल्फर र नाइट्रोजन मेटाबोलिक मार्ग भए तापनि T. oleiverans MIL-1T ले गर्दैन। यसको विपरित, T. oleiverans MIL-1T सँग पूर्ण सिस्टिन र मेथियोनिन मेटाबोलिक मार्ग छ, तर ASxL5T मा यो अपूर्ण छ। तसर्थ, ASxL5T सँग सल्फेट एसिमिलेसनको लागि एक विशेषता मोड्युल छ (जिनहरूको सेटको रूपमा परिभाषित गरिएको छ जुन फेनोटाइपिक मार्करहरूको रूपमा प्रयोग गर्न सकिन्छ, जस्तै मेटाबोलिक क्षमता वा रोगजनकता; https://www.genome.jp/kegg/module.html) T मा। oleiverans MIL-1T। ASxL5T को जीन सामग्रीलाई सिकारी जीवनशैलीको सुझाव दिने जीनको सूचीसँग तुलना गर्नु अनिर्णयपूर्ण छ। यद्यपि waaL जीन कोरमा O एन्टिजेन पोलिसेकराइडसँग सम्बन्धित लिगेसलाई एन्कोडिङ गर्ने ASxL5T जीनोममा अवस्थित छ (तर यो धेरै ग्राम-नेगेटिभ ब्याक्टेरियाहरूमा सामान्य छ), ट्रिप्टोफान 2,3-डाइअक्सिजेनेज (TDO) जीनले 60 एमिनो समावेश गर्न सक्छ। एसिड क्षेत्रहरू सामान्यतया शिकारी ब्याक्टेरियाहरूमा पाइन्छ जुन उपस्थित हुँदैन। ASxL5T जीनोममा कुनै अन्य शिकारी विशेषता जीनहरू छैनन्, ती एन्कोडिङ इन्जाइमहरू समावेश छन् जुन मेभालोनेट मार्गमा आइसोप्रिनोइड बायोसिन्थेसिसमा समावेश छन्। ध्यान दिनुहोस् कि जाँच गरिएको शिकारी समूहमा कुनै ट्रान्सक्रिप्शनल नियामक जीन gntR छैन, तर तीन gntR-जस्तो जीनहरू ASxL5T मा पहिचान गर्न सकिन्छ।
ASxL5T को फेनोटाइपिक विशेषताहरू तालिका 3 मा संक्षेप गरिएको छ र साहित्यमा रिपोर्ट गरिएको सम्बन्धित जेनेरा 23, 24, 25, 26, र 27 को फेनोटाइपिक विशेषताहरूसँग तुलना गरिएको छ। T. marinus, T. olevorans, B. sanyensis, र Oceanobacter kriegii बाट आइसोलेट्स सक्रिय, नुन-सहिष्णु, अक्सिडेज-सकारात्मक रड-आकारका शरीरहरू छन्, तर ASxL5T सँग लगभग कुनै अन्य फेनोटाइपिक विशेषताहरू छैनन्। महासागरको औसत pH 8.1 (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77) हो, जुन T. marinus, T. olevorans, B. sanyensis र O मा प्रतिबिम्बित हुन्छ। kriegii। ASxL5T ठूला pH दायरा (4-9) गैर-सामुद्रिक प्रजातिहरूको लागि उपयुक्त छ। थालासोलिटस एसपी के फेनोटाइपिक विशेषताहरू। C2-1। अज्ञात। ASxL5T को वृद्धि तापमान दायरा सामान्यतया समुद्री स्ट्रेन (4–42 °C) भन्दा फराकिलो हुन्छ, यद्यपि केहि तर सबै T. marinus आइसोलेट्स गर्मी सहनशील छैनन्। ब्रोथ मिडियामा ASxL5T बढ्न असक्षमताले थप फेनोटाइपिक विशेषतालाई रोक्यो। BA प्लेट, ONPG, arginine dihydrolase, lysine decarboxylase, ornithine decarboxylase, citrate utilization, urease, tryptophan deaminase, gelatin hydrolysis Enzyme बाट स्क्र्याप गरिएको सामग्री परीक्षण गर्न API 20E प्रयोग गर्नुहोस्, परीक्षणको नतिजा सबै नेगेटिभ थिए, तर H2S2 मा कुनै पनि नकारात्मक थिएन। उत्पादन गरिएको थियो। किण्वित कार्बोहाइड्रेटहरू समावेश छन्: ग्लुकोज, म्याननोज, इनोसिटोल, सोर्बिटोल, रामनोज, सुक्रोज, मेलिबायोज, एमिग्डालिन र एराबिनोज। प्रकाशित सम्बन्धित सन्दर्भ स्ट्रेनहरूसँग तुलना गर्दा, ASxL5T स्ट्रेनको सेलुलर फ्याटी एसिड प्रोफाइल तालिका 4 मा देखाइएको छ। मुख्य सेलुलर फ्याटी एसिडहरू C16:1ω6c र/वा C16:1ω7c, C16:0 र C18:1ω9 हुन्। हाइड्रोक्सी फ्याटी एसिड C12:0 3-OH र C10:0 3-OH पनि अवस्थित छन्। ASxL5T मा C16:0 को अनुपात सम्बन्धित जेनेराको रिपोर्ट गरिएको मान भन्दा उच्च छ। यसको विपरित, रिपोर्ट गरिएको T. marinus IMCC1826TT सँग तुलना गर्दा, ASxL5T मा C18:1ω7c र/वा C18:1ω6c को अनुपात घटाइएको छ। oleivorans MIL-1T र O. kriegii DSM 6294T, तर B. sanyensis KCTC 32220T मा पत्ता लागेन। ASxL5T र ASxLS को फ्याटी एसिड प्रोफाइलहरू तुलना गर्दा दुई स्ट्रेनहरू बीचको व्यक्तिगत फ्याटी एसिडको मात्रामा सूक्ष्म भिन्नताहरू पत्ता लाग्यो, जुन एउटै प्रजातिको जीनोमिक डीएनए अनुक्रमसँग मेल खान्छ। सुडान ब्ल्याक टेस्ट प्रयोग गरेर कुनै पोली-3-हाइड्रोक्सीब्युटाइरेट (PHB) कणहरू फेला परेनन्।
ASxL5T ब्याक्टेरियाको शिकार गतिविधि शिकारको दायरा निर्धारण गर्न अध्ययन गरिएको थियो। यो ब्याक्टेरियमले क्याम्पिलोब्याक्टर प्रजातिहरूमा फलकहरू बनाउन सक्छ, जसमा: क्याम्पिलोब्याक्टर सुइस 11608T, क्याम्पिलोब्याक्टर जेजुनी PT14, क्याम्पिलोब्याक्टर जेजुनी 12662, क्याम्पिलोब्याक्टर जेजुनी NCTC 11168T; Escherichia coli NCTC 12667; C. हेल्भेटिकस NCTC 12472; C lari NCTC 11458 र C. upsaliensis NCTC 11541T। ग्राम-नेगेटिभ र ग्राम-पोजिटिभ ब्याक्टेरियाको फराकिलो दायरा परीक्षण गर्न विधिको होस्ट दायरा निर्धारण खण्डमा सूचीबद्ध संस्कृतिहरू प्रयोग गर्नुहोस्। परिणामहरूले देखाउँछन् कि ASxL5T Escherichia coli NCTC 86 र Citrobacter freundii NCTC 9750T मा पनि प्रयोग गर्न सकिन्छ। Klebsiella oxytoca 11466 मा बनाइएको फलकहरू। E. coli NCTC 86 सँगको TEM अन्तरक्रिया चित्र 4A-D मा देखाइएको छ, र Campylobacter jejuni PT14 र Campylobacter suis S12 सँगको अन्तरक्रिया चित्र 4E-H मध्यमा देखाइएको छ। प्रत्येक ASxL5T कोषमा एक वा बढी E. coli कोषहरू जोडिएको र शोषण हुनु अघि विस्तारित सेलको छेउमा पार्श्व रूपमा राखिएको, परीक्षण गरिएका शिकार प्रकारहरू बीच आक्रमणको संयन्त्र फरक देखिन्छ। यसको विपरित, ASxL5T सम्पर्कको एकल बिन्दु मार्फत क्याम्पिलोब्याक्टरसँग जोडिएको देखिन्छ, सामान्यतया शिकारी कोशिकाको शीर्षको सम्पर्कमा र क्याम्पिलोब्याक्टर सेलको शीर्षको नजिक (चित्र 4H)।
ASx5LT र शिकार बीचको अन्तरक्रिया देखाउँदै TEM: (AD) र E. coli prey; (EH) र सी. जेजुनी शिकार। (A) एकल E. coli (EC) कोषसँग जोडिएको एक विशिष्ट ASx5LT सेल; (B) एकल EC सेलमा संलग्न फिलामेन्टस ASx5LT; (C) एक filamentous ASx5LT सेल धेरै EC कोशिकाहरूसँग जोडिएको छ; (D) एकल E. coli (EC) कोषमा संलग्न सानो ASx5LT कक्षहरू; (E) क्याम्पिलोब्याक्टर जेजुनी (CJ) कोषसँग जोडिएको एकल ASx5LT सेल; (F) ASx5LT ले C. hyointestinalis (CH) कोशिकाहरूलाई आक्रमण गर्छ; (G) दुई एक ASx5LT सेलले CJ सेललाई आक्रमण गर्यो; (H) ASx5LT एट्याचमेन्ट पोइन्टको क्लोज-अप दृश्य, CJ सेलको शीर्ष नजिक (बार ०.२ μm)। पट्टीले 1 μm (A-G) मा प्रतिनिधित्व गर्दछ।
शिकारी ब्याक्टेरियाहरू शिकारको प्रचुर स्रोतहरूको फाइदा लिन विकसित भएका छन्। स्पष्ट रूपमा, तिनीहरू धेरै फरक वातावरणमा व्यापक रूपमा उपस्थित छन्। जनसंख्या सदस्यहरूको साँघुरो आकारको कारण, फेज पृथकीकरण विधि प्रयोग गरेर ASxL5T ब्याक्टेरियालाई स्लरीबाट अलग गर्न सम्भव छ। समुद्री ब्याक्टेरियाको oceanospirillaceae परिवारका सदस्यहरूमा ASxL5T को जीनोमिक सान्दर्भिकता आश्चर्यजनक छ, यद्यपि जीव नुन-सहनशील छ र 5% नुन भएको माध्यममा बढ्न सक्छ। स्लरीको पानीको गुणस्तर विश्लेषणले सोडियम क्लोराइडको मात्रा ०.१% भन्दा कम रहेको देखाएको छ। तसर्थ, माटो भौगोलिक र रासायनिक दुवै रूपमा समुद्री वातावरणबाट टाढा छ। एउटै स्रोतबाट तीन सम्बन्धित तर फरक आइसोलेट्सको उपस्थितिले यी शिकारीहरू यस गैर-सामुद्रिक वातावरणमा फस्टाउँदैछन् भन्ने प्रमाण दिन्छ। थप रूपमा, माइक्रोबायोम विश्लेषण (डाटा फाइलहरू https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990 बाट उपलब्ध छ) ले देखाएको छ कि उही 16S rRNA जीन अनुक्रम शीर्ष 50 सबैभन्दा प्रचुर मात्रामा परिचालन कर (OTU) मा अवस्थित छ। ) माटोको केही नमूना अन्तरालहरूमा। Genbank डाटाबेसमा धेरै असंस्कृत ब्याक्टेरियाहरू भेटिए, जसमा 16S rRNA जीन अनुक्रमहरू ASxL5T ब्याक्टेरिया जस्तै छन्। यी अनुक्रमहरू, ASxL5T, ASxS5, र ASxO5 को अनुक्रमहरूसँग, Thalassolituus र Oceanobacter (चित्र 2) बाट अलग गरिएका विभिन्न क्लेडहरू प्रतिनिधित्व गर्दछन्। सन् २००९ मा दक्षिण अफ्रिकी सुन खानीमा तीन प्रकारका असंस्कृत ब्याक्टेरिया (GQ921362, GQ921357 र GQ921396) लाई 1.3 किलोमिटर गहिराइमा फिसर पानीबाट अलग गरिएको थियो, र अन्य दुई (DQ256320 र DQ21320 दक्षिण अफ्रिकाको जमिनबाट) थिए। मा 2005)। 16S rRNA जीन अनुक्रम ASxL5T सँग सबैभन्दा नजिकको सम्बन्ध भएको 16S rRNA जीन अनुक्रमको भाग हो जुन 2006 मा उत्तरी फ्रान्सको समुद्र तटबाट प्राप्त बलौटे तलछटको संवर्धन संस्कृतिबाट प्राप्त गरिएको थियो (एक्सेसन नम्बर AM29240828)। असंस्कृत ब्याक्टेरियम HQ183822.1 बाट अर्को नजिकबाट सम्बन्धित 16S rRNA जीन अनुक्रम चीनको नगरपालिका ल्यान्डफिलबाट लीच गरिएको संग्रह ट्यांकबाट प्राप्त गरिएको थियो। जाहिर छ, ASxL5T ब्याक्टेरिया वर्गीकरण डाटाबेसहरूमा उच्च प्रतिनिधित्व गर्दैनन्, तर असंस्कृत ब्याक्टेरियाका यी अनुक्रमहरूले ASxL5T जस्तै जीवहरूको प्रतिनिधित्व गर्ने सम्भावना हुन्छ, जुन प्राय: चुनौतीपूर्ण वातावरणमा संसारभर फैलिन्छ। सम्पूर्ण जीनोम फाइलोजेनेटिक विश्लेषणबाट, ASxL5T को सबैभन्दा नजिकको सापेक्ष थलासोलिटस एसपी हो। C2-1, T. marinus, T. oleivorans। र O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. Thalassolituus समुद्री बाध्य हाइड्रोकार्बन खण्डीकरण ब्याक्टेरिया (OHCB) को एक सदस्य हो, जो समुद्री र स्थलीय वातावरण मा व्यापक छ, र सामान्यतया हाइड्रोकार्बन प्रदूषण घटनाहरु पछि प्रबल हुन्छ,301। समुद्री ब्याक्टेरिया OHCB समूहका सदस्यहरू होइनन्, तर समुद्री वातावरणबाट अलग छन्।
फेनोटाइपिक डेटाले संकेत गर्छ कि ASxL5T नयाँ प्रजाति हो र समुद्री spirospiraceae परिवारमा पहिले अपरिचित जीनसको सदस्य हो। नयाँ पृथक स्ट्रेनहरूलाई नयाँ जीनसमा वर्गीकरण गर्न हाल कुनै स्पष्ट मानक छैन। सार्वभौमिक जेनेरा सीमाहरू निर्धारण गर्न प्रयास गरिएको छ, उदाहरणका लागि, एक रूढ़िवादी प्रोटीन (POCP) को जीनोमको प्रतिशतमा आधारित, यो सिफारिस गरिएको छ कि कट-अफ मान 50% सन्दर्भ तनावसँग समान छ। अरूले AAI मानहरू प्रयोग गर्ने सुझाव दिन्छन्, जसमा POCP भन्दा फाइदाहरू छन् किनभने तिनीहरू अपूर्ण जीनोमहरू 34 बाट प्राप्त गर्न सकिन्छ। लेखकको विश्वास छ कि यदि AAI मान मोडेल प्रजातिको मोडेल स्ट्रेनको तुलनामा 74% भन्दा कम छ भने, तनाव फरक जेनेराको प्रतिनिधि हो। समुद्री spirillaceae मा मोडेल जीनस समुद्री स्पिरिलम हो, र मोडेल स्ट्रेन O. linum ATCC 11336T हो। ASxL5T र O. linum ATCC 11336T बीचको AAI मान 54.34% छ, र ASxL5T र T. oleivorans MIL-1T (जीनस प्रकार स्ट्रेन) बीचको AAI मान 67.61% छ, जसले ASxL5T ले थालास stuolius बाट फरक फरक जनाउँछ। वर्गीकरण मानकको रूपमा 16S rRNA जीन अनुक्रम प्रयोग गर्दै, सुझाव गरिएको जीनस सीमांकन सीमा 94.5% 35 हो। ASxL5T लाई T. oleivorans MIL-1T र 96.17% सँग 95.03% 16S rRNA अनुक्रम पहिचान देखाउँदै थलासोलिटस जीनसमा राख्न सकिन्छ। marinus IMCC1826T। यद्यपि, यसलाई B. sanyensis NV9 सँग 94.64% 16S rRNA जीन पहिचान भएको Bacteroides genus मा पनि राखिनेछ, जसले 16S rRNA जीन जस्ता एकल जीनको प्रयोगले मनमानी वर्गीकरण र असाइनमेन्ट निम्त्याउन सक्छ भन्ने संकेत गर्दछ। अर्को सुझाव गरिएको विधिले ANI र Genome Alignment Score (AF) को सबै प्रकारका र विद्यमान जेनेराका गैर-प्रकार स्ट्रेनहरूबाट डाटा पोइन्टहरूको क्लस्टरिङ जाँच गर्न प्रयोग गर्दछ। लेखकले विश्लेषण गरिँदै आएको करको अनुमानित जीनसको इन्फ्लेक्शन बिन्दुसँग जीनस सीमा संयोजन गर्न सिफारिस गर्दछ। यद्यपि, यदि थलासोलिटस आइसोलेट्सबाट पर्याप्त पूर्ण जीनोम अनुक्रमहरू छैनन् भने, यो विधिद्वारा ASxL5T थालासोलिटस जीनसको हो कि होइन भनेर निर्धारण गर्न असम्भव छ। विश्लेषणको लागि पूर्ण जीनोम अनुक्रमहरूको सीमित उपलब्धताको कारणले, सम्पूर्ण जीनोम फाइलोजेनेटिक रूखलाई सावधानीपूर्वक व्याख्या गरिनु पर्छ। दोस्रो, सम्पूर्ण जीनोम तुलना विधिहरूले तुलनात्मक जीनोमहरूको आकारमा पर्याप्त भिन्नताहरूको लागि खाता बनाउन सक्दैन। तिनीहरूले सम्बन्धित जेनेराहरू बीच संरक्षित कोर एकल-प्रतिलिपि जीनको समानता मापन गरे, तर ASxL5T को धेरै सानो जीनोममा उपस्थित नभएका जीनहरूको ठूलो संख्यालाई ध्यानमा राखेनन्। जाहिर छ, ASxL5T र Thalassolituus, Oceanobacter, र Bacterioplanes लगायतका समूहहरूको एउटै पूर्वज छ, तर विकासले फरक बाटो लिएको छ, जसले गर्दा जीनोममा कमी आएको छ, जुन शिकारी जीवनशैलीमा अनुकूल हुन सक्छ। यो T. oleivorans MIL-1T को विपरीत हो, जुन 28% ठुलो छ र हाइड्रोकार्बन 23,30 को उपयोग गर्न विभिन्न वातावरणीय दबाब अन्तर्गत विकसित भएको छ। रिकेटसिया, क्लामिडिया र बुचनेरा जस्ता बाध्यकारी इन्ट्रासेलुलर परजीवी र सिम्बियोन्टहरूसँग एक रोचक तुलना गर्न सकिन्छ। तिनीहरूको जीनोम आकार लगभग 1 Mb छ। होस्ट सेल मेटाबोलाइटहरू प्रयोग गर्ने क्षमताले जीन हानि निम्त्याउँछ, त्यसैले महत्त्वपूर्ण विकासवादी जीनोमिक गिरावटको सामना गर्यो। समुद्री रासायनिक पौष्टिक जीवहरूबाट शिकारी जीवनशैलीमा विकासवादी परिवर्तनहरूले जीनोम आकारमा समान कमी ल्याउन सक्छ। COG र KEGG विश्लेषणले ASxL5T र T. oleivorans MIL-1T बीचको जीनोमिक मार्गहरूमा विशेष प्रकार्यहरूका लागि प्रयोग गरिएका जीनहरूको संख्या र विश्वव्यापी भिन्नताहरू हाइलाइट गर्दछ, जुन मोबाइल आनुवंशिक तत्वहरूको व्यापक उपलब्धताको कारणले होइन। ASxL5T को सम्पूर्ण जीनोमको G + C अनुपातमा भिन्नता 56.1% छ, र T. oleivorans MIL-1T को 46.6% छ, जसले यसलाई अलग गरिएको पनि संकेत गर्दछ।
ASxL5T जीनोमको कोडिङ सामग्रीको परीक्षणले फेनोटाइपिक विशेषताहरूमा कार्यात्मक अन्तरदृष्टि प्रदान गर्दछ। जीन इन्कोडिङ प्रकार IV fimbriae (Tfp) को उपस्थिति विशेष चासोको विषय हो किनभने तिनीहरूले सेल आन्दोलनलाई बढावा दिन्छ, जसलाई सामाजिक ग्लाइडिङ वा आक्षेप भनिन्छ, सतहमा फ्ल्यागेला बिना। रिपोर्टहरूका अनुसार, Tfp सँग अन्य कार्यहरू छन्, जसमा शिकार, रोगजनन, बायोफिल्म गठन, प्राकृतिक डीएनए अपटेक, स्वचालित सेल एकत्रीकरण र विकास 38 लगायत छन्। ASxL5T जीनोममा 18 जीनहरू एन्कोडिङ diguanylate cyclase (एक इन्जाइम जसले 2 guanosine triphosphate लाई guanosine 2 phosphate र cyclic diGMP मा रूपान्तरण गर्न उत्प्रेरित गर्दछ) र 6 genes सम्बन्धित diguanylate cyclase को इन्कोडिङ गर्दछ। एस्टेरेजको लागि जीन (चक्रिक di-GMP को गुआनोसिन मोनोफोस्फेटमा घटाउने उत्प्रेरक) रोचक छ किनभने cycl-di-GMP बायोफिल्म विकास र विभाजन, आन्दोलन, सेल संलग्नता र प्रक्रियामा 39, 40 मा संलग्न एक महत्त्वपूर्ण दोस्रो सन्देशवाहक हो। यो पनि ध्यान दिनु पर्छ कि Bdellovibrio ब्याक्टेरियोभोरस मा, चक्रीय डबल GMP लाई मुक्त जीवन र शिकारी जीवनशैली बीचको संक्रमण नियन्त्रण गर्न देखाइएको छ।
सिकारी ब्याक्टेरियामा धेरै अनुसन्धान Bdellovibrio, Bdellovibrio-जस्तो जीवहरू, र Myxococcus प्रजातिहरूमा केन्द्रित छ। यी र शिकारी ब्याक्टेरियाका अन्य ज्ञात उदाहरणहरूले विविध समूह बनाउँछन्। यस विविधताको बावजुद, 11 ज्ञात शिकारी ब्याक्टेरियाको फेनोटाइपहरू प्रतिबिम्बित गर्ने विशेषता प्रोटीन परिवारहरूको सेट 3,22 पहिचान गरिएको छ। यद्यपि, केवल ओ एन्टिजेन लिगेस (waaL) एन्कोड गर्ने जीनहरू पहिचान गरिएको छ, जुन ग्राम-नकारात्मक ब्याक्टेरियाहरूमा विशेष गरी सामान्य छ। विश्लेषणको यो रूप ASxL5T लाई शिकारीको रूपमा तोक्न उपयोगी छैन, सायद यसले नयाँ आक्रमण रणनीति प्रयोग गरेको हुनाले। अधिक विविध शिकारी ब्याक्टेरियल जीनोमहरूको उपलब्धताले समूहका सदस्यहरू बीचको कार्यात्मक र वातावरणीय भिन्नताहरूको खातामा प्रमाण लिने राम्रो रिजोलुसन विश्लेषणहरू विकास गर्न मद्दत गर्नेछ। यस विश्लेषणमा समावेश नगरिएका सिकारी ब्याक्टेरियाका उदाहरणहरूमा Cupriavidus necator42 र Bradymonabacteria43 का सदस्यहरू समावेश छन्, किनभने अन्वेषकहरूले विभिन्न माइक्रोबियल समुदायहरूको खोजी गर्दा, थप शिकारी ट्याक्सा स्थापित हुन्छन्।
TEM छवि द्वारा कब्जा गरिएको ASxL5T ब्याक्टेरियाको सबैभन्दा उल्लेखनीय विशेषता भनेको यसको अद्वितीय र लचिलो आकारविज्ञान हो, जसले शिकार ब्याक्टेरियासँग अन्तरक्रियालाई बढावा दिन सक्छ। अवलोकन गरिएको अन्तरक्रियाको प्रकार अन्य शिकारी ब्याक्टेरिया भन्दा फरक छ र पहिले पत्ता लगाइएको वा रिपोर्ट गरिएको छैन। प्रस्तावित ASxL5T शिकारी जीवन चक्र चित्र 5 मा देखाइएको छ। हामीले यहाँ रिपोर्ट गरे जस्तै समान शिखर संरचना भएको साहित्यमा केही उदाहरणहरू छन्, तर यी उदाहरणहरूमा Terasakiispira papahanaumokuakeensis, एक समुद्री स्पिरिलम ब्याक्टेरिया, कहिलेकाहीं सर्वोच्च वृद्धि 44, र Alphaproteusaquilla, Terasakiispira papahanaumokuakeensis समावेश छ। , पहिले जीनससँग सम्बन्धित Oceanospirillum, प्रदर्शनी तथाकथित "ध्रुवीय फिल्म" 45. Cocci रूपहरू प्रायः पुरानो संस्कृतिहरूमा अवलोकन गरिन्छ, विशेष गरी Vibrio, Campylobacter, र Helicobacter 46, 47, 48 जस्ता घुमाउरो रूपहरू भएका ब्याक्टेरियाहरूका लागि, जसले पतित अवस्थालाई प्रतिनिधित्व गर्न सक्छ। ASxL5T ब्याक्टेरियाको सटीक जीवन चक्र स्पष्ट गर्न थप काम आवश्यक छ। यसले कसरी कब्जा गर्छ र शिकार गर्छ भनेर निर्धारण गर्न, र यसको जीनोमले जैविक रूपमा सक्रिय यौगिकहरूलाई एन्कोड गर्दछ जुन मेडिकल वा बायोटेक्नोलोजिकल उद्देश्यका लागि प्रयोग गर्न सकिन्छ।
Venatorbacter जेन को विवरण। नोभेम्बर भेनेटरब्याक्टर (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. L. n. venator, 'Hunter' र Gr. n. bacter, 'a rod' बाट भेनेटरहरू मिलेर बनेको छ। Venatorbacter, 'a Hunting Rod' कोशिकाहरू एरोबिक, नुन-सहिष्णु, घुमाउरो ग्राम दाग नकारात्मक, क्याटालेस र अक्सिडेज गतिविधि सकारात्मक छन्। PHB 4 देखि 42 डिग्री सेल्सियस सम्म जम्मा हुँदैन :1ω7c, C16:0 र C18:1ω9; C12:0 3-OH र C10:0 3-OH यो ब्रोथ मिडियामा बढ्दैनन्। परिवारमा यस जीनसको फाइलोजेनेटिक स्थिति हुन्छ।
Venatorbacter cucullus sp को विवरण। नोभेम्बर Venatorbacter cucullus (cu'cull.us.; L. n. cucullus अर्थ फेयरिंग)।
थप रूपमा, यस जीनसको वर्णनात्मक विशेषता यो हो कि जब BA वा BHI मा हुर्किन्छ, कोशिकाहरू 1.63 µm लामो र 0.37 µm चौडा हुन्छन्। BHI आगरमा रहेका उपनिवेशहरू धेरै साना छन्, ७२ घण्टापछि २ मिमी व्यास पुग्छन्। तिनीहरू बेज, पारदर्शी, गोलाकार, उत्तल र चमकदार छन्। यस प्रजातिका सदस्यहरूले Escherichia coli र Klebsiella प्रयोग गर्न सक्छन्। क्याम्पिलोब्याक्टर र धेरै अन्य ग्राम-नेगेटिभ ब्याक्टेरियाले शिकारको रूपमा सेवा गर्छन्।
विशिष्ट स्ट्रेन ASxL5T नटिङ्घमशायर, बेलायतमा गाईको मासुको दूधबाट अलग गरिएको थियो र नेशनल टाइप कल्चर कलेक्शन (युके) मा जम्मा गरिएको थियो: एक्सेस नम्बर NCTC 14397 र नेदरल्यान्ड्स ब्याक्टेरियल कल्चर कलेक्शन (NCCB) एक्सेस नम्बर NCCB Theequente 1007. 1007 पूर्ण। भएको छ CP046056 को थप अनुसार Genbank मा जम्मा गरियो।
फेज आइसोलेसन टेक्नोलोजी ९,४९ को प्रयोग गरेर ASxL5T ब्याक्टेरिया गाईको दूधबाट अलग गरिएको थियो। SM बफर (50 mM Tris-HCl [pH 7.5], 0.1 M NaCl, 8 mM MgSO4.7H2O र 0.01% जिलेटिन; Sigma Aldrich, Gillingham, UK), त्यसपछि स्लरी 1:9 (w/v) पातलो गरिएको थियो। 4 डिग्री सेल्सियसमा 24 घण्टाको लागि, बिस्तारै घुमाउँदै बफरमा शिकारीहरू। निलम्बन 3000g मा 3 मिनेटको लागि सेन्ट्रीफ्यूज गरिएको थियो। सुपरनेटेन्ट संकलन गरी १३,००० ग्राममा दोस्रो पटक ५ मिनेटको लागि सेन्ट्रीफ्युज गरियो। सुपरनेट्यान्टलाई त्यसपछि ०.४५ माइक्रोन झिल्ली फिल्टर (मिनिसर्ट; सार्टोरियस, गोटिंगेन, जर्मनी) र ०.२ माइक्रोन झिल्ली फिल्टर (मिनिसार्ट) मार्फत कुनै पनि बाँकी ब्याक्टेरिया कोशिकाहरू हटाउनको लागि पारित गरियो। ASxL5T ले यी फिल्टरहरू पास गर्न सक्छ। उही स्लरीबाट क्याम्पिलोब्याक्टर इन्टरोसस S12 (NCBI एक्सेसन नम्बर CP040464) को नरम अगर ल्यान मानक प्रविधिहरू प्रयोग गरी तयार गरिएको थियो। फिल्टर गरिएको स्लरी यी प्रत्येक होस्ट सेल प्लेटहरूमा 10 μl थोपा ट्रिपलिकेटमा वितरण गरियो र सुक्न अनुमति दिइयो। प्लेटलाई माइक्रोएरोबिक अवस्था (५% O2, 5% H2, 10% CO2, र 80% N2) अन्तर्गत ४८ घण्टाको लागि ३७°C मा माइक्रोएरोफिलिक ट्याङ्कीमा इन्क्युबेटेड गरिएको थियो। प्राप्त दृश्य फलक एसएम बफरमा निकालिएको थियो र लाइसेड जीवहरूलाई थप प्रचार गर्न C. hyointestinalis S12 को ताजा लनमा स्थानान्तरण गरियो। ब्याक्टेरिया लाइटिक प्लेकको कारण हो र फेज होइन भनेर निर्धारण भएपछि, जीवलाई होस्टबाट स्वतन्त्र रूपमा बढ्ने प्रयास गर्नुहोस् र यसलाई थप विशेषता बनाउनुहोस्। एरोबिक संस्कृति 5% v/v defibrinated घोडा रगत (TCS Biosciences Lt, Buckingham, UK, पूरक) संग 37 ° C मा प्रदर्शन गरिएको थियो। राष्ट्रिय क्लिनिकल मानक समितिको दिशानिर्देश अनुसार, डिस्क प्रसार विधि एन्टिब्याक्टेरियल संवेदनशीलता परीक्षणको लागि प्रयोग गरिन्छ। एरोबिक कल्चरको लागि निम्न एन्टिबायोटिक्स (ओक्साइड) युक्त डिस्क प्रयोग गरी बीएचआई अगर 37 डिग्री सेल्सियसमा कल्चर गरिएको थियो: एमोक्सिसिलिन र क्लाभ्युलेनिक एसिड 30 µg; cefotaxime 30 μg; streptomycin 10 μg; ciprofloxacin 5 μg; Ceftazidime 30 µg Nalidixic एसिड 30 µg; Imipenem 10 μg; Azithromycin 15 μg; क्लोराम्फेनिकोल ३० माइक्रोग्राम; Cefoxitin 30 μg; टेट्रासाइक्लिन 30 μg; नाइट्रोफुरेन्टोइन 300 μg; Aztreonam 30 μg; एम्पिसिलिन 10 μg; Cefpodoxime 10 μg; ट्राइमेथोप्रिम-सल्फामेथोक्साजोल 25 माइक्रोग्राम। नुन सहिष्णुता 37 डिग्री सेल्सियसमा बीएचआई अगर प्लेटहरूमा एरोबिक इन्क्युबेशन द्वारा स्थापित गरिएको थियो। 10% w/v सम्मको एकाग्रता दायरा प्रदान गर्न BHI अगर प्लेटहरूमा थप NaCl थपियो। पीएच दायरा बीएचआई एगर प्लेटहरूमा 37 डिग्री सेल्सियसमा एरोबिक कल्चरद्वारा निर्धारण गरिन्छ, जहाँ pH दायरालाई 4 र 9 बीच बाँझ HCl वा बाँझ NaOH मा समायोजन गरिएको छ, र प्लेट खन्याउन अघि लक्ष्य pH मान प्रमाणित गरिन्छ। सेलुलर फ्याटी एसिड विश्लेषणको लागि, ASxL5T बीएचआई आगरमा 3 दिन र एरोबिक 37 डिग्री सेल्सियसमा कल्चर गरिएको थियो। MIDI (Sherlock Microbial Identification System, version 6.10) FERA Science Ltd, (York, UK) को मानक प्रोटोकल अनुसार, सेल फ्याटी एसिडहरू निकासी, तयार र विश्लेषण गरियो।
TEM को लागि, ASxL5T लाई BA मा 24 घण्टाको लागि 37 डिग्री सेल्सियसमा समान रूपमा फैलाएर एरोबिक कल्चर गरिएको थियो, र त्यसपछि कोठाको तापक्रममा 0.1 एम क्याकोडाइलेट बफरमा 3% (v/v) ग्लुटाराल्डिहाइडको 1 मिलीलीटरमा 1 घण्टाको लागि फिक्स गर्नुहोस्, त्यसपछि सेन्ट्रीफ्यूज गर्नुहोस्। 3 मिनेटको लागि 10,000 ग्राम। त्यसपछि बिस्तारै 600 μl 0.1 M cacodylate बफरमा गोली पुन: सस्पेन्ड गर्नुहोस्। फिक्स्ड ASxL5T निलम्बनलाई 200 जालको तामाको ग्रिडमा Formvar/कार्बन फिल्ममा स्थानान्तरण गर्नुहोस्। ब्याक्टेरियालाई १ मिनेटको लागि ०.५% (w/v) युरेनिल एसीटेटले दाग गरिएको थियो र TEI Tecnai G2 12 Biotwin माइक्रोस्कोप प्रयोग गरेर TEM द्वारा जाँच गरियो। माथि उल्लेख गरिए अनुसार, NZCYM ब्रोथ (BD Difco™, Fisher Scientific UK Ltd, Loughborough) मा समान संख्यामा शिकार र सिकारीलाई मिलाउनुहोस् र क्याम्पिलोब्याक्टर वा क्याम्पिलोब्याक्टरको माइक्रोएरोबिक अवस्थाहरूमा ३७ डिग्री सेल्सियसमा ४८ घण्टासम्म इन्क्युबेट गर्नुहोस्, सिकारी र शिकारीको अन्तरक्रिया। TEM द्वारा पनि जाँच गरिएको थियो। Escherichia coli को लागि एरोबिक अवस्था। शिकारको कारण सेल आकार विज्ञानमा कुनै पनि परिवर्तनहरू निर्धारण गर्न शिकार र सिकारी ब्याक्टेरियालाई स्वतन्त्र रूपमा जाँच गर्नुहोस्। सुडान कालो विधि PHB संचय को अप्टिकल माइक्रोस्कोपी को लागी प्रयोग गरिएको थियो।
बीएचआई वा बीए प्लेटहरूमा बाँझ स्वाबको साथ ग्रोथ स्मेयर गरेर रातभर ASxL5T कल्चरहरू बढाउनुहोस्। ASxL5T कोशिकाहरू सङ्कलन गर्नुहोस् र तिनीहरूलाई MRD (CM0733, Oxoid) मा निलम्बन गर्नुहोस्, र त्यसपछि तिनीहरूलाई 4°C मा 7 दिनको लागि कक्षहरूलाई भोकै राख्नको लागि राख्नुहोस्। NCTC सन्दर्भ वा प्रयोगशाला स्टक ब्याक्टेरियल कल्चरलाई BHI ब्रोथ वा नम्बर 2 पोषक ब्रोथ (CM007, Oxoid) मा इन्क्युलेट गरिएको थियो, रातभर इन्क्युबेटेड, 13,000g मा सेन्ट्रीफ्युज गरिएको थियो र OD600 0.4 सम्म MRD मा पुन: निलम्बन गरिएको थियो। संस्कृति: बेसिलस सब्टिलिस NCTC 3610T, Citrobacter freundii NCTC 9750T, Enterobacter aerogenes NCTC 10006T, Enterococcus faecalis NCTC 775T, Escherichia coli NCTC 86, Klebsiella coli NCTC 86, Lebnostoccau14TC 10817, लिस्टेरिया स्पेशल ब्याक्टेरिया NCTC 4885, Bacillus macerans NCTC 6355T, Providencia stuartsii NCTC 10318, Pseudomonas fluorescens SMDL, Rhodococcus पनडुब्बी ह्याम्बर्गर NCTC 1621 मोनटेडेलेस्टिनभिल, सल्लेडेल्टेल्टीसीभिल mucilage NCTC 10861, Staphylococcus aureus NCTC 8532T, Streptococcus pneumoniae NCTC 7465T, Yersinia Enterocolitica NCTC 10460। क्याम्पिलोब्याक्टर होस्ट माइक्रोएरोबिक रूपमा BA °C BA °C 3 एसपीएन्ड ब्रोटेस र एनसीएसपीएन्ड प्लेटहरूमा इन्क्युबेटेड थियो। परीक्षण गरिएका क्याम्पिलोब्याक्टर होस्टहरू हुन्: C. coli 12667 NCTC, C. jejuni 12662, C. jejuni PT14, C. jejuni NCTC 11168T, C. हेल्भेटिकस NCTC 12472, C. lari NCTC 11458, C.5NCTC 11458, C.5NCTC. PT14, C... MRD मा सेलहरू सङ्कलन गर्नुहोस्, 13,000g मा सेन्ट्रीफ्यूज गर्नुहोस् र OD600 0.4 नभएसम्म MRD मा पुन: सस्पेन्ड गर्नुहोस्। 0.5 ml सस्पेन्सनको एलीकोट 5 ml पग्लिएको NZCYM माथि अगर (0.6% agar) मा थप्नुहोस् र यसलाई 1.2% NZCYM तलको प्लेटमा हाल्नुहोस्। निको पार्ने र सुकाइसकेपछि, क्रमशः पातलो ASxL5T लाई प्रत्येक लन बोर्डमा 20 μl थोपाको रूपमा ट्रिपलिकेटमा वितरण गरिएको थियो। संस्कृतिको तापक्रम र वातावरण परीक्षण ब्याक्टेरियाको आवश्यकताहरूमा निर्भर गर्दछ।
GenElute™ ब्याक्टेरियल जेनोमिक DNA किट (Sigma Aldridge) प्रयोग गर्नुहोस् ब्याक्टेरियल आइसोलेट्सबाट DNA तयार गर्न। मानक विधिहरू 16S rRNA जीनको PCR एम्प्लीफिकेशन र डाई टर्मिनेशन केमिस्ट्री (यूरोफिन्स भ्यालु रीड सर्भिस, जर्मनी) को प्रयोग गरेर उत्पादन अनुक्रम निर्धारणको लागि प्रयोग गरिएको थियो। BLAST-N कार्यक्रम प्रयोग गर्नुहोस् यी अनुक्रमहरूलाई अन्य 16S rRNA जीन अनुक्रमहरूसँग नजिकबाट सम्बन्धित प्रजातिहरू पहिचान गर्न र सङ्कलन गर्न तुलना गर्न। यी MEGA X कार्यक्रममा ClustalW प्रयोग गरेर पङ्क्तिबद्ध छन्। फाइलोजेनेटिक रूख 1000 निर्देशित प्रतिलिपिहरू सहित, Tamura-Nei मोडेलमा आधारित अधिकतम सम्भावना विधि प्रयोग गरेर MEGA X प्रयोग गरेर पुनर्निर्माण गरिएको थियो। PureLink™ Genomic DNA Kit (Fisher Scientific, Loughborough, UK) को सम्पूर्ण-जीनोम अनुक्रमणिका लागि DNA निकाल्न प्रयोग गर्नुहोस्। ASxL5T को जीनोम अनुक्रम Illumina MiSeq संयोजन प्रयोग गरेर निर्धारण गरिएको थियो, जसमा 250 bp डबल-एन्डेड रीडहरू समावेश छन् जुन नेक्स्टेरा लेबलिङ किट प्रयोग गरेर तयार गरिएको पुस्तकालय र PacBio प्लेटफर्मबाट 2 देखि 20 kb लामो रिडहरू समावेश गर्दछ। सेम्बिया विश्वविद्यालयमा जीनोमिक्स डीएनए अनुक्रमण अनुसन्धान सुविधा। जीनोम CLC जेनोमिक्स वर्कबेन्च 12.0.3 (Qiagen, Aarhus, डेनमार्क) को प्रयोग गरेर भेला गरिएको थियो। ASxL5T संस्कृतिहरू नेशनल टाइप कल्चर कलेक्शन (युके) र नेदरल्याण्ड्स ब्याक्टेरियल कल्चर कलेक्शन (NCCB) मा जम्मा गरिन्छ। तुलनाका लागि प्रयोग गरिएका सम्बन्धित जीवहरूको जीनोमहरू हुन्: थालासोलिटस ओलिभोरान्स MIL-1T (एक्सेसन नम्बर HF680312, पूरा); ब्याक्टेरियोप्लेन सेन्येन्सिस KCTC 32220T (एक्सेसन नम्बर BMYY01000001, अपूर्ण); Oceanobacter kriegii DSM 6294T (एक्सेसन नम्बर NZ_AUGV00000000, अपूर्ण); Marinamonas समुदाय DSM 5604T (ASM436330v1 थपियो, अपूर्ण), Oceanospirullum linum ATCC 11336T (MTSD02000001, अपूर्ण थपियो) र Thalassolituus sp। C2-1 (NZ_VNIL01000001, अपूर्ण थप्नुहोस्)। पङ्क्तिबद्धता स्कोर (AF) र औसत न्यूक्लिक एसिड पहिचान (ANI) निर्धारण गर्न https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= मा JGI Genome Portal36 प्रयोग गर्नुहोस्। जोडीमा। एमिनो एसिड पहिचान (AAI) निर्धारण गर्न Rodriguez-R & Konstantinidis55 को विधि प्रयोग गरिएको थियो। GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 को अनुमानित अधिकतम सम्भावना फाइलोजेनेटिक रूख उत्पन्न गर्न प्रयोग गर्नुहोस्। उपलब्ध सन्दर्भ जीनोमको प्रतिनिधित्व गर्ने इनपुट जीनोमलाई 16S rRNA फाइलोजेनीबाट ASxL5T सँग सम्बन्धित भनी पहिचान गरिएको सन्दर्भ जेनेराबाट चयन गरिएको छ। जीवनको अन्तरक्रियात्मक रूख अनलाइन उपकरण (https://itol.embl.de/) प्रयोग गरेर रूख एनोटेट गरियो। ASxL5T जीनोमको कार्यात्मक एनोटेसन र विश्लेषण BlastKOALA KEGG अनलाइन उपकरण प्रयोग गरेर KEGG (जिन र जीनोमहरूको क्योटो इन्साइक्लोपीडिया) मोड्युल संवर्धन वितरण प्रयोग गरी गरिन्छ। COG कोटिहरू (अर्थोलोगस समूहहरू) को वितरण eggNOG-mapper अनलाइन उपकरण प्रयोग गरेर निर्धारण गरिन्छ।
पेरेज, जे., मोरालेडा-मुनोज, ए., मार्कोस-टोरेस, एफजे र मुनोज-डोराडो, जे। ब्याक्टेरियाको शिकार: 75 वर्ष र यो जारी छ! । वातावरण। सूक्ष्मजीव। १८, ७६६–७७९ (२०१६)।
Linares-Otoya, L. आदि। पेरुभियन तटमा सिकारी ब्याक्टेरियाको विविधता र जीवाणुरोधी क्षमता। मार्च ड्रग्स। 15. E308। https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017)।
Pasternak, Z. et al। तिनीहरूको जीन मार्फत, तपाईंले तिनीहरूलाई बुझ्नुहुनेछ: शिकारी ब्याक्टेरियाको जीनोमिक विशेषताहरू। ISME J. 7, 756–769 (2013)।
Sockett, RE ब्याक्टेरियोफेज Bdellovibrio को शिकारी जीवनशैली। स्थापना गर्नुहोस्। पास्टर सूक्ष्मजीवहरू। ६३, ५२३–५३९ (२००९)।
Korp, J., Vela Gurovic, MS & Nett, M. शिकारी ब्याक्टेरियाबाट एन्टिबायोटिक्स। Beilstein J. Histochemistry 12, 594-607 (2016)।
Johnke, J., Fraune, S., Bosch, TCG, Hentschel, U. & Schulenburg, H. Bdellovibrio र समान जीवहरू विभिन्न होस्ट जनसंख्याहरूमा माइक्रोबायोम विविधताको भविष्यवाणीकर्ता हुन्। सूक्ष्मजीव। पारिस्थितिकी। ७९, २५२–२५७ (२०२०)।
Vila, J., Moreno-Morales, J. र Balesté-Delpierre, C. नयाँ जीवाणुरोधी एजेन्टहरूको वर्तमान स्थिति पत्ता लगाउनुहोस्। क्लिनिकल। सूक्ष्मजीव। संक्रमित। https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019)।
Hobley, L. et al। फेज र फेजको दोहोरो शिकारले एकल शिकार बिना नै ई. कोलाई शिकारलाई नष्ट गर्न सक्छ। जे ब्याक्टेरिया। २०२, e00629-19। https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (२०२०)।
El-Shibiny, A., Connerton, PL र Connerton, IF क्याम्पिलोब्याक्टर र ब्याक्टेरियोफेजको गन्ती र विविधता फ्री-रेंज र जैविक कुखुराको खुवाउने चक्रमा अलग हुन्छ। आवेदन वातावरण। सूक्ष्मजीव। ७१, १२५९–१२६६ (२००५)।
Wilkinson, DA आदि। क्याम्पिलोब्याक्टर स्वाइनको जीनोमिक वर्गीकरण र महामारी विज्ञान अपडेट गर्नुहोस्। विज्ञान। प्रतिनिधि ८, २३९३। https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018)।
ली, MD GToTree: प्रणाली जीनोमिक्सका लागि प्रयोगकर्ता-अनुकूल कार्यप्रवाह। बायोइन्फर्मेटिक्स ३५, ४१६२–४१६४ (२०१९)।
एडगर, आरसी मसल: एक बहु अनुक्रम पङ्क्तिबद्ध विधि जसले समय र स्थान जटिलता कम गर्दछ। BMC जैविक जानकारी। ५, ११३ (२००४)।
Capella-Gutiérrez, S., Silla-Martínez, JM & Gabaldón, T. TrimAl: ठूला-ठूला फाइलोजेनेटिक विश्लेषणमा स्वचालित पङ्क्तिबद्धता र ट्रिमिङका लागि एउटा उपकरण। बायोइन्फर्मेटिक्स 25, 1972-1973 (2009)।
Hyatt, D., LoCascio, PF, Hauser, LJ र Uberbacher, EC जीन र मेटाजेनोमिक अनुक्रम अनुवाद सुरु साइट भविष्यवाणी। बायोइन्फर्मेटिक्स 28, 2223-2230 (2012)।
शेन, डब्ल्यू. र Xiong, जे TaxonKit: क्रस-प्लेटफर्म र कुशल NCBI वर्गीकरण टूलकिट। बायो Rxiv। (जुन १, २०२१ मा पहुँच गरिएको); https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019)।
मूल्य, MN, Dehal, PS र Arkin, AP FastTree 2 - ठूलो पङ्क्तिबद्धता संग अनुमानित अधिकतम सम्भावना रूख। PLOS One 5, e9490 (2010)।
Tange, O. GNU समानान्तर। (जुन १, २०२१ मा पहुँच गरिएको); https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018)।
Kanehisa, M. & Goto, S. KEGG: जिन्स र जीनोमको क्योटो विश्वकोश। न्यूक्लिक एसिड अनुसन्धान। २८, २७-३० (२०००)।
चेक रिपब्लिक, L. आदि। तनाव संरक्षक र पोषक तत्वहरूको रूपमा एक्स्ट्रोमोलाइट्स एक्टोइन र हाइड्रोक्सीक्टोइनको भूमिका: आनुवंशिकी, प्रणाली जीनोमिक्स, बायोकेमिस्ट्री, र संरचनात्मक विश्लेषण। जीन (बासेल)। 9. E177। https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018)।
Gregson, BH, Metodieva, G., Metodiev, MV, Golyshin, PN र McKew, BA डिफरेंशियल प्रोटीन अभिव्यक्ति बाध्य समुद्री हाइड्रोकार्बन-डिग्रेडिंग ब्याक्टेरियम थालासोलिटस ओलिभोरान्स MIL-1 को बृद्धिको क्रममा मध्यम र लामो चेन अल्कानेसको बृद्धिको क्रममा। अगाडि। सूक्ष्मजीव। ९, ३१३० (२०१८)।
Pasternak, Z., Ben Sasson, T., Cohen, Y., Segev, E., र Jurkevitch, E. फेनोटाइपिक-विशिष्ट संकेतकहरू परिभाषित गर्नको लागि एक नयाँ तुलनात्मक जीनोमिक्स विधिले शिकारी ब्याक्टेरिया चिन्हमा विशिष्ट विरासत प्रकट गर्दछ। सार्वजनिक विज्ञान पुस्तकालय एक। १०. e0142933। https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015)।
याकिमोभ, एमएम, आदि। थालासोलिटस ओलिभोरान्स जीन। मंसिर, एसपी। नोभेम्बर, एक नयाँ प्रकारको समुद्री ब्याक्टेरिया जसले हाइड्रोकार्बनको प्रयोगमा विशेषज्ञता दिन्छ। अन्तर्राष्ट्रियता। जे प्रणाली। विकास। सूक्ष्मजीव। ५४, १४१–१४८ (२००४)।
वांग, वाई., यू, एम., लिउ, वाई, यांग, एक्स र झांग, एक्सएच ब्याक्टेरियोप्लानाइड्स प्यासिफिकम जेन। मंसिर, एसपी। नोभेम्बरमा, यो दक्षिण प्रशान्तमा घुम्ने समुद्री पानीबाट अलग भयो। अन्तर्राष्ट्रियता। जे प्रणाली। विकास। सूक्ष्मजीव। ६६, ५०१०–५०१५ (२०१६)।