ଏକ ନୂତନ ପ୍ରକାରର ଗ୍ରାମ-ନେଗେଟିଭ୍, ଏରୋବିକ୍, ଲୁଣ-ସହନଶୀଳ, ସକ୍ରିୟ, ବାଡ଼ି ଆକୃତିର ଏବଂ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ASxL5T ଇଂଲଣ୍ଡର ନଟିଂହାମଶାୟାରର ଏକ ଗା d ଗୋବର ପୋଖରୀରୁ ପୃଥକ ହୋଇ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟରକୁ ଏହାର ଶିକାର ଭାବରେ ବ୍ୟବହାର କରିଥିଲେ। ପରବର୍ତ୍ତୀ ସମୟରେ, ଅନ୍ୟ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ପ୍ରଜାତି ଏବଂ ଏଣ୍ଟେରୋବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ପରିବାରର ସଦସ୍ୟମାନେ ଶିକାର ଭାବରେ ଆବିଷ୍କୃତ ହୋଇଥିଲେ। ହୋଷ୍ଟ କୋଷ ବିନା ଉପ-ସଂସ୍କୃତି ପରେ, ବ୍ରେନ୍ ହାର୍ଟ ଇନଫ୍ୟୁଜନ୍ ଅଗରରେ ଦୁର୍ବଳ ଆସେପ୍ଟିକ୍ ଅଭିବୃଦ୍ଧି ହାସଲ ହେଲା | ସର୍ବୋଚ୍ଚ ଅଭିବୃଦ୍ଧି ଅବସ୍ଥା 37 ° C ଏବଂ pH 7 ଅଟେ | ଟ୍ରାନ୍ସମିସନ୍ ଇଲେକ୍ଟ୍ରୋନ ମାଇକ୍ରୋସ୍କୋପି ଶିକାରର ଉପଲବ୍ଧତା ସହିତ ଜଡିତ କିଛି ଅସାଧାରଣ morphological ବ features ଶିଷ୍ଟ୍ୟ ପ୍ରକାଶ କଲା | 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ବ୍ୟବହାର କରି ଫିଲୋଜେନେଟିକ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ ସୂଚାଇ ଦେଇଛି ଯେ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୁଲିନା ପରିବାରର ଜଣେ ସଦସ୍ୟ ସହିତ ଜଡିତ, କିନ୍ତୁ କ known ଣସି ଜଣାଶୁଣା ବଂଶର ସଦସ୍ୟ ଭାବରେ ସ୍ପଷ୍ଟ ଭାବରେ ଶ୍ରେଣୀଭୁକ୍ତ ହୋଇପାରିବ ନାହିଁ | ASxL5T ର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ-ଜିନୋମ କ୍ରମ ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୋଚେଟ୍ ସଦସ୍ୟମାନଙ୍କ ସହିତ ସମ୍ପର୍କକୁ ନିଶ୍ଚିତ କଲା | ଏକ ଡାଟାବେସ୍ ସନ୍ଧାନରୁ ଜଣାପଡିଛି ଯେ ଅନେକ ASxL5Ts 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମକୁ ସମୁଦ୍ର, ସ୍ଥଳଭାଗ ଏବଂ ଭୂତଳ ଜଳରୁ ଅନେକ ଅଣସଂଗଠିତ ଜୀବାଣୁ ସହିତ ଅଂଶୀଦାର କରନ୍ତି | ଆମେ ପରାମର୍ଶ ଦେଉଛୁ ଯେ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ASxL5T ଏକ ନୂତନ ପ୍ରଜାତିର ଏକ ନୂତନ ପ୍ରଜାତିର ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ | ଆମେ ଭେନେଟରବ୍ୟାକ୍ଟର୍ କୁକୁଲସ୍ ଜେନ ନାମକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ | ନଭେମ୍ବର, ସ୍ପ। ନଭେମ୍ବରରେ, ASxL5T ଟାଇପ୍ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ ହେଲା |
ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ହେଉଛି ଜୀବାଣୁ ଯାହା ବାୟୋସାଇନ୍ଥେଟିକ୍ ସାମଗ୍ରୀ ଏବଂ ଶକ୍ତି ପାଇବା ପାଇଁ ଅନ୍ୟ ଜୀବ ଜୀବାଣୁଙ୍କୁ ଶିକାର କରିବା ଏବଂ ହତ୍ୟା କରିବାର କ୍ଷମତା ପ୍ରଦର୍ଶନ କରେ | ମୃତ ମାଇକ୍ରୋଅର୍ଗାନ୍ସରୁ ପୁଷ୍ଟିକର ପୁଷ୍ଟିକର ପୁନରୁଦ୍ଧାର ଠାରୁ ଏହା ଭିନ୍ନ, ଏବଂ ଏହା ପରଜୀବୀ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଠାରୁ ମଧ୍ୟ ଭିନ୍ନ, ଯେଉଁଥିରେ ଜୀବାଣୁ ସେମାନଙ୍କୁ ହତ୍ୟା ନକରି ସେମାନଙ୍କ ହୋଷ୍ଟ ସହିତ ଘନିଷ୍ଠ ସମ୍ପର୍କ ସ୍ଥାପନ କରନ୍ତି | ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ବିଭିନ୍ନ ଜୀବନ ଚକ୍ରକୁ ବିକଶିତ କରିଛନ୍ତି ଯେଉଁଠାରେ ସେମାନେ ମିଳୁଥିବା ଖାଦ୍ୟରେ (ଯେପରିକି ସାମୁଦ୍ରିକ ବାସସ୍ଥାନ) ପ୍ରଚୁର ଖାଦ୍ୟ ଉତ୍ସର ଲାଭ ଉଠାଇବା ପାଇଁ | ସେମାନେ ଏକ ଟ୍ୟାକ୍ସୋନୋମିକ୍ ବିବିଧ ଗୋଷ୍ଠୀ, ଯାହା କେବଳ ସେମାନଙ୍କର ଅନନ୍ୟ ନିରାକରଣ ଜୀବନ ଚକ୍ର ଦ୍ୱାରା ସଂଯୁକ୍ତ | ବିଭିନ୍ନ ପ୍ରକାରର ଫାଇଲାରେ ଶିକାରକାରୀ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ଉଦାହରଣ ଦେଖିବାକୁ ମିଳିଛି, ଏଥିରେ: ପ୍ରୋଟୋବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ, ଜୀବାଣୁ ଏବଂ କ୍ଲୋରେଲା .3। ଅବଶ୍ୟ, ସବୁଠାରୁ ଭଲ ଅଧ୍ୟୟନ କରୁଥିବା ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ହେଉଛି Bdellovibrio ଏବଂ Bdellovibrio- ଏବଂ ସମାନ ଜୀବ (BALOs4) | ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ନୂତନ ଜ olog ବଗତ ସକ୍ରିୟ ଯ ounds ଗିକ ଏବଂ ଆଣ୍ଟିବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ଏଜେଣ୍ଟଗୁଡିକର ଏକ ପ୍ରତିଜ୍ଞାକାରୀ ଉତ୍ସ |
ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ବିବିଧତାକୁ ବ enhance ାଇଥାଏ ଏବଂ ଇକୋସିଷ୍ଟମ୍ ସ୍ୱାସ୍ଥ୍ୟ, ଉତ୍ପାଦକତା ଏବଂ ସ୍ଥିରତା ଉପରେ ସକରାତ୍ମକ ପ୍ରଭାବ ପକାଇଥାଏ | ଏହି ସକରାତ୍ମକ ଗୁଣଗୁଡିକ ସତ୍ତ୍ bacter େ, ଜୀବାଣୁ ସଂସ୍କୃତିର ଅସୁବିଧା ହେତୁ ଏବଂ ସେମାନଙ୍କର ଜଟିଳ ଜୀବନଚକ୍ର ବୁ understand ିବା ପାଇଁ କୋଷର ପାରସ୍ପରିକ କାର୍ଯ୍ୟକଳାପକୁ ଯତ୍ନର ସହ ପାଳନ କରିବାର ଆବଶ୍ୟକତା ହେତୁ ନୂତନ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ଉପରେ କିଛି ଅଧ୍ୟୟନ ଅଛି | କମ୍ପ୍ୟୁଟର ବିଶ୍ଳେଷଣରୁ ଏହି ସୂଚନା ପାଇବା ସହଜ ନୁହେଁ |
ଆଣ୍ଟିମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ପ୍ରତିରୋଧର ଏକ ଯୁଗରେ, ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଜୀବାଣୁକୁ ଟାର୍ଗେଟ କରିବା ପାଇଁ ନୂତନ ରଣନୀତି ଅଧ୍ୟୟନ କରାଯାଉଛି, ଯେପରିକି ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଫେଜ୍ ଏବଂ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ 7,8 | ASxL5T ଜୀବାଣୁ 2019 ରେ ନଟିଂହାମଶାୟାରର ନଟିଂହାମ ବିଶ୍ୱବିଦ୍ୟାଳୟର ଦୁଗ୍ଧ କେନ୍ଦ୍ରରୁ ସଂଗୃହିତ ଗା d ଗୋବରରୁ ଫେଜ୍ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ପ୍ରଯୁକ୍ତିକୁ ବ୍ୟବହାର କରି ପୃଥକ କରାଯାଇଥିଲା | ଅନୁସନ୍ଧାନର ଉଦ୍ଦେଶ୍ୟ ହେଉଛି ଜ bi ବ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ଏଜେଣ୍ଟ ଭାବରେ ସମ୍ଭାବ୍ୟ ଜୀବମାନଙ୍କୁ ଅଲଗା କରିବା | କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ହାଇଏଣ୍ଟେଷ୍ଟାଇନାଲିସ୍ ହେଉଛି ଏକ ଜୁନୋଟିକ୍ ପାଥୋଜେନ, ଯାହା ମାନବଙ୍କ ଅନ୍ତନଳୀ ରୋଗ ସହିତ ଅଧିକ ଜଡିତ | ଏହା ସେରମ୍ରେ ସର୍ବବ୍ୟାପୀ ଏବଂ ଏକ ଟାର୍ଗେଟ୍ ହୋଷ୍ଟ ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ ହୁଏ |
ASxL5T ଜୀବାଣୁ ଗୋମାଂସ ଜେଲିରୁ ପୃଥକ ହୋଇଥିଲେ କାରଣ ଏହା ଦେଖାଯାଇଥିଲା ଯେ ସି ହାଇଓଏଣ୍ଟେଷ୍ଟାଇନାଲିସର ଲନରେ ଏହା ତିଆରି ହୋଇଥିବା ଫଳକ ଜୀବାଣୁ ଦ୍ produced ାରା ଉତ୍ପାଦିତ ସମାନ ଥିଲା। ଏହା ଏକ ଅପ୍ରତ୍ୟାଶିତ ସନ୍ଧାନ, କାରଣ ଫେଜ୍ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ପ୍ରକ୍ରିୟାର ଏକ ଅଂଶ 0.2। Μ ମିଟର ଫିଲ୍ଟର ମାଧ୍ୟମରେ ଫିଲ୍ଟର କରିଥାଏ, ଯାହା ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ କୋଷଗୁଡ଼ିକୁ ବାହାର କରିବା ପାଇଁ ପରିକଳ୍ପିତ | ଫଳକରୁ ବାହାର କରାଯାଇଥିବା ପଦାର୍ଥର ମାଇକ୍ରୋସ୍କୋପିକ୍ ପରୀକ୍ଷଣରୁ ଜଣାପଡିଛି ଯେ ଛୋଟ ଗ୍ରାମ-ନକାରାତ୍ମକ ବକ୍ର ରଡ ଆକୃତିର ଜୀବାଣୁ ପଲିହାଇଡ୍ରକ୍ସାଇବୁଟାଇରେଟ୍ (PHB) ଜମା କରିନଥିଲେ। ଶିକାର କୋଷରୁ ସ୍ independent ାଧୀନ ଥିବା ଆସେପ୍ଟିକ୍ ସଂସ୍କୃତି ସମୃଦ୍ଧ କଠିନ ମାଧ୍ୟମ (ଯେପରିକି ମସ୍ତିଷ୍କ ହୃଦୟ ଇନଫ୍ୟୁଜନ୍ ଅଗର (BHI) ଏବଂ ରକ୍ତ ଅଗର (BA)) ରେ ହୃଦୟଙ୍ଗମ ହୁଏ ଏବଂ ଏହାର ଅଭିବୃଦ୍ଧି ଦୁର୍ବଳ | ଭାରୀ ଇନୋକୁଲମ୍ ଉନ୍ନତି ସହିତ ଉପ-ସଂସ୍କୃତି ପରେ ଏହା ପ୍ରାପ୍ତ ହୁଏ | ଏହା ମାଇକ୍ରୋଏରୋବିକ୍ (7% v / v ଅମ୍ଳଜାନ) ଏବଂ ବାୟୁମଣ୍ଡଳୀୟ ଅମ୍ଳଜାନ ଅବସ୍ଥାରେ ସମାନ ଭାବରେ ବ ows େ, କିନ୍ତୁ ଆନାର୍ବୋବିକ ବାୟୁମଣ୍ଡଳରେ ନୁହେଁ | 72 ଘଣ୍ଟା ପରେ, କଲୋନୀର ବ୍ୟାସ ବହୁତ ଛୋଟ ଥିଲା, 2 ମିମିରେ ପହଞ୍ଚିଲା, ଏବଂ ଏହା ବେଜି, ସ୍ୱଚ୍ଛ, ଗୋଲାକାର, ଉନ୍ମୁକ୍ତ ଏବଂ ଚକଚକିଆ | ଷ୍ଟାଣ୍ଡାର୍ଡ ବାୟୋକେମିକାଲ୍ ପରୀକ୍ଷଣରେ ବାଧା ସୃଷ୍ଟି ହୁଏ କାରଣ ASxL5T ତରଳ ମିଡିଆରେ ନିର୍ଭରଯୋଗ୍ୟ ଭାବରେ ସଂସ୍କୃତି ହୋଇପାରିବ ନାହିଁ, ଯାହା ସୂଚିତ କରେ ଯେ ଏହା ବାୟୋଫିଲ୍ମ ଗଠନର ଜଟିଳ ଜୀବନଚକ୍ର ଉପରେ ନିର୍ଭର କରିପାରେ | ଅବଶ୍ୟ, ପ୍ଲେଟ୍ ସସପେନ୍ସନ୍ ଦର୍ଶାଇଲା ଯେ ASxL5T ଏରୋବିକ୍, ଅକ୍ସିଡେଜ୍ ଏବଂ କାଟାଲେଜ୍ ପାଇଁ ସକରାତ୍ମକ ଏବଂ 5% NaCl କୁ ସହ୍ୟ କରିପାରିବ | ASxL5T 10 µg ଷ୍ଟ୍ରେପ୍ଟୋମାଇସିନ୍ ପ୍ରତିରୋଧକ, କିନ୍ତୁ ପରୀକ୍ଷିତ ଅନ୍ୟ ସମସ୍ତ ଆଣ୍ଟିବାୟୋଟିକ୍ ପ୍ରତି ସମ୍ବେଦନଶୀଳ | ASxL5T ଜୀବାଣୁ କୋଷଗୁଡିକ TEM (ଚିତ୍ର 1) ଦ୍ୱାରା ପରୀକ୍ଷା କରାଯାଇଥିଲା | ଯେତେବେଳେ BA ରେ ଶିକାର କୋଷ ବିନା ବ grown ଼େ, ASxL5T କୋଷଗୁଡ଼ିକ ଛୋଟ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍, ଯାହାର ହାରାହାରି ଲମ୍ବ 1.63 μm (± 0.4), ମୋଟେଇ 0.37 μm (± 0.08) ଏବଂ ଗୋଟିଏ ଲମ୍ବା (5 μm ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ) ପୋଲ | ଯ Sex ନ ଫ୍ଲାଗେଲା | ପାଖାପାଖି 1.6% କୋଷଗୁଡ଼ିକର ମୋଟେଇ 0.2 μm ରୁ କମ୍ ଥିବା ପରି ଦେଖାଯାଏ, ଯାହା ଫିଲ୍ଟର ଡିଭାଇସ୍ ଦେଇ ଯିବାକୁ ଅନୁମତି ଦେବ | କିଛି କୋଷର ଉପରି ଭାଗରେ ଏକ ଅସାଧାରଣ ଗଠନମୂଳକ ବିସ୍ତାର ପରିଲକ୍ଷିତ ହୋଇଥିଲା, ଏକ ମେଳା (ଲାଟିନ୍ କୁକୁଲସ୍) ପରି (1D, E, G ରେ ତୀର ଦେଖନ୍ତୁ) | ଏହା ଅତ୍ୟଧିକ ବାହ୍ୟ br ୁଲାକୁ ନେଇ ଗଠିତ ହୋଇଥିବା ପରି ମନେହୁଏ, ଯାହା ପେରିପ୍ଲାଜାମିକ୍ ଏନଭଲପ୍ ଆକାରର ଦ୍ରୁତ ହ୍ରାସ ହେତୁ ହୋଇପାରେ, ଯେତେବେଳେ ବାହ୍ୟ br ୁଲା ଅକ୍ଷୁର୍ଣ୍ଣ ରହିଥାଏ, ଏକ “ଖାଲି” ରୂପ ଦେଖାଏ | ପୋଷକତତ୍ତ୍ୱର ଅନୁପସ୍ଥିତିରେ (PBS ରେ) ଦୀର୍ଘ ସମୟ ଧରି 4 ° C ରେ ASxL5T କୁ ଚାଷ କରିବା ଦ୍ most ାରା ଅଧିକାଂଶ (କିନ୍ତୁ ସମସ୍ତ ନୁହେଁ) କୋଷଗୁଡ଼ିକ ଏକ କୋକାଲ୍ ମର୍ଫୋଲୋଜି ଦେଖାଇଲେ (ଚିତ୍ର 1C) | ଯେତେବେଳେ ASxL5T କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜେଜୁନି ସହିତ 48 ଘଣ୍ଟା ଶିକାର ଭାବରେ ବ ows େ, ହାରାହାରି କୋଷର ଆକାର ହୋଷ୍ଟ ବିନା ବ cells ଼ୁଥିବା କୋଷଗୁଡ଼ିକ ଅପେକ୍ଷା ଯଥେଷ୍ଟ ଲମ୍ବା ଏବଂ ସଂକୀର୍ଣ୍ଣ ହୋଇଥାଏ (ସାରଣୀ 1 ଏବଂ ଚିତ୍ର 1E) | ଏହାର ବିପରୀତରେ, ଯେତେବେଳେ ASxL5T ଇ କୋଲି ସହିତ 48 ଘଣ୍ଟା ଶିକାର ଭାବରେ ବ ows େ, ହାରାହାରି କୋଷର ଆକାର ଲମ୍ବା ଏବଂ ପ୍ରଶସ୍ତ ହୁଏ ଯେତେବେଳେ ଏହା ଶିକାର ବିନା ବ ows େ (ସାରଣୀ 1), ଏବଂ କୋଷର ଦ length ର୍ଘ୍ୟ ପରିବର୍ତ୍ତନଶୀଳ, ସାଧାରଣତ f ଚିଲାମାଣ୍ଟ ଦେଖାଏ (ଚିତ୍ର 1F) | ଯେତେବେଳେ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜେଜୁନି କିମ୍ବା ଇ କୋଲି ସହିତ 48 ଘଣ୍ଟା ଶିକାର କରାଯାଏ, ASxL5T କୋଷଗୁଡ଼ିକ କ flag ଣସି ଫ୍ଲାଗେଲା ଦେଖାଇଲେ ନାହିଁ | ଟେବୁଲ୍ 1 ASxL5T ର ଉପସ୍ଥିତି, ଅନୁପସ୍ଥିତି ଏବଂ ଶିକାର ପ୍ରକାର ଉପରେ ଆଧାର କରି କୋଷ ଆକାରର ପରିବର୍ତ୍ତନଗୁଡ଼ିକର ପର୍ଯ୍ୟବେକ୍ଷଣକୁ ସାରାଂଶିତ କରେ |
ASx5LT ର TEM ପ୍ରଦର୍ଶନ: (A) ASx5LT ଲମ୍ବା ଚାବୁ ଦେଖାଏ | (ଖ) ସାଧାରଣ ASx5LT ବ୍ୟାଟେରୀ; (ଗ) ପୁଷ୍ଟିକର ବିନା ଦୀର୍ଘ ଇନକ୍ୟୁବେସନ ପରେ କୋକି ASx5LT କୋଷଗୁଡ଼ିକ; ) (ଚ) ଇ କୋଲି ଶିକାର ସହିତ ଇନ୍କ୍ୟୁବେସନ ପରେ ବଡ଼ ଫିଲାମେଣ୍ଟସ୍ ଫ୍ଲାଗେଲା, ASx5LT କୋଷଗୁଡ଼ିକ; (ଜି) ଇ କୋଲି ସହିତ ଇନକ୍ୟୁବେସନ ପରେ ଏକକ ASx5LT କକ୍ଷ, ଏକ ଅସାଧାରଣ ଉପର ଗଠନ ଦେଖାଏ | ଦଣ୍ଡିକା 1 μm ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ |
16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବା (ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା MT636545.1) ଗାମାପ୍ରୋଟୋବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଶ୍ରେଣୀର ସମାନ କ୍ରମ ପ୍ରତିଷ୍ଠା କରିବାକୁ ଡାଟାବେସ୍ ସନ୍ଧାନକୁ ସକ୍ଷମ କରିଥାଏ ଏବଂ ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରିଲମ୍ ପରିବାରର ସାମୁଦ୍ରିକ ଜୀବାଣୁ (ଚିତ୍ର 2) ର ନିକଟତର, ଏବଂ ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ବଂଶର ସଦସ୍ୟ ଅଟନ୍ତି | ସାମୁଦ୍ରିକ ବାକିଲସ୍ ସହିତ ନିକଟତମ ସମ୍ପର୍କୀୟ | 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) ପରିବାରର ସମ୍ପୃକ୍ତ ଜୀବାଣୁଠାରୁ ଭିନ୍ନ ଅଟେ | ବି ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଓଭୋରସ୍ HD100T (ଟାଇପ୍ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍, DSM 50701) ଏବଂ ବି ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଭୋରସ୍ DM11A ର ଯୁଗ୍ମ ତୁଳନାତ୍ମକତା 48.4% ଏବଂ 47.7% ଥିଲା ଏବଂ ବି ଏକ୍ସୋଭୋରସ୍ JSS ପାଇଁ ଏହା 46.7% ଥିଲା | ASxL5T ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆରେ 16S rRNA ଜିନ୍ ର 3 କପି ଅଛି, ସେଥିମଧ୍ୟରୁ ଦୁଇଟି ପରସ୍ପର ସହିତ ସମାନ ଏବଂ ତୃତୀୟଟି ହେଉଛି 3 ବେସ୍ ପୃଥକ | ଅନ୍ୟ ଦୁଇଟି ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ପୃଥକ (ASx5S ଏବଂ ASx5O; 16S rRNA ଜିନ୍ ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା ଯଥାକ୍ରମେ MT636546.1 ଏବଂ MT636547.1) ସମାନ ସ୍ଥାନରୁ ସମାନ morphological ଏବଂ phenotypic ବ characteristics ଶିଷ୍ଟ୍ୟ ସମାନ ନୁହେଁ, କିନ୍ତୁ ସେମାନେ ASxL5T ଏବଂ ଅଣସଂରକ୍ଷିତ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ଠାରୁ ଭିନ୍ନ | ଡାଟାବେସ୍ କ୍ରମଗୁଡ଼ିକ Oceanospirillaceae (ଚିତ୍ର 2) ର ଅନ୍ୟ ଜେନେରା ସହିତ ଏକତ୍ରିତ ହୋଇଛି | ASxL5T ର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ କ୍ରମ ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରାଯାଇଛି ଏବଂ NCBI ଡାଟାବେସରେ ସଞ୍ଚୟ ହୋଇଛି, ଏବଂ ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା ହେଉଛି CP046056 | ASxL5T ର ଜିନୋମ 2,831,152 ବିପି ର ଏକ ବୃତ୍ତାକାର କ୍ରୋମୋଜୋମକୁ ନେଇ G + C ଅନୁପାତରେ 56.1% ଧାରଣ କରିଥାଏ | ଜିନୋମ କ୍ରମରେ 2653 CDS (ସମୁଦାୟ) ଥାଏ, ସେଥିମଧ୍ୟରୁ 2567 ଟି ପ୍ରୋଟିନ୍ ଏନକୋଡ୍ କରିବାକୁ ପୂର୍ବାନୁମାନ କରାଯାଇଛି, ଯେଉଁଥିରୁ 1596 ଟି ପୁଟିଭ୍ ଫଙ୍କସନ୍ (60.2%) ଭାବରେ ନ୍ୟସ୍ତ ହୋଇପାରିବ | ଏହି ଜିନୋମରେ 67 ଟି ଆରଏନ୍ଏ-କୋଡିଂ ଜିନ୍ ଅଛି, ଯେଉଁଥିରେ 9 ଟି RRNA (ପ୍ରତ୍ୟେକ 5S, 16S, ଏବଂ 23S ପାଇଁ 3) ଏବଂ 57 ଟିଆରଏନ୍ଏ ଅଛି | ASSL5T ର ଜେନୋମିକ୍ ବ characteristics ଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡିକ 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ (ଟେବୁଲ୍ 2) ରୁ ଚିହ୍ନିତ ନିକଟତମ ଆପେକ୍ଷିକ ପ୍ରକାରର ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ଗୁଡିକର ଉପଲବ୍ଧ ଜେନୋମ ସହିତ ତୁଳନା କରାଯାଇଥିଲା | ସମସ୍ତ ଉପଲବ୍ଧ ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ଜେନୋମକୁ ASxL5T ସହିତ ତୁଳନା କରିବାକୁ ଆମିନୋ ଏସିଡ୍ ପରିଚୟ (AAI) ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | AAI ଦ୍ determined ାରା ନିର୍ଦ୍ଧିଷ୍ଟ ନିକଟତମ ଉପଲବ୍ଧ (ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ) ଜିନୋମ୍ କ୍ରମ ହେଉଛି ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ସ୍ପ। C2-1 (NZ_VNIL01000001 ଯୋଡନ୍ତୁ) | ଏହି ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ମାରିଆନା ଟ୍ରେଞ୍ଚର ଗଭୀର ସମୁଦ୍ର ପଙ୍କରୁ ବିଚ୍ଛିନ୍ନ ହୋଇଥିଲା, କିନ୍ତୁ ତୁଳନା ପାଇଁ ଏହି ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ବିଷୟରେ ବର୍ତ୍ତମାନ କ phen ଣସି ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ସୂଚନା ନାହିଁ | ASxL5T ର 2.82 Mb ସହିତ ତୁଳନା କଲେ, ଜୀବଙ୍କ ଜିନୋମ 4.36 Mb ରେ ବଡ ଅଟେ | ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୋଚେଟ୍ ର ହାରାହାରି ଜିନୋମ ଆକାର ପ୍ରାୟ 4.16 Mb (± 1.1; n = 92 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assemble ରୁ ଅନୁସନ୍ଧାନ କରାଯାଇଛି), ତେଣୁ ASxL5T ର ଜିନୋମ ସହିତ ମେଳ ଖାଉଛି | ଅର୍ଡର ଅନ୍ୟ ସଦସ୍ୟମାନଙ୍କ ତୁଳନାରେ, ଏହା ବହୁତ ଛୋଟ | ଏକ ଜିନୋମ-ଆଧାରିତ ଆନୁମାନିକ ସର୍ବାଧିକ ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ଗଛ (ଚିତ୍ର 3A) ସୃଷ୍ଟି କରିବାକୁ GToTree 1.5.54 ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ, ଗାମାପ୍ରୋଟୋବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ପାଇଁ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ 172 ଏକକ-କପି ଜିନ୍ ର ଆଲାଇନ୍ ଏବଂ ଲିଙ୍କ୍ ହୋଇଥିବା ଆମିନୋ ଏସିଡ୍ କ୍ରମ ବ୍ୟବହାର କରି 11,12,13,14,15,16, 17, 18 ବିଶ୍ଳେଷଣରୁ ଜଣାପଡିଛି ଯେ ଏହା ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍, ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ପ୍ଲେନ ଏବଂ ମେରାଇନ୍ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ସହିତ ନିବିଡ ଭାବରେ ଜଡିତ। ତଥାପି, ଏହି ତଥ୍ୟ ସୂଚାଇଥାଏ ଯେ ASxL5T ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୁଲିନାରେ ଥିବା ସମ୍ପର୍କୀୟଙ୍କଠାରୁ ଭିନ୍ନ ଏବଂ ଏହାର ଜିନୋମ୍ କ୍ରମ ତଥ୍ୟ ଉପଲବ୍ଧ |
16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ବ୍ୟବହାର କରି ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ଗଛ ASXL5T, ASxO5, ଏବଂ ASxS5 ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ (ଅନ୍ତ gut ସ୍ଥଳୀ ସହିତ) ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୁଲିନାସିରେ ଅଣସଂଗଠିତ ଏବଂ ସାମୁଦ୍ରିକ ଜୀବାଣୁ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ସହିତ ଆଲୋକିତ କରେ | ଜେନବ୍ୟାକ୍ ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା ପାରେନ୍ଥେସିସରେ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ନାମ ଅନୁସରଣ କରେ | କ୍ରମକୁ ସଜାଡିବା ପାଇଁ କ୍ଲଷ୍ଟାଲ୍ ଡବ୍ଲୁ ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ, ଏବଂ ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ସମ୍ପର୍କକୁ ଅନୁଧ୍ୟାନ କରିବା ପାଇଁ ସର୍ବାଧିକ ସମ୍ଭାବନା ପଦ୍ଧତି ଏବଂ ତ Tam ମୁରା-ନେ ମଡେଲ୍ ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ ଏବଂ MEGA X ପ୍ରୋଗ୍ରାମରେ 1000 ଗାଇଡ୍ ନକଲ କାର୍ଯ୍ୟ କରନ୍ତୁ | ଶାଖାରେ ଥିବା ସଂଖ୍ୟା ସୂଚିତ କରେ ଯେ ଗାଇଡ୍ କପି ମୂଲ୍ୟ 50% ରୁ ଅଧିକ ଅଟେ | Escherichia coli U / 541T ଏକ ଆଉଟ ଗ୍ରୁପ୍ ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ ହେଉଥିଲା |
(କ) ଜିନୋମ ଉପରେ ଆଧାରିତ ଏକ ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ଗଛ, ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୋସ୍ପିରାସିୟା ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ASxL5T ଏବଂ ଏହାର ନିକଟ ସମ୍ପର୍କୀୟ, ଇ.କୋଲି U 5 / 41T ମଧ୍ୟରେ ଏକ ସମ୍ପର୍କକୁ ଦର୍ଶାଏ | (ଖ) ଟି। ବାମ ପାର୍ଶ୍ୱରେ ଥିବା ଚିତ୍ର ପ୍ରତ୍ୟେକ ଜିନୋମରେ ପ୍ରତ୍ୟେକ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ COG ବର୍ଗରେ ଜିନ୍ ସଂଖ୍ୟା ଦର୍ଶାଏ | ଡାହାଣ ପାର୍ଶ୍ୱରେ ଥିବା ଗ୍ରାଫ୍ ପ୍ରତ୍ୟେକ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ COG ଗୋଷ୍ଠୀରେ ଥିବା ଜେନୋମର ଶତକଡ଼ା ଦର୍ଶାଏ | (ଗ) ଟି।
ASxL5T ଜିନୋମରେ ଉପସ୍ଥିତ ଥିବା ଉପାଦାନ ଜିନ୍ଗୁଡ଼ିକୁ ପରୀକ୍ଷା କରିବା ପାଇଁ KEGG ଡାଟାବେସ୍ ବ୍ୟବହାର କରି ଏରୋବିକ୍ ଗାମା ପ୍ରୋଟିସର ସାଧାରଣ ମେଟାବୋଲିକ୍ ପଥ ପ୍ରକାଶ ପାଇଲା | ASxL5T ରେ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ମୋଟର ପ୍ରୋଟିନ୍ ପାଇଁ ନ୍ୟସ୍ତ ହୋଇଥିବା ମୋଟ 75 ଟି ଜିନ୍ ଅଛି, ଏଥିରେ କେମୋଟାକ୍ସିସ୍, ଫ୍ଲାଗେଲା ଆସେମ୍ବଲି ଏବଂ ଟାଇପ୍ IV ଫିମ୍ବ୍ରିଆ ସିଷ୍ଟମରେ ଜଡିତ ଜିନ୍ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ | ଶେଷ ବର୍ଗରେ, 10 ଟି ଜିନ୍ ମଧ୍ୟରୁ 9 ଟି ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ଜୀବଙ୍କ ଗତିବିଧି ପାଇଁ ଦାୟୀ | ASxL5T ର ଜିନୋମରେ ଏକ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଟେଟ୍ରାହାଇଡ୍ରୋପାଇରିମିଡାଇନ୍ ବାୟୋସାଇନ୍ଥେଟିକ୍ ପଥ ରହିଥାଏ ଯାହା ହାଲୋଫାଇଲ୍ ପାଇଁ ଆଶା କରାଯାଉଥିବା ପରି ଓସୋମୋଟିକ୍ ଚାପ 20 ର ପ୍ରତିରକ୍ଷା ପ୍ରତିକ୍ରିୟାରେ ଅଂଶଗ୍ରହଣ କରିଥାଏ | ଜିନୋମରେ କୋଫାକ୍ଟର ଏବଂ ଭିଟାମିନ୍ ପାଇଁ ଅନେକ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ପଥ ଅଛି, ରିବୋଫ୍ଲାଭିନ୍ ସିନ୍ଥେସିସ୍ ପଥ ସହିତ | ଯଦିଓ ଆଲକେନ୍ 1-ମୋନୋକ୍ସିଜେନେଜ୍ (alkB2) ଜିନ୍ ASxL5T ରେ ଅଛି, ହାଇଡ୍ରୋକାର୍ବନ୍ ବ୍ୟବହାର ପଥ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ନୁହେଁ | ASxL5T ର ଜିନୋମ୍ କ୍ରମରେ, ଜିନ୍ ର ହୋମୋଲୋଜ୍ ଗୁଡିକ ମୁଖ୍ୟତ T. T. oleiverans MIL-1T21 ରେ ହାଇଡ୍ରୋକାର୍ବନର ଅବକ୍ଷୟ ପାଇଁ ଦାୟୀ ବୋଲି TOL_2658 (alkB) ଏବଂ TOL_2772 (ମଦ୍ୟପାନ ଡିହାଇଡ୍ରୋଜେନେଜ୍) ଅନୁପସ୍ଥିତ | ଚିତ୍ର 3B COX ବର୍ଗରେ ASxL5T ଏବଂ ଅଲିଭ୍ ତେଲ MIL-1T ମଧ୍ୟରେ ଜିନ୍ ବଣ୍ଟନର ତୁଳନାକୁ ଦର୍ଶାଏ | ସାମଗ୍ରିକ ଭାବରେ, ଛୋଟ ASxL5T ଜିନୋମ ବୃହତ COG ବର୍ଗରୁ ଆନୁପାତିକ ଭାବରେ କମ୍ ଜିନ୍ ଧାରଣ କରିଥାଏ | ଯେତେବେଳେ ପ୍ରତ୍ୟେକ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ବର୍ଗରେ ଜିନ୍ ସଂଖ୍ୟା ଜେନୋମର ଶତକଡ଼ା ଭାବରେ ପ୍ରକାଶ କରାଯାଏ, ଅନୁବାଦ, ରାଇବୋସୋମାଲ୍ ଗଠନ ଏବଂ ବାୟୋଜେନେସିସ୍ ବର୍ଗ, ଏବଂ ଶକ୍ତି ଉତ୍ପାଦନ ଏବଂ ରୂପାନ୍ତର କାର୍ଯ୍ୟ ବର୍ଗରେ ଜିନ୍ ଶତକଡା ପାର୍ଥକ୍ୟ ଦେଖାଯାଏ, ଯାହା ବୃହତ ASxL5T ଗଠନ କରେ | ଜେନୋମ ଟି। oleiverans MIL-1T ଜିନୋମରେ ଉପସ୍ଥିତ ଥିବା ସମାନ ଗୋଷ୍ଠୀ ସହିତ ତୁଳନା କରାଯାଏ | ଏହାର ବିପରୀତରେ, ASxL5T ଜିନୋମ ସହିତ ତୁଳନା କଲେ, ଟି। କ Interest ତୁହଳର ବିଷୟ, ଦୁଇଟି ଜିନୋମର ପ୍ରତ୍ୟେକ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ବର୍ଗର ବିଷୟବସ୍ତୁରେ ସବୁଠାରୁ ବଡ ପାର୍ଥକ୍ୟ ହେଉଛି ASxL5T (ଚିତ୍ର 3 ବି) ରେ ଉପସ୍ଥିତ ଅଜ୍ଞାତ ଜିନ୍ ସଂଖ୍ୟା | KEGG ମଡ୍ୟୁଲଗୁଡିକର ଏକ ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରାଯାଇଥିଲା, ଯେଉଁଠାରେ ପ୍ରତ୍ୟେକ KEGG ମଡ୍ୟୁଲ୍ ଜିନୋମ କ୍ରମ ତଥ୍ୟର ଟିପ୍ପଣୀ ଏବଂ ଜ ological ବିକ ବ୍ୟାଖ୍ୟା ପାଇଁ ମାନୁଆଲ ଭାବରେ ବ୍ୟାଖ୍ୟା କରାଯାଇଥିବା କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଏକକଗୁଡ଼ିକର ଏକ ସେଟ୍ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ | ASxL5T ଏବଂ ଅଲିଭ୍ MIL-1T ର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ KOG ମଡ୍ୟୁଲ୍ ପଥରେ ଜିନ୍ ବିତରଣର ତୁଳନା ଚିତ୍ର 3C ରେ ଦର୍ଶାଯାଇଛି | ଏହି ବିଶ୍ଳେଷଣ ଦର୍ଶାଏ ଯେ ଯଦିଓ ASxL5T ର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ସଲଫର୍ ଏବଂ ନାଇଟ୍ରୋଜେନ୍ ମେଟାବୋଲିକ୍ ପଥ ଅଛି, ଟି। ଅଲିଭେରାନ୍ସ MIL-1T ନାହିଁ | ଏହାର ବିପରୀତରେ, ଟି। ତେଣୁ, ASxL5T ର ସଲଫେଟ୍ ଆସ୍ମିଲେସନ୍ ପାଇଁ ଏକ ଚରିତ୍ରିକ ମଡ୍ୟୁଲ୍ ଅଛି (ଜିନ୍ ର ଏକ ସେଟ୍ ଭାବରେ ବ୍ୟାଖ୍ୟା କରାଯାଇଛି ଯାହା ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ମାର୍କର ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ ହୋଇପାରେ, ଯେପରିକି ମେଟାବୋଲିକ୍ କ୍ଷମତା କିମ୍ବା ପାଥୋଜେନିସିଟି; https://www.genome.jp/kegg/module.html) T ରେ oleiverans MIL-1T | ASxL5T ର ଜିନ୍ ବିଷୟବସ୍ତୁକୁ ଜିନ୍ ତାଲିକା ସହିତ ତୁଳନା କରିବା ଯାହା ଏକ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବନଶ lifestyle ଳୀକୁ ସୂଚିତ କରେ | ଯଦିଓ O ଆଣ୍ଟିଜେନ୍ ପଲିସାକାରାଇଡ୍ ସହିତ ଜଡିତ ଲିଗେଜ୍କୁ କୋଏଲ୍ ସହିତ ଏନକୋଡିଂ ASxL5T ଜିନୋମରେ ଉପସ୍ଥିତ ଅଛି (କିନ୍ତୁ ଏହା ଅନେକ ଗ୍ରାମ-ନକାରାତ୍ମକ ଜୀବାଣୁରେ ସାଧାରଣ), ଟ୍ରାଇପଟୋଫାନ୍ 2,3-ଡାଇଅକ୍ସିଜେନେଜ୍ (TDO) ଜିନ୍ ଗୁଡିକ 60 ଆମିନୋକୁ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ କରିପାରେ | ଏସିଡ୍ ଅଞ୍ଚଳ ସାଧାରଣତ pred ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁରେ ଦେଖାଯାଏ ଯାହା ଉପସ୍ଥିତ ନଥାଏ | ASVL5T ଜିନୋମରେ ଅନ୍ୟ କ pred ଣସି ଶିକାରକାରୀ ଚରିତ୍ରଗତ ଜିନ୍ ନାହିଁ, ମେଭାଲୋନାଟ୍ ପଥରେ ଆଇସୋପ୍ରେନଏଡ୍ ବାୟୋସାଇନ୍ଥେସିସ୍ ସହିତ ଜଡିତ ଏନକୋଡିଂ ଏନଜାଇମ୍ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ | ଧ୍ୟାନ ଦିଅନ୍ତୁ ଯେ ପରୀକ୍ଷିତ ଶିକାରକାରୀ ଗୋଷ୍ଠୀରେ କ trans ଣସି ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପସନ୍ ନିୟାମକ ଜିନ୍ gntR ନାହିଁ, କିନ୍ତୁ ASxL5T ରେ ତିନୋଟି gntR ପରି ଜିନ୍ ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇପାରିବ |
ASxL5T ର ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ବ characteristics ଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡିକ ସାରଣୀ 3 ରେ ସଂକ୍ଷିପ୍ତ ହୋଇଛି ଏବଂ ସାହିତ୍ୟରେ ରିପୋର୍ଟ ହୋଇଥିବା 23, 24, 25, 26, ଏବଂ 27 ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ଜେନେରାର ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ବ characteristics ଶିଷ୍ଟ୍ୟ ସହିତ ତୁଳନା କରାଯାଇଛି | ଟି। ମାରିନସ୍, ଟି। ସମୁଦ୍ରର ହାରାହାରି pH ହେଉଛି 8.1 (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77), ଯାହା ଟି ମାରିନସ୍, ଟି। kriegii ଅଣ-ସାମୁଦ୍ରିକ ପ୍ରଜାତିର ସାଧାରଣ pH ପରିସର (4-9) ପାଇଁ ASxL5T ଉପଯୁକ୍ତ | ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ sp ର ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ଗୁଣ | C2-1 ଅଜ୍ଞାତ ASxL5T ର ଅଭିବୃଦ୍ଧି ତାପମାତ୍ରା ପରିସର ସାଧାରଣତ mar ସାମୁଦ୍ରିକ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ (4–42 ° C) ତୁଳନାରେ ବ୍ୟାପକ ଅଟେ, ଯଦିଓ କିଛି କିନ୍ତୁ ସମସ୍ତ ଟି ମାରିନସ୍ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ଉତ୍ତାପ-ସହନଶୀଳ ନୁହେଁ | ବ୍ରୋଥ ମିଡିଆରେ ASxL5T ବ to ିବାରେ ଅସମର୍ଥତା ଅଧିକ ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ଚରିତ୍ରବୋଧକୁ ରୋକିଥାଏ | BA ପ୍ଲେଟ, ONPG, ଆର୍ଜିନାଇନ୍ ଡିହାଇଡ୍ରୋଲେଜ୍, ଲାଇସେନ୍ ଡିକାରବକ୍ସିଲେଜ୍, ଅର୍ନିଥାଇନ୍ ଡିକାରବକ୍ସିଲେଜ୍, ସାଇଟ୍ରେଟ୍ ବ୍ୟବହାର, ୟୁରିଆସ୍, ଟ୍ରାଇପଟୋଫାନ୍ ଡିମିନେଜ୍, ଜେଲାଟିନ୍ ହାଇଡ୍ରୋଲାଇସିସ୍ ଏନଜାଇମରୁ ସ୍କ୍ରାପ୍ ହୋଇଥିବା ସାମଗ୍ରୀଗୁଡିକ ପରୀକ୍ଷା କରିବାକୁ API 20E ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ, ପରୀକ୍ଷା ଫଳାଫଳ ସବୁ ନକାରାତ୍ମକ ଥିଲା, କିନ୍ତୁ ଇଣ୍ଡୋଲ୍, ଏସିଟୋଏନ୍ ଏବଂ H2S | ଉତ୍ପାଦିତ ହେଲା | ଅବ୍ୟବହୃତ କାର୍ବୋହାଇଡ୍ରେଟ୍ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ କରେ: ଗ୍ଲୁକୋଜ୍, ମନୋଜ୍, ଇନୋସିଟୋଲ୍, ସୋର୍ବିଟୋଲ୍, ରାମନୋଜ୍, ସୁକ୍ରୋଜ୍, ମେଲିବିଓଜ୍, ଆମିଗଡାଲିନ୍ ଏବଂ ଆରବିନୋଜ୍ | ପ୍ରକାଶିତ ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ରେଫରେନ୍ସ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ତୁଳନାରେ, ASxL5T ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ର ସେଲୁଲାର୍ ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ସାରଣୀ 4 ରେ ଦର୍ଶାଯାଇଛି | ମୁଖ୍ୟ ସେଲୁଲାର୍ ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ହେଉଛି C16: 1ω6c ଏବଂ / କିମ୍ବା C16: 1ω7c, C16: 0 ଏବଂ C18: 1ω9 | ହାଇଡ୍ରୋକ୍ସି ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ C12: 0 3-OH ଏବଂ C10: 0 3-OH ମଧ୍ୟ ବିଦ୍ୟମାନ | ASxL5T ରେ C16: 0 ର ଅନୁପାତ ସମ୍ବନ୍ଧିତ ଜେନେରାର ରିପୋର୍ଟ ହୋଇଥିବା ମୂଲ୍ୟଠାରୁ ଅଧିକ | ଏହାର ବିପରୀତରେ, ରିପୋର୍ଟ ହୋଇଥିବା ଟି ମାରିନସ୍ IMCC1826TT ସହିତ ତୁଳନା କଲେ, ASxL5T ରେ C18: 1ω7c ଏବଂ / କିମ୍ବା C18: 1ω6c ଅନୁପାତ କମିଯାଏ | oleivorans MIL-1T ଏବଂ O. kriegii DSM 6294T, କିନ୍ତୁ B. sanyensis KCTC 32220T ରେ ଚିହ୍ନଟ ହୋଇନାହିଁ | ASxL5T ଏବଂ ASxLS ର ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ତୁଳନାରେ ଦୁଇଟି ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ମଧ୍ୟରେ ବ୍ୟକ୍ତିଗତ ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ପରିମାଣରେ ସୂକ୍ଷ୍ମ ପାର୍ଥକ୍ୟ ପ୍ରକାଶ ପାଇଲା, ଯାହା ସମାନ ପ୍ରଜାତିର ଜେନୋମିକ୍ DNA କ୍ରମ ସହିତ ସମାନ | ସୁଦର୍ଶନ କଳା ପରୀକ୍ଷଣ ବ୍ୟବହାର କରି କ pol ଣସି ପଲି -3-ହାଇଡ୍ରୋକ୍ସିବୁଟାଇରେଟ୍ (PHB) କଣିକା ଚିହ୍ନଟ ହୋଇପାରିଲା ନାହିଁ |
ଶିକାରର ପରିସର ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବା ପାଇଁ ASxL5T ଜୀବାଣୁମାନଙ୍କର ପୂର୍ବାନୁମାନ କାର୍ଯ୍ୟକଳାପ ଅଧ୍ୟୟନ କରାଯାଇଥିଲା | ଏହି ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର ପ୍ରଜାତି ଉପରେ ପ୍ଲେକ୍ ଗଠନ କରିପାରିବ, ଏଥିରେ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ: କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ସୁଇସ୍ 11608 ଟି, କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜେଜୁନି PT14, କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜେଜୁନି 12662, କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜେଜୁନି NCTC 11168T; Escherichia coli NCTC 12667; C. helveticus NCTC 12472; C lari NCTC 11458 ଏବଂ C. upsaliensis NCTC 11541T | ଗ୍ରାମ-ନକାରାତ୍ମକ ଏବଂ ଗ୍ରାମ-ପଜିଟିଭ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ଏକ ବ୍ୟାପକ ପରିସର ପରୀକ୍ଷା କରିବାକୁ ପଦ୍ଧତିର ହୋଷ୍ଟ ପରିସର ନିର୍ଣ୍ଣୟ ବିଭାଗରେ ତାଲିକାଭୁକ୍ତ ସଂସ୍କୃତିଗୁଡିକ ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | ଫଳାଫଳଗୁଡିକ ଦର୍ଶାଏ ଯେ ASxL5T ମଧ୍ୟ Escherichia coli NCTC 86 ଏବଂ Citrobacter freundii NCTC 9750T ରେ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇପାରିବ | କ୍ଲେବସିଏଲା ଅକ୍ସିଟୋକା 11466 ରେ ଗଠିତ ଫଳକଗୁଡିକ ଇ କୋଲି NCTC 86 ସହିତ TEM ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଚିତ୍ର 4A-D ରେ ଦର୍ଶାଯାଇଛି, ଏବଂ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର ଜେଜୁନି PT14 ଏବଂ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ସୁଇସ୍ S12 ସହିତ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଚିତ୍ର 4E-H ମଧ୍ୟଭାଗରେ ଦର୍ଶାଯାଇଛି | ପରୀକ୍ଷିତ ଶିକାର ପ୍ରକାରଗୁଡିକ ମଧ୍ୟରେ ଆକ୍ରମଣ ଯନ୍ତ୍ରକ different ଶଳ ଭିନ୍ନ ମନେହୁଏ, ପ୍ରତ୍ୟେକ ASxL5T କକ୍ଷରେ ଗୋଟିଏ କିମ୍ବା ଅଧିକ ଇ କୋଲି କୋଷ ସଂଲଗ୍ନ ହୋଇ ଆଡସର୍ପସନ୍ ପୂର୍ବରୁ ବିସ୍ତାରିତ କକ୍ଷରେ ପାର୍ଶ୍ୱରେ ଅବସ୍ଥିତ | ଏହାର ବିପରୀତରେ, ASxL5T ଏକ ସମ୍ପର୍କ ବିନ୍ଦୁ ମାଧ୍ୟମରେ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ସହିତ ସଂଲଗ୍ନ ହୋଇଥିବା ପରି ଦେଖାଯାଏ, ସାଧାରଣତ the ଶିକାରକାରୀ କୋଷର ଶିଖରରେ ଏବଂ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର କୋଷର ଶିଖରରେ (ଚିତ୍ର 4H) |
ASx5LT ଏବଂ ଶିକାର ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଦେଖାଉଥିବା TEM: (AD) ଏବଂ E. coli ଶିକାର; (EH) ଏବଂ C. jejuni ଶିକାର | (କ) ଗୋଟିଏ ସାଧାରଣ କୋଲି (EC) କକ୍ଷ ସହିତ ସଂଯୁକ୍ତ ଏକ ସାଧାରଣ ASx5LT କକ୍ଷ; (ଖ) ଗୋଟିଏ EC କୋଷ ସହିତ ସଂଯୁକ୍ତ ଏକ ଚିଲିକା ASx5LT; (ଗ) ଏକାଧିକ EC କୋଷ ସହିତ ସଂଯୁକ୍ତ ଏକ ଚିଲିକା ASx5LT କୋଷ; (ଘ) ଗୋଟିଏ ଇ କୋଲି (EC) କକ୍ଷରେ ଛୋଟ ASx5LT କୋଷଗୁଡ଼ିକ ସଂଲଗ୍ନ କରନ୍ତୁ | (ଇ) ଏକ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜେଜୁନି (CJ) କକ୍ଷ ସହିତ ସଂଯୁକ୍ତ ଏକକ ASx5LT ସେଲ୍; (F) ASx5LT C. hyointestinalis (CH) କୋଷଗୁଡିକ ଉପରେ ଆକ୍ରମଣ କରେ; (ଜି) ଦୁଇଟି ASx5LT ସେଲ୍ ଏକ CJ ସେଲ୍ ଉପରେ ଆକ୍ରମଣ କଲା; (ହ) CJ ସେଲ୍ (ବାର୍ 0.2 μm) ର ଶୀର୍ଷରେ ଥିବା ASx5LT ସଂଲଗ୍ନ ବିନ୍ଦୁର ଏକ ନିକଟତର ଦୃଶ୍ୟ | ବାରଟି (A - G) ରେ 1 μm ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ |
ଶିକାରର ପ୍ରଚୁର ଉତ୍ସର ଲାଭ ଉଠାଇବା ପାଇଁ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ବିକଶିତ ହୋଇଛି | ଆଜ୍ଞା ହଁ, ସେମାନେ ବିଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ପରିବେଶରେ ବହୁଳ ଭାବରେ ଉପସ୍ଥିତ | ଜନସଂଖ୍ୟା ସଦସ୍ୟମାନଙ୍କର ସଂକୀର୍ଣ୍ଣ ଆକାର ହେତୁ, ଫେଜ୍ ପୃଥକ ପ୍ରଣାଳୀ ବ୍ୟବହାର କରି ASxL5T ଜୀବାଣୁକୁ ସ୍ଲୁରିରୁ ପୃଥକ କରିବା ସମ୍ଭବ | ସାମୁଦ୍ରିକ ଜୀବାଣୁର ସାମୁଦ୍ରିକ ଜୀବାଣୁର ସଦସ୍ୟମାନଙ୍କ ପାଇଁ ASxL5T ର ଜେନୋମିକ୍ ପ୍ରାସଙ୍ଗିକତା ଆଶ୍ଚର୍ଯ୍ୟଜନକ, ଯଦିଓ ଜୀବଜନ୍ତୁ ଲୁଣ ସହନଶୀଳ ଏବଂ 5% ଲୁଣ ଧାରଣ କରିଥିବା ଏକ ମାଧ୍ୟମରେ ବ grow ିପାରେ | ସ୍ଲୁରିର ଜଳ ଗୁଣବତ୍ତା ବିଶ୍ଳେଷଣରୁ ଜଣାପଡିଛି ଯେ ସୋଡିୟମ୍ କ୍ଲୋରାଇଡ୍ ପରିମାଣ 0.1। %% ରୁ କମ୍ ଥିଲା | ତେଣୁ, କାଦୁଅ ସାମୁଦ୍ରିକ ପରିବେଶଠାରୁ ବହୁ ଦୂରରେ - ଉଭୟ ଭ ograph ଗୋଳିକ ଏବଂ ରାସାୟନିକ | ସମାନ ଉତ୍ସରୁ ତିନୋଟି ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ କିନ୍ତୁ ଭିନ୍ନ ପୃଥକ ପୃଥକତାର ଉପସ୍ଥିତି ପ୍ରମାଣ ଦିଏ ଯେ ଏହି ଶିକାରକାରୀମାନେ ଏହି ଅଣ-ସାମୁଦ୍ରିକ ପରିବେଶରେ ଆଗକୁ ବ .ୁଛନ୍ତି | ଏହା ସହିତ, ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990 ରୁ ଉପଲବ୍ଧ ଡାଟା ଫାଇଲଗୁଡିକ) ଦର୍ଶାଇଲା ଯେ ସମାନ 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ଶ୍ରେଷ୍ଠ 50 ପ୍ରଚୁର କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଟ୍ୟାକ୍ସ (OTU) ରେ ଅବସ୍ଥିତ | ) କାଦୁଅର କିଛି ନମୁନା ବ୍ୟବଧାନରେ | ଜେନବ୍ୟାକ୍ ଡାଟାବେସରେ ଅନେକ ଅଣସଂଗଠିତ ଜୀବାଣୁ ମିଳିଥିଲେ, ଯାହାର ASSL5T ଜୀବାଣୁ ପରି 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ଅଛି | ଏହି କ୍ରମଗୁଡିକ, ASxL5T, ASxS5, ଏବଂ ASxO5 ର କ୍ରମ ସହିତ, ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ଏବଂ ଓସେନୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ (ଚିତ୍ର 2) ରୁ ପୃଥକ ହୋଇଥିବା ବିଭିନ୍ନ କ୍ଲେଡ୍ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରୁଥିବା ପରି ମନେହୁଏ | 2009 ରେ ଦକ୍ଷିଣ ଆଫ୍ରିକାର ସୁନା ଖଣିରେ 1.3 କିଲୋମିଟର ଗଭୀରତାରେ ଫିସର ଜଳରୁ ତିନି ପ୍ରକାରର ଅଣସଂଗଠିତ ଜୀବାଣୁ (GQ921362, GQ921357 ଏବଂ GQ921396) ପୃଥକ କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ ଅନ୍ୟ ଦୁଇଟି (DQ256320 ଏବଂ DQ337006) ଭୂତଳ ଜଳରୁ ମଧ୍ୟ ଆସିଥିଲା ​​| 2005 ରେ) ASSL5T ସହିତ ଅତି ଘନିଷ୍ଠ ଥିବା 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ହେଉଛି 2006 ରେ ଉତ୍ତର ଫ୍ରାନ୍ସର ସମୁଦ୍ର କୂଳରୁ ମିଳିଥିବା ବାଲୁକା ପଙ୍କ ସମୃଦ୍ଧ ସଂସ୍କୃତିରୁ ପ୍ରାପ୍ତ 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମର ଏକ ଅଂଶ (ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା AM29240828) | ଚାଇନାର ଏକ ମ୍ୟୁନିସିପାଲିଟି ଲ୍ୟାଣ୍ଡଫିଲରୁ ଲଞ୍ଚ ହୋଇଥିବା ଏକ ସଂଗ୍ରହ ଟ୍ୟାଙ୍କରୁ ଅଣସଂରକ୍ଷିତ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ HQ183822.1 ରୁ ଅନ୍ୟ ଏକ ଘନିଷ୍ଠ ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ | ଆଜ୍ଞା ହଁ, ASxL5T ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଟ୍ୟାକ୍ସୋନୋମିକ୍ ଡାଟାବେସରେ ଉଚ୍ଚ ପ୍ରତିନିଧୀ ନୁହଁନ୍ତି, କିନ୍ତୁ ଅଣସଂଗଠିତ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ଏହି କ୍ରମଗୁଡିକ ASxL5T ପରି ଜୀବମାନଙ୍କୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ likely କରିବାର ସମ୍ଭାବନା ଅଛି, ଯାହା ସମଗ୍ର ବିଶ୍ୱରେ ବିତରଣ ହୁଏ, ସାଧାରଣତ chall ଚ୍ୟାଲେଞ୍ଜ ପରିବେଶରେ | ସମଗ୍ର ଜିନୋମ ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣରୁ, ASxL5T ର ନିକଟତମ ସମ୍ପର୍କୀୟ ହେଉଛି ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ସ୍ପ | C2-1, T. marinus, T. oleivorans | ଓ। ସାମୁଦ୍ରିକ ଜୀବାଣୁ OHCB ଗୋଷ୍ଠୀର ସଦସ୍ୟ ନୁହଁନ୍ତି, କିନ୍ତୁ ସାମୁଦ୍ରିକ ପରିବେଶରୁ ବିଚ୍ଛିନ୍ନ ଅଟନ୍ତି |
ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ତଥ୍ୟ ସୂଚିତ କରେ ଯେ ASxL5T ହେଉଛି ଏକ ନୂତନ ପ୍ରଜାତି ଏବଂ ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରୋସ୍ପିରାସିୟା ପରିବାରରେ ପୂର୍ବରୁ ଏକ ଅଜ୍ଞାତ ବଂଶର ସଦସ୍ୟ | ନୂତନ ବିଚ୍ଛିନ୍ନ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ଗୁଡ଼ିକୁ ଏକ ନୂତନ ବଂଶରେ ଶ୍ରେଣୀଭୁକ୍ତ କରିବାକୁ ବର୍ତ୍ତମାନ କ clear ଣସି ସ୍ପଷ୍ଟ ମାନକ ନାହିଁ | ସର୍ବଭାରତୀୟ ଜେନେରା ସୀମା ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବାକୁ ଚେଷ୍ଟା କରାଯାଇଛି, ଉଦାହରଣ ସ୍ୱରୂପ, ରକ୍ଷଣଶୀଳ ପ୍ରୋଟିନ୍ (POCP) ର ଜିନୋମର ଶତକଡ଼ା ଉପରେ ଆଧାର କରି, କଟ୍ ଅଫ୍ ମୂଲ୍ୟ ରେଫରେନ୍ସ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ସହିତ 50% ସମାନ ବୋଲି ପରାମର୍ଶ ଦିଆଯାଇଛି | ଅନ୍ୟମାନେ AAI ମୂଲ୍ୟ ବ୍ୟବହାର କରିବାକୁ ପରାମର୍ଶ ଦିଅନ୍ତି, ଯାହାର POCP ଉପରେ ସୁବିଧା ଅଛି କାରଣ ସେଗୁଡିକ ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜେନୋମରୁ ମିଳିପାରିବ 34 | ଲେଖକ ବିଶ୍ believes ାସ କରନ୍ତି ଯେ ଯଦି ମଡେଲ ପ୍ରଜାତିର ମଡେଲ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ତୁଳନାରେ AAI ମୂଲ୍ୟ 74% ରୁ କମ୍, ତେବେ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ଏକ ଭିନ୍ନ ଜେନେରାର ପ୍ରତିନିଧୀ | ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରିଲାସିରେ ଥିବା ମଡେଲ୍ ଜେନସ୍ ହେଉଛି ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରିଲମ୍, ଏବଂ ମଡେଲ୍ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ହେଉଛି O. linum ATCC 11336T | ASxL5T ଏବଂ O. linum ATCC 11336T ମଧ୍ୟରେ AAI ମୂଲ୍ୟ ହେଉଛି 54.34%, ଏବଂ ASxL5T ଏବଂ T. oleivorans MIL-1T (ଜେନସ୍ ପ୍ରକାର ଷ୍ଟ୍ରେନ୍) ମଧ୍ୟରେ AAI ମୂଲ୍ୟ 67.61% ଅଟେ, ସୂଚାଇଥାଏ ଯେ ASxL5T ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ଠାରୁ ଭିନ୍ନ ଏକ ନୂତନ ବଂଶକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ | 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମକୁ ଶ୍ରେଣୀକରଣ ମାନକ ଭାବରେ ବ୍ୟବହାର କରି, ପ୍ରସ୍ତାବିତ ଜେନସ୍ ବିସ୍ତାର ସୀମା ହେଉଛି 94.5% 35 | ASxL5T ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ବଂଶରେ ସ୍ଥାନିତ ହୋଇପାରେ, ଯାହା 95.03% 16S rRNA କ୍ରମ ପରିଚୟକୁ T. oleivorans MIL-1T ଏବଂ 96.17% ଦର୍ଶାଇଥାଏ | ମାରିନସ୍ IMCC1826T | ଅବଶ୍ୟ, ଏହା ବ୍ୟାକ୍ଟେରଏଡସ୍ ବଂଶରେ ମଧ୍ୟ ରଖାଯିବ ଯେଉଁଥିରେ ବି ସାନାଇସିସ୍ NV9 ସହିତ 94.64% 16S rRNA ଜିନ୍ ପରିଚୟ ରହିଛି, ସୂଚାଇଥାଏ ଯେ 16S rRNA ଜିନ୍ ପରି ଗୋଟିଏ ଜିନ୍ ବ୍ୟବହାର କରିବା ଦ୍ arbit ାରା ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ବର୍ଗୀକରଣ ଏବଂ ଆସାଇନମେଣ୍ଟ ହୋଇପାରେ। ଅନ୍ୟ ଏକ ପରାମର୍ଶିତ ପଦ୍ଧତି ANI ଏବଂ ଜେନୋମ ଆଲାଇଜମେଣ୍ଟ ସ୍କୋର (AF) କୁ ବ୍ୟବହାର କରିଥାଏ ଯାହାକି ସମସ୍ତ ପ୍ରକାରର ଡାଟା ପଏଣ୍ଟଗୁଡିକର କ୍ଲଷ୍ଟରିଂ ଏବଂ ବିଦ୍ୟମାନ ଜେନେରାର ଅଣ-ପ୍ରକାର ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ଗୁଡ଼ିକୁ ପରୀକ୍ଷା କରିଥାଏ | ବିଶ୍ଳେଷଣ କରାଯାଉଥିବା ଟ୍ୟାକ୍ସ ପାଇଁ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଆନୁମାନିକ ବଂଶର ଇନଫ୍ଲେକ୍ସନ୍ ପଏଣ୍ଟ ସହିତ ଜେନସ୍ ସୀମାକୁ ମିଶ୍ରଣ କରିବାକୁ ଲେଖକ ପରାମର୍ଶ ଦେଇଛନ୍ତି | ଯଦିଓ, ଯଦି ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ବିଚ୍ଛିନ୍ନରୁ ପର୍ଯ୍ୟାପ୍ତ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ୍ କ୍ରମ ନଥାଏ, ତେବେ ଏହି ପଦ୍ଧତି ଦ୍ AS ାରା ASxL5T ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ବଂଶର ଅଟେ କି ନାହିଁ ତାହା ସ୍ଥିର କରିବା ଅସମ୍ଭବ ଅଟେ | ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ କ୍ରମର ସୀମିତ ଉପଲବ୍ଧତା ହେତୁ, ସମଗ୍ର ଜିନୋମ ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ଗଛକୁ ସତର୍କତାର ସହିତ ବ୍ୟାଖ୍ୟା କରାଯିବା ଉଚିତ | ଦ୍ୱିତୀୟତ whole, ତୁଳନାତ୍ମକ ଜେନୋମର ଆକାରରେ ଯଥେଷ୍ଟ ପାର୍ଥକ୍ୟ ପାଇଁ ସମଗ୍ର ଜେନୋମ ତୁଳନା ପଦ୍ଧତିଗୁଡ଼ିକ ହିସାବ କରିପାରିବ ନାହିଁ | ସେମାନେ ସଂପୃକ୍ତ ଜେନେରା ମଧ୍ୟରେ ସଂରକ୍ଷିତ କୋର ସିଙ୍ଗଲ୍-କପି ଜିନ୍ ର ସମାନତା ମାପ କଲେ, କିନ୍ତୁ ବହୁ ସଂଖ୍ୟକ ଜିନ୍ ଧ୍ୟାନ ଦେଲେ ନାହିଁ ଯାହା ASxL5T ର ବହୁତ ଛୋଟ ଜିନୋମରେ ନାହିଁ | ଆଜ୍ଞା ହଁ, ASxL5T ଏବଂ ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍, ଓସେନୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍, ଏବଂ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଓପ୍ଲାନ୍ସ ସମେତ ଗୋଷ୍ଠୀର ଏକ ସାଧାରଣ ପିତୃପୁରୁଷ ଅଛନ୍ତି, କିନ୍ତୁ ବିବର୍ତ୍ତନ ଏକ ଭିନ୍ନ ରାସ୍ତା ଆପଣେଇଛି, ଯାହା ଜିନୋମ୍ର ହ୍ରାସ ଘଟାଇଥାଏ, ଯାହା ଏକ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବନଶ to ଳୀ ସହିତ ଖାପ ଖାଇପାରେ | ଏହା T. oleivorans MIL-1T ର ବିପରୀତ, ଯାହା 28% ବଡ ଏବଂ ହାଇଡ୍ରୋକାର୍ବନ୍ ବ୍ୟବହାର କରିବା ପାଇଁ ବିଭିନ୍ନ ପରିବେଶ ଚାପରେ ବିକଶିତ ହୋଇଛି | ବାଧ୍ୟତାମୂଳକ ଇଣ୍ଟ୍ରାସେଲୁଲାର୍ ପରଜୀବୀ ଏବଂ ସିମ୍ବିଓନ୍ସ ସହିତ ଏକ ଆକର୍ଷଣୀୟ ତୁଳନା କରାଯାଇପାରେ, ଯେପରିକି ରିକେଟସିଆ, କ୍ଲାମିଡିଆ, ଏବଂ ବୁଚନେରା | ସେମାନଙ୍କର ଜିନୋମ ଆକାର ପ୍ରାୟ 1 Mb | ହୋଷ୍ଟ ସେଲ୍ ମେଟାବୋଲାଇଟ୍ ବ୍ୟବହାର କରିବାର କ୍ଷମତା ଜିନ୍ କ୍ଷୟକୁ ନେଇଥାଏ, ତେଣୁ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ବିବର୍ତ୍ତନଶୀଳ ଜେନୋମିକ୍ ଅବକ୍ଷୟ ଘଟିଲା | ସାମୁଦ୍ରିକ ରାସାୟନିକ ପୁଷ୍ଟିକର ଜୀବଠାରୁ ଆରମ୍ଭ କରି ଶିକାରକାରୀ ଜୀବନଶ les ଳୀରେ ବିବର୍ତ୍ତନିକ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଜିନୋମ ଆକାରରେ ସମାନ ହ୍ରାସ ଘଟାଇପାରେ | COG ଏବଂ KEGG ବିଶ୍ଳେଷଣ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ କାର୍ଯ୍ୟ ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ଜିନ୍ ସଂଖ୍ୟା ଏବଂ ASxL5T ଏବଂ T. oleivorans MIL-1T ମଧ୍ୟରେ ଜେନୋମିକ୍ ପଥରେ ବିଶ୍ global ର ପାର୍ଥକ୍ୟକୁ ଆଲୋକିତ କରେ, ଯାହା ମୋବାଇଲ୍ ଜେନେଟିକ୍ ଉପାଦାନଗୁଡ଼ିକର ବ୍ୟାପକ ଉପଲବ୍ଧତା ହେତୁ ହୋଇନଥାଏ | ASxL5T ର ସମଗ୍ର ଜିନୋମର G + C ଅନୁପାତରେ ପାର୍ଥକ୍ୟ ହେଉଛି 56.1%, ଏବଂ ଟି।
ASxL5T ଜିନୋମର କୋଡିଂ ବିଷୟବସ୍ତୁର ପରୀକ୍ଷଣ ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ବ characteristics ଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡିକ ଉପରେ କାର୍ଯ୍ୟକଳାପ ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ | ଜିନ୍ ଏନକୋଡିଂ ପ୍ରକାର IV ଫିମ୍ବ୍ରିଆ (Tfp) ର ଉପସ୍ଥିତି ବିଶେଷ ଆଗ୍ରହର କାରଣ ସେମାନେ ଭୂପୃଷ୍ଠରେ ଫ୍ଲାଗେଲା ବିନା ସାମାଜିକ ଗ୍ଲାଇଡିଂ କିମ୍ବା କନ୍ଭଲସନ୍ ନାମକ କୋଷ ଗତିକୁ ପ୍ରୋତ୍ସାହିତ କରନ୍ତି | ରିପୋର୍ଟ ଅନୁଯାୟୀ, Tfp ର ଅନ୍ୟାନ୍ୟ କାର୍ଯ୍ୟ ଅଛି, ଯାହାର ପୂର୍ବାନୁମାନ, ପାଥୋଜେନେସିସ୍, ବାୟୋଫିଲ୍ମ ଗଠନ, ପ୍ରାକୃତିକ ଡିଏନ୍ଏ ଅପ୍ଟେକ୍, ସ୍ୱୟଂଚାଳିତ ସେଲ୍ ଏକୀକରଣ ଏବଂ ବିକାଶ 38 | ASxL5T ଜିନୋମରେ 18 ଟି ଜିନ୍ ଏନକୋଡିଂ ଡିଗୁଏନାଲେଟ୍ ସାଇକ୍ଲେସ୍ (ଏକ ଏନଜାଇମ୍ ଯାହା 2 ଗୁଆନୋସିନ୍ ଟ୍ରାଇଫୋସଫେଟ୍ କୁ ଗୁଆନୋସିନ୍ 2 ଫସଫେଟ୍ ଏବଂ ସାଇକ୍ଲିକ୍ ଡିଜିଏମ୍ପିରେ ରୂପାନ୍ତର କରିଥାଏ) ଏବଂ 6 ଟି ଜିନ୍ ସଂପୃକ୍ତ ଡିଗୁଏନାଲେଟ୍ ସାଇକ୍ଲେସ୍ ଫସଫେଟ୍ ଡିଗୁଏନାଲେଟ୍ ଧାରଣ କରିଥାଏ | ଏଷ୍ଟେରେଜ୍ ପାଇଁ ଜିନ୍ (ସାଇକ୍ଲିକ୍ ଡି-ଜିଏମ୍ପି ର ଗୁଆନୋସିନ୍ ମୋନୋଫୋସଫେଟ୍ ର ଅବକ୍ଷୟକୁ ଅନୁକରଣ କରିଥାଏ) ଆକର୍ଷଣୀୟ କାରଣ ସାଇକ୍ଲ୍-ଡି-ଜିଏମ୍ପି ବାୟୋଫିଲ୍ମ ବିକାଶ ଏବଂ ପୃଥକତା, ଗତିବିଧି, କୋଷ ସଂଲଗ୍ନ ଏବଂ ଭୁତାଣୁ 39, 40 ସହିତ ଜଡିତ ଏକ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ଦ୍ୱିତୀୟ ବାର୍ତ୍ତା ଅଟେ | ଏହା ମଧ୍ୟ ମନେ ରଖିବା ଉଚିତ ଯେ ବିଡେଲୋଭାଇବ୍ରିଓ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଓଭୋରସରେ ସାଇକ୍ଲିକ୍ ଡବଲ୍ ଜିଏମ୍ପି ମୁକ୍ତ ଜୀବନ ଏବଂ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବନଶ lifestyle ଳୀ ମଧ୍ୟରେ ପରିବର୍ତ୍ତନକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରିବା ପାଇଁ ଦର୍ଶାଯାଇଛି |
ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁ ଉପରେ ଅଧିକାଂଶ ଅନୁସନ୍ଧାନ Bdellovibrio, Bdellovibrio ପରି ଜୀବ ଏବଂ ମାଇକ୍ସୋକୋକସ୍ ପ୍ରଜାତି ଉପରେ ଧ୍ୟାନ ଦେଇଛି | ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁଙ୍କର ଏହି ଏବଂ ଅନ୍ୟ ଜଣାଶୁଣା ଉଦାହରଣଗୁଡିକ ଏକ ବିବିଧ ଗୋଷ୍ଠୀ ଗଠନ କରନ୍ତି | ଏହି ବିବିଧତା ସତ୍ତ୍ character େ, ଚରିତ୍ରଗତ ପ୍ରୋଟିନ୍ ପରିବାରଗୁଡିକର ଏକ ସେଟ୍ ଯାହା 11 ଟି ଜଣାଶୁଣା ଶିକାରକାରୀ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ଫେନୋଟାଇପ୍ ପ୍ରତିଫଳିତ କରେ 3,22 ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇଛି | ଅବଶ୍ୟ, କେବଳ ଜିନ୍ ଏନକୋଡିଂ O ଆଣ୍ଟିଜେନ୍ ଲିଗେଜ୍ (waaL) ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇଛି, ଯାହା ଗ୍ରାମ-ନକାରାତ୍ମକ ଜୀବାଣୁରେ ବିଶେଷ ଦେଖାଯାଏ | ବିଶ୍ଳେଷଣର ଏହି ଫର୍ମ ASxL5T କୁ ଶିକାରକାରୀ ଭାବରେ ଡିଜାଇନ୍ କରିବାରେ ସହାୟକ ହୁଏ ନାହିଁ, ବୋଧହୁଏ ଏହା ଏକ ଉପନ୍ୟାସ ଆକ୍ରମଣ ରଣନୀତି ବ୍ୟବହାର କରେ | ଅଧିକ ବିବିଧ ଶିକାରକାରୀ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଜେନୋମର ଉପଲବ୍ଧତା ସୂକ୍ଷ୍ମ ରିଜୋଲ୍ୟୁସନ୍ ଆନାଲିସିସ୍ ବିକାଶରେ ସାହାଯ୍ୟ କରିବ ଯାହା ଗୋଷ୍ଠୀ ସଦସ୍ୟଙ୍କ ମଧ୍ୟରେ କାର୍ଯ୍ୟକଳାପ ଏବଂ ପରିବେଶଗତ ପାର୍ଥକ୍ୟର ପ୍ରମାଣକୁ ବିଚାରକୁ ନେଇଥାଏ | ଏହି ବିଶ୍ଳେଷଣରେ ଅନ୍ତର୍ଭୂକ୍ତ ହୋଇନଥିବା ଶିକାରକାରୀ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ଉଦାହରଣରେ କପ୍ରିଆଭିଡସ୍ ନେକାଟର୍ 42 ଏବଂ ବ୍ରାଡିମୋନାବାକ୍ଟେରିଆ 43 ର ସଦସ୍ୟ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ, କାରଣ ଅନୁସନ୍ଧାନକାରୀମାନେ ବିଭିନ୍ନ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟର ଅନୁସନ୍ଧାନ କରୁଥିବାବେଳେ ଅଧିକ ଶିକାରକାରୀ ଟ୍ୟାକ୍ସ ପ୍ରତିଷ୍ଠା କରାଯାଇଥାଏ |
TEM ପ୍ରତିଛବି ଦ୍ୱାରା ଧରାଯାଇଥିବା ASxL5T ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ସବୁଠାରୁ ଉଲ୍ଲେଖନୀୟ ବ its ଶିଷ୍ଟ୍ୟ ହେଉଛି ଏହାର ଅନନ୍ୟ ଏବଂ ନମନୀୟ ମର୍ଫୋଲୋଜି, ଯାହା ଶିକାର ଜୀବାଣୁ ସହିତ ପାରସ୍ପରିକ ସମ୍ପର୍କକୁ ପ୍ରୋତ୍ସାହନ ଦେଇପାରେ | ଦେଖାଯାଇଥିବା ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଅନ୍ୟ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁଠାରୁ ଭିନ୍ନ ଏବଂ ଏହା ପୂର୍ବରୁ ଆବିଷ୍କୃତ କିମ୍ବା ରିପୋର୍ଟ ହୋଇନାହିଁ | ପ୍ରସ୍ତାବିତ ASxL5T ଶିକାରକାରୀ ଜୀବନ ଚକ୍ର ଚିତ୍ର 5 ରେ ଦର୍ଶାଯାଇଛି | ସାହିତ୍ୟରେ କିଛି ଆପିକାଲ୍ ସଂରଚନା ସହିତ ଏଠାରେ କିଛି ରିପୋର୍ଟ ଅଛି, କିନ୍ତୁ ଏହି ଉଦାହରଣଗୁଡ଼ିକରେ ଟେରାସାକିସପିରା ପାପାହାନାମୋକୁଏକେନ୍ସିସ୍, ସାମୁଦ୍ରିକ ସ୍ପିରିଲମ୍ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ, ବେଳେବେଳେ ଆପେକ୍ସ ବିସ୍ତାର 44, ଏବଂ ଆଲଫାପ୍ରୋଟୋବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ, ଟେରାସାକିଲା ପୁସିଲା ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ | , ପୂର୍ବରୁ ଓସେନୋସ୍ପିରିଲମ୍ ବଂଶର ତଥାକଥିତ "ପୋଲାର ଫିଲ୍ମ" 45 ପ୍ରଦର୍ଶିତ କରିଥିଲା ​​| କୋକି ଫର୍ମଗୁଡିକ ପୁରାତନ ସଂସ୍କୃତିରେ ପ୍ରାୟତ observed ପାଳନ କରାଯାଏ, ବିଶେଷତ cur ବକ୍ର ଫର୍ମ ଥିବା ଜୀବାଣୁ ଯେପରିକି ଭିବ୍ରିଓ, କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଏବଂ ହେଲିକୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ 46, 47, 48, ଯାହା ଏକ ଅବକ୍ଷୟ ଅବସ୍ଥାକୁ ପ୍ରତିପାଦିତ କରିପାରେ | ASxL5T ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ସଠିକ ଜୀବନଚକ୍ରକୁ ସ୍ପଷ୍ଟ କରିବାକୁ ଅଧିକ କାର୍ଯ୍ୟ ଆବଶ୍ୟକ | ଏହା କିପରି ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରେ ଏବଂ ଶିକାର କରେ, ଏବଂ ଏହାର ଜିନୋମ ଜ olog ବଗତ ଭାବରେ ସକ୍ରିୟ ଯ ounds ଗିକକୁ ଏନକୋଡ୍ କରେ ଯାହା ଡାକ୍ତରୀ କିମ୍ବା ବାୟୋଟେକ୍ନୋଲୋଜିକାଲ ଉଦ୍ଦେଶ୍ୟରେ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇପାରିବ |
ଭେନେଟରବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଜିନ୍ ର ବର୍ଣ୍ଣନା | ନଭେମ୍ବର ଭେନେଟରବ୍ୟାକ୍ଟର୍ (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. L. n। ଭେନେଟର, 'ଶିକାରୀ' ଏବଂ ଗ୍ର। କକ୍ଷଗୁଡ଼ିକ ଏରୋବିକ୍, ଲୁଣ-ସହନଶୀଳ, ବକ୍ର ଗ୍ରାମ ଦାଗ ନକାରାତ୍ମକ, ବ୍ୟାୟାମ ରଡ୍ | 4-9 ର ପରିସର ଅସାଧାରଣ ଅଟେ | ସାମୁଦ୍ରିକ ଶାବକମାନଙ୍କରେ, ଅଧିକାଂଶ ଅମ୍ଳୀୟ pH ର ଅସହିଷ୍ଣୁତା | : 0 3-OH ହାଇଡ୍ରୋକ୍ସି ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ଭାବରେ ମିଳିଥାଏ | ସେମାନେ ବ୍ରୋଟ୍ ମିଡିଆରେ ବ grow ନ୍ତି ନାହିଁ | ଏବଂ ଏଣ୍ଟେରୋବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ପରିବାରର ସଦସ୍ୟମାନଙ୍କର ଶିକାର ଆଚରଣ ଏହି ପରିବାରରେ ଥିବା ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ସ୍ଥିତି |
ଭେନେଟରବ୍ୟାକ୍ଟର୍ କୁକୁଲସ୍ sp ର ବର୍ଣ୍ଣନା | ନଭେମ୍ବର ଭେନେଟରବ୍ୟାକ୍ଟର୍ କୁକୁଲସ୍ (cu'cull.us।; L. n। Cucullus ର ଅର୍ଥ ହେଉଛି ମେଳା) |
ଏହା ସହିତ, ଏହି ବଂଶର ବର୍ଣ୍ଣନାକାରୀ ବ feature ଶିଷ୍ଟ୍ୟ ହେଉଛି ଯେ ଯେତେବେଳେ BA କିମ୍ବା BHI ରେ ବ grown ଼େ, କୋଷଗୁଡ଼ିକ 1.63 µ ମିଟର ଲମ୍ବ ଏବଂ 0.37 µ ମିଟର ଚଉଡା | BHI ଅଗରରେ ଥିବା ଉପନିବେଶଗୁଡିକ ବହୁତ ଛୋଟ, 72 ଘଣ୍ଟା ପରେ ବ୍ୟାସ 2 ମିମିରେ ପହଞ୍ଚିଛି | ସେଗୁଡ଼ିକ ବେଜି, ସ୍ୱଚ୍ଛ, ଗୋଲାକାର, ଉନ୍ମୁକ୍ତ ଏବଂ ଚକଚକିଆ | ଏହି ପ୍ରଜାତିର ସଦସ୍ୟମାନେ Escherichia coli ଏବଂ Klebsiella ବ୍ୟବହାର କରିପାରିବେ | କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ଗ୍ରାମ-ନକାରାତ୍ମକ ଜୀବାଣୁ ଶିକାର ଭାବରେ କାର୍ଯ୍ୟ କରନ୍ତି |
ସାଧାରଣ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ASxL5T, ନଟିଂହାମଶାୟର୍, ବ୍ରିଟେନର ଗୋମାଂସ କ୍ଷୀରରୁ ପୃଥକ ହୋଇ ଜାତୀୟ ପ୍ରକାର ସଂସ୍କୃତି ସଂଗ୍ରହ (ୟୁକେ) ରେ ଜମା କରାଯାଇଥିଲା: ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା NCTC 14397 ଏବଂ ନେଦରଲ୍ୟାଣ୍ଡ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ସଂସ୍କୃତି ସଂଗ୍ରହ (NCCB) ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା NCCB 100775 | ASxL5T ର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ୍ କ୍ରମ | CP046056 ର ଯୋଗ ଅନୁଯାୟୀ ଜେନବ୍ୟାଙ୍କରେ ଜମା କରାଯାଇଛି |
ଫେଜ୍ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ବ୍ୟବହାର କରି ASxL5T ଜୀବାଣୁ ଗୋମାଂସ କ୍ଷୀରରୁ ପୃଥକ ହୋଇଥିଲେ | ସ୍ଲୁରି 1: 9 (w / v) କୁ SM ବଫର୍ (50 ମିମି ଟ୍ରାଇସ୍- HCl [pH 7.5], 0.1 M NaCl, 8 mM MgSO4.7H2O ଏବଂ 0.01% ଜେଲାଟିନ୍; ସିଗମା ଆଲଡ୍ରିଚ୍, ଗିଲିଙ୍ଗହମ୍, ୟୁକେ) ରେ ମିଶ୍ରିତ କରାଯାଇଥିଲା 24 ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ 4 ° C ରେ, ଶିକାରକୁ ବଫର୍ରେ ଧୀରେ ଧୀରେ ଘୂର୍ଣ୍ଣନ କରେ | ନିଲମ୍ବନ 3000g ରେ 3 ​​ମିନିଟ୍ ପାଇଁ ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ କରାଯାଇଥିଲା | ଅଲ ern କିକ ଶକ୍ତି ସଂଗ୍ରହ କରାଯାଇ 5,000 ମିନିଟ୍ ପାଇଁ ଦ୍ୱିତୀୟ ଥର ପାଇଁ 13,000g ରେ ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ କରାଯାଇଥିଲା | ଅଲ ern କିକ ତତ୍ତ୍ then ପରେ 0.45 µm ମେମ୍ବ୍ରେନ୍ ଫିଲ୍ଟର୍ (ମିନିସାର୍ଟ; ସାର୍ଟୋରିୟସ୍, ଗୋଟିଙ୍ଗେନ୍, ଜର୍ମାନୀ) ଏବଂ ଅବଶିଷ୍ଟ ଜୀବାଣୁ କୋଷଗୁଡ଼ିକୁ ବାହାର କରିବା ପାଇଁ 0.2 µ ମିଟର ମେମ୍ବ୍ରେନ୍ ଫିଲ୍ଟର୍ (ମିନିସାର୍ଟ) ଦେଇ ପଠାଗଲା | ASxL5T ଏହି ଫିଲ୍ଟରଗୁଡିକ ପାସ୍ କରିପାରିବ | ସମାନ ସ୍ଲୁରିରୁ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର ଏଣ୍ଟେରୋସସ୍ S12 (NCBI ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା CP040464) ର ଏକ କୋମଳ ଅଗର ଲନ୍ ପ୍ରସ୍ତୁତ କରାଯାଇଥିଲା | ଫିଲ୍ଟର୍ ହୋଇଥିବା ସ୍ଲୁରି ଏହି ହୋଷ୍ଟ ସେଲ୍ ପ୍ଲେଟଗୁଡିକର ପ୍ରତ୍ୟେକରେ ଟ୍ରିପ୍ଲିକେଟ୍ ରେ 10 µl ବୁନ୍ଦା ରେ ବଣ୍ଟନ କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ ଶୁଖିବାକୁ ଦିଆଗଲା | ଏହି ପ୍ଲେଟଟି ମାଇକ୍ରୋଏରୋବିକ୍ ଟ୍ୟାଙ୍କରେ 37 ° C ରେ 48 ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ ମାଇକ୍ରୋଏରୋବିକ୍ ଅବସ୍ଥାରେ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ କରାଯାଇଥିଲା (5% O2, 5% H2, 10% CO2, ଏବଂ 80% N2) | ପ୍ରାପ୍ତ ଦୃଶ୍ୟମାନ ଫଳକକୁ SM ବଫର୍ରେ ବାହାର କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ ଲାଇସେଡ୍ ଜୀବମାନଙ୍କୁ ଅଧିକ ବିସ୍ତାର କରିବା ପାଇଁ C. hyointestinalis S12 ର ତାଜା ଲନ୍ କୁ ସ୍ଥାନାନ୍ତରିତ କରାଯାଇଥିଲା | ଥରେ ଏହା ସ୍ଥିର ହେଲା ଯେ ଜୀବାଣୁ ଲାଇଟିକ୍ ପ୍ଲେକ୍ ର କାରଣ ଏବଂ ଫେଜ୍ ନୁହେଁ, ହୋଷ୍ଟ ଠାରୁ ସ୍ ently ାଧୀନ ଭାବରେ ଜୀବକୁ ବ to ାଇବାକୁ ଚେଷ୍ଟା କର ଏବଂ ଏହାକୁ ଆହୁରି ବର୍ଣ୍ଣିତ କର | ଏରୋବିକ୍ ସଂସ୍କୃତି 37 ° C ରେ 5% v / v ଡିଫିବ୍ରିନାଟେଡ୍ ଘୋଡା ରକ୍ତ (TCS ବାୟୋ ସାଇନ୍ସେସ୍ Lt, ବକିଙ୍ଗହମ୍, ୟୁକେ, ସପ୍ଲିମେଣ୍ଟ) ସହିତ କରାଯାଇଥିଲା | ନ୍ୟାସନାଲ କ୍ଲିନିକାଲ୍ ଷ୍ଟାଣ୍ଡାର୍ଡ କମିଟିର ନିର୍ଦ୍ଦେଶାବଳୀ ଅନୁଯାୟୀ, ଆଣ୍ଟିବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ସମ୍ବେଦନଶୀଳତା ପରୀକ୍ଷା ପାଇଁ ଡିସ୍କ ବିସ୍ତାର ପ୍ରଣାଳୀ ବ୍ୟବହୃତ ହୁଏ | ଏରୋବିକ୍ ସଂସ୍କୃତି ପାଇଁ ନିମ୍ନଲିଖିତ ଆଣ୍ଟିବାୟୋଟିକ୍ (ଅକ୍ସଏଡ୍) ଧାରଣ କରିଥିବା ଡିସ୍କ ବ୍ୟବହାର କରି BHI ଅଗରକୁ 37 ° C ରେ ସଂସ୍କୃତି ଦିଆଯାଇଥିଲା: ଆମୋକ୍ସିସିଲିନ୍ ଏବଂ କ୍ଲାଭୁଲାନିକ୍ ଏସିଡ୍ 30 µg; cefotaxime 30 µg; ଷ୍ଟ୍ରେପ୍ଟୋମାଇସିନ୍ 10 µg; ସିପ୍ରୋଫ୍ଲୋକ୍ସାସିନ୍ 5 µg; ସେଫ୍ଟାଜିଡାଇମ୍ 30 µg ନାଲିଡିକ୍ସିକ୍ ଏସିଡ୍ 30 µg; ଇମିପେନେମ୍ 10 µg; ଆଜିଥ୍ରୋମାଇସିନ୍ 15 µg; କ୍ଲୋରାମଫେନିକୋଲ 30 µg; ସେଫୋକ୍ସିଟିନ୍ 30 µg; ଟେଟ୍ରାସାଇକ୍ଲିନ୍ 30 µg; ନାଇଟ୍ରୋଫୁରାଣ୍ଟୋଏନ୍ 300 µg; Aztreonam 30 µg; ଆମ୍ପିସିଲିନ୍ 10 µg; ସେଫପୋଡକ୍ସାଇମ୍ 10 µg; ଟ୍ରାଇମେଥୋପ୍ରିମ୍-ସଲଫାମେଟୋକ୍ସାଜୋଲ୍ 25 µg | ଲୁଣ ସହନଶୀଳତା BHI ଅଗର ପ୍ଲେଟରେ 37 ° C ରେ ଏରୋବିକ୍ ଇନକ୍ୟୁବେସନ ଦ୍ୱାରା ପ୍ରତିଷ୍ଠିତ ହୋଇଥିଲା | 10% w / v ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ଏକାଗ୍ରତା ପରିସର ଯୋଗାଇବା ପାଇଁ BHI ଅଗର ପ୍ଲେଟରେ ଅତିରିକ୍ତ NaCl ଯୋଗ କରାଯାଇଥିଲା | BHI ଅଗର ପ୍ଲେଟଗୁଡିକରେ 37 ° C ରେ ଏରୋବିକ୍ ସଂସ୍କୃତି ଦ୍ୱାରା pH ପରିସର ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରାଯାଏ, ଯେଉଁଠାରେ pH ପରିସରକୁ 4 ରୁ 9 ମଧ୍ୟରେ ସ୍ଥିର HCl କିମ୍ବା ନିର୍ଜଳ NaOH ସହିତ ସଜାଡି ଦିଆଯାଏ, ଏବଂ ପ୍ଲେଟ୍ pour ାଳିବା ପୂର୍ବରୁ ଲକ୍ଷ୍ୟ pH ମୂଲ୍ୟ ଯାଞ୍ଚ କରାଯାଇଥାଏ | ସେଲୁଲାର୍ ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ, ASxL5T BHI ଅଗରରେ 3 ଦିନ ଏବଂ ଏରୋବିକ୍ 37 ° C ରେ ସଂସ୍କୃତ ହୋଇଥିଲା | FERA ସାଇନ୍ସ ଲିମିଟେଡ୍ (ୟର୍କ, ୟୁକେ) ର MIDI (ଶେର୍ଲକ୍ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ଆଇଡେଣ୍ଟିଫିକେସନ୍ ସିଷ୍ଟମ୍, ସଂସ୍କରଣ 6.10) ଅନୁଯାୟୀ, ସେଲ୍ ଫ୍ୟାଟି ଏସିଡ୍ ବାହାର କରାଯାଇଥିଲା, ପ୍ରସ୍ତୁତ ଏବଂ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରାଯାଇଥିଲା |
TEM ପାଇଁ, ASxL5T 24 ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ BA ରେ 37 ° C ରେ ସମାନ ଭାବରେ ବିସ୍ତାର କରି ଏରୋବିକ୍ ସଂସ୍କୃତି ପ୍ରାପ୍ତ ହୋଇଥିଲା, ଏବଂ ତା’ପରେ 1 ମିଲି ମିଟର 3% (v / v) ଗ୍ଲୁଟାରାଲଡିହାଇଡରେ ରୁମ୍ ତାପମାତ୍ରାରେ 0.1 ମି କାକୋଡିଲେଟ୍ ବଫର୍ରେ 1 ଘଣ୍ଟା ସ୍ଥିର କର, ତା’ପରେ ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ | 3 ମିନିଟ୍ ପାଇଁ 10,000 ଗ୍ରାମରେ | ତା’ପରେ 600 μl 0.1 M କାକୋଡାଇଲେଟ୍ ବଫର୍ରେ ପେଲେଟ୍କୁ ଧୀରେ ଧୀରେ ପୁନ us ପଠାନ୍ତୁ | 200 ଟି ତମ୍ବା ଗ୍ରୀଡରେ ସ୍ଥିର ASxL5T ନିଲମ୍ବନକୁ ଫର୍ମଭର୍ / କାର୍ବନ ଚଳଚ୍ଚିତ୍ରକୁ ସ୍ଥାନାନ୍ତର କରନ୍ତୁ | ଜୀବାଣୁ 0.5। %% (w / v) ୟୁରାନିଲ୍ ଆସେଟେଟ୍ ସହିତ 1 ମିନିଟ୍ ପାଇଁ ଦାଗିତ ହୋଇଥିଲେ ଏବଂ TEI Tecnai G2 12 ବାୟୋଟୱିନ୍ ମାଇକ୍ରୋସ୍କୋପ୍ ବ୍ୟବହାର କରି TEM ଦ୍ୱାରା ପରୀକ୍ଷା କରାଯାଇଥିଲା | ଉପରୋକ୍ତ ପରି, NZCYM ବ୍ରୋଥରେ (BD Difco ™, Fisher Scientific UK Ltd, Loughborough) ସମାନ ସଂଖ୍ୟକ ଶିକାର ଏବଂ ଶିକାରକୁ ଏକତ୍ର କର ଏବଂ 37 ° C ରେ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର କିମ୍ବା କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟରର ମାଇକ୍ରୋଏରୋବିକ୍ ଅବସ୍ଥାରେ 48 ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ ଇନ୍କ୍ୟୁବେଟ୍ କର | TEM ଦ୍ୱାରା ମଧ୍ୟ ପରୀକ୍ଷା କରାଯାଇଥିଲା | ଇଚେରିଚିଆ କୋଲି ପାଇଁ ଏରୋବିକ୍ ଅବସ୍ଥା | ସ୍ pred ାଧୀନ ଭାବରେ ଶିକାର ଏବଂ ଶିକାରକାରୀ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆକୁ ଯାଞ୍ଚ କର, ଯାହା ଶିକାର ହେତୁ କୋଷର morphology ରେ କ changes ଣସି ପରିବର୍ତ୍ତନ ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରେ | PHB ସଂଗ୍ରହର ଅପ୍ଟିକାଲ୍ ମାଇକ୍ରୋସ୍କୋପି ପାଇଁ ସୁଦାନ କଳା ପଦ୍ଧତି ବ୍ୟବହୃତ ହୋଇଥିଲା |
ଏକ ନିର୍ଜଳ ସ୍ ab ାବ୍ ସହିତ BHI କିମ୍ବା BA ପ୍ଲେଟରେ ଅଭିବୃଦ୍ଧିକୁ ଧୂଳି ଦେଇ ASxL5T ରାତାରାତି ସଂସ୍କୃତି ବ .ାନ୍ତୁ | ASxL5T କୋଷଗୁଡିକ ସଂଗ୍ରହ କରନ୍ତୁ ଏବଂ ସେମାନଙ୍କୁ MRD (CM0733, ଅକ୍ସଏଡ୍) ରେ ସ୍ଥଗିତ ରଖନ୍ତୁ, ଏବଂ ତାପରେ କୋଷଗୁଡ଼ିକୁ ଭୋକରେ ରଖିବା ପାଇଁ ସେମାନଙ୍କୁ 4 ° C ରେ ରଖନ୍ତୁ | NCTC ରେଫରେନ୍ସ କିମ୍ବା ଲାବୋରେଟୋରୀ ଷ୍ଟକ୍ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ସଂସ୍କୃତି BHI ବ୍ରୋଟ୍ କିମ୍ବା ନମ୍ବର 2 ପୁଷ୍ଟିକର ବ୍ରୋଟ୍ (CM007, ଅକ୍ସଏଡ୍) ରେ ଇନକ୍ୟୁଲେଡ୍ କରାଯାଇଥିଲା, ରାତାରାତି ଇନ୍କ୍ୟୁବେଡ୍ କରାଯାଇଥିଲା, 13,000g ରେ ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ OD600 0.4 ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ MRD ରେ ପୁନ us ପଠାଯାଇଥିଲା | ସଂସ୍କୃତି: Bacillus subtilis NCTC 3610T, Citrobacter freundii NCTC 9750T, Enterobacter aerogenes NCTC 10006T, Enterococcus faecalis NCTC 775T, Escherichia coli NCTC 86, Klebsiella oxytoca 11466, Leuconostoc NCTC 10817, Listeria ସ୍ପେସିଆଲ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ NCTC stuartsii NCTC 10318, Pseudomonas fluorescens SMDL, Rhodococcus submarine hamburger NCTC 1621T, Salmonella intestinal bacteria Mondeville NCTC 5747, mucilage NCTC 10861, Staphylococcus aureus NCTC 8532T, Streptococcus pneumocolia NCTC 7465T କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର ହୋଷ୍ଟକୁ BA ° ପ୍ଲେଟରେ 37 ° C ରେ ମାଇକ୍ରୋଏରୋବିକ୍ ଭାବରେ ଇନକ୍ୟୁବେଡ୍ କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ NZCYM ବ୍ରଥରେ ନିଲମ୍ବିତ କରାଯାଇଥିଲା | ପରୀକ୍ଷିତ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ହୋଷ୍ଟଗୁଡ଼ିକ ହେଉଛି: C. coli 12667 NCTC, C. jejuni 12662, C. jejuni PT14, C. jejuni NCTC 11168T, C. helveticus NCTC 12472, C. lari NCTC 11458, C. lari NCTC 11458, C. jejuni PT14 , C ... MRD ରେ କୋଷ ସଂଗ୍ରହ କରନ୍ତୁ, 13,000g ରେ ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ କରନ୍ତୁ ଏବଂ OD600 0.4 ନହେବା ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ MRD ରେ ପୁନ us ପଠାନ୍ତୁ | 5 ମିଲି ତରଳାଯାଇଥିବା NZCYM ଟପ୍ ଅଗର (0.6% ଅଗର) ରେ 0.5 ମିଲି ସସପେନ୍ସନ୍ ର ଏକ ଆଲିକଟ୍ ମିଶାନ୍ତୁ ଏବଂ ଏହାକୁ 1.2% NZCYM ତଳ ପ୍ଲେଟରେ pour ାଳନ୍ତୁ | ଆରୋଗ୍ୟ ଏବଂ ଶୁଖିବା ପରେ, କ୍ରମିକ ଭାବରେ ମିଶ୍ରିତ ASxL5T କୁ ଟ୍ରାଇପ୍ଲିକେଟ୍ ରେ ପ୍ରତ୍ୟେକ ଲନ୍ ବୋର୍ଡରେ 20 µl ବୁନ୍ଦା ଭାବରେ ବଣ୍ଟନ କରାଯାଇଥିଲା | ପରୀକ୍ଷା ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ଆବଶ୍ୟକତା ଉପରେ ସଂସ୍କୃତିର ତାପମାତ୍ରା ଏବଂ ପରିବେଶ ନିର୍ଭର କରେ |
ଜୀବାଣୁ ପୃଥକରୁ DNA ପ୍ରସ୍ତୁତ କରିବାକୁ GenElute ™ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ଜେନୋମିକ୍ DNA କିଟ୍ (ସିଗମା ଆଲଡ୍ରିଜ୍) ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | 16S rRNA ଜିନ୍ ର PCR ବିସ୍ତାର ଏବଂ ରଙ୍ଗ ସମାପ୍ତି ରସାୟନ (ୟୁରୋଫିନ୍ସ ମୂଲ୍ୟ ପଠନ ସେବା, ଜର୍ମାନୀ) ବ୍ୟବହାର କରି ଉତ୍ପାଦ କ୍ରମ ନିର୍ଣ୍ଣୟ ପାଇଁ ମାନକ ପଦ୍ଧତି ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇଥିଲା | ଏହି କ୍ରମକୁ ଅନ୍ୟ 16S rRNA ଜିନ୍ କ୍ରମ ସହିତ ତୁଳନା କରିବାକୁ BLAST-N ପ୍ରୋଗ୍ରାମ୍ ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | MEGA X ପ୍ରୋଗ୍ରାମରେ ClustalW ବ୍ୟବହାର କରି ଏଗୁଡିକ ଆଲାଇନ୍ ହୋଇଛି | 1000 ଗାଇଡ୍ କପି ସହିତ ତ Tam ମୁରା-ନେ ମଡେଲ ଉପରେ ଆଧାର କରି ସର୍ବାଧିକ ସମ୍ଭାବନା ପ୍ରଣାଳୀ ବ୍ୟବହାର କରି ଫିଲୋଜେନେଟିକ୍ ଗଛକୁ MEGA X ବ୍ୟବହାର କରି ପୁନ str ନିର୍ମାଣ କରାଯାଇଥିଲା | ପୁରା-ଜେନୋମ କ୍ରମ ପାଇଁ DNA ବାହାର କରିବା ପାଇଁ PureLink ™ Genomic DNA Kit (Fisher Scientific, Loughborough, UK) ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | ASxL5T ର ଜିନୋମ କ୍ରମ ଇଲୁମିନା ମିସେକ୍ ମିଶ୍ରଣ ବ୍ୟବହାର କରି ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରାଯାଇଥିଲା, ଯେଉଁଥିରେ 250 ବିପି ଡବଲ୍-ଏଣ୍ଡ୍ ପ read ଼ା ନକ୍ସଟେରା ଲେବେଲିଂ କିଟ୍ ବ୍ୟବହାର କରି ପ୍ରସ୍ତୁତ ହୋଇଥିବା ଲାଇବ୍ରେରୀ ଏବଂ ପ୍ୟାକ୍ବିଓ ପ୍ଲାଟଫର୍ମରୁ 2 ରୁ 20 kb ଲମ୍ବା ପ read ଼ା ଗଠିତ | ସେମ୍ବିଆ ୟୁନିଭରସିଟିରେ ଜେନୋମିକ୍ସ DNA ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ରିସର୍ଚ୍ଚ ସୁବିଧା | ଏହି ଜିନୋମକୁ CLC ଜେନୋମିକ୍ସ ୱର୍କବେଞ୍ଚ 12.0.3 (କିଆଗେନ୍, ଅରହସ୍, ଡେନମାର୍କ) ବ୍ୟବହାର କରି ଏକତ୍ର କରାଯାଇଥିଲା | ASxL5T ସଂସ୍କୃତିଗୁଡିକ ଜାତୀୟ ପ୍ରକାର ସଂସ୍କୃତି ସଂଗ୍ରହ (ୟୁକେ) ଏବଂ ନେଦରଲ୍ୟାଣ୍ଡ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ସଂସ୍କୃତି ସଂଗ୍ରହ (NCCB) ରେ ଜମା ହୋଇଛି | ତୁଳନା ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ଆନୁସଙ୍ଗିକ ଜୀବମାନଙ୍କର ଜିନୋମଗୁଡ଼ିକ ହେଉଛି: ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ଓଲିଭୋରାନ୍ସ MIL-1T (ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା HF680312, ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ); ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଓପ୍ଲାନ୍ସ ସାନେନିସିସ୍ KCTC 32220T (ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା BMYY01000001, ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ); Oceanobacter kriegii DSM 6294T (ଯୋଗଦାନ ସଂଖ୍ୟା NZ_AUGV00000000, ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ); ମରିନାମୋନାସ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟ DSM 5604T (ASM436330v1, ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ), ଓସେନୋସ୍ପିରୁଲମ୍ ଲିନମ୍ ATCC 11336T (MTSD02000001, ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ) ଏବଂ ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ସ୍ପ। C2-1 (NZ_VNIL01000001 ଯୋଡନ୍ତୁ, ଅସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ) | ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟ ସ୍କୋର (AF) ଏବଂ ହାରାହାରି ନ୍ୟୁକ୍ଲିୟିକ୍ ଏସିଡ୍ ପରିଚୟ (ANI) ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବାକୁ https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= ରେ JGI ଜେନୋମ ପୋର୍ଟାଲ 36 ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | ଯୋଡିରେ | ଆମିନୋ ଏସିଡ୍ ପରିଚୟ (AAI) ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବା ପାଇଁ ରୋଡ୍ରିଗେଜ୍-ଆର ଏବଂ କନଷ୍ଟାଣ୍ଟିନିଡିସ୍ 55 ର ପଦ୍ଧତି ବ୍ୟବହୃତ ହୋଇଥିଲା | ଆନୁମାନିକ ସର୍ବାଧିକ ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ଗଛ ସୃଷ୍ଟି କରିବାକୁ GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 ବ୍ୟବହାର କରନ୍ତୁ | ଉପଲବ୍ଧ ରେଫରେନ୍ସ ଜିନୋମକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରୁଥିବା ଇନପୁଟ୍ ଜିନୋମ 16S rRNA ଫାଇଲୋଜେନିରୁ ASxL5T ସହିତ ଜଡିତ ଥିବା ରେଫରେନ୍ସ ଜେନେରାରୁ ମନୋନୀତ | ଲାଇଫ୍ ଅନ୍ଲାଇନ୍ ଟୁଲ୍ (https://itol.embl.de/) ବ୍ୟବହାର କରି ବୃକ୍ଷର ଟିପ୍ପଣୀ | ASXL5T ଜିନୋମର କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଟିପ୍ପଣୀ ଏବଂ ବିଶ୍ଳେଷଣ KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) ମଡ୍ୟୁଲ୍ ସମୃଦ୍ଧ ବଣ୍ଟନ ବ୍ୟବହାର କରି ବ୍ଲାଷ୍ଟକୋଲା KEGG ଅନ୍ଲାଇନ୍ ଉପକରଣ ବ୍ୟବହାର କରି କରାଯାଇଥାଏ | COG ବର୍ଗର ବଣ୍ଟନ (ଅର୍ଥୋଲୋଜିକାଲ୍ ଗୋଷ୍ଠୀ) ଅଣ୍ଡା NOG- ମ୍ୟାପର୍ ଅନ୍ଲାଇନ୍ ଉପକରଣ ବ୍ୟବହାର କରି ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରାଯାଏ |
ପେରେଜ୍, ଜେ।, ମୋରେଲେଡା-ମୁ ñ ୋଜ, ଏ।, ମାର୍କୋସ-ଟୋରେସ୍, ଏଫଜେ ଏବଂ ମୁ ñ ୋଜ-ଡୋରାଡୋ, ଜେ। । ପରିବେଶ ଅଣୁଜୀବ 18, 766–779 (2016) |
ଲିନାରେସ୍-ଓଟୋୟା, ଏଲ୍ ଇତ୍ୟାଦି ପେରୁଆ ଉପକୂଳରେ ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁଙ୍କର ବିବିଧତା ଏବଂ ଆଣ୍ଟିବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ସମ୍ଭାବନା | ମାର୍ଚ୍ଚ drugs ଷଧ | 15 E308 https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017) |
ପାଷ୍ଟରନାକ୍, ଜେ। ସେମାନଙ୍କର ଜିନ୍ ମାଧ୍ୟମରେ, ଆପଣ ସେଗୁଡ଼ିକୁ ବୁ will ିବେ: ଶିକାରକାରୀ ଜୀବାଣୁଙ୍କର ଜେନୋମିକ୍ ଗୁଣ | ISME J. 7, 756–769 (2013) |
ସକେଟ୍, RE ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଫେଜ୍ ବିଡେଲୋଭାଇବ୍ରିଓର ଶିକାରକାରୀ ଜୀବନଶ lifestyle ଳୀ | ସଂସ୍ଥାପନ କରନ୍ତୁ | ପାଳକ ମାଇକ୍ରୋବସ୍ | 63, 523-539 (2009)
କୋରପ, ଜେ।, ଭେଲା ଗୁରୁଭିକ୍, ଏମ୍ଏସ୍ ଏବଂ ନେଟ୍, ଏମ୍। ବିଲଷ୍ଟାଇନ୍ ଜେ। ହିଷ୍ଟୋକେମିଷ୍ଟ୍ରି 12, 594–607 (2016) |
ଜଙ୍କେ, ଜେ।, ଫ୍ରାଉନ୍, ଏସ୍, ବୋସ୍, ଟିସିଜି, ହେଣ୍ଟସେଲ୍, ୟୁ। ଅଣୁଜୀବ ଇକୋଲୋଜି 79, 252-257 (2020)
ଭିଲା, ଜେ।, ମୋରେନୋ-ମୋରେଲେସ୍, ଜେ ଏବଂ ବାଲେଷ୍ଟେ-ଡେଲପିଅର୍, ସି ନୂତନ ଆଣ୍ଟିବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ ଏଜେଣ୍ଟମାନଙ୍କର ବର୍ତ୍ତମାନର ସ୍ଥିତି ଆବିଷ୍କାର କରନ୍ତୁ | କ୍ଲିନିକାଲ୍ ଅଣୁଜୀବ ସଂକ୍ରମଣ https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019) |
ହୋବଲି, ଏଲ୍। ଫେଜ୍ ଏବଂ ଫେଜ୍ ର ଦ୍ୱ ual ତ ପୂର୍ବାନୁମାନ E. coli ଶିକାରକୁ ଗୋଟିଏ ବି ପୂର୍ବାନୁମାନ ବିନା ବିଲୋପ କରିପାରେ | ଜେ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ 202, e00629-19 https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020) |
ଏଲ୍-ଶିବିନି, ଏ।, କନର୍ଟନ୍, ପିଏଲ୍ ଏବଂ କନର୍ଟନ୍, ଯଦି ମାଗଣା ପରିସର ଏବଂ ଜ organic ବ କୁକୁଡ଼ାମାନଙ୍କର ଖାଇବା ଚକ୍ରରେ କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଏବଂ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଓଫେଜ୍ ଗଣନା ଏବଂ ବିବିଧତା | ପ୍ରୟୋଗ ପରିବେଶ | ଅଣୁଜୀବ 71, 1259–1266 (2005)
ୱିଲକିନ୍ସନ୍, ଡିଏ ଇତ୍ୟାଦି କ୍ୟାମ୍ପିଲୋବ୍ୟାକ୍ଟର ଘୁଷୁରିର ଜେନୋମିକ୍ ଟ୍ୟାକ୍ସୋନୋମି ଏବଂ ଏପିଡେମୋଲୋଜି ଅପଡେଟ୍ କରନ୍ତୁ | ବିଜ୍ଞାନ ପ୍ରତିନିଧୀ 8, 2393। Https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018) |
ଲି, MD GToTree: ସିଷ୍ଟମ୍ ଜେନୋମିକ୍ସ ପାଇଁ ଉପଭୋକ୍ତା-ଅନୁକୂଳ କାର୍ଯ୍ୟ ପ୍ରବାହ | ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ 35, 4162–4164 (2019) |
ଏଡ୍ଗାର, ଆରସି ମସକଲ୍: ଏକାଧିକ କ୍ରମ ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟ ପଦ୍ଧତି ଯାହା ସମୟ ଏବଂ ସ୍ଥାନ ଜଟିଳତାକୁ ହ୍ରାସ କରିଥାଏ | BMC ଜ bi ବିକ ସୂଚନା | 5, 113 (2004)
କ୍ୟାପେଲା-ଗୁଟିରେସ୍, ଏସ୍, ସିଲା-ମାର୍ଟିନେଜ୍, ଜେଏମ୍ ଏବଂ ଗାବାଲଡନ୍, ଟି। ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ 25, 1972–1973 (2009) |
ହାଇଟ୍, ଡି। ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ 28, 2223-2230 (2012) |
ଶେନ୍, ଡବ୍ଲୁ। Bio Rxiv। (ଜୁନ୍ 1, 2021 ରେ ପ୍ରବେଶ ହୋଇଛି); https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019) |
ମୂଲ୍ୟ, MN, ଦେହଲ୍, PS ଏବଂ ଆର୍କିନ୍, ଏପି ଫାଷ୍ଟଟ୍ରି 2-ଆନୁମାନିକ ସର୍ବାଧିକ ସମ୍ଭାବନା ଗଛ ବଡ଼ ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟ ସହିତ | PLoS One 5, e9490 (2010) |
ଟାଙ୍ଗେ, O. GNU ସମାନ୍ତରାଳ | (ଜୁନ୍ 1, 2021 ରେ ପ୍ରବେଶ ହୋଇଛି); https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018) |
କେନେହିସା, ଏମ୍। ନ୍ୟୁକ୍ଲିକ୍ ଏସିଡ୍ ଗବେଷଣା | 28, 27-30 (2000)
ଚେକ୍ ରିପବ୍ଲିକ୍, ଏଲ୍। ଜିନ୍ (ବେସେଲ୍) | 917 E177 https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018) |
ଗ୍ରେଗସନ୍, ବିଏଚ୍, ମେଟୋଡିଏଭା, ଜି। ଆଗ ଅଣୁଜୀବ 9, 3130 (2018) |
ପାଷ୍ଟରନାକ, ଜେ।, ବେନ ସାସନ, ଟି।, କୋହେନ, Y., ସେଗେଭ, ଇ, ଏବଂ ଜୁରେକେଭିଚ, ଇ। ପବ୍ଲିକ୍ ସାଇନ୍ସ ଲାଇବ୍ରେରୀ ଏକ | 10 e0142933 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015) |
ୟାକିମୋଭ୍, ଏମ୍, ଇତ୍ୟାଦି ଥାଲାସୋଲିଟୁସ୍ ଅଲିଭୋରାନ୍ସ ଜିନ୍ | ନଭେମ୍ବର, ସ୍ପ। nov।, ଏକ ନୂତନ ପ୍ରକାରର ସାମୁଦ୍ରିକ ଜୀବାଣୁ ଯାହା ହାଇଡ୍ରୋକାର୍ବନ୍ ବ୍ୟବହାରରେ ବିଶେଷଜ୍ଞ | ଆନ୍ତର୍ଜାତୀୟତା ଜେ ସିଷ୍ଟମ୍ | ବିବର୍ତ୍ତନ ଅଣୁଜୀବ 54, 141–148 (2004) |
ୱାଙ୍ଗ, Y., Yu, M., Liu, Y., Yang, X. & Zhang, XH Bacterioplanoides pacificum gen। ନଭେମ୍ବର, ସ୍ପ। ନଭେମ୍ବରରେ, ଏହା ଦକ୍ଷିଣ ପ୍ରଶାନ୍ତରେ ପ୍ରବାହିତ ସମୁଦ୍ର ଜଳଠାରୁ ଅଲଗା ହୋଇଥିଲା | ଆନ୍ତର୍ଜାତୀୟତା ଜେ ସିଷ୍ଟମ୍ | ବିବର୍ତ୍ତନ ଅଣୁଜୀବ 66, 5010–5015 (2016) |