هڪ نئين قسم جو گرام-منفي، ايروبڪ، لوڻ برداشت ڪندڙ، سرگرم، ڇنڊ ڇاڻ وارو، ۽ شڪاري بيڪٽيريا ASxL5T انگلينڊ جي ناٽنگهم شائر ۾ ڳئون جي گوبر جي تلاءَ مان ڌار ڪيو ويو ۽ ڪيميلو بڪٽر کي ان جي شڪار طور استعمال ڪيو ويو. ان کان پوءِ، ڪيمپيلو بڪٽر جا ٻيا جنس ۽ Enterobacteriaceae خاندان جا ميمبر شڪار طور دريافت ٿيا. ذيلي ڪلچر کان پوءِ ميزبان سيلن کان سواءِ، دماغي دل جي انفيوژن آگر تي ضعيف ايسپٽڪ واڌ حاصل ڪئي وئي. وڌ ۾ وڌ ترقي جون حالتون 37 °C ۽ pH 7 آهي. ٽرانسميشن اليڪٽران مائڪرو اسڪوپي ظاهر ڪيو ته شڪار جي دستيابي سان لاڳاپيل ڪجهه تمام غير معمولي مورفولوجيڪل خاصيتون. 16S rRNA جين جي ترتيب کي استعمال ڪندي Phylogenetic تجزيو ظاهر ڪيو ويو آهي ته ڌار ڌار مارين Spirulina خاندان جي ميمبر سان لاڳاپيل آهي، پر واضح طور تي ڪنهن به ڄاڻايل جينس جي ميمبر جي طور تي درجه بندي نه ٿو ڪري سگهجي. ASxL5T جي مڪمل جينوم جي ترتيب جي تصديق ڪئي وئي آهي ته سامونڊي اسپيروچيٽس جي ميمبرن سان تعلق. هڪ ڊيٽابيس جي ڳولا انڪشاف ڪيو آهي ته ڪيترائي ASxL5Ts 16S rRNA جين ترتيبن کي سمنڊ، زمين جي مٿاڇري ۽ زميني پاڻي مان ڪيترن ئي غير ثقافتي بيڪٽيريا سان حصيداري ڪن ٿا. اسان جو مشورو ڏيون ٿا ته ASxL5T تناؤ نئين نسل ۾ نئين نسل جي نمائندگي ڪري ٿو. اسان نالو Venatorbacter cucullus gen جي سفارش ڪريون ٿا. نومبر، sp. نومبر ۾، ASxL5T قسم جي دٻاء جي طور تي استعمال ڪيو ويو.
شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا اهي بيڪٽيريا آهن جيڪي بايو سنٿيٽڪ مواد ۽ توانائي حاصل ڪرڻ لاءِ ٻين جاندار بيڪٽيريا کي شڪار ڪرڻ ۽ مارڻ جي صلاحيت رکن ٿا. اهو مئل مائڪروجنزمن مان غذائي اجزاء جي عام وصولي کان مختلف آهي، ۽ اهو پڻ پاراسائيڪ رابطي کان مختلف آهي، جنهن ۾ بيڪٽيريا انهن کي مارڻ کان سواء انهن جي ميزبان سان ويجهي تعلق قائم ڪن ٿا. شڪاري بيڪٽيريا مختلف زندگيءَ جي چڪرن ۾ ترقي ڪئي آهي ته جيئن انهن هنڌن تي موجود خوراڪ جي وسيع ذريعن جو فائدو وٺن (جهڙوڪ سامونڊي رهائشون). اھي ھڪڙي قسم جي متنوع گروھ آھن، جيڪي صرف پنھنجي منفرد نسبندي واري زندگي جي چڪر سان ڳنڍيل آھن. شڪاري بيڪٽيريا جا مثال ڪيترن ئي مختلف فيلا ۾ مليا آهن، جن ۾ شامل آهن: پروٽو بيڪٽيريا، بيڪٽيريا، ۽ ڪلوريلا.3. جڏهن ته، سڀ کان وڌيڪ چڱي طرح اڀياس ڪيل شڪاري بيڪٽيريا Bdellovibrio ۽ Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs4) آهن. شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا نئين حياتياتي طور تي فعال مرکبات ۽ اينٽي بيڪٽيريل ايجنٽن جو هڪ واعدو ذريعو آهن.
اڳڪٿي ڪندڙ بيڪٽيريا کي مڃيو وڃي ٿو ته اهي مائڪروبيل تنوع کي وڌائين ٿا ۽ ماحولياتي نظام جي صحت، پيداوار ۽ استحڪام تي مثبت اثر پون ٿا6. انهن مثبت خاصيتن جي باوجود، بيڪٽيريا کي ڪلچر ڪرڻ جي مشڪلات ۽ انهن جي پيچيده زندگي جي چڪر کي سمجهڻ لاء سيل جي رابطي کي احتياط سان مشاهدو ڪرڻ جي ضرورت جي ڪري نئين شڪاري بيڪٽيريا تي ڪجھ مطالعو موجود آهن. هي معلومات ڪمپيوٽر جي تجزيي مان حاصل ڪرڻ آسان ناهي.
وڌندڙ antimicrobial مزاحمت جي دور ۾، بيڪٽيريا جي پيٿوجنز کي نشانو بڻائڻ لاء نئين حڪمت عملي جو اڀياس ڪيو پيو وڃي، جيئن ته بيڪٽيريا جي استعمال ۽ شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا 7,8. ASxL5T بيڪٽيريا کي 2019 ۾ ناٽنگھم شائر يونيورسٽي جي ڊيري سينٽر مان گڏ ڪيل ڳئون جي گوبر مان فيج آئسوليشن ٽيڪنالاجي استعمال ڪندي ڌار ڪيو ويو. تحقيق جو مقصد حياتياتي ڪنٽرول ايجنٽ جي حيثيت سان امڪاني جاندارن کي الڳ ڪرڻ آهي. Campylobacter hyointestinalis هڪ zoonotic pathogen آهي، جيڪو وڌندڙ انساني آنڊن جي بيمارين سان جڙيل آهي10. اهو سيرم ۾ هر جڳهه آهي ۽ هڪ ٽارگيٽ ميزبان طور استعمال ڪيو ويو آهي.
ASxL5T بيڪٽيريا کي بيف جيلي کان الڳ ڪيو ويو ڇاڪاڻ ته اهو ڏٺو ويو ته اهو تختيون C. hyointestinalis جي لان تي ٺهيون آهن، جيڪي بيڪٽيرياوفاجز جي ذريعي پيدا ٿين ٿيون. هي هڪ اڻڄاتل ڳولها آهي، ڇاڪاڻ ته فيج جي الڳ ڪرڻ واري عمل جو حصو شامل آهي 0.2 µm فلٽر ذريعي فلٽرنگ، جيڪو بيڪٽيريا سيلز کي هٽائڻ لاء ٺهيل آهي. تختي مان ڪڍيل مواد جي خوردبيني جانچ پڌرو ڪيو ويو آهي ته ننڍڙو گرام-منفي وکر راڊ جي شڪل واري بيڪٽيريا polyhydroxybutyrate (PHB) کي گڏ نه ڪيو. پري سيلز کان آزاد اسيپٽڪ ڪلچر کي ڀرپور مضبوط وچولي تي محسوس ڪيو ويندو آهي (جهڙوڪ دماغ دل جي انفيوژن آگر (BHI) ۽ بلڊ آگر (BA))، ۽ ان جي واڌ ڪمزور آهي. اهو حاصل ڪيو ويندو آهي subculture کان پوء ڳري inoculum بهتري سان. اهو مائيڪرو ايروبڪ (7٪ v/v آڪسيجن) ۽ آڪسيجن جي ماحول جي حالتن ۾ هڪجهڙائي سان وڌي ٿو، پر anaerobic ماحول ۾ نه. 72 ڪلاڪن کان پوء، ڪالوني جو قطر تمام ننڍڙو هو، 2 ملي ميٽر تائين پهچي ويو، ۽ اهو بيج، شفاف، گول، محدب ۽ چمڪندڙ هو. معياري بايو ڪيميڪل ٽيسٽنگ کي روڪيو ويو آهي ڇاڪاڻ ته ASxL5T معتبر طور تي مائع ميڊيا ۾ ثقافت نه ٿي سگهي، جنهن مان اهو ظاهر ٿئي ٿو ته اهو بايوفيلم ٺهڻ جي پيچيده زندگي جي چڪر تي ڀاڙي ٿو. بهرحال، پليٽ جي معطلي ڏيکاري ٿي ته ASxL5T ايروبڪ آهي، آڪسائيڊس ۽ ڪيٽليز لاء مثبت، ۽ 5٪ NaCl برداشت ڪري سگهي ٿو. ASxL5T 10 µg streptomycin جي مزاحمتي آهي، پر ٻين سڀني اينٽي بايوٽيڪٽس جي آزمائش لاءِ حساس آهي. ASxL5T بيڪٽيريا سيلز TEM پاران جانچيا ويا (شڪل 1). جڏهن BA تي پرائي سيلز کان سواءِ وڌيا وڃن ٿا، ASxL5T خانا ننڍا ڪيمپائلوبڪٽر هوندا آهن، جن جي سراسري ڊيگهه 1.63 μm (± 0.4)، ويڪر 0.37 μm (± 0.08)، ۽ هڪ ڊگهو (5 μm تائين) قطب آهي. جنسي فليگيلا. لڳ ڀڳ 1.6% سيلن جي ويڪر 0.2 μm کان گھٽ آهي، جيڪا فلٽر ڊوائيس ذريعي گذرڻ جي اجازت ڏيندو. ڪجهه خانن جي چوٽي تي هڪ غير معمولي ساخت جي واڌ جو مشاهدو ڪيو ويو، جهڙوڪ هڪ فيئرنگ (لاطيني ڪوڪولس) (ڏسو تير 1D، E، G ۾). اهو لڳي ٿو ته اهو اضافي ٻاهرئين جھلي سان ٺهيل آهي، جيڪو شايد پيريپلاسمڪ لفافي جي سائيز ۾ تيزيء سان گهٽتائي سبب ٿي سگهي ٿو، جڏهن ته ٻاهرئين جھلي برقرار رهي ٿي، "لوز" ظاهر ڪري ٿي. ASxL5T کي غذائي اجزاء جي غير موجودگيءَ ۾ (PBS ۾) ڊگھي عرصي تائين 4°C تي ڪلچر ڪرڻ جي نتيجي ۾ گھڻا (پر سڀ نه) سيلز ڪوڪل مورفولوجي (Figure 1C) ڏيکاريندا آھن. جڏهن ASxL5T ڪيمپيلو بڪٽر جيجوني سان 48 ڪلاڪن تائين شڪار جي طور تي وڌندو آهي، سراسري سيل جي سائيز وڏي ۽ تنگ هوندي آهي انهن سيلن جي ڀيٽ ۾ جيڪي بغير ميزبان جي وڌيل آهن (ٽيبل 1 ۽ شڪل 1E). ان جي ابتڙ، جڏهن ASxL5T E. coli سان 48 ڪلاڪن لاءِ شڪار جي طور تي وڌي ٿو، ته سيل جي سراسري سائيز ان کان وڌيڪ ڊگھي ۽ ويڪر هوندي آهي جڏهن اها بغير ڪنهن شڪار جي وڌندي آهي (ٽيبل 1)، ۽ سيل جي ڊيگهه متغير هوندي آهي، عام طور تي فليمينٽس ڏيکاريندي آهي (شڪل 1F). جڏهن ڪيمپيلو بڪٽر جيجوني يا اي ڪولي سان 48 ڪلاڪن تائين شڪار ڪيو ويو، ASxL5T سيلز ۾ ڪو به فليگيلا ظاهر نه ٿيو. جدول 1 ASxL5T جي موجودگي، غير موجودگي، ۽ شڪار جي قسم جي بنياد تي سيل جي سائيز ۾ تبديلين جي مشاهدي کي اختصار ڪري ٿو.
ASx5LT جو TEM ڊسپلي: (A) ASx5LT ڊگھو وائپ ڏيکاري ٿو؛ (ب) عام ASx5LT بيٽري؛ (سي) cocci ASx5LT سيلز ڊگھي انڪيوبيشن کان پوءِ بغير غذائيت جي؛ (D) ASx5LT سيلن جو هڪ گروپ غير معمولي ڏيکاري ٿو (E) ASx5LT سيل گروپ جيڪو ڪيمپيلو بيڪٽر جي شڪار سان پکڙيل آهي انهن جي مقابلي ۾ سيل جي ڊيگهه وڌي وئي آهي انهن جي مقابلي ۾ جن جو شڪار نه آهي (D) پڻ ظاهري ساخت ڏيکاري ٿي؛ (F) وڏا فلامينٽس فلاجلا، ASx5LT سيلز، E. coli prey سان انڪيوبيشن کان پوءِ؛ (G) هڪ واحد ASx5LT سيل E. coli سان انڪيوبيشن کان پوءِ، هڪ غير معمولي مٿين ساخت ڏيکاريندي. بار 1 μm جي نمائندگي ڪري ٿو.
16S rRNA جين جي ترتيب کي طئي ڪرڻ (رسائي نمبر MT636545.1) ڊيٽابيس جي ڳولها کي قابل بڻائي ٿو ته اهي ساڳيون ترتيبون قائم ڪن جيڪي Gammaproteobacteria طبقي ۾ آهن، ۽ سامونڊي اسپيريلم فيملي (Figure 2) ۾ سامونڊي بيڪٽيريا جي ويجھو آهن، ۽ Thalassolituusgen جا ميمبر آهن. مرين جي ويجھو مائٽ بيسلس. 16S rRNA جين جي ترتيب واضح طور تي Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) خاندان سان تعلق رکندڙ شڪاري بيڪٽيريا کان مختلف آهي. B. bacteriovorus HD100T (type strain, DSM 50701) ۽ B. bacteriovorus DM11A جو گڏيل مقابلو 48.4% ۽ 47.7% هو، ۽ B. exovorus JSS لاءِ اهو 46.7% هو. ASxL5T بيڪٽيريا وٽ 16S rRNA جين جون 3 ڪاپيون آهن، جن مان ٻه هڪ ٻئي سان هڪجهڙا آهن، ۽ ٽيون 3 بنيادن کان ڌار آهن. ٻه ٻيا شڪاري بيڪٽيريا آئسوليٽس (ASx5S ۽ ASx5O؛ 16S rRNA جين جي رسائي جا نمبر آهن MT636546.1 ۽ MT636547.1، ترتيب سان) ساڳئي هنڌ کان ساڳيا مورفولوجيڪل ۽ فينوٽائپڪ خاصيتون ساڳيا نه آهن، پر اهي مختلف آهن بيڪٽريريل ۽ بيڪٽريريل 5. ڊيٽابيس تسلسل Oceanospirillaceae (شڪل 2) ۾ ٻين نسلن سان گڏ گڏ ٿيل آهن. ASxL5T جو سڄو جينوم ترتيب طئي ڪيو ويو آهي ۽ NCBI ڊيٽابيس ۾ محفوظ ڪيو ويو آهي، ۽ رسائي نمبر CP046056 آهي. ASxL5T جو جينوم 2,831,152 bp جي گول ڪروموزوم تي مشتمل آهي G + C تناسب 56.1٪ سان. جينوم جي ترتيب ۾ 2653 CDS (مجموعي طور تي) شامل آهن، جن مان 2567 پروٽينن کي انڪوڊ ڪرڻ جي اڳڪٿي ڪئي وئي آهي، جن مان 1596 کي مقرر ڪري سگهجي ٿو (60.2٪). جينوم ۾ 67 RNA-ڪوڊنگ جينز شامل آهن، جن ۾ 9 rRNAs (3 هر هڪ 5S، 16S، ۽ 23S لاءِ) ۽ 57 tRNAs شامل آهن. ASxL5T جي جينوميڪ خاصيتون 16S rRNA جين جي ترتيب (ٽيبل 2) مان سڃاڻي ويجھي رشتي واري قسم جي اسٽرين جي موجود جينومس سان مقابلو ڪيو ويو. استعمال ڪريو امينو اسيد جي سڃاڻپ (AAI) سڀني موجود Thalassolituus جينومس کي ASxL5T سان موازنہ ڪرڻ لاءِ. AAI پاران مقرر ڪيل سڀ کان ويجھو موجود (نامڪمل) جينوم تسلسل آهي Thalassolituus sp. C2-1 (شامل ڪريو NZ_VNIL01000001). هي ٻوٽو ماريانا خندق جي اونهي سمنڊ جي ٿڌن کان ڌار ڪيو ويو هو، پر هن وقت مقابلي لاءِ هن دڙي بابت فينوٽائپڪ معلومات موجود ناهي. ASxL5T جي 2.82 Mb جي مقابلي ۾، آرگنزم جو جينوم 4.36 Mb تي وڏو آهي. سامونڊي اسپيروچيٽس جي سراسري جينوم سائيز اٽڪل 4.16 Mb (± 1.1؛ n = 92 مڪمل ريفرنس جينووم https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly مان تحقيق ڪئي وئي آهي)، تنهن ڪري ASxL5T جو جينوم ان جي مطابق آهي. آرڊر ٻين ميمبرن جي مقابلي ۾، اهو تمام ننڍڙو آهي. GToTree 1.5.54 استعمال ڪريو جينوم جي بنياد تي اندازي مطابق وڌ ۾ وڌ امڪاني فلوجنيٽڪ وڻ (شڪل 3A)، 172 سنگل ڪاپي جين جي ترتيب ڏنل ۽ جڙيل امينو اسيد ترتيبن کي استعمال ڪندي مخصوص Gammaproteobacteria 11,12,13,165,15 17،18. تجزيي ڏيکاري ٿي ته ان جو ويجھو تعلق ٿالاسوليٽس، بيڪٽيريل پلين ۽ مرين بيڪٽيريا سان آهي. بهرحال، اهي ڊيٽا ظاهر ڪن ٿا ته ASxL5T مختلف آهي ان جي مائٽن کان مئرين اسپيرولينا ۾ ۽ ان جي جينوم جي ترتيب واري ڊيٽا موجود آهي.
16S rRNA جين جي ترتيب کي استعمال ڪندي phylogenetic وڻ ASxL5T، ASxO5، ۽ ASxS5 strains جي پوزيشن کي نمايان ڪري ٿو (گٽ سان) مارين اسپيروليناسيا ۾ غير پوکيل ۽ سامونڊي بيڪٽيريا اسٽرين جي نسبت. Genbank Accession نمبر قوس ۾ strain نالي پٺيان اچي ٿو. ClustalW استعمال ڪريو ترتيبن کي ترتيب ڏيڻ لاءِ، ۽ استعمال ڪريو وڌ ۾ وڌ ممڪن طريقو ۽ Tamura-Nei ماڊل phylogenetic لاڳاپن جو اندازو لڳائڻ لاءِ، ۽ MEGA X پروگرام ۾ 1000 ھدايت ڪيل نقلون انجام ڏيو. شاخ تي نمبر ظاهر ڪري ٿو ته ھدايت ڪيل ڪاپي جي قيمت 50٪ کان وڌيڪ آھي. Escherichia coli U/541T هڪ گروپ جي طور تي استعمال ڪيو ويو.
(الف) جينوم تي ٻڌل هڪ phylogenetic وڻ، جيڪو سامونڊي اسپيروسپراسيائي بيڪٽيريا ASxL5T ۽ ان جي ويجهن مائٽن جي وچ ۾ تعلق ڏيکاري ٿو، E. coli U 5/41T هڪ آئوٽ گروپ طور. (B) T. oleivorans MIL-1T جي مقابلي ۾، جين جي فنڪشنل درجي جي ورڇ ASx5LT پروٽين جي orthologous گروپ (COG) ڪلستر جي بنياد تي پيش ڪئي وئي آهي. کاٻي پاسي واري انگ اکر ڏيکاري ٿو جين جو تعداد هر فنڪشنل COG درجي ۾ هر جينوم ۾. ساڄي پاسي گراف ڏيکاري ٿو جينوم جو سيڪڙو هر فنڪشنل COG گروپ ۾ موجود آهي. (سي) T. oleiverans MIL-1T جي مقابلي ۾، ASxL5T جي مڪمل KEGG (ڪيوٽو انسائيڪلوپيڊيا آف جينس ۽ جينومس) ماڊلر رستي جو تجزيو.
ASxL5T جينوم ۾ موجود جزو جين کي جانچڻ لاءِ KEGG ڊيٽابيس کي استعمال ڪندي ايروبڪ گاما پروٽيوس جو عام ميٽابولڪ رستو پڌرو ڪيو. ASxL5T ۾ مجموعي طور تي 75 جينز شامل آهن جيڪي بيڪٽيريا موٽر پروٽينن کي تفويض ڪيا ويا آهن، جن ۾ شامل ڪيل جين شامل آهن ڪيموٽيڪس، فليگيلا اسيمبلي، ۽ ٽائپ IV فيمبريا سسٽم. آخري درجي ۾، 10 مان 9 جينس ٻين جاندارن جي هڪ حد تائين ڇڪڻ واري حرڪت لاء ذميوار آهن. ASxL5T جي جينوم ۾ هڪ مڪمل tetrahydropyrimidine biosynthetic pathway آهي جيڪو osmotic stress20 جي حفاظتي جواب ۾ حصو وٺندو آهي، جيئن ته هالوفائلز جي توقع ڪئي ويندي آهي. جينوم ۾ ڪوفيڪٽرز ۽ وٽامنز لاءِ ڪيترائي مڪمل رستا پڻ شامل آھن، جن ۾ رائبوفلاوين سنٿيسس رستا شامل آھن. جيتوڻيڪ alkane 1-monooxygenase (alkB2) جين ASxL5T ۾ موجود آهي، هائيڊرو ڪاربن جي استعمال جو رستو مڪمل نه آهي. ASxL5T جي جينوم جي ترتيب ۾، جين جا هومولوگس جن کي خاص طور تي T. oleiverans MIL-1T21 ۾ هائيڊرو ڪاربن جي تباهيءَ لاءِ ذميوار قرار ڏنو ويو آهي، جيئن ته TOL_2658 (alkB) ۽ TOL_2772 (الڪوحل ڊيهائيڊروجنيز) واضح طور تي آهن. شڪل 3B ASxL5T ۽ زيتون جو تيل MIL-1T جي وچ ۾ COG درجي ۾ جين ورڇ جو مقابلو ڏيکاري ٿو. مجموعي طور تي، ننڍو ASxL5T جينوم وڏي سان لاڳاپيل جينوم جي مقابلي ۾ هر COG درجي مان تناسب گهٽ جين تي مشتمل آهي. جڏهن هر فنڪشنل درجي ۾ جين جو تعداد جينوم جي فيصد جي طور تي ظاهر ڪيو ويو آهي، فرق ترجمي ۾ جين جي فيصد، رائبوسومل ساخت ۽ بايوجنسي زمرے، ۽ توانائي جي پيداوار ۽ تبادلي جي ڪم جي زمرے ۾ نوٽ ڪيو ويو آهي، جيڪي وڏي ASxL5T ٺاهيندا آهن. جينوم جو تناسب ساڳئي گروپ سان مقابلو ڪيو ويو آهي جيڪو T. oleiverans MIL-1T جينوم ۾ موجود آهي. ان جي ابتڙ، ASxL5T جينوم جي مقابلي ۾، T. oleivorans MIL-1T ۾ جين جو هڪ اعلي سيڪڙو آهي نقل، ٻيهر ٺهڻ ۽ مرمت، ۽ ٽرانسپشن جي زمرے ۾. دلچسپ ڳالهه اها آهي ته ٻن جينومس جي هر فنڪشنل درجي جي مواد ۾ سڀ کان وڏو فرق ASxL5T (شڪل 3B) ۾ موجود نامعلوم جينز جو تعداد آهي. KEGG ماڊلز جي هڪ افزودگي جو تجزيو ڪيو ويو، جتي هر KEGG ماڊل جينوم تسلسل ڊيٽا جي تشريح ۽ حياتياتي تشريح لاءِ دستي طور تي بيان ڪيل فنڪشنل يونٽن جي هڪ سيٽ جي نمائندگي ڪري ٿو. ASxL5T ۽ زيتون MIL-1T جي مڪمل KOG ماڊل رستي ۾ جين ورڇ جو مقابلو تصوير 3C ۾ ڏيکاريو ويو آهي. اهو تجزيو ڏيکاري ٿو ته جيتوڻيڪ ASxL5T وٽ مڪمل سلفر ۽ نائٽروجن ميٽابولڪ رستو آهي، T. oleiverans MIL-1T نٿو ڪري. ان جي ابتڙ، T. oleiverans MIL-1T ۾ هڪ مڪمل سيسٽين ۽ ميٿيونائن ميٽابولڪ رستو آهي، پر اهو ASxL5T ۾ نامڪمل آهي. تنهن ڪري، ASxL5T وٽ سلفيٽ جي جذبي لاءِ هڪ خاص ماڊل آهي (جين جي هڪ سيٽ جي طور تي بيان ڪيل آهي جنهن کي فينوٽائپڪ مارڪرز طور استعمال ڪري سگهجي ٿو، جهڙوڪ ميٽابولڪ ظرفيت يا pathogenicity؛ https://www.genome.jp/kegg/module.html) T ۾ oleiverans MIL-1T. جين جي فهرست سان ASxL5T جي جين مواد جو مقابلو ڪرڻ جيڪي تجويز ڪن ٿا ته هڪ شڪاري طرز زندگي غير معقول آهي. جيتوڻيڪ waaL جين O antigen polysaccharide سان جڙيل ligase کي انڪوڊ ڪري ٿو، ASxL5T جينوم ۾ موجود آهي (پر اهو ڪيترن ئي گرام-منفي بيڪٽيريا ۾ عام آهي)، tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO) جين ۾ 60 امينو شامل ٿي سگهن ٿا. تيزابي علائقا عام طور تي شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا ۾ مليا آهن جيڪي موجود نه آهن. ASxL5T جينوم ۾ ٻيو ڪوبه شڪاري خاصيت وارو جين نه آهي، جنهن ۾ اهي انڪوڊنگ اينزايمز شامل آهن جيڪي mevalonate pathway ۾ isoprenoid biosynthesis ۾ شامل آهن. ياد رهي ته پريڊٽر گروپ ۾ ڪوبه ٽرانسڪرپشن ريگيوليٽري جين gntR نه آهي، پر ٽي gntR-جهڙا جين ASxL5T ۾ سڃاڻي سگهجن ٿا.
ASxL5T جي فينوٽائپڪ خاصيتن کي جدول 3 ۾ اختصار ڪيو ويو آهي ۽ ادب ۾ رپورٽ ڪيل لاڳاپيل نسل 23، 24، 25، 26، ۽ 27 جي فينوٽائپڪ خاصيتن سان مقابلو ڪيو ويو آهي. T. marinus، T. olevorans، B. sanyensis، ۽ Oceanobacter kriegii کان الڳ ٿيل، فعال، لوڻ برداشت ڪندڙ، oxidase-positive rod-shaped جسم آهن، پر ASxL5T سان لڳ ڀڳ ٻيون فينو ٽائپڪ خاصيتون نه آهن. سمنڊ جو سراسري pH 8.1 آهي (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77)، جيڪو T. marinus، T. olevorans، B. sanyensis ۽ O ۾ ظاهر ٿئي ٿو. ڪريگي ASxL5T وڏي پي ايڇ رينج لاءِ موزون آهي (4-9) عام غير سامونڊي نسلن جي. Thalassolituus sp جي فينوٽائپڪ خاصيتون. C2-1. اڻڄاتل. ASxL5T جي واڌ جي درجه حرارت جي حد عام طور تي سامونڊي اسٽرين (4-42 °C) کان وڌيڪ وسيع آهي، جيتوڻيڪ ڪجھ نه پر سڀ T. مارينس آئسوليٽ گرمي برداشت ڪندڙ آهن. برٿ ميڊيا ۾ ASxL5T وڌڻ جي ناڪامي وڌيڪ فينوٽائپڪ خاصيت کي روڪيو. API 20E استعمال ڪريو BA پليٽ مان ڇڪيل مواد کي جانچڻ لاءِ، ONPG، arginine dihydrolase، lysine decarboxylase، ornithine decarboxylase، citrate utilization، urease، tryptophan deaminase، gelatin hydrolysis Enzyme، ٽيسٽ جا نتيجا سڀ ناڪاري هئا، پر H2000 ۾ ڪو به نه. پيدا ڪيا ويا. اڻڄاتل ڪاربوهائيڊريٽ شامل آهن: گلوڪوز، مننوز، انوسيٽول، سوربٽول، رمنوز، سوڪروز، ميليبيوز، ايمگدالين ۽ arabinose. شايع ٿيل لاڳاپيل ريفرنس اسٽرين جي مقابلي ۾، ASxL5T اسٽرين جو سيلولر فيٽي ايسڊ پروفائل جدول 4 ۾ ڏيکاريو ويو آھي. مکيه سيلولر فيٽي ايسڊس آھن C16:1ω6c ۽/يا C16:1ω7c، C16:0 ۽ C18:1ω9. Hydroxy fatty acids C12:0 3-OH ۽ C10:0 3-OH پڻ موجود آهن. ASxL5T ۾ C16:0 جو تناسب لاڳاپيل نسل جي ڄاڻايل قيمت کان وڌيڪ آهي. ان جي ابتڙ، ڄاڻايل T. marinus IMCC1826TT جي مقابلي ۾، ASxL5T ۾ C18:1ω7c ۽/يا C18:1ω6c جو تناسب گھٽجي ويو آھي. oleivorans MIL-1T ۽ O. kriegii DSM 6294T، پر B. sanyensis KCTC 32220T ۾ نه مليا. ASxL5T ۽ ASxLS جي فيٽي ايسڊ پروفائلز جي مقابلي ڪرڻ سان ٻن اسٽرين جي وچ ۾ انفرادي فيٽي ايسڊز جي مقدار ۾ ذيلي فرق ظاهر ڪيو ويو، جيڪي ساڳئي نسل جي جينومڪ ڊي اين اي ترتيب سان مطابقت رکن ٿا. سوڊان بليڪ ٽيسٽ استعمال ڪندي ڪو به پولي-3-هائيڊروڪسائيبيوٽريٽ (PHB) ذرات نه مليا.
ASxL5T بيڪٽيريا جي اڳڪٿي واري سرگرمي جو اڀياس ڪيو ويو ته جيئن شڪار جي حد کي طئي ڪيو وڃي. هي بيڪٽيريا ڪيمپيلو بيڪٽر جي جنس تي تختيون ٺاهي سگھي ٿو، جن ۾ شامل آهن: ڪيمپلو بڪٽر سوس 11608T، ڪيمپلو بڪٽر جيجوني PT14، ڪيمپلو بڪٽر جيجوني 12662، ڪيمپلو بڪٽر جيجوني NCTC 11168T؛ Escherichia coli NCTC 12667؛ C. helveticus NCTC 12472; سي لاري NCTC 11458 ۽ C. upsaliensis NCTC 11541T. گرام-منفي ۽ گرام-مثبت بيڪٽيريا جي وسيع رينج کي جانچڻ لاءِ طريقي جي ميزبان رينج جي تعين واري حصي ۾ درج ڪيل ثقافتن کي استعمال ڪريو. نتيجن مان ظاهر ٿئي ٿو ته ASxL5T Escherichia coli NCTC 86 ۽ Citrobacter freundii NCTC 9750T ۾ پڻ استعمال ڪري سگھجي ٿو. Klebsiella oxytoca 11466 تي ٺهيل تختيون. E. coli NCTC 86 سان TEM جو تعامل شڪل 4A-D ۾ ڏيکاريو ويو آهي، ۽ Campylobacter jejuni PT14 ۽ Campylobacter suis S12 سان رابطي کي شڪل 4E-H وچ ۾ ڏيکاريو ويو آهي. حملي جو ميڪانزم، آزمايل شڪار جي قسمن جي وچ ۾ مختلف ڏسڻ ۾ اچي ٿو، جنهن ۾ هڪ يا وڌيڪ E. coli سيلز هر ASxL5T سيل سان جڙيل آهن ۽ جذب ٿيڻ کان اڳ وڌايل سيل سان گڏ پوئتي رکيل آهن. ان جي ابتڙ، ASxL5T رابطي جي هڪ نقطي ذريعي ڪيمپيلو بڪٽر سان ڳنڍڻ لڳي ٿو، عام طور تي شڪار ڪندڙ سيل جي چوٽي سان رابطي ۾ ۽ ڪئمپيلو بڪٽر سيل جي چوٽي جي ويجهو (شڪل 4H).
TEM ASx5LT ۽ شڪار جي وچ ۾ رابطي کي ڏيکاريندي: (AD) ۽ E. coli prey؛ (EH) ۽ C. جيجوني پرائي. (الف) هڪ عام ASx5LT سيل هڪ واحد E. coli (EC) سيل سان ڳنڍيل آهي؛ (ب) هڪ تنتي ASx5LT هڪ واحد EC سيل سان ڳنڍيل آهي؛ (سي) ڪيترن ئي EC سيلز سان ڳنڍيل هڪ filamentous ASx5LT سيل؛ (D) منسلڪ ننڍا ASx5LT سيلز هڪ واحد E. coli (EC) سيل تي؛ (اي) هڪ واحد ASx5LT سيل جيڪو ڪيمپيلو بڪٽر جيجوني (CJ) سيل سان ڳنڍيل آهي؛ (F) ASx5LT حملو C. hyointestinalis (CH) سيلز؛ (G) ٻه هڪ ASx5LT سيل هڪ CJ سيل تي حملو ڪيو؛ (H) ASx5LT منسلڪ نقطي جو هڪ ويجهو ڏسڻ، CJ سيل جي چوٽي جي ويجهو (بار 0.2 μm). بار نمائندگي ڪري ٿو 1 μm ۾ (A-G).
شڪاري بيڪٽيريا ترقي ڪئي آهي ته جيئن شڪار جي گهڻائي ذريعن مان فائدو وٺن. ظاهر آهي، اهي وڏي پيماني تي ڪيترن ئي مختلف ماحول ۾ موجود آهن. آبادي جي ميمبرن جي تنگ سائيز جي ڪري، اهو ممڪن آهي ته ASxL5T بيڪٽيريا کي slurry کان الڳ ڪرڻ لاء phage separation method استعمال ڪندي. سامونڊي بيڪٽيريا جي oceanospirillaceae خاندان جي ميمبرن سان ASxL5T جي جينومڪ لاڳاپو حيرت انگيز آهي، جيتوڻيڪ جاندار لوڻ برداشت ڪندڙ آهي ۽ 5٪ لوڻ تي مشتمل وچولي تي وڌي سگهي ٿو. slurry جي پاڻي جي معيار جو تجزيو ڏيکاري ٿو ته سوڊيم کلورائڊ مواد 0.1٪ کان گهٽ هئي. تنهن ڪري، مٽي سامونڊي ماحول کان تمام گهڻو پري آهي - ٻنهي جاگرافيائي ۽ ڪيميائي طور تي. هڪ ئي ماخذ کان ٽن لاڳاپيل پر مختلف الڳ الڳن جي موجودگي ان ڳالهه جو ثبوت ڏئي ٿي ته اهي شڪاري هن غير سامونڊي ماحول ۾ ترقي ڪري رهيا آهن. ان کان علاوه، microbiome تجزيي (ڊيٽا فائلون موجود آهن https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990) ڏيکاريو ويو آهي ته ساڳيو 16S rRNA جين تسلسل مٿين 50 تمام گهڻيون آپريشنل ٽيڪسا (OTU) ۾ واقع آهي. ) مٽيءَ جي چند نمونن جي وقفن ۾. Genbank ڊيٽابيس ۾ ڪيترائي غير ڪلچر ٿيل بيڪرياريا مليا ويا، جن ۾ 16S rRNA جين جو سلسلو ASxL5T بيڪٽيريا سان ملندڙ جلندڙ آهي. اهي سلسلو، ASxL5T، ASxS5، ۽ ASxO5 جي ترتيبن سان گڏ، ٿالاسوليٽس ۽ اوشنوبيڪٽر (شڪل 2) کان الڳ ٿيل مختلف ڪلڊس جي نمائندگي ڪن ٿا. 2009 ۾ ڏکڻ آفريقا جي سون جي مائن ۾ ٽن قسمن جا غير ڪلچر ٿيل بيڪٽيريا (GQ921362, GQ921357 ۽ GQ921396) 1.3 ڪلوميٽرن جي اونهائي تي فشر جي پاڻي کان ڌار ڪيا ويا، ۽ ٻيا ٻه (DQ256320 ۽ DQ256320 ڏکڻ آفريڪا ۾ زمين کان 1.3 ڪلوميٽر) هئا. ۾ 2005). 16S rRNA جين جو سلسلو تمام ويجھو ASxL5T سان لاڳاپيل آهي 16S rRNA جين تسلسل جو حصو آهي جيڪو 2006 ۾ اتر فرانس جي ساحلن مان حاصل ڪيل سٽي سليمن جي افزودگي ڪلچر مان حاصل ڪيو ويو آهي (الحاق نمبر AM29240828). هڪ ٻيو ويجهڙائي سان لاڳاپيل 16S rRNA جين تسلسل غير ثقافتي بيڪٽيريا HQ183822.1 مان حاصل ڪيو ويو هڪ ڪليڪشن ٽينڪ مان حاصل ڪيو ويو چين ۾ ميونسپل لينڊ فل مان. ظاهر آهي، ASxL5T بيڪٽيريا ٽيڪونومڪ ڊيٽابيس ۾ تمام وڏا نمائندا نه آهن، پر غير ثقافتي بيڪٽيريا مان اهي ترتيبون ASxL5T سان ملندڙ جاندارن جي نمائندگي ڪن ٿيون، جيڪي سڄي دنيا ۾ ورهايل آهن، عام طور تي مشڪل ماحول ۾. سڄي جينوم فيلوجينيٽڪ تجزيي مان، ASxL5T جي ويجھي تعلق رکندڙ ٿالاسوليٽس ايس پي آهي. C2-1، T. مارينس، T. اوليورنس. ۽ O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. Thalassolituus سامونڊي واجبي هائيڊرو ڪاربن فريگمينٽيشن بيڪٽيريا (OHCB) جو ميمبر آهي، جيڪو سامونڊي ۽ زميني ماحول ۾ پکڙجي ٿو ۽ عام طور تي هائيڊرو ڪاربن آلودگي جي واقعن کان پوءِ غالب ٿئي ٿو. سامونڊي بيڪٽيريا OHCB گروپ جا ميمبر نه آهن، پر سامونڊي ماحول کان الڳ ٿيل آهن.
فينوٽائپڪ ڊيٽا ظاهر ڪن ٿا ته ASxL5T هڪ نئون نسل آهي ۽ هڪ ميمبر آهي جيڪو اڳ ۾ اڻ ڄاتل جينس جو ميمبر آهي جيڪو مرين اسپيروسپيراسي خاندان ۾ آهي. في الحال ڪوبه واضح معيار نه آهي ته نئين جدا جدا طبقن کي نئين جينس ۾ ورهايو وڃي. عالمگير نسل جي حدن کي طئي ڪرڻ جي ڪوشش ڪئي وئي آهي، مثال طور، هڪ قدامت پسند پروٽين (POCP) جي جينوم جي فيصد جي بنياد تي، اها سفارش ڪئي وئي آهي ته ڪٽ-آف قيمت 50٪ ريفرنس strain33 سان هڪجهڙائي آهي. ٻيا AAI قدر استعمال ڪرڻ جي صلاح ڏين ٿا، جيڪي POCP تي فائدا آھن ڇو ته اھي حاصل ڪري سگھجن ٿيون نامڪمل جينومس 34 مان. ليکڪ کي يقين آهي ته جيڪڏهن AAI قدر 74 سيڪڙو کان گهٽ آهي ماڊل جي نسلن جي ماڊل جي ڀيٽ ۾، دٻاء هڪ مختلف نسل جو نمائندو آهي. سامونڊي اسپيريلاسي ۾ ماڊل جينس مرين اسپريلم آهي، ۽ ماڊل اسٽريٽ O. linum ATCC 11336T آهي. ASxL5T ۽ O. linum ATCC 11336T جي وچ ۾ AAI قدر 54.34٪ آهي، ۽ ASxL5T ۽ T. oleivorans MIL-1T جي وچ ۾ AAI قدر 67.61٪ آهي (جينس ٽائيپ اسٽرينز)، اهو ظاهر ڪري ٿو ته ASxL5T هڪ نئين جينس ٿالاسسوس کان مختلف آهي. 16S rRNA جين جي ترتيب کي درجه بندي معيار جي طور تي استعمال ڪندي، تجويز ڪيل جينس جي حد بندي جي حد 94.5٪ 35 آهي. ASxL5T ٿي سگهي ٿو ٿالاسوليٽس جينس ۾ رکيل هجي، ڏيکاريندي 95.03٪ 16S rRNA ترتيب جي سڃاڻپ T. oleivorans MIL-1T ۽ 96.17٪ سان. مارينس IMCC1826T. بهرحال، ان کي به Bacteroides genus ۾ رکيو ويندو جنهن ۾ B. sanyensis NV9 سان 94.64% 16S rRNA جين جي سڃاڻپ آهي، اهو ظاهر ڪري ٿو ته هڪ واحد جين جهڙوڪ 16S rRNA جين جو استعمال خودمختاري درجي بندي ۽ تفويض جي ڪري سگھي ٿو. ٻيو تجويز ڪيل طريقو ANI ۽ Genome Alignment Score (AF) استعمال ڪري ٿو ڊيٽا پوائنٽن جي ڪلسٽرنگ کي جانچڻ لاءِ سڀني قسمن ۽ موجوده نسلن جي غير قسم جي اسٽين. ليکڪ تجويز ڪري ٿو ته جينس جي حد کي گڏ ڪرڻ جي اندازي مطابق جينس جي انفليڪشن پوائنٽ سان مخصوص ٽيڪسا لاءِ تجزيو ڪيو وڃي. تنهن هوندي، جيڪڏهن ڪافي مڪمل جينوم تسلسل نه آهن Thalassolituus isolates مان، اهو طئي ڪرڻ ناممڪن آهي ته ڇا ASxL5T هن طريقي سان Thalassolituus genus سان تعلق رکي ٿو. تجزيي لاءِ مڪمل جينوم ترتيبن جي محدود دستيابي جي ڪري، پوري جينوم فيلوجينيٽڪ وڻ کي احتياط سان تعبير ڪيو وڃي. ٻيو، سڄي جينوم جي مقابلي جا طريقا مقابلي جي جينوم جي سائيز ۾ اهم فرق جي حساب سان نٿا ڪري سگهن. انهن لاڳاپيل نسلن جي وچ ۾ محفوظ ٿيل ڪور سنگل ڪاپي جين جي هڪجهڙائي کي ماپيو، پر انهن جين جي وڏي تعداد کي نه ورتو جيڪي ASxL5T جي تمام ننڍڙن جينوم ۾ موجود نه آهن. ظاھر آھي، ASxL5T ۽ گروپن جن ۾ Thalassolituus، Oceanobacter ۽ Bacterioplanes شامل آھن ھڪڙو عام ابا ڏاڏا آھن، پر ارتقاء ھڪ مختلف رستو اختيار ڪيو آھي، جنھن جي نتيجي ۾ جينوم ۾ گھٽتائي ٿي سگھي ٿي، جيڪا شايد شڪاري طرز زندگي کي اپنائڻ لاءِ ٿي سگھي ٿي. هي T. oleivorans MIL-1T جي ابتڙ آهي، جيڪو 28 سيڪڙو وڏو آهي ۽ هائيڊرو ڪاربن 23,30 کي استعمال ڪرڻ لاءِ مختلف ماحولياتي دٻاءُ هيٺ ترقي ڪري چڪو آهي. هڪ دلچسپ مقابلو ڪري سگهجي ٿو واجبي intracellular parasites ۽ symbionts، جهڙوڪ Rickettsia، Chlamydia، ۽ Buchnera. انهن جي جينوم سائيز اٽڪل 1 Mb آهي. ميزبان سيل ميٽابولائٽس کي استعمال ڪرڻ جي صلاحيت جين جي نقصان جي ڪري ٿي، تنهنڪري اهم ارتقائي جينوميڪ تباهي کي ختم ڪيو ويو. ارتقائي تبديليون سامونڊي ڪيميائي غذائي جاندارن کان وٺي شڪاري طرز زندگي ۾ ٿي سگهي ٿي نتيجي ۾ جينوم جي سائيز ۾ ساڳئي گهٽتائي. COG ۽ KEGG تجزيو خاص ڪمن لاءِ استعمال ٿيل جين جو تعداد ۽ ASxL5T ۽ T. oleivorans MIL-1T جي وچ ۾ جينومڪ رستن ۾ عالمي فرق کي نمايان ڪري ٿو، جيڪي موبائل جينياتي عناصر جي وسيع دستيابي جي سبب نه آهن. ASxL5T جي سڄي جينوم جي G + C تناسب ۾ فرق 56.1٪ آهي، ۽ T. oleivorans MIL-1T جو فرق 46.6٪ آهي، جيڪو پڻ ظاهر ڪري ٿو ته اهو الڳ ٿيل آهي.
ASxL5T جينوم جي ڪوڊنگ مواد جو امتحان فينوٽائپڪ خاصيتن ۾ فنڪشنل بصيرت مهيا ڪري ٿو. جينز انڪوڊنگ ٽائپ IV fimbriae (Tfp) جي موجودگي خاص دلچسپي جي ڪري آهي ڇاڪاڻ ته اهي سيل جي حرڪت کي فروغ ڏين ٿا، جنهن کي سوشل گلائڊنگ يا ڪنولشنز چئجي ٿو، بغير سطح تي flagella جي. رپورٽن مطابق، Tfp جا ٻيا ڪم آهن، جن ۾ اڳڪٿي، پيٿوجنيسس، بايوفلم ٺهڻ، قدرتي ڊي اين اي اپٽيڪ، خودڪار سيل ايگريگيشن ۽ ڊولپمينٽ 38 شامل آهن. ASxL5T جينوم تي مشتمل آهي 18 جينز انڪوڊنگ ڊيگوانائيليٽ سائڪليس (هڪ اينزيم جيڪو 2 guanosine triphosphate کي guanosine 2 phosphate ۽ cyclic diGMP ۾ تبديل ڪري ٿو) ۽ 6 جينز لاڳاپيل diguanylate cyclase کي انڪوڊنگ ڪري ٿو. ايسٽريس لاءِ جين (سائڪلڪ ڊي-جي ايم پي جي تباهي کي گانوسين مونوفاسفٽ ڏانهن وڌائڻ) دلچسپ آهي ڇاڪاڻ ته سائڪ ڊي-جي ايم پي هڪ اهم سيڪنڊ ميسينجر آهي جيڪو بائيوفلم ڊولپمينٽ ۽ علحدگي، حرڪت، سيل منسلڪ ۽ وائرس 39، 40 ۾ عمل ۾ شامل آهي. اهو پڻ ياد رکڻ گهرجي ته Bdellovibrio بيڪٽيريووورس ۾، سائيڪل ڊبل جي ايم پي کي آزاد زندگي ۽ شڪاري طرز زندگي جي وچ ۾ منتقلي کي ڪنٽرول ڪرڻ لاء ڏيکاريو ويو آهي41.
شڪاري بيڪٽيريا تي اڪثر تحقيق Bdellovibrio، Bdellovibrio-like organisms، ۽ Myxococcus species تي مرکوز ڪئي وئي آهي. اهي ۽ ٻيا ڄاتل سڃاتل مثالن جو شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا هڪ متنوع گروپ ٺاهيندا آهن. هن تنوع جي باوجود، خاصيتن جي پروٽين خاندانن جو هڪ سيٽ جيڪو 11 ڄاتل سڃاتل بيڪٽيريا جي فينوٽائپ کي ظاهر ڪري ٿو 3,22 جي سڃاڻپ ڪئي وئي آهي. بهرحال، O antigen ligase (waaL) جي انڪوڊنگ صرف جينز جي سڃاڻپ ڪئي وئي آهي، جيڪا خاص طور تي گرام-منفي بيڪٽيريا ۾ عام آهي. تجزيي جو هي روپ ASxL5T کي شڪاري جي طور تي نامزد ڪرڻ ۾ مددگار نه آهي، شايد ان ڪري ته اهو هڪ نئين حملي واري حڪمت عملي استعمال ڪري ٿو. وڌيڪ متنوع شڪاري بيڪٽيريا جينوم جي دستيابي بهتر حل تجزيي کي ترقي ڪرڻ ۾ مدد ڪندي جيڪا گروپ جي ميمبرن جي وچ ۾ فعلي ۽ ماحولياتي اختلافن جي ثبوتن ۾ وٺندي. هن تجزيي ۾ شامل نه ڪيل شڪاري بيڪٽيريا جا مثال Cupriavidus necator42 ۽ Bradymonabacteria43 جا ميمبر شامل آهن، ڇاڪاڻ ته جيئن محقق مختلف مائڪروبيل برادرين جي تحقيق ڪري رهيا آهن، وڌيڪ شڪاري ٽيڪسا قائم ڪيا ويا آهن.
TEM تصوير پاران قبضو ڪيل ASxL5T بيڪٽيريا جي سڀ کان وڌيڪ قابل ذڪر خصوصيت ان جي منفرد ۽ لچڪدار مورفولوجي آهي، جيڪا اڳڪٿي بيڪٽيريا سان رابطي کي فروغ ڏئي سگهي ٿي. رابطي جو قسم مشاهدو ٻين شڪاري بيڪٽيريا کان مختلف آهي ۽ اڳ ۾ دريافت يا رپورٽ نه ڪيو ويو آهي. تجويز ڪيل ASxL5T شڪاري زندگيءَ جي چڪر کي شڪل 5 ۾ ڏيکاريو ويو آهي. ادب ۾ ڪجھ مثال موجود آهن جن سان ملندڙ apical ڍانچيون آهن جيئن اسان هتي رپورٽ ڪريون ٿا، پر انهن مثالن ۾ شامل آهن Terasakiispira papahanaumokuakeensis، هڪ سمندري اسپيريلم بيڪٽيريا جنهن ۾ ڪڏهن ڪڏهن اپڪس اينالارجمينٽ 44، ۽ Alphaproteellausakiria ، اڳي جينس سان تعلق رکندڙ Oceanospirillum, exhibiting The so-cond "polar film" 45. Cocci فارم اڪثر ڪري پراڻن ثقافتن ۾ ڏسڻ ۾ اچن ٿا، خاص طور تي بيڪٽيريا جن ۾ وکر ٿيل شڪلون آهن، جهڙوڪ Vibrio، Campylobacter، ۽ Helicobacter 46, 47, 48، جيڪي شايد خراب حالت جي نمائندگي ڪن ٿيون. ASxL5T بيڪٽيريا جي صحيح زندگي جي چڪر کي واضح ڪرڻ لاء وڌيڪ ڪم جي ضرورت آهي. اهو طئي ڪرڻ لاءِ ته اهو ڪيئن قبضو ڪري ٿو ۽ شڪار ڪري ٿو، ۽ ڇا ان جو جينوم حياتياتي طور تي فعال مرکبات کي انڪوڊ ڪري ٿو جيڪي طبي يا بايو ٽيڪنالاجي مقصدن لاءِ استعمال ٿي سگهن ٿا.
Venatorbacter جين جي وضاحت. نومبر Venatorbacter (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. L. n. venator، 'hunter' ۽ Gr. n. bacter، 'a rod' جي وينٽرز تي مشتمل آھي. Venatorbacter، 'a Hunting Rod' سيلز ايروبڪ، لوڻ برداشت ڪندڙ، گھميل گرام داغ منفي، ورزش راڊ ۽ آڪسائيڊس سرگرميون مثبت آهن. PHB 4 کان 42 ° C جي درجه حرارت جي حد ۾ غير معمولي آهي، اڪثر ڪري تيزابي پي ايڇ C16:1ω6c ۽/يا C16 آهن :1ω7c، C16:0 ۽ C18:1ω9 ؛ C12:0 3-OH ۽ C10:0 3-OH hydroxy fatty acids جي طور تي مليا آھن اھي برٿ ميڊيا ۾ نه وڌندا آھن DNA G + C مواد 56.1 mol آھي ھن جينس جي ميمبرن ۽ Enterobacteriaceae جي اڳڪٿي واري رويي کي. خاندان ۾ هن نسل جي phylogenetic پوزيشن آهي.
Venatorbacter cucullus sp جي وضاحت. نومبر Venatorbacter cucullus (cu'cull.us.؛ L. n. cucullus جو مطلب آهي fairing).
ان کان علاوه، هن جينس جي وضاحتي خصوصيت اها آهي ته جڏهن BA يا BHI تي پوکيا ويندا آهن، سيلز 1.63 µm ڊگھا ۽ 0.37 µm ويڪرا هوندا آهن. BHI آگر تي ڪالونيون تمام ننڍيون آهن، 72 ڪلاڪن کان پوءِ قطر ۾ 2 ملي ميٽر تائين پهچن ٿيون. اهي بيج، شفاف، گول، محدب ۽ چمڪندڙ آهن. هن نسل جا ميمبر Escherichia coli ۽ Klebsiella استعمال ڪري سگهن ٿا. ڪيمپلو بڪٽر ۽ ٻيا ڪيترائي گرام-منفي بيڪٽيريا شڪار طور ڪم ڪن ٿا.
عام قسم جي ASxL5T کي ناٽنگھم شائر، UK ۾ گوشت جي کير مان ڌار ڪيو ويو ۽ نيشنل ٽائپ ڪلچر ڪليڪشن (UK) ۾ جمع ڪيو ويو: Accession نمبر NCTC 14397 ۽ هالينڊ جي بيڪٽيريل ڪلچر ڪليڪشن (NCCB) Accession NCCB 1007 Theequence 1007. ٿي چڪو آهي CP046056 جي اضافي جي مطابق Genbank ۾ جمع ٿيل.
ASxL5T بيڪٽيريا کي بيف کير مان ڌار ڪيو ويو فيج آئسوليشن ٽيڪنالاجي 9,49 استعمال ڪندي. slurry 1:9 (w/v) SM بفر ۾ (50 mM Tris-HCl [pH 7.5]، 0.1 M NaCl، 8 mM MgSO4.7H2O ۽ 0.01٪ جليٽين؛ سگما Aldrich، Gillingham، UK)، پوءِ انبڪيٽ ڪيو ويو 4 ° C تي 24 ڪلاڪن لاءِ، آهستي آهستي گھمڻ لاءِ شڪاري بفر ۾. معطلي کي 3000 گرام تي 3 منٽن لاءِ سينٽرفيوج ڪيو ويو. سپرنيٽنٽ گڏ ڪيو ويو ۽ 13,000 گرام تي 5 منٽن لاء ٻيو ڀيرو centrifuged. ان کان پوءِ سپرنيٽنٽ کي 0.45 µm ميمبرين فلٽر (Minisart؛ Sartorius، Gottingen، Germany) ۽ 0.2 µm جھلي فلٽر (Minisart) مان گذريو ويو ته جيئن باقي بچيل بيڪٽيريا سيلز کي هٽايو وڃي. ASxL5T اهي فلٽر پاس ڪري سگھن ٿا. ساڳي سلري مان ڪيمپيلو بڪٽر انٽروسوس S12 (NCBI Accession نمبر CP040464) جو نرم آگر لان معياري ٽيڪنالاجي استعمال ڪندي تيار ڪيو ويو. فلٽر ٿيل سلوري انهن ميزبان سيل پليٽن مان هر هڪ تي 10 µl قطرن ۾ ورهايو ويو ۽ سڪي وڃڻ جي اجازت ڏني وئي. پليٽ کي مائڪرو ايروفيلڪ ٽينڪ ۾ 37 ° C تي 48 ڪلاڪن لاءِ مائڪرو ايروبيڪ حالتن ۾ (5% O2، 5% H2، 10% CO2، ۽ 80% N2). حاصل ڪيل نمايان تختي کي SM بفر ۾ ڪڍيو ويو ۽ C. hyointestinalis S12 جي تازي لان ۾ منتقل ڪيو ويو ته جيئن lysed organisms کي اڳتي وڌايو وڃي. هڪ دفعو اهو طئي ڪيو وڃي ٿو ته بيڪٽيريا lytic تختي جو سبب آهن ۽ فيج نه، عضوي کي ميزبان کان آزاديء سان وڌڻ جي ڪوشش ڪريو ۽ ان کي وڌيڪ خاصيت ڏيو. ايروبڪ ڪلچر 37 ° C تي 5٪ v/v defibrinated گھوڙن جي رت سان ڪيو ويو (TCS Biosciences Lt, Buckingham, UK, supplement). نيشنل ڪلينڪ اسٽينڊ ڪميٽي جي هدايتن جي مطابق، ڊسڪ ڊفيوشن جو طريقو استعمال ڪيو ويندو آهي اينٽي بيڪٽيريل حساسيت جي جاچ لاءِ. BHI آگر 37 ° C تي ڪلچر ڪيو ويو هڪ ڊسڪ استعمال ڪندي جنهن ۾ ايروبڪ ڪلچر لاءِ هيٺيون اينٽي بايوٽڪ دوائون (آڪسائيڊ) شامل آهن: اموڪسسيلين ۽ ڪلوولينڪ ايسڊ 30 µg؛ cefotaxime 30 µg؛ streptomycin 10 µg؛ ciprofloxacin 5 µg؛ Ceftazidime 30 µg Nalidixic acid 30 µg؛ امپينيم 10 µg؛ Azithromycin 15 µg؛ کلورامفينڪول 30 µg؛ Cefoxitin 30 µg؛ Tetracycline 30 µg؛ Nitrofurantoin 300 µg؛ Aztreonam 30 µg؛ امپيسلن 10 µg؛ Cefpodoxime 10 µg؛ Trimethoprim-Sulfamethoxazole 25 µg. لوڻ رواداري 37 ° C تي BHI آگر پليٽ تي ايروبڪ انڪيوبيشن ذريعي قائم ڪئي وئي. اضافي NaCl شامل ڪيو ويو BHI آگر پليٽن ۾ 10٪ w/v تائين ڪنسنٽريشن رينج مهيا ڪرڻ لاءِ. pH جي حد ايروبڪ ڪلچر ذريعي BHI آگر پليٽس تي 37 ° C تي طئي ڪئي وئي آهي، جتي pH جي حد کي 4 ۽ 9 جي وچ ۾ sterile HCl يا sterile NaOH سان ترتيب ڏنو ويو آهي، ۽ پليٽ ڀرڻ کان اڳ ٽارگيٽ پي ايڇ ويل جي تصديق ڪئي ويندي آهي. سيلولر فيٽي ايسڊ جي تجزيي لاءِ، ASxL5T BHI آگر تي 3 ڏينهن ۽ ايروبڪ 37 ° C تي ڪلچر ڪيو ويو. MIDI (Sherlock Microbial Identification System, version 6.10) FERA Science Ltd, (York, UK) جي معياري پروٽوڪول جي مطابق، سيل فيٽي ايسڊز ڪڍيا ويا، تيار ڪيا ويا ۽ تجزيو ڪيو ويو.
TEM لاءِ، ASxL5T کي 24 ڪلاڪن لاءِ 37°C تي BA تي هڪجهڙائي سان ڦهلائي ايروبڪ ڪيو ويو، ۽ پوءِ 1 ml جي 3% (v/v) glutaraldehyde ۾ 0.1 M cacodylate بفر ۾ ڪمري جي حرارت تي 1 ڪلاڪ لاءِ فڪس ڪيو، پوءِ سينٽريفيوج 3 منٽن لاء 10,000 گرام تي. پوءِ نرميءَ سان 600 μl 0.1 M cacodylate بفر ۾ pellet respend ڪريو. مقرر ٿيل ASxL5T معطلي کي 200 ميش ڪاپر گرڊ تي فارموار/ڪاربن فلم ڏانهن منتقل ڪريو. بيڪٽيريا کي 0.5٪ (w/v) 1 منٽ لاءِ uranyl acetate سان داغ ڪيو ويو ۽ TEI Tecnai G2 12 Biotwin خوردبيني استعمال ڪندي TEM پاران جانچيو ويو. جيئن مٿي ذڪر ڪيو ويو آهي، NZCYM برٿ (BD Difco™, Fisher Scientific UK Ltd, Loughborough) ۾ هڪ ئي تعداد ۾ شڪار ۽ شڪار ڪندڙ کي گڏ ڪريو ۽ 48 ڪلاڪن لاءِ ڪيمپيلو بڪٽر يا ڪيمپيلو بڪٽر جي مائڪرو ايروبڪ حالتن هيٺ 37 ڊگري سينٽي گريڊ تي انڪيوبيٽ ڪريو، شڪاري ۽ شڪاري جو رابطو TEM پاران پڻ جانچيو ويو. Escherichia coli لاء ايروبيڪ حالتون. پريڪيشن جي ڪري سيل جي مورفولوجي ۾ ڪنهن به تبديلي کي طئي ڪرڻ لاءِ آزاديءَ سان شڪار ۽ شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا کي جانچيو. سوڊان ڪارو طريقو پي ايڇ بي جي جمع جي نظرياتي خوردبيني لاء استعمال ڪيو ويو.
BHI يا BA پليٽن تي جراثيم کان پاڪ swab سان ASxL5T رات جو ڪلچر وڌو. ASxL5T سيلز گڏ ڪريو ۽ انھن کي MRD (CM0733، Oxoid) ۾ معطل ڪريو، ۽ پوء انھن کي 4 ° C تي 7 ڏينھن تائين رکو ته سيلز کي بکيو. NCTC ريفرنس يا ليبارٽري اسٽاڪ بيڪٽيريل ڪلچر کي BHI برٿ يا نمبر 2 nutrient برٿ (CM007، Oxoid) ۾ داخل ڪيو ويو، رات جو انڪيوب ڪيو ويو، 13,000g تي سينٽرفيوج ڪيو ويو ۽ OD600 0.4 تائين MRD ۾ بحال ڪيو ويو. ثقافت: بيسلس سبٽيليس NCTC 3610T، Citrobacter freundii NCTC 9750T، Enterobacter aerogenes NCTC 10006T، Enterococcus faecalis NCTC 775T، Escherichia coli NCTC 86، Klebnostoccoxy16TC4NCTC 10817، ليسٽريا اسپيشل بيڪٽيريا NCTC 4885، Bacillus macerans NCTC 6355T، Providencia stuartsii NCTC 10318، Pseudomonas fluorescens SMDL، Rhodococcus submarine hamburger NCTC 1621 ۾ مونٽيونٽيڪل 7 ٽي سي ايل، بي سي ايلس ميسران. mucilage NCTC 10861، Staphylococcus aureus NCTC 8532T، Streptococcus pneumoniae NCTC 7465T، Yersinia enterocolitica NCTC 10460. ڪيمپيلو بڪٽر ميزبان مائڪرو ايروبيڪي طور تي BA 7 ° سي 3 اسپيسڊڊ پليٽس ۽ اين اي زيڊ ۾ BA ° سي تي اين سي سي اين ڊي ايم تي پکڙيل هو. آزمايل ڪيمپيلو بڪٽر هسٽون آهن: C. coli 12667 NCTC، C. جيجوني 12662، C. جيجوني PT14، C. جيجوني NCTC 11168T، C. helveticus NCTC 12472، C. لاري NCTC 11458، C. جيجوني 11458، C. جيجوني 11458، سي. PT14، C... MRD ۾ سيلز گڏ ڪريو، 13,000g تي سينٽريفيوج ۽ MRD ۾ ريزسپنڊ ڪريو جيستائين OD600 0.4 نه ٿئي. 0.5 ml معطلي جو aliquot شامل ڪريو 5 ml ڳليل NZCYM ٽاپ آگر (0.6% agar) ۽ ان کي 1.2% NZCYM ھيٺئين پليٽ تي وجھو. علاج ڪرڻ ۽ سڪي وڃڻ کان پوءِ، هر لان بورڊ تي 20 µl قطرن جي طور تي ورهايل ASxL5T کي ورهايو ويو. ڪلچر جي درجه حرارت ۽ ماحول جو دارومدار ٽيسٽ بيڪٽيريا جي گهرجن تي آهي.
استعمال ڪريو GenElute™ بيڪٽيريل جينومڪ ڊي اين اي کٽ (سگما الڊريج) بيڪٽيريا جي ڌار ڌار مان ڊي اين اي تيار ڪرڻ لاءِ. معياري طريقا استعمال ڪيا ويا 16S rRNA جين جي پي سي آر ايمپليفڪيشن ۽ پراڊڪٽ جي ترتيب جي تعين لاءِ ڊائي ٽرمينيشن ڪيمسٽري استعمال ڪندي (يوروفنز ويليو ريڊ سروس، جرمني). BLAST-N پروگرام استعمال ڪريو انھن ترتيبن کي ٻين 16S rRNA جين جي ترتيبن سان ڀيٽڻ لاءِ سڃاڻڻ ۽ گڏ ڪرڻ لاءِ ويجهي سان لاڳاپيل نسلن کي. اهي ميگا ايڪس پروگرام ۾ ClustalW استعمال ڪندي ترتيب ڏنل آهن. phylogenetic وڻ کي MEGA X استعمال ڪندي 1000 ھدايت ٿيل نقلن سان، Tamura-Nei ماڊل جي بنياد تي وڌ ۾ وڌ امڪاني طريقي سان استعمال ڪيو ويو 54. استعمال ڪريو PureLink™ Genomic DNA Kit (Fisher Scientific, Loughborough, UK) پوري جينوم جي ترتيب لاءِ ڊي اين اي ڪڍڻ لاءِ. ASxL5T جو جينوم تسلسل Illumina MiSeq ميلاپ استعمال ڪندي طئي ڪيو ويو، جيڪو 250 bp ڊبل-اينڊڊ ريڊس تي مشتمل آهي جيڪو هڪ لائبريري تي مشتمل آهي جيڪو Nextera ليبلنگ ڪٽ استعمال ڪندي تيار ڪيو ويو آهي ۽ PacBio پليٽ فارم تان 2 کان 20 kb ڊگها پڙهيا ويا آهن. سيمبيا يونيورسٽي ۾ جينومڪس ڊي اين اي ترتيب ڏيڻ جي تحقيق جي سهولت. جينوم کي CLC جينومڪس ورڪ بينچ 12.0.3 استعمال ڪندي گڏ ڪيو ويو (Qiagen, Aarhus, Denmark). ASxL5T ثقافتون نيشنل ٽائپ ڪلچر ڪليڪشن (UK) ۽ هالينڊ جي بيڪٽيريل ڪلچر ڪليڪشن (NCCB) ۾ جمع ٿيل آهن. مقابلي لاءِ استعمال ٿيندڙ لاڳاپيل جاندارن جا جينوم هي آهن: Thalassolituus oleivorans MIL-1T (Accession number HF680312، مڪمل)؛ بيڪٽيريا جهازن سانينسس KCTC 32220T (Accession number BMYY01000001، نامڪمل)؛ Oceanobacter kriegii DSM 6294T (Accession number NZ_AUGV00000000، نامڪمل)؛ ماريناموناس ڪميونٽي DSM 5604T (شامل ٿيل ASM436330v1، نامڪمل)، Oceanospirullum linum ATCC 11336T (شامل ٿيل MTSD02000001، نامڪمل) ۽ Thalassolituus sp. C2-1 (شامل ڪريو NZ_VNIL01000001، نامڪمل). استعمال ڪريو JGI Genome Portal36 at https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= ترتيب ڏيڻ لاءِ الائنمينٽ اسڪور (AF) ۽ اوسط نيوڪليڪ ايسڊ سڃاڻپ (ANI). جوڙن ۾. Rodriguez-R & Konstantinidis55 جو طريقو امينو اسيد جي سڃاڻپ (AAI) کي طئي ڪرڻ لاءِ استعمال ڪيو ويو. GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 استعمال ڪريو اندازي مطابق وڌ ۾ وڌ امڪاني فيلوجينيٽڪ وڻ پيدا ڪرڻ لاءِ. دستياب ريفرنس جينوم جي نمائندگي ڪندڙ ان پٽ جينوم کي 16S rRNA فائيلوجني مان ASxL5T سان لاڳاپيل هجڻ جي طور تي سڃاڻپ ٿيل ريفرنس جينيرا مان چونڊيو ويو آهي. آن لائين آن لائين اوزار (https://itol.embl.de/) استعمال ڪندي وڻ کي بيان ڪيو. ASxL5T جينوم جي فنڪشنل تشريح ۽ تجزيو ڪيو ويندو آهي BlastKOALA KEGG آن لائن ٽول استعمال ڪندي KEGG (ڪيوٽو انسائيڪلوپيڊيا آف جينس ۽ جينومس) ماڊل افزودگي تقسيم. COG زمرے جي ورڇ (orthologous گروپن) کي استعمال ڪندي طئي ڪيو ويو آهي eggNOG-mapper آن لائن اوزار.
Pérez, J., Moraleda-Muñoz, A., Marcos-Torres, FJ and Muñoz-Dorado, J. بيڪٽيريا جي اڳڪٿي: 75 سال ۽ اهو جاري آهي! . ماحول. microorganism. 18، 766-779 (2016).
Linares-Otoya، L. وغيره. پيرو جي ساحلي پٽي تي شڪاري بيڪٽيريا جي تنوع ۽ اينٽي بيڪٽيريا جي صلاحيت. مارچ جي دوا. 15. E308. https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017).
Pasternak، Z. et al. انهن جي جين ذريعي، توهان انهن کي سمجهي سگهندا: شڪاري بيڪٽيريا جي جينوميڪ خاصيتون. ISME J. 7، 756-769 (2013).
ساڪٽ، RE بيڪٽيريوفاج جي شڪاري طرز زندگي Bdellovibrio. انسٽال ڪريو. پادري مائڪروبس. 63، 523-539 (2009).
ڪورپ، جي.، ويلا گورووڪ، ايم ايس ۽ نيٽ، ايم اينٽي بايوٽيڪٽس کان بچاء واري بيڪٽيريا. بيلسٽن جي. هسٽو ڪيمسٽري 12، 594-607 (2016).
Johnke, J., Fraune, S., Bosch, TCG, Hentschel, U. & Schulenburg, H. Bdellovibrio ۽ ساڳيا جاندار آھن مختلف ميزبان آبادي ۾ microbiome diversity جو اڳڪٿي ڪندڙ. microorganism. ماحوليات. 79، 252-257 (2020).
Vila, J., Moreno-Morales, J. ۽ Balesté-Delpierre, C. دريافت ڪريو نئين اينٽي بيڪٽيريل ايجنٽ جي موجوده صورتحال. ڪلينڪل. microorganism. انفيڪشن. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019).
Hobley، L. et al. phage ۽ phage جي ٻٽي اڳڪٿي E. coli جي شڪار کي بغير ڪنهن اڳڪٿي جي ختم ڪري سگهي ٿي. جي بيڪٽيريا. 202، e00629-19. https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020).
El-Shibiny, A., Connerton, PL & Connerton, IF ڪيمپيلو بڪٽر ۽ بيڪٽيريوفاجز جي ڳڻپ ۽ تنوع آزاد رينج ۽ نامياتي مرغن جي فيڊنگ چڪر دوران الڳ ٿيل آهي. ايپليڪيشن ماحول. microorganism. 71، 1259-1266 (2005).
ولکنسن، ڊي اي وغيره. ڪيمپيلو بڪٽر سوائن جي جينومڪ ٽيڪسونومي ۽ ايپيڊميولوجي کي اپڊيٽ ڪريو. سائنس. نمائندو 8، 2393. https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018).
لي، ايم ڊي GToTree: سسٽم جينومڪس لاءِ صارف دوست ورڪ فلو. بايو انفارميٽڪس 35، 4162–4164 (2019).
ايڊگر، آر سي MUSCLE: هڪ گھڻن ترتيب واري ترتيب جو طريقو جيڪو وقت ۽ خلا جي پيچيدگي کي گھٽائي ٿو. بي ايم سي حياتياتي ڄاڻ. 5، 113 (2004).
Capella-Gutiérrez, S., Silla-Martínez, JM & Gabaldón, T. TrimAl: A tool for automatic alignment and trimming in large-scale phylogenetic analysis. بايو انفارميٽڪس 25، 1972-1973 (2009).
Hyatt, D., LoCascio, PF, Hauser, LJ & Uberbacher, EC gene and metagenomic sequence translation start site prediction. بايو انفارميٽڪس 28، 2223-2230 (2012).
شين، W. ۽ Xiong، J. TaxonKit: ڪراس پليٽ فارم ۽ موثر NCBI درجه بندي ٽول ڪٽ. Bio Rxiv. (پهچايل جون 1، 2021)؛ https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019).
قيمت، ايم اين، دهل، پي ايس ۽ آرڪين، اي پي فاسٽ ٽري 2-تقريبن وڌ ۾ وڌ امڪاني وڻ وڏي ترتيب سان. PLOS One 5، e9490 (2010).
تانج، O. GNU متوازي. (پهچايل جون 1، 2021)؛ https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018).
ڪنهيسا، ايم ۽ گوٽو، ايس ڪي جي جي: ڪيوٽو انسائيڪلوپيڊيا آف جينس ۽ جينومس. نيوڪليڪ ايسڊ ريسرچ. 28، 27-30 (2000).
چيڪ ريپبلڪ، ايل وغيره. extremolytes ectoine ۽ hydroxyectoine جو ڪردار دٻاءُ جي محافظن ۽ غذائي اجزاء جي طور تي: جينياتي، سسٽم جينومڪس، بايو ڪيمسٽري، ۽ ساخت جي تجزيو. جين (بيسل). 9. E177. https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018).
Gregson, BH, Metodieva, G., Metodiev, MV, Golyshin, PN & McKew, BA فرقي پروٽين ايڪسپريشن دوران اوبلگيٽ ميرين هائيڊرو ڪاربن-ڊيگريڊنگ بيڪٽيريا Thalassolituus oleivorans MIL-1 وچولي ۽ ڊگھي زنجير جي واڌ جي دوران. سامهون. microorganism. 9، 3130 (2018).
Pasternak, Z., Ben Sasson, T., Cohen, Y., Segev, E., and Jurkevitch, E. فينوٽائپڪ مخصوص اشارن جي وضاحت ڪرڻ لاءِ هڪ نئون تقابلي جينومڪس طريقو ظاهر ڪري ٿو مخصوص وراثت کي شڪار ڪندڙ بيڪٽيريا نشان ۾. پبلڪ سائنس لائبريري 1. 10. e0142933. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015).
Yakimov، MM، وغيره Thalassolituus oleivorans gene. نومبر، sp. nov.، سامونڊي بيڪٽيريا جو هڪ نئون قسم جيڪو هائيڊرو ڪاربن جي استعمال ۾ ماهر آهي. بين الاقواميت. جي سسٽم ارتقا. microorganism. 54، 141-148 (2004).
وانگ، يو، يو، ايم، ليو، يو، يانگ، ايڪس ۽ ژانگ، ايڪس ايڇ بيڪٽيريوپلانوائيڊس پيسفڪم جين. نومبر، sp. نومبر ۾، اهو ڏکڻ پئسفڪ ۾ گردش ڪندڙ سامونڊي پاڻي کان جدا ٿي ويو. بين الاقواميت. جي سسٽم ارتقا. microorganism. 66، 5010-5015 (2016).