يېڭى تىپتىكى گرام مەنپىي ، ئاۋىئاتسىيە ، تۇزغا چىداملىق ، ئاكتىپ ، تاياق شەكىللىك ۋە يىرتقۇچ باكتېرىيە ASxL5T ئەنگىلىيەنىڭ نوتتىڭخامشىردىكى كالا تېزىكى كۆلچىكىدىن ئايرىۋېتىلىپ ، Campylobacter نى ئولجى قىلىپ ئىشلەتكەن. ئۇنىڭدىن كېيىن ، باشقا Campylobacter تۈرى ۋە Enterobacteriaceae جەمەتىنىڭ ئەزالىرى ئولجى سۈپىتىدە بايقالغان. ساھىبجامال ھۈجەيرىسى بولمىغان ئىككىلەمچى مەدەنىيەتتىن كېيىن ، چوڭ مېڭە يۈرەك سوقۇش ئېغىزىدا ئاجىز ئاشقازاننىڭ ئۆسۈشى قولغا كەلگەن. ئەڭ ياخشى ئۆسۈش شارائىتى 37 سېلسىيە گرادۇس ، pH 7. توك يەتكۈزۈش ئېلېكترونلۇق مىكروسكوپتا ئولجىنىڭ بارلىقىغا مۇناسىۋەتلىك ئىنتايىن غەلىتە مورفولوگىيەلىك ئالاھىدىلىكلەر ئاشكارىلاندى. 16S rRNA گېن تەرتىپىنى ئىشلىتىپ فىلوگېنتىك ئانالىز شۇنى ئىسپاتلىدىكى ، بۇ ئايرىلىش دېڭىز-ئوكيان سىپىرىلىنا ئائىلىسىنىڭ بىر ئەزاسى بىلەن مۇناسىۋەتلىك ، ئەمما ئېنىق مەلۇم بىر گېننىڭ ئەزاسى دەپ ئېنىق ئايرىلمايدۇ. ASxL5T نىڭ پۈتۈن گېن تەرتىپى دېڭىز-ئوكيان روھى ئەزالىرى بىلەن بولغان مۇناسىۋەتنى ئىسپاتلىدى. بىر سانلىق مەلۇمات ئامبىرىدا بايقىلىشىچە ، بىر قانچە ASxL5Ts 16S rRNA گېن تەرتىپىنى دېڭىز-ئوكيان ، قۇرۇقلۇق ۋە يەر ئاستى سۈيىدىكى بىر قانچە مەدەنىيەتسىز باكتېرىيە بىلەن ئورتاقلىشىدىكەن. بىز جىددىيلەشكەن ASxL5T نىڭ يېڭى بىر تۈردىكى يېڭى تۈرگە ۋەكىللىك قىلىدىغانلىقىنى تەۋسىيە قىلىمىز. Venatorbacter cucullus gen دېگەن ئىسىمنى تەۋسىيە قىلىمىز. نويابىر ، س. 11-ئايدا ، ASxL5T تىپ تىپىدىكى بېسىم سۈپىتىدە ئىشلىتىلگەن.
يىرتقۇچ باكتېرىيە باشقا جانلىقلارنى ئوۋلاش ۋە ئۆلتۈرۈش ئىقتىدارىنى نامايان قىلىدىغان باكتېرىيە بولۇپ ، بىئولوگىيىلىك ماتېرىيال ۋە ئېنېرگىيەگە ئېرىشىدۇ. بۇ ئۆلۈك مىكرو ئورگانىزملاردىكى ئوزۇقلۇق ماددىلارنىڭ ئەسلىگە كېلىشىگە ئوخشىمايدۇ ، ئۇ يەنە پارازىت ئۆز-ئارا تەسىرگە ئوخشىمايدۇ ، بۇ باكتېرىيە ئۇلارنى ئۆلتۈرمەي تۇرۇپ ساھىبجامال بىلەن قويۇق مۇناسىۋەت ئورنىتىدۇ. يىرتقۇچ باكتېرىيە ئوخشىمىغان ھاياتلىق دەۋرىيلىكىنى تەرەققىي قىلدۇردى ، ئۇلار تېپىلغان ئورۇنلاردىكى مول يېمەكلىك مەنبەلىرىدىن پايدىلاندى (مەسىلەن دېڭىز ماكانى). ئۇلار تاكتىكىسى كۆپ خىللاشقان گۇرۇپپا بولۇپ ، ئۇلار پەقەت ئۆزگىچە تۇغماسلىق ھايات دەۋرىيلىكى بىلەن باغلىنىدۇ. يىرتقۇچ باكتېرىيەنىڭ مىسالى ئوخشىمىغان بىر نەچچە خىل فىلادا بايقالغان ، مەسىلەن: ئاقسىل باكتېرىيەسى ، باكتېرىيە ۋە خلورېللا .3. قانداقلا بولمىسۇن ، ئەڭ ياخشى تەتقىق قىلىنغان يىرتقۇچ باكتېرىيە Bdellovibrio ۋە Bdellovibrio ۋە شۇنىڭغا ئوخشاش جانلىقلار (BALOs4). يىرتقۇچ باكتېرىيە يېڭى بىئولوگىيىلىك ئاكتىپ بىرىكمىلەر ۋە باكتېرىيەگە قارشى تۇرغۇچى ماددىلارنىڭ ئۈمىدۋار مەنبەسى 5.
يىرتقۇچ باكتېرىيە مىكروبلارنىڭ كۆپ خىللىقىنى ئاشۇرۇپ ، ئېكولوگىيىلىك سىستېمىنىڭ ساغلاملىقى ، ئىشلەپچىقىرىش كۈچى ۋە مۇقىملىقىغا ئاكتىپ تەسىر كۆرسىتىدۇ دەپ قارىلىدۇ. گەرچە بۇ ئىجابىي سۈپەتلەرگە قارىماي ، يېڭى يىرتقۇچ باكتېرىيە ئۈستىدە باكتېرىيە يېتىشتۈرۈشنىڭ قىيىنلىقى ۋە ھۈجەيرىلەرنىڭ ئۆز-ئارا تەسىرلىرىنى ئەستايىدىللىق بىلەن كۆزىتىپ ، ئۇلارنىڭ مۇرەككەپ ھايات دەۋرىيلىكىنى چۈشىنىش كېرەك. بۇ ئۇچۇرلارنى كومپيۇتېر ئانالىزىدىن ئېلىش ئاسان ئەمەس.
مىكروبقا قارشى تۇرۇش كۈچى كۈچىيىۋاتقان دەۋردە ، باكتېرىيە پەيدا قىلغۇچى باكتېرىيەنى نىشانلاشنىڭ يېڭى ئىستراتېگىيىسى تەتقىق قىلىنىۋاتىدۇ ، مەسىلەن باكتېرىيە ۋە يىرتقۇچ باكتېرىيە 7،8. ASxL5T باكتېرىيەسى 2019-يىلى نوتتىڭخامشىر ئۇنۋېرسىتىتى سۈتچىلىك مەركىزىدىن يىغىلغان كالا تېزىكىدىن باسقۇچلۇق ئايرىۋېتىش تېخنىكىسى ئارقىلىق ئايرىۋېتىلدى. تەكشۈرۈشنىڭ مەقسىتى بىئولوگىيىلىك كونترول قىلغۇچى سۈپىتىدە يوشۇرۇن كۈچى بار جانلىقلارنى ئايرىۋېتىش. Campylobacter hyointestinalis بولسا زۇنوتىك كېسەللىك قوزغاتقۇچى بولۇپ ، ئۇ ئىنسانلارنىڭ ئۈچەي كېسەللىكلىرى بىلەن بارغانسېرى مۇناسىۋەتلىك. ئۇ قان زەردابىدە ھەممىلا جايدا بار بولۇپ ، نىشان ساھىبجامال سۈپىتىدە ئىشلىتىلىدۇ.
ASxL5T باكتېرىيەسى كالا گۆشى مېغىزىدىن ئايرىۋېتىلدى ، چۈنكى ئۇنىڭ C. hyointestinalis چىملىقىدا شەكىللەنگەن تاختايلارنىڭ باكتېرىيە پەيدا قىلغان دورىلارغا ئوخشايدىغانلىقى بايقالغان. بۇ كۈتۈلمىگەن بايقاش ، چۈنكى باسقۇچنى ئايرىۋېتىش جەريانىنىڭ بىر قىسمى 0.2 µm سۈزگۈچ ئارقىلىق سۈزۈشنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، بۇ باكتېرىيە ھۈجەيرىسىنى يوقىتىش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن. تاختايدىن ئېلىنغان ماتېرىيالنى مىكروسكوپ ئارقىلىق تەكشۈرگەندە ، كىچىك گرام مەنپىي ئەگرى تاياقچە تاياقچە باكتېرىيەنىڭ پولى ھىدروكسىبۇترات (PHB) توپلانمىغانلىقى ئېنىقلاندى. ئولجى ھۈجەيرىسىدىن مۇستەقىل بولغان ئاشقازان مەدەنىيىتى مول قاتتىق ۋاسىتە (مەسىلەن مېڭە يۈرەك سوقۇش ئېغىزى (BHI) ۋە قان ئاگار) (BA) غا ئوخشاش ئەمەلگە ئاشىدۇ ، ئۇنىڭ ئۆسۈشى ئاجىز. ئۇ ئېغىر دەرىجىدىكى ئىندۇكسىيە ياخشىلانغاندىن كېيىن ئېرىشىدۇ. ئۇ مىكرو ئورگانىك (% 7 v / v ئوكسىگېن) ۋە ئاتموسفېرا ئوكسىگىن شارائىتىدا ئوخشاشلا ياخشى ئۆسىدۇ ، ئەمما ئانانىروب مۇھىتىدا ئەمەس. 72 سائەتتىن كېيىن ، مۇستەملىكىنىڭ دىئامېتىرى ئىنتايىن كىچىك بولۇپ ، 2 مىللىمېتىرغا يەتتى ، ئۇ ھالرەڭ ، سۈزۈك ، يۇمىلاق ، يۇمىلاق ۋە پارقىراق ئىدى. ئۆلچەملىك بىئو-خىمىيىلىك سىناق توسقۇنلۇققا ئۇچرايدۇ ، چۈنكى ASxL5T سۇيۇق مېدىيادا ئىشەنچلىك يېتىلدۈرۈلمەيدۇ ، بۇ ئۇنىڭ بىئولوگىيىلىك شەكىللىنىشنىڭ مۇرەككەپ ھايات دەۋرىگە تايىنىدىغانلىقىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ. قانداقلا بولمىسۇن ، تەخسىنىڭ ئاسما جازىسى ASxL5T نىڭ ئاۋىئاتسىيە ، ئوكسىد ۋە كاتالوزاغا پايدىلىق ئىكەنلىكىنى ،% 5 NaCl غا بەرداشلىق بېرەلەيدىغانلىقىنى كۆرسەتتى. ASxL5T 10 µg streptomycin غا چىداملىق ، ئەمما تەكشۈرۈلگەن باشقا ئانتىبىئوتىكلارغا سەزگۈر. ASxL5T باكتېرىيە ھۈجەيرىلىرى TEM تەرىپىدىن تەكشۈرۈلگەن (1-رەسىم). BA دا ئولتۇرىدىغان ھۈجەيرىلەر بولمىسا ، ASxL5T ھۈجەيرىلىرى كىچىك Campylobacter بولۇپ ، ئوتتۇرىچە ئۇزۇنلۇقى 1.63 μm (± 0.4) ، كەڭلىكى 0.37 μm (± 0.08) ، يەككە ئۇزۇن (5 μm). جىنسىي بايراق. تەخمىنەن% 1.6 ھۈجەيرىلەرنىڭ كەڭلىكى 0.2 mm دىن تۆۋەندەك قىلىدۇ ، بۇ سۈزگۈچ ئۈسكۈنىسىدىن ئۆتەلەيدۇ. بەزى ھۈجەيرىلەرنىڭ ئۈستىدە پەرىزات (لاتىنچە كۇكۇس) غا ئوخشاش ئادەتتىن تاشقىرى قۇرۇلما كېڭەيتىش كۆرۈلگەن (1D ، E ، G دىكى ئوقلارغا قاراڭ). بۇ قارىماققا ئارتۇقچە تاشقى پەردىدىن تەركىب تاپقاندەك قىلىدۇ ، بۇ بەلكىم سىرتقى كونۋېرتنىڭ چوڭ-كىچىكلىكىنىڭ تېز سۈرئەتتە ئازىيىشىدىن بولۇشى مۇمكىن ، تاشقى پەردە ساقلىنىپ ، «بوش» كۆرۈنگەن. ئۇزۇن مۇددەت 4 سېلسىيە گرادۇسلۇق ئوزۇقلۇق بولمىغان ئەھۋال ئاستىدا (PBS دا) ASxL5T نى يېتىشتۈرۈش كۆپىنچە (ئەمما ھەممىسى ئەمەس) ھۈجەيرىلەرنىڭ كوكۇس مورفولوگىيىسىنى كۆرسىتىپ بەردى (1C رەسىم). ASxL5T Campylobacter jejuni بىلەن 48 سائەت ئولجىدا ئۆسكەندە ، ئوتتۇرىچە ھۈجەيرە چوڭلۇقى ساھىبجامال بولمىغان ھۈجەيرىلەرگە قارىغاندا كۆرۈنەرلىك ئۇزۇن ۋە تار بولىدۇ (1-جەدۋەل ۋە 1E رەسىم). بۇنىڭغا سېلىشتۇرغاندا ، ASxL5T E. coli بىلەن 48 سائەت ئولجىدا ئۆسكەندە ، ئوتتۇرىچە ھۈجەيرىلەرنىڭ چوڭ-كىچىكلىكى ئولجىسىز ئۆسكەنگە قارىغاندا ئۇزۇن ۋە كەڭ بولىدۇ (1-جەدۋەل) ، ھۈجەيرىلەرنىڭ ئۇزۇنلۇقى ئۆزگىرىشچان بولۇپ ، ئادەتتە يىرىك بولىدۇ (1F رەسىم). Campylobacter jejuni ياكى E. coli بىلەن 48 سائەت ئولجا قىلىنغاندا ، ASxL5T ھۈجەيرىسىدە بايراق يوق. 1-جەدۋەلدە ASxL5T نىڭ مەۋجۇتلۇقى ، يوقلۇقى ۋە ئولجى تۈرىگە ئاساسەن ھۈجەيرە چوڭلۇقىدىكى ئۆزگىرىشلەرنى كۆزىتىش خۇلاسە قىلىندى.
ASx5LT نىڭ TEM ئېكرانى: (A) ASx5LT ئۇزۇن قامچا كۆرسىتىدۇ. (2) تىپىك ASx5LT باتارېيە; (3) كوكۇس ASx5LT ھۈجەيرىسى ئۇزۇن مۇددەت يوشۇرۇن ھالەتتە ئوزۇقلۇقسىز. (D) بىر گۇرۇپپا ASx5LT ھۈجەيرىلىرى بىنورماللىقنى كۆرسىتىدۇ (E) Campylobacter ئولجىسى يوشۇرۇنغان ASx5LT ھۈجەيرە گۇرۇپپىسى ئولجىنىڭ ئۆسمىگەنلىرى بىلەن سېلىشتۇرغاندا ھۈجەيرىلەرنىڭ ئۇزۇنلۇقىنىڭ ئېشىپ كەتكەنلىكىنى كۆرسەتتى. (F) چوڭ تىپتىكى بايراقدار بايراق ، ASx5LT ھۈجەيرىسى ، E. coli ئولجىسى يوشۇرۇنغاندىن كېيىن. (G) E. coli بىلەن يوشۇرۇنغاندىن كېيىن يەككە ASx5LT ھۈجەيرىسى ، ئادەتتىن تاشقىرى ئۈستۈنكى قۇرۇلمىنى كۆرسىتىدۇ. بالداق 1 μm غا ۋەكىللىك قىلىدۇ.
16S rRNA گېن تەرتىپىنى ئېنىقلاش (قوشۇلۇش نومۇرى MT636545.1) سانلىق مەلۇمات ئامبىرىنى ئىزدەپ ، گامماپروتاباكتېرىيە سىنىپىدىكىگە ئوخشاش تەرتىپلەرنى تۇرغۇزالايدۇ ، ھەمدە دېڭىز-ئوكيان ئىسپېرمىسى ئائىلىسىدىكى دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيەسىگە ئەڭ يېقىن (2-رەسىم) ، ئۇلار تالاسسولىتۇس جەمەتىنىڭ ئەزالىرى. دېڭىز-ئوكيان باكىلۇسقا ئەڭ يېقىن تۇغقان. 16S rRNA گېن تەرتىپى Bdelvibrionaceae (Deltaproteobacteria) ئائىلىسىگە تەۋە يىرتقۇچ باكتېرىيە بىلەن روشەن پەرقلىنىدۇ. B. bacteriovorus HD100T (تىپ تىپىدىكى بېسىم ، DSM 50701) ۋە B. باكتېرىيە DM11A نىڭ قوش يۆنىلىشلىك سېلىشتۇرمىسى% 48.4 ۋە% 47.7 ، B. exovorus JSS ئۈچۈن بولسا% 46.7 بولغان. ASxL5T باكتېرىيىسىنىڭ 16S rRNA گېنىنىڭ 3 نۇسخىسى بار ، ئىككىسى بىر-بىرىگە ئوخشايدۇ ، ئۈچىنچىسى ئايرىم-ئايرىم ھالدا 3 ئاساسى. باشقا ئىككى خىل يىرتقۇچ باكتېرىيە ئايرىمىسى (ASx5S ۋە ASx5O; 16S rRNA گېنىنىڭ قوشۇلۇش نومۇرى ئايرىم-ئايرىم ھالدا MT636546.1 ۋە MT636547.1) ئوخشاش جايدىن كەلگەن مورفولوگىيەلىك ۋە فېنوتىك تىپى ئوخشاش ئەمەس ، ئەمما ئۇلار ASxL5T ۋە مەدەنىيەتسىز باكتېرىيەگە ئوخشىمايدۇ. ساندان تەرتىپى Oceanospirillaceae دىكى باشقا گېنلار بىلەن بىرلەشتۈرۈلگەن (2-رەسىم). ASxL5T نىڭ پۈتكۈل گېن تەرتىپى NCBI سانلىق مەلۇمات ئامبىرىدا بېكىتىلدى ۋە ساقلاندى ، قوشۇلۇش نومۇرى CP046056. ASxL5T نىڭ گېن گۇرۇپپىسى ئايلانما خروموسومىدىن تەركىب تاپقان بولۇپ ، 2 مىليون 831،152 bp ، G + C نىسبىتى% 56.1. گېن تەرتىپى 2653 CDS (ئومۇمىي) نى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، بۇنىڭ ئىچىدە 2567 خىل ئاقسىلنىڭ كودلىنىشى مۆلچەرلەنگەن ، بۇنىڭ 1596 ىنى ئاكتىپلاش ئىقتىدارى (% 60.2) قىلىپ بېكىتىشكە بولىدۇ. بۇ گېننىڭ تەركىبىدە 67 RNA كودلاش گېنى بار ، بۇنىڭ ئىچىدە 9 rRNA (ھەر بىرى 3S ، 16S ۋە 23S) ۋە 57 tRNA. ASxL5T نىڭ گېن ئالاھىدىلىكى 16S rRNA گېن تەرتىپىدىن ئېنىقلانغان ئەڭ يېقىن نىسپىي تىپنىڭ گېنلىرى بىلەن سېلىشتۇرۇلدى (2-جەدۋەل). ئامىنو كىسلاتا كىملىكى (AAI) ئارقىلىق بارلىق Thalassolituus گېنلىرىنى ASxL5T بىلەن سېلىشتۇرۇڭ. AAI تەرىپىدىن بېكىتىلگەن ئەڭ يېقىن (تولۇق ئەمەس) گېن تەرتىپى Thalassolituus sp. C2-1 (NZ_VNIL01000001 نى قوشۇڭ). بۇ جىددىيلىك مارىئانا ئۆستەڭنىڭ چوڭقۇر دېڭىز چۆكمىلىرىدىن ئايرىۋېتىلدى ، ئەمما سېلىشتۇرۇش ئۈچۈن ھازىر بۇ جىددىيلىك توغرىسىدا ھېچقانداق فېنوتىك ئۇچۇر يوق. ASxL5T نىڭ 2.82 Mb غا سېلىشتۇرغاندا ، ئورگانىزىمنىڭ گېن گۇرۇپپىسى 4.36 Mb. دېڭىز-ئوكيان سپروخېتلىرىنىڭ ئوتتۇرىچە گېن چوڭلۇقى تەخمىنەن 4.16 Mb ( زاكاز باشقا ئەزالارغا سېلىشتۇرغاندا ، ئۇ بىر قەدەر كىچىك. GToTree 1.5.54 نى ئىشلىتىپ گېننى ئاساس قىلغان مۆلچەردىكى ئەڭ چوڭ ئېھتىماللىق فىلوگېنتىك دەرەخ ھاسىل قىلىڭ (3A رەسىم) ، گامماپروبوباكتېرىيەگە خاس 172 يەككە كۆپەيتىلگەن گېننىڭ ماسلاشتۇرۇلغان ۋە ئۇلانغان ئامىنو كىسلاتا تەرتىپىنى ئىشلىتىپ ، 11،12،13،14،15،16 ، 17, 18. تەھلىلدە كۆرسىتىلىشچە ، ئۇ تالاسسولىتۇس ، باكتېرىيە ئايروپىلانى ۋە دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيىسى بىلەن زىچ مۇناسىۋەتلىك. قانداقلا بولمىسۇن ، بۇ سانلىق مەلۇماتلار ASxL5T نىڭ دېڭىز-ئوكيان سىپىرۇلىنادىكى تۇغقانلىرىغا ئوخشىمايدىغانلىقىنى ، ئۇنىڭ گېن تەرتىپى سانلىق مەلۇماتلىرىنىڭ بارلىقىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ.
16S rRNA گېن تەرتىپىنى ئىشلىتىپ فىلوگېنتىك دەرەخ ASxL5T ، ASxO5 ۋە ASxS5 تۈرىنىڭ (ئۈچەي بىلەن) دېڭىز-ئوكياندىكى ۋىرۇسسىزلاندۇرۇلغان ۋە دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيە توپىغا سېلىشتۇرغاندا ئورنىنى گەۋدىلەندۈرىدۇ. گېنبانكنىڭ قوشۇلۇش نومۇرى تىرناق ئىچىدىكى جىددىي ئىسىمغا ئەگىشىدۇ. تەرتىپنى توغرىلاش ئۈچۈن ClustalW نى ئىشلىتىڭ ، ھەمدە ئەڭ چوڭ ئېھتىماللىق ئۇسۇلى ۋە Tamura-Nei ئەندىزىسىنى ئىشلىتىپ فىلوگېنتىك مۇناسىۋەتنى يەكۈنلەڭ ، ھەمدە MEGA X پروگراممىسىدا 1000 يېتەكچى كۆپەيتىش ئېلىپ بېرىڭ. شاختىكى سان يېتەكچى كۆپەيتىلگەن قىممەتنىڭ% 50 تىن يۇقىرى ئىكەنلىكىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ. Escherichia coli U / 541T گۇرۇپپا سۈپىتىدە ئىشلىتىلگەن.
(A) گېننى ئاساس قىلغان فىلوگېنتىك دەرەخ ، دېڭىزدىكى Spirospiraceae باكتېرىيەسى ASxL5T بىلەن ئۇنىڭ يېقىن تۇغقانلىرى E. coli U 5 / 41T نىڭ بىر گۇرۇپپا ئىكەنلىكىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ. B. سول تەرەپتىكى رەسىمدە ھەر بىر گېندىكى ھەر بىر ئىقتىدارلىق COG تۈرىدىكى گېن سانى كۆرسىتىلدى. ئوڭ تەرەپتىكى گرافىكتا ھەر بىر ئىقتىدارلىق COG گۇرۇپپىسىدىكى گېنلارنىڭ نىسبىتى كۆرسىتىلدى. .
KEGG سانلىق مەلۇمات ئامبىرىدىن پايدىلىنىپ ، ASxL5T گېن گۇرۇپپىسىدىكى زاپچاس گېنلىرىنى تەكشۈرۈش ئارقىلىق ، ئاۋىئاتسىيە گامما ئاقسىلىنىڭ تىپىك مېتابولىزم يولىنى ئاشكارىلىدى. ASxL5T باكتېرىيە ماتورلۇق ئاقسىلغا تەقسىم قىلىنغان جەمئىي 75 گېننى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، بۇنىڭ ئىچىدە خىمىيىلىك دورا ، بايراق قۇراشتۇرۇش ۋە IV تىپلىق فىبرىيە سىستېمىسى قاتارلىقلار بار. ئاخىرقى تۈردە ، 10 گېننىڭ 9 ى باشقا بىر قاتار جانلىقلارنىڭ تارتىشىش ھەرىكىتىگە مەسئۇل. ASxL5T نىڭ گېن گۇرۇپپىسىدا گالوفىللارنىڭ مۆلچەرىدەك ئوسموتىك بېسىمنىڭ قوغداش ئىنكاسىغا قاتنىشىدىغان مۇكەممەل تېتراخايدروپىرىمىن بىئوسىنتېز يولى بار. بۇ گېن يەنە كوفاكتور ۋە ۋىتامىنلارنىڭ رىبوفلاۋىن بىرىكمە يولىنى ئۆز ئىچىگە ئالغان نۇرغۇن مۇكەممەل يوللارنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ. گەرچە ئالكان 1-ئوكسىد ئوكسىگېن (alkB2) گېنى ASxL5T دا بار بولسىمۇ ، ئەمما ھىدرو كاربوندىن پايدىلىنىش يولى تولۇق ئەمەس. ASxL5T نىڭ گېن تەرتىپىدە ، T. oleiverans MIL-1T21 دىكى TOL_2658 (alkB) ۋە TOL_2772 (ئىسپىرت دېھىدروگېنازا) قاتارلىق ھىدرو كاربوننىڭ بۇزۇلۇشىغا ئاساسلىق سەۋەب بولغان گېنلارنىڭ گولوگولوگىيىسى ئېنىق ئەمەس. 3B رەسىمدە COG تۈرىدىكى گېننىڭ تەقسىملىنىشى ASxL5T بىلەن زەيتۇن يېغى MIL-1T ئوتتۇرىسىدىكى سېلىشتۇرما كۆرسىتىلدى. ئومۇمىي جەھەتتىن ئالغاندا ، كىچىكرەك ASxL5T گېن گۇرۇپپىسىدا چوڭراق مۇناسىۋەتلىك گېنلارغا سېلىشتۇرغاندا ، ھەر بىر COG تۈرىدىكى گېنلار ماس ھالدا ئاز بولىدۇ. ھەر بىر ئىقتىدار تۈرىدىكى گېن سانى گېننىڭ پىرسەنتى سۈپىتىدە ئىپادىلەنسە ، تەرجىمىنىڭ گېن نىسبىتى ، رىبوسومال قۇرۇلمىسى ۋە بىيوگېنېز تۈرى ۋە تېخىمۇ چوڭ ASxL5T نى تەشكىل قىلىدىغان ئېنېرگىيە ئىشلەپچىقىرىش ۋە ئايلاندۇرۇش ئىقتىدار تۈرلىرىدە پەرق كۆرۈلىدۇ. گېن نىسبىتى T. oleiverans MIL-1T گېن گۇرۇپپىسىدىكى ئوخشاش گۇرۇپپا بىلەن سېلىشتۇرۇلىدۇ. بۇنىڭغا سېلىشتۇرغاندا ، ASxL5T گېنلىرىغا سېلىشتۇرغاندا ، T. oleivorans MIL-1T نىڭ كۆپەيتىش ، قايتا قۇرۇش ۋە رېمونت قىلىش ۋە ترانسكرىپسىيە تۈرىدىكى گېنلارنىڭ نىسبىتى تېخىمۇ يۇقىرى. قىزىقارلىق يېرى ، ئىككى گېننىڭ ھەر بىر ئىقتىدار تۈرىنىڭ مەزمۇنىدىكى ئەڭ چوڭ پەرق ASxL5T دا بار بولغان نامەلۇم گېنلارنىڭ سانى (3B رەسىم). KEGG مودۇللىرىنى بېيىتىش ئانالىزى ئېلىپ بېرىلدى ، ھەر بىر KEGG مودۇلى گېن تەرتىپى سانلىق مەلۇماتلىرىنى ئىزاھلاش ۋە بىئولوگىيىلىك چۈشەندۈرۈش ئۈچۈن قولدا بېكىتىلگەن بىر يۈرۈش ئىقتىدار بىرلىكىنى كۆرسىتىدۇ. 3C رەسىمدە ASxL5T ۋە زەيتۇن MIL-1T نىڭ تولۇق KOG مودۇل يولىدىكى گېن تەقسىملەش سېلىشتۇرمىسى كۆرسىتىلدى. بۇ ئانالىزدا كۆرسىتىلىشىچە ، گەرچە ASxL5T نىڭ گۈڭگۈرت ۋە ئازوتنىڭ مېتابولىزم يولى تولۇق بولسىمۇ ، T. oleiverans MIL-1T يوق. بۇنىڭغا سېلىشتۇرغاندا ، T. oleiverans MIL-1T نىڭ مۇكەممەل سىستېن ۋە مېتونىن مېتابولىزم يولى بار ، ئەمما ئۇ ASxL5T دا تولۇق ئەمەس. شۇڭلاشقا ، ASxL5T نىڭ سۇلفات ئاسسىمىلياتسىيە قىلىش ئالاھىدىلىكى بار (مېتابولىزم ئىقتىدارى ياكى كېسەللىك قوزغاتقۇچ قاتارلىق فېنوتىپتىك بەلگە سۈپىتىدە ئىشلىتىشكە بولىدىغان گېنلار گۇرۇپپىسى دەپ ئېنىقلىما بېرىلگەن ؛ https://www.genome.jp/kegg/module.html) T oleiverans MIL-1T. ASxL5T نىڭ گېن مەزمۇنىنى يىرتقۇچ تۇرمۇش ئۇسۇلىنى كۆرسىتىپ بېرىدىغان گېن تىزىملىكى بىلەن سېلىشتۇرۇش نەتىجىسىز. گەرچە O ئانتىگېن پولىساخارىد بىلەن مۇناسىۋەتلىك بولغان لەگلەكنى كودلاشتۇرىدىغان waaL گېنى ASxL5T گېنىدا بولسىمۇ (ئەمما ئۇ نۇرغۇن گرام مەنپىي باكتېرىيەدە كۆپ ئۇچرايدۇ) ، تىرىپتوفان 2,3 دىئوكسىگېنازا (TDO) گېنى 60 ئامىنونى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ. كىسلاتا رايونلىرى ئادەتتە يىرتقۇچ باكتېرىيەدە كۆپ ئۇچرايدۇ. ASxL5T گېن گۇرۇپپىسىدا باشقا يىرتقۇچ خاراكتېرلىق گېن يوق ، بۇنىڭ ئىچىدە مېۋونونات يولىدىكى ئىزوپرېنوئىد بىئوسىنتېزغا مۇناسىۋەتلىك كودلاش فېرمېنتى بار. شۇنىڭغا دىققەت قىلىڭكى ، تەكشۈرۈلگەن يىرتقۇچ گۇرۇپپىدا ترانسكرىپسىيەلىك تەڭشەش گېنى gntR يوق ، ئەمما ASxL5T دا ئۈچ gntR غا ئوخشاش گېننى پەرقلەندۈرگىلى بولىدۇ.
ASxL5T نىڭ فېنوتىپتىك ئالاھىدىلىكى 3-جەدۋەلدە يىغىنچاقلانغان بولۇپ ، ئەدەبىياتتا دوكلات قىلىنغان 23 ، 24 ، 25 ، 26 ۋە 27 مۇناسىۋەتلىك گېنلارنىڭ فېنوتىك ئالاھىدىلىكى بىلەن سېلىشتۇرۇلغان. T. marinus ، T. olevorans ، B. sanyensisis ۋە Oceanobacter kriegii دىن ئايرىۋېتىلگەنلەر ئاكتىپ ، تۇزغا چىداملىق ، ئوكسىدلىنىشقا قارشى ئاكتىپ تاياق شەكىللىك بەدەن ، ئەمما ASxL5T بىلەن باشقا فېنوتىپتىك ئالاھىدىلىك يوق دېيەرلىك. دېڭىز-ئوكياننىڭ ئوتتۇرىچە pH قىممىتى 8.1 (https://ocean.si.edu/ocean-life/invertebrates/ocean-acidification#section_77) بولۇپ ، T. marinus ، T. olevorans ، B. sanyensis ۋە O. kriegii. ASxL5T دېڭىزدىن باشقا تۈرلەرگە خاس چوڭراق pH دائىرىسى (4-9) گە ماس كېلىدۇ. Thalassolituus sp نىڭ فېنوتىپتىك ئالاھىدىلىكى. C2-1. نامەلۇم. ASxL5T نىڭ ئۆسۈش تېمپېراتۇرىسى ئادەتتە دېڭىز سۈيىنىڭ (4-42 سېلسىيە گرادۇس) غا قارىغاندا كەڭرەك بولىدۇ ، گەرچە T. marinus يېگانەلىرىنىڭ ھەممىسى ئىسسىققا بەرداشلىق بېرەلمىسىمۇ. شورپا مېدىياسىدا ASxL5T نى ئۆستۈرەلمەسلىك تېخىمۇ كۆپ فېنوتىك خاراكتېرنىڭ ئالدىنى ئالدى. API 20E نى ئىشلىتىپ BA تەخسىسى ، ONPG ، ئارگىن دى ھىدرولازا ، لىزىن دېكاربىللازا ، ئورنىتىن دېكاربىللازا ، سىترىتتىن پايدىلىنىش ، ئۇرېيە ، تىرىپتوفان دېئامىنازا ، ھايۋانات يىلىمى گىدرولىز ئېنزىمدىن ئېلىنغان ماتېرىياللارنى سىناق قىلىڭ ، سىناق نەتىجىسى ھەممىسى مەنپىي ، ئەمما ئىندول ، ئاتسېتوئىن ۋە H2S يوق. were produced. ئىشلىتىلمىگەن كاربون سۇ بىرىكمىلىرى: گلۇكوزا ، ماننوزا ، ئىنوسىتول ، سوربىتول ، رامنوزا ، ساخاروزا ، مېلىبىئوزا ، ئامىگدالىن ۋە ئارابىنوزا قاتارلىقلارنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ. ئېلان قىلىنغان مۇناسىۋەتلىك پايدىلىنىش سىستىمىسىغا سېلىشتۇرغاندا ، ASxL5T بېسىمنىڭ ھۈجەيرە ياغ كىسلاتاسى ئارخىپى 4-جەدۋەلدە كۆرسىتىلدى. ئاساسلىق ھۈجەيرە ياغ كىسلاتاسى C16: 1ω6c ۋە / ياكى C16: 1ω7c ، C16: 0 ۋە C18: 1ω9. گىدروكىسىي ياغ كىسلاتاسى C12: 0 3-OH ۋە C10: 0 3-OH مۇ مەۋجۇت. ASxL5T دىكى C16: 0 نىڭ نىسبىتى مۇناسىۋەتلىك گېنلارنىڭ دوكلات قىلىنغان قىممىتىدىن يۇقىرى. بۇنىڭغا سېلىشتۇرغاندا ، دوكلات قىلىنغان T. marinus IMCC1826TT غا سېلىشتۇرغاندا ، ASxL5T دىكى C18: 1ω7c ۋە / ياكى C18: 1ω6c نىڭ نىسبىتى تۆۋەنلىدى. oleivorans MIL-1T ۋە O. kriegii DSM 6294T ، ئەمما B. سانىensis KCTC 32220T دا بايقالمىدى. ASxL5T ۋە ASxLS نىڭ ياغ كىسلاتا ئارخىپىنى سېلىشتۇرۇشتا ، ئوخشاش تۈردىكى گېن گۇرۇپپىسىدىكى DNA تەرتىپى بىلەن بىردەك بولغان ئىككى خىل بېسىم ئارىسىدىكى يەككە ياغ كىسلاتاسىنىڭ مىقدارىدا ئىنچىكە پەرقلەر ئاشكارىلاندى. سۇدان قارا سىنىقىدىن پايدىلىنىپ پولى -3-گىدروكىبىبرات (PHB) زەررىچىسى بايقالمىدى.
ASxL5T باكتېرىيىسىنىڭ يىرتقۇچ ھايۋانلار ئولجىنىڭ دائىرىسىنى ئېنىقلاش ئۈچۈن تەتقىق قىلىنغان. بۇ باكتېرىيە Campylobacter تۈرىدە لەۋھە ھاسىل قىلالايدۇ ، بۇنىڭ ئىچىدە: Campylobacter suis 11608T ، Campylobacter jejuni PT14 ، Campylobacter jejuni 12662 ، Campylobacter jejuni NCTC 11168T; Escherichia coli NCTC 12667; C. helveticus NCTC 12472; C lari NCTC 11458 ۋە C. upsaliensis NCTC 11541T. ئۇسۇلنىڭ ساھىبجامال دائىرىسىنى بەلگىلەش بۆلىكىدە كۆرسىتىلگەن مەدەنىيەتلەرنى ئىشلىتىپ ، تېخىمۇ كەڭ دائىرىدىكى Gram مەنپىي ۋە گرام مۇسبەت باكتېرىيەنى سىناڭ. نەتىجىدە كۆرسىتىلىشىچە ، ASxL5T نى Escherichia coli NCTC 86 ۋە Citrobacter freundii NCTC 9750T دا ئىشلىتىشكە بولىدۇ. Klebsiella oxytoca 11466 دا شەكىللەنگەن تاختايلار E. coli NCTC 86 بىلەن TEM نىڭ ئۆز-ئارا تەسىر كۆرسىتىشى 4A-D رەسىمدە كۆرسىتىلدى ، Campylobacter jejuni PT14 ۋە Campylobacter يۈرۈشلۈك S12 بىلەن بولغان ئۆز-ئارا تەسىر 4E-H ئوتتۇرىدا كۆرسىتىلدى. ھۇجۇم قىلىش مىخانىزىمى سىناق قىلىنغان ئولجىلارغا ئوخشىمايدىغاندەك قىلىدۇ ، ھەر بىر ASxL5T ھۈجەيرىسىگە بىر ياكى بىر قانچە E. coli ھۈجەيرىسى ئۇلىنىپ ، سۈمۈرۈلۈشتىن ئىلگىرى كېڭەيتىلگەن كاتەكچىنىڭ يېنىغا ئورۇنلاشتۇرۇلغان. بۇنىڭغا سېلىشتۇرغاندا ، ASxL5T بىر خىل ئالاقىلىشىش نۇقتىسى ئارقىلىق Campylobacter غا باغلانغاندەك قىلىدۇ ، ئادەتتە يىرتقۇچ ھۈجەيرىلەرنىڭ چوققىسى ۋە كامپىلوباكتېر ھۈجەيرىسىنىڭ چوققىسىغا يېقىنلىشىدۇ (4H رەسىم).
TEM ASx5LT بىلەن ئولجىنىڭ ئۆز-ئارا تەسىر كۆرسىتىشىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ: (AD) بىلەن E. coli ئولجىسى. (EH) ۋە C. jejuni ئولجىسى. (A) يەككە E. coli (EC) ھۈجەيرىسىگە ئۇلانغان تىپىك ASx5LT ھۈجەيرىسى; (2) يەككە EC ھۈجەيرىسىگە چاپلانغان سۈزۈك ASx5LT; (3) كۆپ خىل EC ھۈجەيرىسىگە ئۇلانغان ASx5LT ھۈجەيرىسى; (4) يەككە E. coli (EC) ھۈجەيرىسىگە كىچىكرەك ASx5LT ھۈجەيرىسىنى چاپلاش; (5) Campylobacter jejuni (CJ) ھۈجەيرىسىگە ئۇلانغان يەككە ASx5LT ھۈجەيرىسى; (F) ASx5LT C. hyointestinalis (CH) ھۈجەيرىسىگە ھۇجۇم قىلىدۇ. (G) ئىككى دانە ASx5LT ھۈجەيرىسى CJ ھۈجەيرىسىگە ھۇجۇم قىلدى. (H) CJ ھۈجەيرىسىنىڭ چوققىسىغا يېقىن (0.2 mm) ASx5LT ئۇلىنىش نۇقتىسىنى يېقىندىن كۆرۈش. بۇ بالداق (A - G) دىكى 1 مىللىمېتىرغا ۋەكىللىك قىلىدۇ.
يىرتقۇچ باكتېرىيە تەرەققىي قىلىپ مول ئولجى مەنبەسىدىن پايدىلانغان. ئېنىقكى ، ئۇلار ئوخشىمىغان مۇھىتتا كەڭ تارقالغان. نوپۇس ئەزالىرىنىڭ كۆلىمى كىچىك بولغاچقا ، باسقۇچنى ئايرىش ئۇسۇلى ئارقىلىق ASxL5T باكتېرىيەسىنى پاتقاقتىن ئايرىپ قويغىلى بولىدۇ. ASxL5T نىڭ دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيەسى دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيەسى ئائىلىسىدىكىلەرنىڭ گېن جەھەتتىكى باغلىنىشى كىشىنى ھەيران قالدۇرىدۇ ، گەرچە بۇ ئورگانىزم تۇزغا چىداملىق بولۇپ ، تەركىبىدە% 5 تۇز بار. پاتقاقنىڭ سۇ سۈپىتىنى ئانالىز قىلىش نەتىجىسىدە ناترىي خىلورنىڭ مىقدارىنىڭ% 0.1 كىمۇ يەتمەيدىغانلىقىنى كۆرسەتتى. شۇڭلاشقا ، لاي دېڭىز مۇھىتىدىن جۇغراپىيىلىك ۋە خىمىيىلىك جەھەتتىن يىراق. ئوخشاش مەنبەدىن مۇناسىۋەتلىك ، ئەمما ئوخشىمىغان ئۈچ ئايرىغۇچىنىڭ بولۇشى بۇ يىرتقۇچ ھايۋانلارنىڭ بۇ دېڭىز-ئوكيان مۇھىتىدا جۇش ئۇرۇپ راۋاجلىنىۋاتقانلىقىنى ئىسپاتلاپ بېرىدۇ. ئۇنىڭدىن باشقا ، مىكروبوم ئانالىزى (https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB38990 دىن كەلگەن سانلىق مەلۇمات ھۆججەتلىرى) ئوخشاش 16S rRNA گېن تەرتىپىنىڭ ئەڭ مول 50 مەشغۇلات تاكسىغا جايلاشقانلىقىنى كۆرسەتتى. ) لاينىڭ بىر قانچە ئەۋرىشكە ئارىلىقىدا. گېنبانك سانلىق مەلۇمات ئامبىرىدا بىر قانچە مەدەنىيەتسىز باكتېرىيە بايقالدى ، ئۇلارنىڭ ASSL5T باكتېرىيەسىگە ئوخشاش 16S rRNA گېن تەرتىپى بار. بۇ تەرتىپلەر ASxL5T ، ASxS5 ۋە ASxO5 نىڭ تەرتىپلىرى بىلەن بىرلىكتە تالاسسولىتۇس ۋە ئوكيانوباكتېردىن ئايرىلغان ئوخشىمىغان كلادلارغا ۋەكىللىك قىلىدۇ (2-رەسىم). ئۈچ خىل مەدەنىيەتسىز باكتېرىيە (GQ921362 ، GQ921357 ۋە GQ921396) 2009-يىلى جەنۇبىي ئافرىقا ئالتۇن كانىدا 1.3 كىلومىتىر چوڭقۇرلۇقتىكى يېرىق سۈيىدىن ئايرىۋېتىلدى ، قالغان ئىككىسى (DQ256320 ۋە DQ337006) يەر ئاستى سۈيىدىن (جەنۇبىي ئافرىقادىمۇ). 2005). ASSL5T بىلەن ئەڭ زىچ مۇناسىۋەتلىك بولغان 16S rRNA گېن تەرتىپى 16S rRNA گېن تەرتىپىنىڭ بىر قىسمى بولۇپ ، 2006-يىلى فرانسىيەنىڭ شىمالىدىكى دېڭىز ساھىلىدىن ئېرىشكەن قۇم چۆكمىلىرىنى بېيىتىش مەدەنىيىتىدىن ئېرىشكەن (قوشۇلۇش نومۇرى AM29240828). مەدەنىيەتسىز باكتېرىيە HQ183822.1 دىن زىچ مۇناسىۋەتلىك 16S rRNA گېن تەرتىپى جۇڭگودىكى شەھەر ئەخلەت مەيدانىدىن ئېقىپ كەتكەن يىغىۋېلىش باكىدىن ئېلىنغان. ئېنىقكى ، ASxL5T باكتېرىيىسى تاكتىكىلىق سانلىق مەلۇمات ئامبىرىدا ئانچە ۋەكىللىك قىلالمايدۇ ، ئەمما مەدەنىيەتسىز باكتېرىيەنىڭ بۇ تەرتىپلىرى دۇنيانىڭ ھەرقايسى جايلىرىغا تارقالغان ASxL5T غا ئوخشاش جانلىقلارغا ۋەكىللىك قىلىشى مۇمكىن ، ئادەتتە رىقابەت مۇھىتىدا. پۈتكۈل گېن فىلوگېنتىك ئانالىزىدىن قارىغاندا ، ASxL5T غا ئەڭ يېقىن تۇغقان Thalassolituus sp. C2-1, T. marinus, T. oleivorans. O. kriegii 23, 24, 25, 26, 27. Talassolituus دېڭىز-ئوكيان مەجبۇرىي ھىدرو كاربون پارچىلىنىش باكتېرىيىسى (OHCB) نىڭ ئەزاسى ، ئۇ دېڭىز-ئوكيان ۋە قۇرۇقلۇق مۇھىتىدا كەڭ تارقالغان ، ئادەتتە ھىدرو كاربون بۇلغىنىش ۋەقەسىدىن كېيىن ھۆكۈمران ئورۇندا تۇرىدۇ. دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيىسى OHCB گۇرۇپپىسىنىڭ ئەزاسى ئەمەس ، بەلكى دېڭىز-ئوكيان مۇھىتىدىن ئايرىۋېتىلگەن.
فېنوتىپتىك سانلىق مەلۇماتلاردا كۆرسىتىلىشىچە ، ASxL5T يېڭى بىر خىل جانلىق بولۇپ ، ئىلگىرى دېڭىز-ئوكيان سپروسپىراسى ئائىلىسىدىكى تونۇلمىغان بىر ئەزانىڭ ئەزاسى ئىكەن. يېڭى ئايرىۋېتىلگەن تۈرلەرنى يېڭى تۈرگە ئايرىشنىڭ ھازىرچە ئېنىق ئۆلچىمى يوق. ئۇنىۋېرسال گېن چەكلىمىسىنى ئېنىقلاشقا ئۇرۇندى ، مەسىلەن ، مۇتەئەسسىپ ئاقسىل (POCP) نىڭ گېن گۇرۇپپىسىنىڭ نىسبىتىگە ئاساسەن ، كېسىلگەن قىممەتنىڭ پايدىلىنىش بېسىمى بىلەن% 50 ئوخشاش بولۇشى تەۋسىيە قىلىنىدۇ. يەنە بەزىلەر تولۇق بولمىغان گېندىن ئېرىشكىلى بولىدىغانلىقى ئۈچۈن POCP غا قارىغاندا ئەۋزەللىكى بار AAI قىممىتىنى ئىشلىتىشنى تەۋسىيە قىلىدۇ. ئاپتورنىڭ قارىشىچە ، ئەگەر AAI قىممىتى مودېل تۈرلىرىنىڭ مودېل بېسىمىغا سېلىشتۇرغاندا% 74 كىمۇ يەتمىسە ، بۇ خىل ئوخشىمىغان گېننىڭ ۋەكىلى. دېڭىز بوغۇزىدىكى مودېل تۈرى دېڭىز سۈيى ، مودېل جىددىيلىكى O. linum ATCC 11336T. ASxL5T بىلەن O. linum ATCC 11336T ئارىسىدىكى AAI قىممىتى% 54.34 ، ASxL5T بىلەن T. oleivorans MIL-1T (ئۇرۇق تىپىدىكى تۈرلەر) ئارىسىدىكى AAI قىممىتى% 67.61 بولۇپ ، بۇ ASxL5T نىڭ تالاسسولىتۇسقا ئوخشىمايدىغان يېڭى ئۇرۇققا ۋەكىللىك قىلىدىغانلىقىنى كۆرسىتىدۇ. 16S rRNA گېن تەرتىپىنى تۈرگە ئايرىش ئۆلچىمى قىلىپ ، تەۋسىيە قىلىنغان ئۇرۇقنى ئايرىش چېگرىسى% 94.5. ASxL5T بەلكىم Thalassolituus تۈرىگە قويۇلۇشى مۇمكىن ، T. oleivorans MIL-1T ۋە% 96.17 بىلەن% 95.03% 16S rRNA رەت تەرتىپى كۆرسىتىلىدۇ. marinus IMCC1826T. قانداقلا بولمىسۇن ، ئۇ يەنە B سانىerois NV9 بىلەن% 94.64% 16S rRNA گېنى بار باكتېرىيە توپىغا ئورۇنلاشتۇرۇلىدۇ ، بۇ 16S rRNA گېنى قاتارلىق يەككە گېننى ئىشلىتىشنىڭ خالىغانچە تۈرگە ئايرىش ۋە تاپشۇرۇشنى كەلتۈرۈپ چىقىرىدىغانلىقىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ. يەنە بىر تەۋسىيە قىلىنغان ئۇسۇل ANI ۋە گېن گۇرۇپپىسىنى توغرىلاش نومۇرى (AF) نى ئىشلىتىپ ، بارلىق گېنلارنىڭ سانلىق مەلۇمات نۇقتىلىرىنىڭ توپلىنىشىنى تەكشۈردى. ئاپتور ئانالىز قىلىنىۋاتقان تاكسىغا خاس مۆلچەرلەنگەن ئۇرۇقنىڭ بۇرۇلۇش نۇقتىسى بىلەن ئۇرۇق چېگرىسىنى بىرلەشتۈرۈشنى تەۋسىيە قىلغان. قانداقلا بولمىسۇن ، ئەگەر تالاسسولىتۇس ئايرىمىسىدىن يېتەرلىك مۇكەممەل گېن گۇرۇپپىسى بولمىسا ، ASxL5T نىڭ بۇ ئۇسۇل ئارقىلىق تالاسولىتۇس تۈرىگە تەۋە ياكى ئەمەسلىكىنى ئېنىقلىغىلى بولمايدۇ. ئانالىز قىلىش ئۈچۈن مۇكەممەل گېن تەرتىپلىرى چەكلىك بولغاچقا ، پۈتكۈل گېن فىلوگېنتىك دەرىخىنى ئېھتىياتچانلىق بىلەن ئىزاھلاش كېرەك. ئىككىنچىدىن ، پۈتكۈل گېننى سېلىشتۇرۇش ئۇسۇللىرى سېلىشتۇرۇلغان گېننىڭ چوڭ-كىچىكلىكىدىكى ماھىيەتلىك پەرقلەرنى ھېسابلىيالمايدۇ. ئۇلار ساقلانغان يادرولۇق يەككە كۆپەيتىلگەن گېننىڭ مۇناسىۋەتلىك گېنلار بىلەن ئوخشاشلىقىنى ئۆلچەپ چىقتى ، ئەمما ASxL5T نىڭ تېخىمۇ كىچىك گېنلىرىدا بولمىغان گېنلارنىڭ كۆپلىكىنى نەزەرگە ئالمىدى. ئېنىقكى ، ASxL5T ۋە تالاسسولىتۇس ، ئوكيانوباكتېر ۋە باكتېرىئوپلانانى ئۆز ئىچىگە ئالغان گۇرۇپپىلارنىڭ ئورتاق ئەجدادى بار ، ئەمما تەدرىجى تەرەققىيات باشقىچە يولنى بېسىپ ، گېننىڭ ئازىيىشىنى كەلتۈرۈپ چىقىرىدۇ ، بۇ بەلكىم يىرتقۇچ ھاياتقا ماسلىشىشى مۇمكىن. بۇ T. oleivorans MIL-1T بىلەن سېلىشتۇرغاندا ، ئۇ% 28 چوڭ بولۇپ ، ئوخشىمىغان مۇھىت بېسىمى ئاستىدا تەرەققىي قىلىپ ھىدرو كاربون 23،30 نى ئىشلىتىدۇ. رىكېتسىيە ، خلامىدىيە ۋە بۇچنېرا قاتارلىق مەجبۇرىي ھۈجەيرە ئىچىدىكى پارازىت قۇرت ۋە سىمبونىتلار بىلەن قىزىقارلىق سېلىشتۇرۇشقا بولىدۇ. ئۇلارنىڭ گېن گۇرۇپپىسىنىڭ چوڭلۇقى تەخمىنەن 1 Mb. ساھىبجامال ھۈجەيرە مېتابولىتلىرىنى ئىشلىتىش ئىقتىدارى گېننىڭ يوقىلىشىنى كەلتۈرۈپ چىقىرىدۇ ، شۇڭا كۆرۈنەرلىك تەدرىجىي تەرەققىيات گېن گۇرۇپپىسىنىڭ بۇزۇلۇشىنى باشتىن كەچۈردى. دېڭىز-ئوكيان خىمىيىلىك ئوزۇقلۇق جانلىقلىرىدىن يىرتقۇچ ھاياتقا تەدرىجىي ئۆزگىرىش گېن گۇرۇپپىسىنىڭ چوڭ-كىچىكلىكىنى كەلتۈرۈپ چىقىرىشى مۇمكىن. COG ۋە KEGG تەھلىلى كۆچمە گېن ئېلېمېنتلىرىنىڭ كەڭ تارقىلىشىدىن ئەمەس ، بەلكى ASxL5T بىلەن T. oleivorans MIL-1T ئارىسىدىكى گېن فۇنكسىيەسىدىكى ئالاھىدە ئىقتىدارغا ئىشلىتىلىدىغان گېننىڭ سانى ۋە يەر شارىنىڭ ئوخشىماسلىقىنى گەۋدىلەندۈردى. ASxL5T نىڭ پۈتكۈل گېن گۇرۇپپىسىنىڭ G + C نىسبىتىدىكى پەرق% 56.1 ، T. oleivorans MIL-1T نىڭ پەرقى% 46.6 ، بۇمۇ ئۇنىڭ ئايرىلغانلىقىنى كۆرسىتىدۇ.
ASxL5T گېن گۇرۇپپىسىنىڭ كودلاش مەزمۇنىنى تەكشۈرۈش فېنوتىپتىك ئالاھىدىلىككە قارىتا ئىقتىدار خاراكتېرلىك چۈشەنچە بېرىدۇ. IV تىپلىق فىمبرىيا (Tfp) كودلاشتۇرىدىغان گېننىڭ بولۇشى ئالاھىدە قىزىقىدۇ ، چۈنكى ئۇلار يەر يۈزىدە بايراق يوق ، ئىجتىمائىي سىيرىلىش ياكى تەۋرىنىش دەپ ئاتىلىدىغان ھۈجەيرە ھەرىكىتىنى ئىلگىرى سۈرىدۇ. خەۋەرلەرگە قارىغاندا ، Tfp نىڭ باشقا ئىقتىدارلىرى بار ، ئۇلار ئالدىن پەرەز قىلىش ، كېسەللىك پەيدا قىلىش ، بىئوفىلم ھاسىل قىلىش ، تەبىئىي DNA قوبۇل قىلىش ، ئاپتوماتىك ھۈجەيرىلەرنى توپلاش ۋە تەرەققىي قىلدۇرۇش 38. ASxL5T گېن گۇرۇپپىسىدا 18 خىل گېن كودلاشتۇرۇلغان دىگۇئانىلات دەۋرىيلىكى (2 خىل گانوسىن ترىفوسفاتنىڭ گانوزىن 2 فوسفات ۋە دەۋرىيلىك diGMP غا ئايلىنىشىنى ئىلگىرى سۈرىدىغان ئېنزىم) ۋە ماس كېلىدىغان دىگۇئانىلات دەۋرىي فوسفات دىگۇئانىلاتنى كودلاشتۇرىدىغان 6 گېن بار. ئېستېرېزنىڭ گېنى (دەۋرىيلىك di-GMP نىڭ گانوزىن مونوفوسفاتنىڭ تۆۋەنلىشىنى ئىلگىرى سۈرىدۇ) قىزىقارلىق ، چۈنكى دەۋرىي دى- GMP بىئولوگىيىلىك فىلم تەرەققىي قىلدۇرۇش ۋە ئايرىش ، ھەرىكەت ، ھۈجەيرە باغلاش ۋە ۋىرۇسقا مۇناسىۋەتلىك مۇھىم ئىككىنچى خەۋەرچى. يەنە شۇنىڭغا دىققەت قىلىش كېرەككى ، Bdellovibrio باكتېرىيەسى ، دەۋرىيلىك قوش GMP ئەركىن تۇرمۇش بىلەن يىرتقۇچ تۇرمۇش ئوتتۇرىسىدىكى ئۆتكۈنچى باسقۇچنى كونترول قىلىدىغانلىقى كۆرسىتىلدى.
يىرتقۇچ باكتېرىيە توغرىسىدىكى تەتقىقاتلارنىڭ كۆپىنچىسى Bdellovibrio ، Bdellovibrio غا ئوخشاش جانلىقلار ۋە Myxococcus تۈرىگە مەركەزلەشكەن. يىرتقۇچ باكتېرىيەنىڭ بۇ ۋە باشقا بىلىنگەن مىساللىرى كۆپ خىل توپنى شەكىللەندۈرىدۇ. بۇ خىل كۆپ خىللىققا قارىماي ، 11 خىل يىرتقۇچ ھايۋاننىڭ فېنوتىپلىرىنى ئەكىس ئەتتۈرىدىغان بىر يۈرۈش ئالاھىدىلىككە ئىگە ئاقسىل ئائىلىلىرى ئېنىقلاندى. قانداقلا بولمىسۇن ، پەقەت O ئانتىگېن لىگاسى (waaL) نى كودلاشتۇرىدىغان گېنلا ئېنىقلاندى ، بۇ گرام مەنپىي باكتېرىيەدە كۆپ ئۇچرايدۇ. بۇ خىل ئانالىز شەكلى ASxL5T نى يىرتقۇچ ھايۋان قىلىپ بېكىتىشكە پايدىسى يوق ، بەلكىم ئۇ رومان ھۇجۇم ئىستراتېگىيىسىنى قوللانغان بولۇشى مۇمكىن. كۆپ خىل يىرتقۇچ باكتېرىيە گېنلىرىنىڭ بولۇشى گۇرۇپپا ئەزالىرى ئوتتۇرىسىدىكى ئىقتىدار ۋە مۇھىت پەرقىنىڭ ئىسپاتىنى نەزەردە تۇتۇپ ، ئىنچىكە ئېنىقلىق ئانالىزلىرىنى تەرەققىي قىلدۇرۇشقا ياردەم بېرىدۇ. بۇ ئانالىزغا كىرگۈزۈلمىگەن يىرتقۇچ باكتېرىيەنىڭ مىسالى Cupriavidus necator42 ۋە Bradymonabacteria43 ئەزالىرىنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، چۈنكى تەتقىقاتچىلار ئوخشىمىغان مىكروب توپلىرىنى تەكشۈرگەندە ، تېخىمۇ كۆپ يىرتقۇچ تاكسى قۇرۇلدى.
TEM سۈرىتى تارتقان ASxL5T باكتېرىيىسىنىڭ ئەڭ كۆرۈنەرلىك ئالاھىدىلىكى ئۇنىڭ ئۆزگىچە ۋە ئەۋرىشىم مورفولوگىيىسى بولۇپ ، ئۇ ئولجى باكتېرىيەسى بىلەن ئۆز-ئارا تەسىر كۆرسىتەلەيدۇ. كۆزىتىلگەن ئۆز-ئارا تەسىرنىڭ تۈرى باشقا يىرتقۇچ باكتېرىيەگە ئوخشىمايدۇ ، ئىلگىرى بايقالمىغان ياكى دوكلات قىلىنمىغان. ئوتتۇرىغا قويۇلغان ASxL5T يىرتقۇچ ھايۋانلارنىڭ ھاياتلىق دەۋرى 5-رەسىمدە كۆرسىتىلدى. ئەدەبىياتتا بۇ يەردە دوكلات قىلغىنىمىزدەك ئوپتىكىلىق قۇرۇلمىلارغا ئوخشاش مىساللار ناھايىتى ئاز ، ئەمما بۇ مىساللار ئاندا-ساندا چوققىسى چوڭىيىدىغان دېڭىز-ئوكيان باكتېرىيەسى Terasakiispira papahanaumokuakeensis نى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ. ، ئىلگىرى Oceanospirillum تۈرىگە تەۋە بولۇپ ، ئاتالمىش ​​«قۇتۇپ فىلىمى» 45 نى كۆرگەزمە قىلغان. كوكسى شەكىللىرى كونا مەدەنىيەتلەردە دائىم كۆرۈلىدۇ ، بولۇپمۇ ئەگرى شەكىلدىكى باكتېرىيەگە ئوخشاش ، مەسىلەن Vibrio ، Campylobacter ۋە Helicobacter 46 ، 47 ، 48 قاتارلىقلار. ASxL5T باكتېرىيىسىنىڭ ئېنىق ھايات دەۋرىنى ئايدىڭلاشتۇرۇش ئۈچۈن يەنىمۇ ئىلگىرىلىگەن ھالدا ئىشلەشكە توغرا كېلىدۇ. ئۇنىڭ قانداق تۇتۇلغانلىقى ۋە ئولجىلارنى ، گېن گۇرۇپپىسىنىڭ داۋالاش ياكى بىئوتېخنىكا مەقسىتىدە ئىشلىتىشكە بولىدىغان بىئولوگىيىلىك ئاكتىپ بىرىكمىلەرنى كودلاش-قويماسلىقىنى ئېنىقلاش.
Venatorbacter گېننىڭ چۈشەندۈرۈشى. نويابىردىكى Venatorbacter (Ven.a.tor, ba'c.ter, L. L. n. Venator ، «ئوۋچى» ۋە Gr. . ھۈجەيرىلەر ئاۋىئاتسىيە تىزىلىپ, تۇزسىز, ئەگرى سىزىق. CHATLASE ۋە OXDIECE پائالىيىتى. Phb 4-9 ئارىلىقى ئادەتتىن تاشقىرى. دېڭىز يىلپىزىدا كۆپىنچىسى كىسلاتالىق pH غا چىدىمايدۇ. ئاساسلىق ياغ كىسلاتاسى C16: 1ω6c ۋە / ياكى C16: 1ω7c ، C16: 0 ۋە C18: 1ω9; : 0 3-OH سۇيۇقلاندۇرۇلغان ياغ كىسلاتاسى دەپ قارىلىدۇ. ئۇلار شورپا مېدىياسىدا ئۆسمەيدۇ ھەمدە Enterobacteriaceae جەمەتىنىڭ ئەزالىرىنىڭ ئالدىن پەرەز قىلىش ھەرىكىتى بۇ جەمەتنىڭ فىلوگېنتىك ئورنى ئائىلىدە.
Venatorbacter cucullus sp نىڭ چۈشەندۈرۈشى. نويابىردىكى Venatorbacter cucullus (cu'cull.us. L. n. Cucullus ئادىل بولۇشنى كۆرسىتىدۇ).
ئۇنىڭدىن باشقا ، بۇ نەسىلنىڭ تەسۋىرلەش ئالاھىدىلىكى شۇكى ، BA ياكى BHI دا ئۆسكەندە ھۈجەيرىلەرنىڭ ئۇزۇنلۇقى 1.63 µm ، كەڭلىكى 0.37 µm. BHI ئاگاردىكى مۇستەملىكە ئىنتايىن كىچىك بولۇپ ، 72 سائەتتىن كېيىن دىئامېتىرى 2 مىللىمېتىرغا يېتىدۇ. ئۇلار ھالرەڭ ، سۈزۈك ، يۇمىلاق ، يۇمىلاق ۋە پارقىراق. بۇ تۈردىكى ئەزالار Escherichia coli ۋە Klebsiella نى ئىشلىتەلەيدۇ. Campylobacter ۋە باشقا بىر قانچە Gram مەنپىي باكتېرىيە ئولجى رولىنى ئوينايدۇ.
تىپىك بېسىم ASxL5T ئەنگلىيەنىڭ نوتتىڭخامشىردىكى كالا سۈتىدىن ئايرىۋېتىلىپ ، دۆلەتلىك تىپ مەدەنىيەت توپلىمى (ئەنگىلىيە) گە قويۇلدى: قوشۇلۇش نومۇرى NCTC 14397 ۋە گوللاندىيە باكتېرىيە مەدەنىيەت توپلىمى (NCCB) قوشۇلۇش نومۇرى NCCB 100775. ASxL5T نىڭ گېن گۇرۇپپىسىنىڭ تولۇق تەرتىپى. CP046056 نىڭ قوشۇلۇشىغا ئاساسەن گېنبانكقا قويۇلغان.
ASxL5T باكتېرىيەسى باسقۇچلۇق ئايرىۋېتىش تېخنىكىسى ئارقىلىق كالا سۈتىدىن ئايرىۋېتىلدى. سۇلياۋ يوپۇق 1: 9 (w / v) SM بۇففېردا (50 mM Tris-HCl [pH 7.5] ، 0.1 M NaCl ، 8 mM MgSO4.7H2O ۋە% 0.01 ھايۋانات يىلىمى سۇيۇلدى ؛ سىگما ئالدرىچ ، ئەنگىلىيە گىللىڭخام) 4 سېلسىيە گرادۇستا 24 سائەت ، ئاستا-ئاستا ئايلىنىدۇ. ئاسما جازا 3000g دە 3 مىنۇت مەركەزلەشتۈرۈلگەن. خاسىيەتلىك كېمە يىغىۋېلىنىپ 13000 گرامدا ئىككىنچى قېتىم 5 مىنۇت مەركەزلەشتۈرۈلدى. ئاندىن خاسىيەتلىك ماددا 0.45 µm پەردى سۈزگۈچ (Minisart; Sartorius, Gottingen, گېرمانىيە) ۋە 0.2 µm پەردە سۈزگۈچ (Minisart) دىن ئۆتۈپ ، قالغان باكتېرىيە ھۈجەيرىلىرىنى چىقىرىپ تاشلىدى. ASxL5T بۇ سۈزگۈچلەردىن ئۆتەلەيدۇ. ئوخشاش لايدىن Campylobacter enterosus S12 (NCBI نىڭ كىرىش نومۇرى CP040464) نىڭ يۇمشاق ئاگار چىملىقى ئۆلچەملىك تېخنىكىدىن پايدىلىنىپ تەييارلانغان. سۈزۈلگەن پاتقاق بۇ ساھىبجامال تاختايلارنىڭ ھەر بىرىگە 10 µl تامچە ئۈچ ھەسسە تارقىتىلىپ ، قۇرۇتىلىدۇ. بۇ تەخسە مىكرو مىكرو باكتا 37 سېلسىيە گرادۇسلۇق مىكرو باكتا 48 سائەت سىلىندى (% 5 O2 ،% 5 H2 ،% 10 CO2 ۋە% 80 N2). ئېرىشىلگەن كۆرۈنەرلىك تاختاي SM بۇففېرغا چىقىرىلىپ ، C. hyointestinalis S12 نىڭ يېڭى چىملىقىغا يۆتكىلىپ ، لايلانغان جانلىقلار تېخىمۇ كېڭەيدى. باكتېرىيەنىڭ فاكتور ئەمەس بەلكى لىتىي تاختاينىڭ سەۋەبى ئىكەنلىكى ئېنىقلانغاندىن كېيىن ، ساھىبجامالدىن مۇستەقىل ھالدا ئورگانىزىمنى تەرەققىي قىلدۇرۇشقا تىرىشىڭ ۋە ئۇنى تېخىمۇ خاسلاشتۇرۇڭ. ئاۋىئاتسىيە مەدەنىيىتى 37 سېلسىيە گرادۇستا% 5 لىك v / v دېزىنفېرلانغان ئات قېنى بىلەن ئېلىپ بېرىلدى (TCS Biosciences Lt ، ئەنگىلىيە بۇككىنخام ، تولۇقلىما). دۆلەتلىك كلىنىكىلىق ئۆلچەم كومىتېتىنىڭ كۆرسەتمىسىگە ئاساسەن ، دىسكا تارقىتىش ئۇسۇلى باكتېرىيەگە قارشى سەزگۈرلۈكنى تەكشۈرۈشتە ئىشلىتىلىدۇ. BHI ئاگارلىقى 37 سېلسىيە گرادۇسلۇق ھاۋا بوشلۇقى مەدەنىيىتى ئۈچۈن تۆۋەندىكى ئانتىبىئوتىكلار (ئوكسىد) بار دىسكىنى ئىشلىتىپ مەدەنىيەتلەشتۈرۈلگەن: ئاموكسىلىن ۋە كلاۋۇلان كىسلاتاسى 30 µg; cefotaxime 30 µg; streptomycin 10 µg; ciprofloxacin 5 µg; Ceftazidime 30 µg Nalidixic كىسلاتاسى 30 µg; Imipenem 10 µg; Azithromycin 15 µg; Chloramphenicol 30 µg; Cefoxitin 30 µg; Tetracycline 30 µg; Nitrofurantoin 300 µg; Aztreonam 30 µg; ئامپىسلىن 10 µg; Cefpodoxime 10 µg; Trimethoprim-Sulfamethoxazole 25 µg. تۇزغا بەرداشلىق بېرىش ئىقتىدارى BHI ئاگار تەخسىسىنىڭ ° C 37 قا يېتىشى بىلەن ئورنىتىلغان. BHI ئاگار تەخسىگە قوشۇمچە NaCl قوشۇلدى ، قويۇقلۇقى 10% w / v غا يەتتى. PH دائىرىسى 37 سېلسىيە گرادۇسلۇق BHI ئاگار تەخسىسىدىكى ئاۋىئاتسىيە مەدەنىيىتى تەرىپىدىن بەلگىلىنىدۇ ، pH دائىرىسى ستېرېئولۇق HCl ياكى ستېرېئولۇق NaOH بىلەن 4 دىن 9 گىچە تەڭشەلدى ، تەخسە قۇيۇشتىن بۇرۇن نىشان pH قىممىتى تەكشۈرۈلدى. ھۈجەيرە ياغ كىسلاتاسىنى ئانالىز قىلىش ئۈچۈن ، ASxL5T BHI ئاگاردا 3 كۈن ، ھاۋا تېمپېراتۇرىسى ° C 37 قا يېتىلدى. FERA Science Ltd ، (ئەنگىلىيە يورك) نىڭ MIDI (Sherlock Microbial Identification System ، 6.10 نەشرى) ئۆلچەملىك كېلىشىمنامىسىگە ئاساسەن ، ھۈجەيرە ياغ كىسلاتاسى چىقىرىلىپ ، تەييارلىنىپ ئانالىز قىلىندى.
TEM غا نىسبەتەن ، ASxL5T 37 سېلسىيە گرادۇسلۇق ھاۋارايىدا 24 سائەت بىردەك تارقىلىپ ، ئاندىن ھاۋا تېمپېراتۇرىسى يېتىلدۈرۈلۈپ ، ئاندىن ئۆي تېمپېراتۇرىسىدا 0.1 M لىك كاكودىلات بۇففېردا% 1 لىك% 3 (v / v) گلۇتارالدېھىدقا يىغىۋېلىندى ، ئاندىن مەركەزدىن قاچۇرۇش. 10 مىڭ گرامدا 3 مىنۇت. ئاندىن ئاستا-ئاستا 600 مىللىمېتىر 0.1 M كاكودىلاتلىق بۇففېردا پېلەكنى توختىتىڭ. مۇقىم ASxL5T ئاسما جازىسىنى 200 تور مىس تورىدا Formvar / كاربون پىلاستىنكىسىغا يۆتكەڭ. بۇ باكتېرىيە% 0.5 (w / v) ئۇران كىسلاتاسى بىلەن 1 مىنۇت داغلانغان ۋە TEM تەرىپىدىن TEI Tecnai G2 12 Biotwin مىكروسكوپ ئارقىلىق تەكشۈرۈلگەن. يۇقىرىدا دەپ ئۆتكىنىمىزدەك ، NZCYM شورپىسى (BD Difco ™ ، Fisher Scientific UK Ltd ، Loughborough) دىكى ئوخشاش ساندىكى ئولجى ۋە يىرتقۇچ ھايۋانلارنى بىرلەشتۈرۈپ ، كامپىلوباكتېر ياكى كامپىلوباكتېرنىڭ 37 سېلسىيە گرادۇسلۇق مىكرو مىكرو شارائىتىدا 48 سائەت يوشۇرۇن ھالەتتە تۇرۇڭ. TEM تەرىپىدىنمۇ تەكشۈرۈلگەن. ئېشېرىچيە كولىنىڭ ئاۋىئاتسىيە شارائىتى. يىرتقۇچ ھايۋانلار ۋە يىرتقۇچ ھايۋانلارنى مۇستەقىل تەكشۈرۈپ ، يىرتقۇچ ھايۋانلارنىڭ ھۈجەيرە مورفولوگىيىسىدىكى ئۆزگىرىشلەرنى ئېنىقلاڭ. سۇدان قارا ئۇسۇلى PHB يىغىلىشنىڭ ئوپتىكىلىق مىكروسكوپتا ئىشلىتىلگەن.
ASHL5T بىر كېچىدىلا مەدەنىيەتنى ئۆستۈرۈڭ ، BHI ياكى BA تاختىسىنىڭ ئۆسۈشىنى ستېرېئولۇق پۈركۈش ئارقىلىق ئۆستۈرۈڭ. ASxL5T ھۈجەيرىسىنى يىغىپ ، MRD (CM0733 ، Oxoid) دە توختىتىڭ ، ئاندىن 4 سېلسىيە گرادۇسقا 7 كۈن قويۇپ ، ھۈجەيرىلەرنى ئاچ قالدۇرۇڭ. NCTC پايدىلىنىش ماتېرىيالى ياكى تەجرىبىخانا زاپاس باكتېرىيە مەدەنىيىتى BHI شورپىسى ياكى 2-نومۇرلۇق ئوزۇقلۇق شورپىسى (CM007, Oxoid) غا ئوكۇل قىلىندى ، بىر كېچىدىلا يوشۇرۇن ھالەتتە ، 13،000 گرام مەركەزگە يەتكۈزۈلۈپ ، OD600 0.4 بولغۇچە MRD دا ئەسلىگە كەلتۈرۈلدى. مەدەنىيەت: Bacillus subtilis NCTC 3610T ، Citrobacter freundii NCTC 9750T ، Enterobacter aerogenes NCTC 10006T ، Enterococcus faecalis NCTC 775T ، Escherichia coli NCTC 86 ، Klebsiella oxytoca 11466 ، Luconostoc NCTC 10817 ، Listeria ئالاھىدە باكتېرىيە NCTC stuartsii NCTC 10318 ، Pseudomonas فلۇئورېسسېنسى SMDL ، رودوككوك سۇ ئاستى پاراخوتى ھامبۇرگ بولكىسى NCTC 1621T ، سالمونېللا ئۈچەي باكتېرىيەسى موندېۋىللې NCTC 5747 ، شىلىمشىق سۇيۇقلۇق NCTC 10861 ، ستافىلوككوك تاياقچە باكتېرىيەسى NCTC 8532T ، Streptococcus ئۆپكە NCTC 7465. كامپىلوباكتېر ساھىبى 37 سېلسىيە گرادۇسلۇق BA تاختىسىدا مىكروبلار بىلەن سىلىندى ۋە NZCYM شورپىسىدا توختىتىلدى. سىناق قىلىنغان Campylobacter ساھىبجاماللىرى: C. coli 12667 NCTC ، C. jejuni 12662 ، C. jejuni PT14 ، C. jejuni NCTC 11168T ، C. helveticus NCTC 12472 ، C. lari NCTC 11458 ، C. lari NCTC 11458 ، C. jejuni PT14 C ... 5 مىللىمېتىر ئېرىتىلگەن NZCYM ئۈستۈنكى ئاگارغا (% 0.6 لىك ئاگار) 0.5 مىللىمېتىر ئاسما ئوكۇل قوشۇپ ،% 1.2 NZCYM ئاستى تاختىغا قۇيۇڭ. ساقايتىپ قۇرۇتقاندىن كېيىن ، تەرتىپلىك سۇيۇلدۇرۇلغان ASxL5T ھەر بىر چىملىق تاختايغا 20 µl تامچە قىلىپ ئۈچ ھەسسە تارقىتىلدى. مەدەنىيەت تېمپېراتۇرىسى ۋە ئاتموسفېراسى سىناق باكتېرىيەسىنىڭ تەلىپىگە باغلىق.
GenElute ™ باكتېرىيە گېن گۇرۇپپىسىنىڭ DNA سى (Sigma Aldridge) نى ئىشلىتىپ ، باكتېرىيە ئايرىغۇچىدىن DNA تەييارلاڭ. 16S rRNA گېنىنىڭ PCR كۈچەيتىلىشى ۋە بوياقنى ئاخىرلاشتۇرۇش خىمىيىسى ئارقىلىق مەھسۇلات تەرتىپىنى ئېنىقلاشتا ئۆلچەملىك ئۇسۇللار قوللىنىلدى (Eurofins قىممەت ئوقۇش مۇلازىمىتى ، گېرمانىيە). BLAST-N پروگراممىسىنى ئىشلىتىپ بۇ تەرتىپلەرنى باشقا 16S rRNA گېن تەرتىپى بىلەن سېلىشتۇرۇپ ، زىچ مۇناسىۋەتلىك تۈرلەرنى ئېنىقلاڭ ۋە توپلاڭ. بۇلار MEGA X پروگراممىسىدا ClustalW ئارقىلىق ماسلاشتۇرۇلغان. فىلوگېنتىك دەرەخ MEGA X ئارقىلىق Tamura-Nei مودېلىنى ئاساس قىلغان ئەڭ چوڭ ئېھتىماللىق ئۇسۇلىنى ئىشلىتىپ قايتا ياسالغان ، 1000 يېتەكچى نۇسخىسى 54. PureLink ™ گېن گۇرۇپپىسىنىڭ DNA زاپچاسلىرىنى ئىشلىتىڭ (Fisher Scientific, Loughborough, UK) پۈتۈن گېن تەرتىپى ئۈچۈن DNA ئاجرىتىڭ. ASxL5T نىڭ گېن تەرتىپى Illumina MiSeq بىرىكمىسى ئارقىلىق بېكىتىلدى ، بۇ Nextera ماركا زاپچاسلىرى ئارقىلىق تەييارلانغان كۇتۇپخانىدىن تەركىب تاپقان 250 bp قوش ئوقلۇق ئوقۇشلۇق ۋە PacBio سۇپىسىنىڭ ئۇزۇنلۇقى 2 دىن 20 كىلوگرامغىچە. سېمبىيە ئۇنۋېرسىتىتىدىكى گېن گۇرۇپپىسىنىڭ DNA تەرتىپ تەتقىقات ئەسلىھەلىرى. بۇ گېن CLC Genomics Workbench 12.0.3 (چىئاگېن ، ئارخۇس ، دانىيە) ئارقىلىق قۇراشتۇرۇلغان. ASxL5T مەدەنىيىتى دۆلەتلىك تىپ مەدەنىيەت توپلىمى (ئەنگىلىيە) ۋە گوللاندىيە باكتېرىيە مەدەنىيەت توپلىمى (NCCB) غا قويۇلغان. سېلىشتۇرۇشقا ئىشلىتىلىدىغان مۇناسىۋەتلىك جانلىقلارنىڭ گېنلىرى: Thalassolituus oleivorans MIL-1T (كىرىش نومۇرى HF680312 ، تولۇق) باكتېرىيە سانانىس KCTC 32220T (قوشۇلۇش نومۇرى BMYY01000001 ، تولۇق ئەمەس) Oceanobacter kriegii DSM 6294T (قوشۇلۇش نومۇرى NZ_AUGV00000000 ، تولۇق ئەمەس); مارىناموناس مەھەللىسى DSM 5604T (ASM436330v1 قوشۇلدى ، تولۇق ئەمەس) ، Oceanospirullum linum ATCC 11336T (MTSD02000001 قوشۇلدى ، تولۇق ئەمەس) ۋە تاللاسولىتۇس sp. C2-1 (NZ_VNIL01000001 نى قوشۇڭ ، تولۇق ئەمەس). ماسلىشىش نومۇرى (AF) ۋە ئوتتۇرىچە يادرو كىسلاتا كىملىكى (ANI) نى ئېنىقلاش ئۈچۈن https://img.jgi.doe.gov//cgi-bin/mer/main.cgi?section=ANI&page= دىكى JGI گېن گۇرۇپپىسىنى ئىشلىتىڭ. جۈپ. Rodriguez-R & Konstantinidis55 نىڭ ئۇسۇلى ئامىنو كىسلاتا كىملىكىنى (AAI) ئېنىقلاشقا ئىشلىتىلگەن. GToTree 1.5.5411,12,13,14,15,16,17,18 نى ئىشلىتىپ ئەڭ يۇقىرى ئېھتىماللىق فىلوگېنتىك دەرەخ ھاسىل قىلىڭ. ئىشلەتكىلى بولىدىغان پايدىلىنىش گېنلىرىغا ۋەكىللىك قىلىدىغان كىرگۈزۈش گېنلىرى 16S rRNA فىلوگېناسىدىن ASxL5T بىلەن مۇناسىۋەتلىك ئىكەنلىكى ئېنىقلانغان پايدىلىنىش گېنلىرىدىن تاللانغان. ھاياتلىق توردىكى قورال (https://itol.embl.de/) ئارقىلىق دەرەخكە ئىزاھات بەردى. ASxL5T گېن گۇرۇپپىسىنىڭ فۇنكسىيەلىك ئىزاھلىنىشى ۋە ئانالىز قىلىنىشى BlastKOALA KEGG تور قورالى ئارقىلىق KEGG (گېن ۋە گېننىڭ كيوتو ئېنسىكلوپېدىيىسى) مودۇلنى بېيىتىش تەقسىماتى ئارقىلىق ئېلىپ بېرىلىدۇ. COG كاتېگورىيەسىنىڭ تارقىلىشى (orthologous گۇرۇپپىلىرى) تۇخۇم NOG-mapper تور قورالى ئارقىلىق بەلگىلىنىدۇ.
پېرېز ، ج. ، مورالېدا-مۇنوز ، ئا. ، ماركوس-توررېس ، FJ ۋە مۇنوز-دورادو ، ج. . مۇھىت. مىكرو ئورگانىزم. 18 ، 766–779 (2016).
لىنارېس-ئوتويا ، پېرۇ دېڭىز قىرغىقىدىكى يىرتقۇچ باكتېرىيەنىڭ كۆپ خىللىقى ۋە باكتېرىيەگە قارشى يوشۇرۇن كۈچى. مارت زەھەرلىك چېكىملىك. 15. E308. https://doi.org/10.3390/md15100308 (2017).
Pasternak, Z. et al. ئۇلارنىڭ گېنى ئارقىلىق سىز ئۇلارنى چۈشىنىسىز: يىرتقۇچ باكتېرىيەنىڭ گېن ئالاھىدىلىكى. ISME J. 7, 756–769 (2013).
Sockett, RE Bdellovibrio باكتېرىيەسىنىڭ يىرتقۇچ تۇرمۇش ئۇسۇلى. قاچىلاش. پوپ مىكروبلىرى. 63 ، 523–539 (2009).
Korp, J., Vela Gurovic, MS & Nett, M. ئانتىبىئوتىك دورىلار يىرتقۇچ باكتېرىيەدىن. بېلشتېين ج. گىستوخېمىيە 12 ، 594–607 (2016).
Johnke, J., Fraune, S., Bosch, TCG, Hentschel, U.S. مىكرو ئورگانىزم. ئېكولوگىيە. 79 ، 252–257 (2020).
Vila, J., Moreno-Morales, J. and Ballesté-Delpierre, C. يېڭى باكتېرىيەگە قارشى دورىلارنىڭ ھازىرقى ھالىتىنى بايقايسىز. كلىنىكىلىق. مىكرو ئورگانىزم. Infect. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.09.015 (2019).
Hobley, L. et al. باسقۇچ ۋە باسقۇچنىڭ قوش مۆلچەرى E. coli ئولجىسىنى بىرمۇ پەرەز قىلمايلا يوقىتالايدۇ. J. باكتېرىيە. 202, e00629-19. https://doi.org/10.1128/JB.00629-19 (2020).
El-Shibiny, A., Connerton, PL & Connerton, IF ئەركىن ۋە ئورگانىك توخۇلارنىڭ ئوزۇقلىنىش دەۋرىدە كامپىلوباكتېر ۋە باكتېرىيە توپىنىڭ سانى ۋە كۆپ خىللىقى. قوللىنىشچان مۇھىت. مىكرو ئورگانىزم. 71 ، 1259–1266 (2005).
ۋىلكىنسون ، DA قاتارلىقلار Campylobacter چوشقا گۆشىنىڭ گېنولوگىيىلىك تاكتىكىسى ۋە يۇقۇم ئەھۋالىنى يېڭىلاڭ. ئىلىم. ۋەكىل 8 ، 2393. https://doi.org/10.1038/s41598-018-20889-x (2018).
لى ، MD GToTree: سىستېما گېنولوگىيىسى ئۈچۈن ئابونتلارغا قۇلايلىق خىزمەت ئېقىمى. Bioinformatics 35, 4162–4164 (2019).
Edgar, RC MUSCLE: ۋاقىت ۋە بوشلۇقنىڭ مۇرەككەپلىكىنى تۆۋەنلىتىدىغان كۆپ خىل تەرتىپكە سېلىش ئۇسۇلى. BMC بىئولوگىيىلىك ئۇچۇرلىرى. 5, 113 (2004).
Capella-Gutiérrez, S., Silla-Martínez, JM & Gabaldón, T. TrimAl: چوڭ تىپتىكى فىلوگېنتىك ئانالىزدا ئاپتوماتىك توغرىلاش ۋە بېزەش قورالى. Bioinformatics 25, 1972–1973 (2009).
Hyatt, D., LoCascio, PF, Hauser, LJ & Uberbacher, EC گېنى ۋە مېتاگېنومىيىلىك تەرتىپلىك تەرجىمە باشلىنىش تور بېتىنى ئالدىن پەرەز قىلىش. Bioinformatics 28, 2223-2230 (2012).
Shen, W. & Xiong, J. TaxonKit: سۇپا ھالقىغان ۋە ئۈنۈملۈك NCBI تۈرگە ئايرىش قوراللىرى. Bio Rxiv. (2021-يىلى 6-ئاينىڭ 1-كۈنى ئېتىراپ قىلىندى) https://www.biorxiv.org/content/10.1101/513523v1 (2019).
باھاسى ، MN ، Dehal ، PS & Arkin ، AP FastTree 2 چوڭ چوڭلۇقتىكى ئەڭ چوڭ ئېھتىماللىق دەرىخى. PLoS One 5, e9490 (2010).
Tange, O. GNU Parallel. (2021-يىلى 6-ئاينىڭ 1-كۈنى ئېتىراپ قىلىندى) https://zenodo.org/record/1146014#.YOHaiJhKiUk (2018).
Kanehisa, M. & Goto, S. KEGG: گېن ۋە گېنلارنىڭ كيوتو ئېنسىكلوپېدىيىسى. يادرو كىسلاتاسى تەتقىقاتى. 28, 27-30 (2000).
چېخ جۇمھۇرىيىتى ، ل. Gene (Basel). 9. E177. https://doi.org/10.3390/genes9040177 (2018).
گرېگسون ، BH ، مېتودىېۋا ، گ. ئالدى. مىكرو ئورگانىزم. 9, 3130 (2018).
پاستېرناك ، ز. ، بېن ساسسون ، ت. ، كوخېن ، ي. ، سېگېۋ ، ئې. ئاممىۋى پەن-تېخنىكا كۇتۇپخانىسى بىرىنچى. 10. E0142933. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0142933 (2015).
ياكىموف ، MM قاتارلىقلار تاللاسولىتۇس oleivorans گېنى. نويابىر ، س. nov. ، ھىدرو كاربون ئىشلىتىش بىلەن شۇغۇللىنىدىغان يېڭى تىپتىكى دېڭىز باكتېرىيەسى. internationality. J. System. تەدرىجى تەرەققىيات. مىكرو ئورگانىزم. 54 ، 141–148 (2004).
ۋاڭ ، ي. ، يۈ ، م. ، ليۇ ، ي. ، ياڭ ، X ۋە جاڭ نويابىر ، س. نويابىردا ئۇ جەنۇبىي تىنچ ئوكياندا ئايلىنىۋاتقان دېڭىز سۈيىدىن ئايرىلدى. internationality. J. System. تەدرىجى تەرەققىيات. مىكرو ئورگانىزم. 66 ، 5010–5015 (2016).